MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 23950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004552	AAG	2	6	23873	23878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_004552	CTT	2	6	23883	23888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_004552	TTG	2	6	23997	24002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184663
504	NC_004552	TGTC	2	8	24039	24046	0 %	50 %	25 %	25 %	62184663
505	NC_004552	AGT	2	6	24051	24056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184663
506	NC_004552	TTG	2	6	24063	24068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184663
507	NC_004552	TCC	2	6	24102	24107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184663
508	NC_004552	AGCT	2	8	24152	24159	25 %	25 %	25 %	25 %	62184663
509	NC_004552	T	7	7	24203	24209	0 %	100 %	0 %	0 %	62184663
510	NC_004552	GA	3	6	24295	24300	50 %	0 %	50 %	0 %	62184663
511	NC_004552	TTG	2	6	24339	24344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184663
512	NC_004552	GAA	2	6	24349	24354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184663
513	NC_004552	T	6	6	24366	24371	0 %	100 %	0 %	0 %	62184663
514	NC_004552	CTT	2	6	24503	24508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184663
515	NC_004552	AGG	2	6	24524	24529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184663
516	NC_004552	GTA	2	6	24537	24542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184663
517	NC_004552	GCA	2	6	24598	24603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184663
518	NC_004552	TTA	2	6	24607	24612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184663
519	NC_004552	AATT	2	8	24614	24621	50 %	50 %	0 %	0 %	62184663
520	NC_004552	GATA	2	8	24680	24687	50 %	25 %	25 %	0 %	62184663
521	NC_004552	CAG	2	6	24743	24748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184663
522	NC_004552	T	8	8	24783	24790	0 %	100 %	0 %	0 %	62184663
523	NC_004552	GTT	2	6	24815	24820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184663
524	NC_004552	GCT	2	6	24865	24870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184663
525	NC_004552	CTA	2	6	24892	24897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184663
526	NC_004552	TAGT	2	8	24970	24977	25 %	50 %	25 %	0 %	62184663
527	NC_004552	TTG	2	6	24985	24990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184663
528	NC_004552	AACT	2	8	25010	25017	50 %	25 %	0 %	25 %	62184663
529	NC_004552	TTTGT	2	10	25053	25062	0 %	80 %	20 %	0 %	62184663
530	NC_004552	ATT	2	6	25098	25103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184663
531	NC_004552	ATT	2	6	25206	25211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184663
532	NC_004552	AGC	2	6	25361	25366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184663
533	NC_004552	TTG	2	6	25374	25379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184663
534	NC_004552	CAG	2	6	25454	25459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184663
535	NC_004552	GCA	2	6	25495	25500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184663
536	NC_004552	GTT	2	6	25528	25533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184663
537	NC_004552	AG	3	6	25596	25601	50 %	0 %	50 %	0 %	62184663
538	NC_004552	CTT	3	9	25634	25642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184663
539	NC_004552	TGT	2	6	25730	25735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184663
540	NC_004552	TCA	2	6	25781	25786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184663
541	NC_004552	CCA	2	6	25801	25806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184663
542	NC_004552	A	6	6	25851	25856	100 %	0 %	0 %	0 %	62184663
543	NC_004552	TCT	2	6	25903	25908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184663
544	NC_004552	ATT	2	6	26025	26030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184663
545	NC_004552	TTG	2	6	26040	26045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184663
546	NC_004552	AGA	2	6	26109	26114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184663
547	NC_004552	AGG	2	6	26280	26285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184663
548	NC_004552	GTT	2	6	26301	26306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184663
549	NC_004552	AAC	2	6	26314	26319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184663
550	NC_004552	GCTG	2	8	26407	26414	0 %	25 %	50 %	25 %	62184663
551	NC_004552	TAAA	2	8	26459	26466	75 %	25 %	0 %	0 %	62184663
552	NC_004552	TA	3	6	26499	26504	50 %	50 %	0 %	0 %	62184663
553	NC_004552	AGA	2	6	26508	26513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184663
554	NC_004552	ATT	2	6	26521	26526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_004552	T	6	6	26525	26530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_004552	TATTT	2	10	26539	26548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_004552	T	7	7	26564	26570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_004552	T	6	6	26579	26584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_004552	ATTT	2	8	26627	26634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_004552	ATTA	2	8	26638	26645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_004552	TTA	2	6	26669	26674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184664
562	NC_004552	ATC	2	6	26711	26716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184664
563	NC_004552	A	6	6	26744	26749	100 %	0 %	0 %	0 %	62184664
564	NC_004552	TAC	2	6	26757	26762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184664
565	NC_004552	CCA	2	6	26788	26793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184664
566	NC_004552	TTA	2	6	26795	26800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184664
567	NC_004552	TGA	2	6	26881	26886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184664
568	NC_004552	AGA	2	6	26929	26934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184664
569	NC_004552	CTG	2	6	27027	27032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184664
570	NC_004552	GTA	2	6	27036	27041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184664
571	NC_004552	AGA	2	6	27058	27063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184664
572	NC_004552	ACA	2	6	27085	27090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184664
573	NC_004552	TTA	2	6	27104	27109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184664
574	NC_004552	CTGG	2	8	27158	27165	0 %	25 %	50 %	25 %	62184664
575	NC_004552	AGC	2	6	27262	27267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184664
576	NC_004552	CAG	2	6	27435	27440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184664
577	NC_004552	AGA	3	9	27535	27543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184664
578	NC_004552	AC	3	6	27598	27603	50 %	0 %	0 %	50 %	62184664
579	NC_004552	TA	3	6	27723	27728	50 %	50 %	0 %	0 %	62184664
580	NC_004552	CTG	2	6	27741	27746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184664
581	NC_004552	TGT	3	9	27760	27768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184664
582	NC_004552	TCC	2	6	27833	27838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184664
583	NC_004552	AGT	2	6	27890	27895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184664
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585	NC_004552	CAA	2	6	27965	27970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184664
586	NC_004552	ATG	2	6	27981	27986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184664
587	NC_004552	AAC	2	6	28000	28005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184664
588	NC_004552	TA	3	6	28022	28027	50 %	50 %	0 %	0 %	62184664
589	NC_004552	TTG	2	6	28047	28052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184664
590	NC_004552	CTA	2	6	28068	28073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184664
591	NC_004552	ACA	2	6	28076	28081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184664
592	NC_004552	CCT	2	6	28155	28160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184664
593	NC_004552	AAG	2	6	28233	28238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184664
594	NC_004552	CAA	2	6	28259	28264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184664
595	NC_004552	AGAT	2	8	28428	28435	50 %	25 %	25 %	0 %	62184664
596	NC_004552	ATCG	2	8	28559	28566	25 %	25 %	25 %	25 %	62184664
597	NC_004552	T	6	6	28588	28593	0 %	100 %	0 %	0 %	62184664
598	NC_004552	CTG	2	6	28725	28730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184664
599	NC_004552	AAAT	2	8	28780	28787	75 %	25 %	0 %	0 %	62184664
600	NC_004552	A	7	7	28801	28807	100 %	0 %	0 %	0 %	62184664
601	NC_004552	CAT	2	6	28912	28917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184664
602	NC_004552	GTGA	2	8	29003	29010	25 %	25 %	50 %	0 %	62184664
603	NC_004552	GAA	2	6	29048	29053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184664
604	NC_004552	GGCA	2	8	29058	29065	25 %	0 %	50 %	25 %	62184664
605	NC_004552	AGA	2	6	29080	29085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184664
606	NC_004552	G	6	6	29123	29128	0 %	0 %	100 %	0 %	62184664
607	NC_004552	CTA	2	6	29145	29150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184664
608	NC_004552	ATCAG	2	10	29155	29164	40 %	20 %	20 %	20 %	62184664
609	NC_004552	GCA	2	6	29227	29232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184664
610	NC_004552	AAG	2	6	29293	29298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184664
611	NC_004552	GAA	2	6	29379	29384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184665
612	NC_004552	AGGG	2	8	29390	29397	25 %	0 %	75 %	0 %	62184665
613	NC_004552	CAA	2	6	29420	29425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184665
614	NC_004552	TGT	2	6	29490	29495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184665
615	NC_004552	AAG	2	6	29544	29549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184665
616	NC_004552	TAA	2	6	29576	29581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184665
617	NC_004552	GAAT	2	8	29584	29591	50 %	25 %	25 %	0 %	62184666
618	NC_004552	TGC	2	6	29603	29608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184666
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620	NC_004552	GAA	2	6	29650	29655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184666
621	NC_004552	AAT	2	6	29668	29673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184666
622	NC_004552	TAA	2	6	29724	29729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184666
623	NC_004552	AATACC	2	12	29731	29742	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	62184666
624	NC_004552	CGT	2	6	29870	29875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184666
625	NC_004552	AG	3	6	29884	29889	50 %	0 %	50 %	0 %	62184666
626	NC_004552	T	6	6	29899	29904	0 %	100 %	0 %	0 %	62184666
627	NC_004552	ATC	2	6	29929	29934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184666
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630	NC_004552	GTT	2	6	30167	30172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184666
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