MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium tetani E88 chromosome

Total Repeats: 79021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004557	ATA	2	6	141519	141524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209955
4002	NC_004557	GTT	2	6	141648	141653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28209955
4003	NC_004557	AAG	2	6	141656	141661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209955
4004	NC_004557	GTA	2	6	141766	141771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209955
4005	NC_004557	AGG	2	6	141803	141808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28209955
4006	NC_004557	TTA	2	6	141831	141836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209955
4007	NC_004557	TTAG	2	8	141903	141910	25 %	50 %	25 %	0 %	28209955
4008	NC_004557	AT	3	6	141914	141919	50 %	50 %	0 %	0 %	28209955
4009	NC_004557	ATA	2	6	141952	141957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209955
4010	NC_004557	AT	3	6	141966	141971	50 %	50 %	0 %	0 %	28209955
4011	NC_004557	A	6	6	141978	141983	100 %	0 %	0 %	0 %	28209955
4012	NC_004557	A	7	7	141994	142000	100 %	0 %	0 %	0 %	28209955
4013	NC_004557	A	6	6	142012	142017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_004557	T	6	6	142024	142029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_004557	AT	4	8	142045	142052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_004557	TA	4	8	142060	142067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_004557	TGT	2	6	142187	142192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_004557	GTTT	2	8	142225	142232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_004557	AATA	2	8	142289	142296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_004557	AGT	2	6	142367	142372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_004557	GAA	2	6	142383	142388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_004557	AGT	2	6	142401	142406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_004557	ACT	2	6	142407	142412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_004557	T	7	7	142415	142421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_004557	ATT	2	6	142422	142427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_004557	A	7	7	142440	142446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_004557	TTA	2	6	142448	142453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_004557	AT	3	6	142469	142474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_004557	ATAA	2	8	142493	142500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_004557	AT	3	6	142501	142506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_004557	TAT	2	6	142559	142564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209956
4032	NC_004557	GCA	2	6	142567	142572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28209956
4033	NC_004557	GA	3	6	142662	142667	50 %	0 %	50 %	0 %	28209956
4034	NC_004557	AGA	2	6	142677	142682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209956
4035	NC_004557	A	6	6	142702	142707	100 %	0 %	0 %	0 %	28209956
4036	NC_004557	AAC	3	9	142763	142771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28209956
4037	NC_004557	CTA	2	6	142810	142815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209956
4038	NC_004557	AAG	2	6	142820	142825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209956
4039	NC_004557	ATTA	2	8	142857	142864	50 %	50 %	0 %	0 %	28209956
4040	NC_004557	TAT	2	6	142935	142940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209956
4041	NC_004557	AAC	2	6	142978	142983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28209956
4042	NC_004557	AAT	2	6	142998	143003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209956
4043	NC_004557	AGA	2	6	143025	143030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209956
4044	NC_004557	AAAT	2	8	143045	143052	75 %	25 %	0 %	0 %	28209956
4045	NC_004557	ATA	3	9	143108	143116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209956
4046	NC_004557	ATT	2	6	143132	143137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209956
4047	NC_004557	A	7	7	143160	143166	100 %	0 %	0 %	0 %	28209956
4048	NC_004557	A	7	7	143172	143178	100 %	0 %	0 %	0 %	28209956
4049	NC_004557	GAA	2	6	143203	143208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209956
4050	NC_004557	AAT	2	6	143301	143306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209956
4051	NC_004557	AAT	2	6	143314	143319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209956
4052	NC_004557	AT	3	6	143322	143327	50 %	50 %	0 %	0 %	28209956
4053	NC_004557	ATA	2	6	143359	143364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209956
4054	NC_004557	TAC	2	6	143378	143383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209956
4055	NC_004557	TAA	2	6	143396	143401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209956
4056	NC_004557	ATA	2	6	143446	143451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209956
4057	NC_004557	TGT	2	6	143460	143465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28209956
4058	NC_004557	TAC	2	6	143483	143488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209956
4059	NC_004557	TAC	2	6	143508	143513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209956
4060	NC_004557	TA	3	6	143530	143535	50 %	50 %	0 %	0 %	28209956
4061	NC_004557	A	7	7	143589	143595	100 %	0 %	0 %	0 %	28209956
4062	NC_004557	ATA	2	6	143609	143614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209956
4063	NC_004557	AT	3	6	143634	143639	50 %	50 %	0 %	0 %	28209956
4064	NC_004557	GTA	2	6	143689	143694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209956
4065	NC_004557	ATG	2	6	143699	143704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209956
4066	NC_004557	GAT	2	6	143734	143739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209956
4067	NC_004557	CATA	2	8	143795	143802	50 %	25 %	0 %	25 %	28209956
4068	NC_004557	ATAA	2	8	143869	143876	75 %	25 %	0 %	0 %	28209956
4069	NC_004557	A	6	6	143893	143898	100 %	0 %	0 %	0 %	28209956
4070	NC_004557	AGG	2	6	143918	143923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_004557	GAAA	2	8	143944	143951	75 %	0 %	25 %	0 %	28209957
4072	NC_004557	TGAT	2	8	144164	144171	25 %	50 %	25 %	0 %	28209957
4073	NC_004557	AG	3	6	144179	144184	50 %	0 %	50 %	0 %	28209957
4074	NC_004557	GAA	2	6	144194	144199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209957
4075	NC_004557	GCA	2	6	144298	144303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28209957
4076	NC_004557	ATC	2	6	144374	144379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209957
4077	NC_004557	AG	3	6	144433	144438	50 %	0 %	50 %	0 %	28209957
4078	NC_004557	TGTAGT	2	12	144441	144452	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	28209957
4079	NC_004557	CAGA	2	8	144494	144501	50 %	0 %	25 %	25 %	28209957
4080	NC_004557	TAT	2	6	144519	144524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209957
4081	NC_004557	AGA	2	6	144532	144537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209957
4082	NC_004557	ATA	2	6	144568	144573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209957
4083	NC_004557	AAGAC	2	10	144584	144593	60 %	0 %	20 %	20 %	28209957
4084	NC_004557	GAT	2	6	144607	144612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209957
4085	NC_004557	GATA	2	8	144615	144622	50 %	25 %	25 %	0 %	28209957
4086	NC_004557	CAG	2	6	144623	144628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28209957
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4088	NC_004557	TTCT	2	8	144704	144711	0 %	75 %	0 %	25 %	28209957
4089	NC_004557	AAG	2	6	144846	144851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209957
4090	NC_004557	AT	3	6	144853	144858	50 %	50 %	0 %	0 %	28209957
4091	NC_004557	GAA	2	6	144859	144864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209957
4092	NC_004557	GTAA	2	8	144871	144878	50 %	25 %	25 %	0 %	28209957
4093	NC_004557	ATT	2	6	144879	144884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209957
4094	NC_004557	AT	4	8	144938	144945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_004557	AAAT	2	8	144946	144953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_004557	T	6	6	144960	144965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_004557	TA	3	6	144989	144994	50 %	50 %	0 %	0 %	28209958
4098	NC_004557	TAAAT	2	10	144998	145007	60 %	40 %	0 %	0 %	28209958
4099	NC_004557	AT	4	8	145006	145013	50 %	50 %	0 %	0 %	28209958
4100	NC_004557	GGA	2	6	145023	145028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28209958
4101	NC_004557	TAG	2	6	145066	145071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209958
4102	NC_004557	ATG	2	6	145072	145077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209958
4103	NC_004557	AT	3	6	145084	145089	50 %	50 %	0 %	0 %	28209958
4104	NC_004557	TAA	2	6	145096	145101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209958
4105	NC_004557	AG	3	6	145112	145117	50 %	0 %	50 %	0 %	28209958
4106	NC_004557	TAA	2	6	145273	145278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209958
4107	NC_004557	GAT	2	6	145335	145340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209958
4108	NC_004557	ATT	2	6	145370	145375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209958
4109	NC_004557	AAG	2	6	145397	145402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209958
4110	NC_004557	GTAA	2	8	145419	145426	50 %	25 %	25 %	0 %	28209958
4111	NC_004557	ATAGAT	2	12	145455	145466	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	28209958
4112	NC_004557	TA	3	6	145478	145483	50 %	50 %	0 %	0 %	28209958
4113	NC_004557	ATT	2	6	145523	145528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209958
4114	NC_004557	TAT	2	6	145530	145535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209958
4115	NC_004557	TAA	2	6	145544	145549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209958
4116	NC_004557	ATT	2	6	145574	145579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209958
4117	NC_004557	GAA	2	6	145659	145664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209958
4118	NC_004557	ATA	2	6	145721	145726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209958
4119	NC_004557	GAA	2	6	145730	145735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209959
4120	NC_004557	TAT	2	6	145772	145777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209959
4121	NC_004557	GTA	2	6	145791	145796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209959
4122	NC_004557	GCT	2	6	145800	145805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28209959
4123	NC_004557	T	6	6	145805	145810	0 %	100 %	0 %	0 %	28209959
4124	NC_004557	ATT	2	6	145831	145836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209959
4125	NC_004557	CAA	2	6	145839	145844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28209959
4126	NC_004557	A	6	6	145847	145852	100 %	0 %	0 %	0 %	28209959
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