MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 23950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004552	GAA	2	6	121400	121405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184760
2502	NC_004552	GTT	2	6	121415	121420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184760
2503	NC_004552	AAG	2	6	121422	121427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184760
2504	NC_004552	AAG	2	6	121470	121475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184760
2505	NC_004552	TCT	2	6	121481	121486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184760
2506	NC_004552	TTC	2	6	121507	121512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184760
2507	NC_004552	TTA	2	6	121613	121618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184760
2508	NC_004552	TAAA	2	8	121639	121646	75 %	25 %	0 %	0 %	62184760
2509	NC_004552	TTA	2	6	121692	121697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184761
2510	NC_004552	AGC	2	6	121737	121742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184761
2511	NC_004552	TGT	2	6	121759	121764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184761
2512	NC_004552	CTG	2	6	121842	121847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184761
2513	NC_004552	AGG	2	6	121927	121932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184761
2514	NC_004552	TTAA	2	8	121943	121950	50 %	50 %	0 %	0 %	62184761
2515	NC_004552	AGC	2	6	121960	121965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184761
2516	NC_004552	GAA	2	6	121982	121987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184761
2517	NC_004552	CTC	2	6	122016	122021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184761
2518	NC_004552	CTC	2	6	122043	122048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184761
2519	NC_004552	AGA	2	6	122100	122105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184761
2520	NC_004552	A	6	6	122105	122110	100 %	0 %	0 %	0 %	62184761
2521	NC_004552	TAA	2	6	122128	122133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184761
2522	NC_004552	AGT	2	6	122146	122151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184761
2523	NC_004552	ATC	2	6	122155	122160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184761
2524	NC_004552	ATT	2	6	122168	122173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184761
2525	NC_004552	GAA	2	6	122186	122191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184761
2526	NC_004552	GAA	2	6	122198	122203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184761
2527	NC_004552	AGA	2	6	122229	122234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184761
2528	NC_004552	TAC	2	6	122244	122249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184761
2529	NC_004552	CTC	2	6	122250	122255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184761
2530	NC_004552	AATT	2	8	122262	122269	50 %	50 %	0 %	0 %	62184761
2531	NC_004552	ATT	2	6	122396	122401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184761
2532	NC_004552	GAA	3	9	122408	122416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184761
2533	NC_004552	CTT	2	6	122454	122459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184761
2534	NC_004552	AGA	2	6	122467	122472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184761
2535	NC_004552	TCT	2	6	122505	122510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_004552	T	6	6	122570	122575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_004552	ATTT	2	8	122620	122627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_004552	TAA	2	6	122631	122636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_004552	ATT	2	6	122652	122657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_004552	TGG	2	6	122665	122670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_004552	AGC	2	6	122737	122742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_004552	T	6	6	122810	122815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_004552	T	6	6	122828	122833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_004552	CT	3	6	122933	122938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2545	NC_004552	TAAT	2	8	122963	122970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_004552	GCG	2	6	122989	122994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184762
2547	NC_004552	TTC	2	6	123055	123060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184762
2548	NC_004552	AT	3	6	123074	123079	50 %	50 %	0 %	0 %	62184762
2549	NC_004552	CAT	2	6	123124	123129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184762
2550	NC_004552	AGC	2	6	123217	123222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184762
2551	NC_004552	ATGC	2	8	123242	123249	25 %	25 %	25 %	25 %	62184762
2552	NC_004552	AG	4	8	123277	123284	50 %	0 %	50 %	0 %	62184762
2553	NC_004552	TGAGA	2	10	123301	123310	40 %	20 %	40 %	0 %	62184762
2554	NC_004552	ACA	2	6	123352	123357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184762
2555	NC_004552	CAA	2	6	123377	123382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184762
2556	NC_004552	TGA	2	6	123406	123411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184762
2557	NC_004552	TGG	2	6	123426	123431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184762
2558	NC_004552	CAA	2	6	123440	123445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184762
2559	NC_004552	GAAG	2	8	123458	123465	50 %	0 %	50 %	0 %	62184762
2560	NC_004552	GCA	2	6	123566	123571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184762
2561	NC_004552	TGTC	2	8	123572	123579	0 %	50 %	25 %	25 %	62184762
2562	NC_004552	AAG	2	6	123582	123587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184762
2563	NC_004552	AAG	2	6	123606	123611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184762
2564	NC_004552	AGA	2	6	123714	123719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184762
2565	NC_004552	TTG	2	6	123744	123749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184762
2566	NC_004552	AGC	2	6	123753	123758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184762
2567	NC_004552	TGT	2	6	123802	123807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184762
2568	NC_004552	GCT	2	6	123829	123834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184762
2569	NC_004552	TA	3	6	123920	123925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_004552	TTG	2	6	124058	124063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161501898
2571	NC_004552	AGC	2	6	124064	124069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161501898
2572	NC_004552	CGATT	2	10	124100	124109	20 %	40 %	20 %	20 %	161501898
2573	NC_004552	AGC	2	6	124142	124147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161501898
2574	NC_004552	TGT	2	6	124194	124199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161501898
2575	NC_004552	GAG	2	6	124259	124264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161501898
2576	NC_004552	GCT	3	9	124276	124284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161501898
2577	NC_004552	AG	3	6	124328	124333	50 %	0 %	50 %	0 %	161501898
2578	NC_004552	TGT	2	6	124335	124340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161501898
2579	NC_004552	TGCATT	2	12	124440	124451	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161501898
2580	NC_004552	GTG	2	6	124519	124524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161501897
2581	NC_004552	CTTA	2	8	124527	124534	25 %	50 %	0 %	25 %	161501897
2582	NC_004552	GGGATT	2	12	124568	124579	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	161501897
2583	NC_004552	GA	3	6	124596	124601	50 %	0 %	50 %	0 %	161501897
2584	NC_004552	GTCAA	2	10	124616	124625	40 %	20 %	20 %	20 %	161501897
2585	NC_004552	GTATAC	2	12	124646	124657	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161501897
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2589	NC_004552	CTT	2	6	124957	124962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161501897
2590	NC_004552	GAA	2	6	124968	124973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161501897
2591	NC_004552	AGC	2	6	124988	124993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161501897
2592	NC_004552	AG	3	6	125018	125023	50 %	0 %	50 %	0 %	161501897
2593	NC_004552	GAGC	2	8	125042	125049	25 %	0 %	50 %	25 %	161501897
2594	NC_004552	TTC	2	6	125077	125082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161501897
2595	NC_004552	A	6	6	125093	125098	100 %	0 %	0 %	0 %	161501897
2596	NC_004552	TCC	2	6	125153	125158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2597	NC_004552	TAC	2	6	125165	125170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_004552	TGT	2	6	125172	125177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_004552	TA	4	8	125188	125195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_004552	ATT	2	6	125257	125262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184765
2601	NC_004552	GCT	2	6	125293	125298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184765
2602	NC_004552	AAT	2	6	125428	125433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184765
2603	NC_004552	CAA	2	6	125465	125470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184765
2604	NC_004552	AAG	2	6	125477	125482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184765
2605	NC_004552	TTC	2	6	125584	125589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184765
2606	NC_004552	CTG	2	6	125612	125617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184765
2607	NC_004552	TG	3	6	125658	125663	0 %	50 %	50 %	0 %	62184766
2608	NC_004552	ACT	2	6	125719	125724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184766
2609	NC_004552	A	6	6	125747	125752	100 %	0 %	0 %	0 %	62184766
2610	NC_004552	CTTT	2	8	125753	125760	0 %	75 %	0 %	25 %	62184766
2611	NC_004552	GTC	2	6	125783	125788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184766
2612	NC_004552	GTT	2	6	125808	125813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184766
2613	NC_004552	ATG	2	6	125820	125825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184766
2614	NC_004552	TTAT	2	8	125861	125868	25 %	75 %	0 %	0 %	62184766
2615	NC_004552	AT	3	6	125918	125923	50 %	50 %	0 %	0 %	62184766
2616	NC_004552	T	7	7	125940	125946	0 %	100 %	0 %	0 %	62184766
2617	NC_004552	TGT	2	6	126084	126089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184766
2618	NC_004552	GCC	2	6	126106	126111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184766
2619	NC_004552	TAT	2	6	126138	126143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184766
2620	NC_004552	TAA	2	6	126225	126230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184766
2621	NC_004552	GAA	2	6	126255	126260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184766
2622	NC_004552	CTT	2	6	126264	126269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184766
2623	NC_004552	T	7	7	126338	126344	0 %	100 %	0 %	0 %	62184767
2624	NC_004552	AGA	2	6	126458	126463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184767
2625	NC_004552	GAC	2	6	126655	126660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184767
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