MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 23950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004552	A	6	6	290787	290792	100 %	0 %	0 %	0 %	62184904
6002	NC_004552	GAA	2	6	290892	290897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184904
6003	NC_004552	TGA	2	6	291043	291048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184904
6004	NC_004552	AG	3	6	291114	291119	50 %	0 %	50 %	0 %	62184904
6005	NC_004552	AGA	2	6	291179	291184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184904
6006	NC_004552	GAT	2	6	291207	291212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184904
6007	NC_004552	ATC	2	6	291302	291307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_004552	TCCT	2	8	291346	291353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_004552	ATTT	2	8	291380	291387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_004552	T	7	7	291385	291391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_004552	AAT	2	6	291392	291397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_004552	AAT	4	12	291417	291428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_004552	T	6	6	291432	291437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_004552	CA	3	6	291454	291459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_004552	GGA	2	6	291491	291496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184905
6016	NC_004552	CTC	2	6	291510	291515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184905
6017	NC_004552	GAT	2	6	291527	291532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184905
6018	NC_004552	GAA	2	6	291665	291670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184905
6019	NC_004552	ATC	2	6	291682	291687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184905
6020	NC_004552	TTC	2	6	291719	291724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184905
6021	NC_004552	GAAA	2	8	291759	291766	75 %	0 %	25 %	0 %	62184905
6022	NC_004552	A	6	6	291818	291823	100 %	0 %	0 %	0 %	62184905
6023	NC_004552	ACGC	2	8	291856	291863	25 %	0 %	25 %	50 %	62184905
6024	NC_004552	AAG	2	6	291876	291881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184905
6025	NC_004552	GATT	2	8	291892	291899	25 %	50 %	25 %	0 %	62184905
6026	NC_004552	TGCAGA	2	12	291916	291927	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	62184905
6027	NC_004552	TTC	2	6	291964	291969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184905
6028	NC_004552	TGG	2	6	292031	292036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184905
6029	NC_004552	AAG	2	6	292056	292061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184905
6030	NC_004552	GAT	2	6	292129	292134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184905
6031	NC_004552	AGCG	2	8	292154	292161	25 %	0 %	50 %	25 %	62184905
6032	NC_004552	TACG	2	8	292186	292193	25 %	25 %	25 %	25 %	62184905
6033	NC_004552	TGT	2	6	292212	292217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184905
6034	NC_004552	TGA	2	6	292270	292275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184905
6035	NC_004552	ATG	2	6	292373	292378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184905
6036	NC_004552	AAG	2	6	292443	292448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184905
6037	NC_004552	CTC	2	6	292538	292543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184905
6038	NC_004552	AAG	2	6	292606	292611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184905
6039	NC_004552	ATG	2	6	292686	292691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184905
6040	NC_004552	GAG	2	6	292760	292765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184905
6041	NC_004552	GTA	2	6	292787	292792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184905
6042	NC_004552	GGGA	2	8	292842	292849	25 %	0 %	75 %	0 %	62184905
6043	NC_004552	GAT	2	6	292859	292864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184905
6044	NC_004552	GAC	2	6	292886	292891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184905
6045	NC_004552	GTG	2	6	292892	292897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184905
6046	NC_004552	GAG	2	6	292901	292906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184905
6047	NC_004552	TTC	2	6	292923	292928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184905
6048	NC_004552	GTG	2	6	293006	293011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184905
6049	NC_004552	CAA	2	6	293030	293035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184905
6050	NC_004552	TA	3	6	293083	293088	50 %	50 %	0 %	0 %	62184905
6051	NC_004552	ATG	2	6	293118	293123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184905
6052	NC_004552	TGAA	2	8	293145	293152	50 %	25 %	25 %	0 %	62184905
6053	NC_004552	GAT	2	6	293156	293161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184905
6054	NC_004552	GGC	2	6	293195	293200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184905
6055	NC_004552	CAG	2	6	293250	293255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184905
6056	NC_004552	GAA	2	6	293339	293344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184905
6057	NC_004552	CCT	2	6	293390	293395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184905
6058	NC_004552	ACC	3	9	293404	293412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184905
6059	NC_004552	AAT	2	6	293426	293431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184905
6060	NC_004552	GTT	2	6	293521	293526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_004552	TTTCTA	2	12	293539	293550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	62184906
6062	NC_004552	AGA	2	6	293593	293598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184906
6063	NC_004552	AGT	2	6	293729	293734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184906
6064	NC_004552	CGA	2	6	293907	293912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184906
6065	NC_004552	GTC	2	6	294052	294057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184906
6066	NC_004552	CCAA	2	8	294132	294139	50 %	0 %	0 %	50 %	62184906
6067	NC_004552	AG	3	6	294178	294183	50 %	0 %	50 %	0 %	62184906
6068	NC_004552	T	6	6	294188	294193	0 %	100 %	0 %	0 %	62184906
6069	NC_004552	TTG	2	6	294220	294225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184906
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6075	NC_004552	GAA	2	6	294392	294397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184906
6076	NC_004552	CGTA	2	8	294403	294410	25 %	25 %	25 %	25 %	62184906
6077	NC_004552	AGT	2	6	294421	294426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184906
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6079	NC_004552	AT	3	6	294467	294472	50 %	50 %	0 %	0 %	62184906
6080	NC_004552	ATTTGT	2	12	294526	294537	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	62184906
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6082	NC_004552	TGT	2	6	294614	294619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184906
6083	NC_004552	AGAGG	2	10	294687	294696	40 %	0 %	60 %	0 %	62184906
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6089	NC_004552	ATG	2	6	295019	295024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184906
6090	NC_004552	GTA	2	6	295043	295048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184906
6091	NC_004552	GGT	2	6	295189	295194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184906
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6094	NC_004552	TTG	2	6	295258	295263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184906
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6099	NC_004552	TGA	2	6	295482	295487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184906
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6102	NC_004552	AT	3	6	295564	295569	50 %	50 %	0 %	0 %	62184906
6103	NC_004552	TGT	3	9	295593	295601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184906
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6107	NC_004552	A	7	7	295879	295885	100 %	0 %	0 %	0 %	62184906
6108	NC_004552	ATT	2	6	295891	295896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184906
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6111	NC_004552	CATT	2	8	295962	295969	25 %	50 %	0 %	25 %	62184906
6112	NC_004552	GCAAA	2	10	295985	295994	60 %	0 %	20 %	20 %	62184906
6113	NC_004552	TTA	2	6	296093	296098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184906
6114	NC_004552	TGA	2	6	296113	296118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184906
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6119	NC_004552	ACAAG	2	10	296455	296464	60 %	0 %	20 %	20 %	62184906
6120	NC_004552	AG	4	8	296463	296470	50 %	0 %	50 %	0 %	62184906
6121	NC_004552	AAG	2	6	296473	296478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184906
6122	NC_004552	AG	3	6	296490	296495	50 %	0 %	50 %	0 %	62184906
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6124	NC_004552	GTT	2	6	296644	296649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184907
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6365	NC_004552	GA	3	6	309695	309700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6373	NC_004552	ATT	2	6	309996	310001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6374	NC_004552	CAG	2	6	310043	310048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6375	NC_004552	CTG	2	6	310052	310057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6376	NC_004552	CATAG	2	10	310077	310086	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6377	NC_004552	A	6	6	310091	310096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6378	NC_004552	T	7	7	310152	310158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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