MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium tetani E88 chromosome

Total Repeats: 79021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004557	TCA	2	6	35678	35683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209858
1002	NC_004557	TC	3	6	35688	35693	0 %	50 %	0 %	50 %	28209858
1003	NC_004557	AAAT	2	8	35696	35703	75 %	25 %	0 %	0 %	28209858
1004	NC_004557	CTT	2	6	35775	35780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209858
1005	NC_004557	TTTAC	2	10	35792	35801	20 %	60 %	0 %	20 %	28209858
1006	NC_004557	TA	3	6	35826	35831	50 %	50 %	0 %	0 %	28209858
1007	NC_004557	CTTT	2	8	35906	35913	0 %	75 %	0 %	25 %	28209858
1008	NC_004557	ATTT	2	8	35917	35924	25 %	75 %	0 %	0 %	28209858
1009	NC_004557	CTAT	2	8	35930	35937	25 %	50 %	0 %	25 %	28209858
1010	NC_004557	ATA	2	6	35956	35961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209858
1011	NC_004557	TAT	2	6	36024	36029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209858
1012	NC_004557	TAT	2	6	36042	36047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209858
1013	NC_004557	T	6	6	36047	36052	0 %	100 %	0 %	0 %	28209858
1014	NC_004557	ATT	3	9	36070	36078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209858
1015	NC_004557	TCT	2	6	36095	36100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209858
1016	NC_004557	ATC	2	6	36103	36108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209858
1017	NC_004557	TATAT	2	10	36136	36145	40 %	60 %	0 %	0 %	28209858
1018	NC_004557	TTC	2	6	36157	36162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209858
1019	NC_004557	T	7	7	36167	36173	0 %	100 %	0 %	0 %	28209858
1020	NC_004557	AAC	2	6	36184	36189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28209858
1021	NC_004557	TAAGTA	2	12	36225	36236	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	28209858
1022	NC_004557	A	7	7	36236	36242	100 %	0 %	0 %	0 %	28209858
1023	NC_004557	ATT	2	6	36257	36262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209858
1024	NC_004557	T	7	7	36273	36279	0 %	100 %	0 %	0 %	28209858
1025	NC_004557	ACT	2	6	36299	36304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209858
1026	NC_004557	TATAAT	2	12	36325	36336	50 %	50 %	0 %	0 %	28209858
1027	NC_004557	TAA	2	6	36346	36351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209858
1028	NC_004557	TTATAT	2	12	36354	36365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209858
1029	NC_004557	TAT	2	6	36424	36429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209858
1030	NC_004557	AT	3	6	36428	36433	50 %	50 %	0 %	0 %	28209858
1031	NC_004557	ATA	3	9	36447	36455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209858
1032	NC_004557	T	6	6	36506	36511	0 %	100 %	0 %	0 %	28209858
1033	NC_004557	TAA	2	6	36573	36578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209858
1034	NC_004557	TTA	2	6	36683	36688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209858
1035	NC_004557	ATT	2	6	36721	36726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209858
1036	NC_004557	GAA	2	6	36732	36737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209858
1037	NC_004557	A	6	6	36761	36766	100 %	0 %	0 %	0 %	28209858
1038	NC_004557	ATG	2	6	36777	36782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209858
1039	NC_004557	ATACA	2	10	36783	36792	60 %	20 %	0 %	20 %	28209858
1040	NC_004557	T	7	7	36811	36817	0 %	100 %	0 %	0 %	28209858
1041	NC_004557	TTA	2	6	36821	36826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209858
1042	NC_004557	T	8	8	36845	36852	0 %	100 %	0 %	0 %	28209858
1043	NC_004557	ATA	2	6	36862	36867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209858
1044	NC_004557	AAT	2	6	36908	36913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209858
1045	NC_004557	A	6	6	36925	36930	100 %	0 %	0 %	0 %	28209858
1046	NC_004557	TAT	2	6	36982	36987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209858
1047	NC_004557	TA	3	6	37002	37007	50 %	50 %	0 %	0 %	28209858
1048	NC_004557	ATA	2	6	37011	37016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209858
1049	NC_004557	TAA	2	6	37047	37052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209858
1050	NC_004557	T	6	6	37054	37059	0 %	100 %	0 %	0 %	28209858
1051	NC_004557	CTT	2	6	37060	37065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209858
1052	NC_004557	ACC	2	6	37075	37080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_004557	TAA	2	6	37082	37087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_004557	T	7	7	37094	37100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_004557	ATA	3	9	37101	37109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_004557	TTATT	2	10	37111	37120	20 %	80 %	0 %	0 %	28209859
1057	NC_004557	AT	3	6	37144	37149	50 %	50 %	0 %	0 %	28209859
1058	NC_004557	TAGTA	2	10	37180	37189	40 %	40 %	20 %	0 %	28209859
1059	NC_004557	CTT	2	6	37246	37251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209859
1060	NC_004557	CAT	2	6	37266	37271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209859
1061	NC_004557	CTA	2	6	37323	37328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209859
1062	NC_004557	TTA	2	6	37338	37343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209859
1063	NC_004557	CTC	2	6	37344	37349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209859
1064	NC_004557	TCT	2	6	37376	37381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209859
1065	NC_004557	TAT	2	6	37408	37413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209859
1066	NC_004557	T	6	6	37435	37440	0 %	100 %	0 %	0 %	28209859
1067	NC_004557	ATA	2	6	37445	37450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209859
1068	NC_004557	CTA	2	6	37467	37472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209859
1069	NC_004557	ACT	2	6	37573	37578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209859
1070	NC_004557	TA	3	6	37594	37599	50 %	50 %	0 %	0 %	28209859
1071	NC_004557	AAT	2	6	37614	37619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209859
1072	NC_004557	ATT	2	6	37624	37629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_004557	CCT	2	6	37630	37635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_004557	TTAAT	2	10	37636	37645	40 %	60 %	0 %	0 %	28209860
1075	NC_004557	CTA	2	6	37699	37704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209860
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1077	NC_004557	TATT	2	8	37793	37800	25 %	75 %	0 %	0 %	28209860
1078	NC_004557	T	8	8	37799	37806	0 %	100 %	0 %	0 %	28209860
1079	NC_004557	AATT	2	8	37889	37896	50 %	50 %	0 %	0 %	28209860
1080	NC_004557	TTA	2	6	37925	37930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209860
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1083	NC_004557	TCTA	2	8	38097	38104	25 %	50 %	0 %	25 %	28209860
1084	NC_004557	TTAAG	2	10	38105	38114	40 %	40 %	20 %	0 %	28209860
1085	NC_004557	TC	3	6	38149	38154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_004557	TATATT	2	12	38156	38167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_004557	AAT	2	6	38176	38181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_004557	AAT	2	6	38184	38189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_004557	AAT	2	6	38192	38197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_004557	AT	3	6	38196	38201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_004557	A	8	8	38216	38223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_004557	T	6	6	38244	38249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_004557	TGG	2	6	38251	38256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_004557	TGG	2	6	38332	38337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_004557	GAA	2	6	38590	38595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_004557	AAT	2	6	38610	38615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_004557	AAT	2	6	38638	38643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_004557	TCAG	2	8	38670	38677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_004557	TGC	2	6	38688	38693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_004557	TTC	2	6	38723	38728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_004557	ACG	2	6	38947	38952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_004557	CGA	2	6	39027	39032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28209861
1103	NC_004557	ACC	2	6	39142	39147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28209861
1104	NC_004557	CG	3	6	39225	39230	0 %	0 %	50 %	50 %	28209861
1105	NC_004557	AGG	2	6	39278	39283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28209861
1106	NC_004557	GGT	2	6	39366	39371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28209861
1107	NC_004557	AGCA	2	8	39503	39510	50 %	0 %	25 %	25 %	28209861
1108	NC_004557	GCC	2	6	39636	39641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28209861
1109	NC_004557	CGCTT	2	10	39664	39673	0 %	40 %	20 %	40 %	28209861
1110	NC_004557	TTC	2	6	39860	39865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_004557	TC	3	6	39881	39886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_004557	ACCT	2	8	39890	39897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_004557	AGCTT	2	10	39997	40006	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1114	NC_004557	AC	3	6	40043	40048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_004557	ACTC	2	8	40260	40267	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_004557	CTT	2	6	40283	40288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_004557	CTC	2	6	40317	40322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_004557	GGT	2	6	40349	40354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_004557	GCT	2	6	40428	40433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_004557	ACTTA	2	10	40480	40489	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1121	NC_004557	GTT	2	6	40518	40523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_004557	TGT	2	6	40611	40616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_004557	GAG	2	6	40686	40691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_004557	TCC	2	6	40774	40779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_004557	CA	3	6	40953	40958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_004557	CTCCC	2	10	41008	41017	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1127	NC_004557	GGT	2	6	41088	41093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_004557	T	6	6	41159	41164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_004557	CT	3	6	41204	41209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_004557	GTCT	2	8	41219	41226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_004557	ATG	2	6	41229	41234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_004557	AAAT	2	8	41253	41260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_004557	TCGC	2	8	41284	41291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_004557	CTA	2	6	41294	41299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_004557	TCC	2	6	41323	41328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1139	NC_004557	TAC	2	6	41641	41646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1145	NC_004557	GT	3	6	42114	42119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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