MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 23950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004552	TAGT	2	8	169924	169931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_004552	T	6	6	169992	169997	0 %	100 %	0 %	0 %	62184803
3503	NC_004552	TAC	2	6	170034	170039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184803
3504	NC_004552	T	6	6	170174	170179	0 %	100 %	0 %	0 %	62184803
3505	NC_004552	TCC	2	6	170237	170242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184803
3506	NC_004552	T	6	6	170264	170269	0 %	100 %	0 %	0 %	62184803
3507	NC_004552	AGT	2	6	170303	170308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184803
3508	NC_004552	TTC	2	6	170315	170320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184803
3509	NC_004552	AAG	2	6	170455	170460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184803
3510	NC_004552	ATG	2	6	170547	170552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184803
3511	NC_004552	TAT	2	6	170598	170603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184803
3512	NC_004552	TCT	2	6	170607	170612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184803
3513	NC_004552	GCT	2	6	170703	170708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184804
3514	NC_004552	GGC	2	6	170709	170714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184804
3515	NC_004552	AGG	2	6	170759	170764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184804
3516	NC_004552	CTA	2	6	170775	170780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184804
3517	NC_004552	CAA	2	6	170797	170802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184804
3518	NC_004552	GAT	2	6	170843	170848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184804
3519	NC_004552	AAT	2	6	170886	170891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184804
3520	NC_004552	AAG	2	6	170932	170937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184804
3521	NC_004552	TAG	2	6	170954	170959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184804
3522	NC_004552	CTT	2	6	170971	170976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184804
3523	NC_004552	GAT	2	6	170995	171000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184804
3524	NC_004552	ATA	2	6	171008	171013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184804
3525	NC_004552	AAC	2	6	171119	171124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184804
3526	NC_004552	T	8	8	171166	171173	0 %	100 %	0 %	0 %	62184804
3527	NC_004552	GGT	2	6	171199	171204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184804
3528	NC_004552	CAA	2	6	171289	171294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184804
3529	NC_004552	CTT	2	6	171319	171324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184804
3530	NC_004552	GA	3	6	171330	171335	50 %	0 %	50 %	0 %	62184804
3531	NC_004552	TCT	2	6	171431	171436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184805
3532	NC_004552	AGGT	2	8	171484	171491	25 %	25 %	50 %	0 %	62184805
3533	NC_004552	ATC	2	6	171514	171519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184805
3534	NC_004552	TC	3	6	171532	171537	0 %	50 %	0 %	50 %	62184805
3535	NC_004552	GTT	2	6	171642	171647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184805
3536	NC_004552	ATAA	2	8	171730	171737	75 %	25 %	0 %	0 %	62184805
3537	NC_004552	CAT	2	6	171750	171755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184805
3538	NC_004552	ACA	2	6	171881	171886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184805
3539	NC_004552	GGA	2	6	171933	171938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184805
3540	NC_004552	AC	3	6	172044	172049	50 %	0 %	0 %	50 %	62184805
3541	NC_004552	ACA	2	6	172055	172060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184805
3542	NC_004552	AGG	2	6	172067	172072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184806
3543	NC_004552	T	7	7	172127	172133	0 %	100 %	0 %	0 %	62184806
3544	NC_004552	AGA	2	6	172144	172149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184806
3545	NC_004552	ATATC	2	10	172261	172270	40 %	40 %	0 %	20 %	62184806
3546	NC_004552	GA	4	8	172312	172319	50 %	0 %	50 %	0 %	62184806
3547	NC_004552	T	6	6	172461	172466	0 %	100 %	0 %	0 %	62184806
3548	NC_004552	GTAT	2	8	172517	172524	25 %	50 %	25 %	0 %	62184806
3549	NC_004552	A	6	6	172698	172703	100 %	0 %	0 %	0 %	62184806
3550	NC_004552	T	7	7	172814	172820	0 %	100 %	0 %	0 %	62184806
3551	NC_004552	AAG	2	6	172990	172995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184806
3552	NC_004552	TA	3	6	173014	173019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_004552	AG	3	6	173058	173063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_004552	GAGAG	2	10	173091	173100	40 %	0 %	60 %	0 %	62184807
3555	NC_004552	TCG	2	6	173162	173167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184807
3556	NC_004552	GAA	2	6	173169	173174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184807
3557	NC_004552	T	6	6	173209	173214	0 %	100 %	0 %	0 %	62184807
3558	NC_004552	T	7	7	173230	173236	0 %	100 %	0 %	0 %	62184807
3559	NC_004552	CAA	2	6	173268	173273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184807
3560	NC_004552	GCT	2	6	173276	173281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184807
3561	NC_004552	GTTTTT	2	12	173320	173331	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	62184807
3562	NC_004552	T	7	7	173327	173333	0 %	100 %	0 %	0 %	62184807
3563	NC_004552	GGT	2	6	173358	173363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_004552	T	6	6	173393	173398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_004552	CAAAA	2	10	173421	173430	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3566	NC_004552	A	7	7	173427	173433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_004552	CTC	2	6	173443	173448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_004552	GTT	2	6	173457	173462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_004552	AAGA	2	8	173521	173528	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_004552	CGG	2	6	173546	173551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_004552	AGA	2	6	173727	173732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184808
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3573	NC_004552	TGCTGG	2	12	174015	174026	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	62184808
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3576	NC_004552	TGA	3	9	174294	174302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184808
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3583	NC_004552	A	6	6	174556	174561	100 %	0 %	0 %	0 %	62184808
3584	NC_004552	ATG	2	6	174661	174666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184808
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3592	NC_004552	GGT	2	6	175238	175243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184809
3593	NC_004552	CTT	2	6	175302	175307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_004552	CTT	2	6	175326	175331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_004552	TCT	2	6	175388	175393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_004552	ATT	2	6	175462	175467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_004552	GGT	2	6	175494	175499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_004552	GTC	2	6	175503	175508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3600	NC_004552	TGA	2	6	175596	175601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_004552	T	6	6	175612	175617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_004552	AT	3	6	175623	175628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_004552	GAA	2	6	175682	175687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_004552	GAA	2	6	175701	175706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_004552	TTG	2	6	175780	175785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_004552	AG	3	6	175875	175880	50 %	0 %	50 %	0 %	62184810
3607	NC_004552	GGT	2	6	175931	175936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184810
3608	NC_004552	ACGC	2	8	175953	175960	25 %	0 %	25 %	50 %	62184810
3609	NC_004552	GAAA	2	8	176015	176022	75 %	0 %	25 %	0 %	62184810
3610	NC_004552	AGA	2	6	176049	176054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184810
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3613	NC_004552	ATG	4	12	176310	176321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184810
3614	NC_004552	TTGA	2	8	176474	176481	25 %	50 %	25 %	0 %	62184810
3615	NC_004552	AGA	2	6	176490	176495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184810
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3618	NC_004552	ATA	2	6	176520	176525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184810
3619	NC_004552	TGGGGG	2	12	176589	176600	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	62184811
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3621	NC_004552	TGC	2	6	176655	176660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184811
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3623	NC_004552	GTA	2	6	176717	176722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184811
3624	NC_004552	T	7	7	176750	176756	0 %	100 %	0 %	0 %	62184811
3625	NC_004552	GCT	2	6	176791	176796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184811
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3627	NC_004552	TAA	2	6	176934	176939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184811
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3737	NC_004552	AGAT	2	8	182133	182140	50 %	25 %	25 %	0 %	62184813
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3745	NC_004552	GA	3	6	182422	182427	50 %	0 %	50 %	0 %	62184813
3746	NC_004552	AGA	2	6	182434	182439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184813
3747	NC_004552	CTT	2	6	182534	182539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184814
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3749	NC_004552	ATC	2	6	182568	182573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184814
3750	NC_004552	AGTG	2	8	182577	182584	25 %	25 %	50 %	0 %	62184814
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3752	NC_004552	GCTCC	2	10	182748	182757	0 %	20 %	20 %	60 %	62184814
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4000	NC_004552	TTATT	2	10	194066	194075	20 %	80 %	0 %	0 %	62184821

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