MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 23950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004552	CTC	2	6	242764	242769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184864
5002	NC_004552	ATCG	2	8	242931	242938	25 %	25 %	25 %	25 %	62184864
5003	NC_004552	CAG	2	6	242953	242958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184864
5004	NC_004552	TTA	2	6	242979	242984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184864
5005	NC_004552	CTT	2	6	243137	243142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184865
5006	NC_004552	ATT	2	6	243163	243168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184865
5007	NC_004552	TG	3	6	243197	243202	0 %	50 %	50 %	0 %	62184865
5008	NC_004552	TC	3	6	243233	243238	0 %	50 %	0 %	50 %	62184865
5009	NC_004552	A	6	6	243247	243252	100 %	0 %	0 %	0 %	62184865
5010	NC_004552	TA	3	6	243282	243287	50 %	50 %	0 %	0 %	62184865
5011	NC_004552	CCT	2	6	243360	243365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184865
5012	NC_004552	CA	4	8	243368	243375	50 %	0 %	0 %	50 %	62184865
5013	NC_004552	AAG	2	6	243392	243397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184865
5014	NC_004552	TTG	2	6	243428	243433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184865
5015	NC_004552	AG	3	6	243589	243594	50 %	0 %	50 %	0 %	62184865
5016	NC_004552	GCG	2	6	243625	243630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184865
5017	NC_004552	TGA	2	6	243698	243703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184865
5018	NC_004552	T	6	6	243780	243785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_004552	TTGAAT	2	12	243787	243798	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_004552	AGGA	2	8	243823	243830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_004552	T	6	6	243844	243849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_004552	TTA	2	6	243933	243938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184866
5023	NC_004552	GA	4	8	243981	243988	50 %	0 %	50 %	0 %	62184866
5024	NC_004552	TTTA	2	8	243991	243998	25 %	75 %	0 %	0 %	62184866
5025	NC_004552	AAG	2	6	244045	244050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184866
5026	NC_004552	GAA	2	6	244068	244073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184866
5027	NC_004552	TCA	2	6	244150	244155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184866
5028	NC_004552	A	6	6	244159	244164	100 %	0 %	0 %	0 %	62184866
5029	NC_004552	GCA	2	6	244274	244279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184866
5030	NC_004552	TAT	2	6	244307	244312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184866
5031	NC_004552	TAA	3	9	244325	244333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184866
5032	NC_004552	TCC	2	6	244514	244519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184866
5033	NC_004552	CGG	2	6	244582	244587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184866
5034	NC_004552	TTTCCT	2	12	244598	244609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184866
5035	NC_004552	GAA	3	9	244662	244670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184866
5036	NC_004552	GA	3	6	244734	244739	50 %	0 %	50 %	0 %	62184866
5037	NC_004552	CTT	2	6	244799	244804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184866
5038	NC_004552	GAC	3	9	244812	244820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184866
5039	NC_004552	TGA	3	9	244826	244834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184866
5040	NC_004552	AGT	2	6	244851	244856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184866
5041	NC_004552	T	6	6	244948	244953	0 %	100 %	0 %	0 %	62184867
5042	NC_004552	GTT	2	6	244983	244988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184867
5043	NC_004552	TAGG	2	8	245029	245036	25 %	25 %	50 %	0 %	62184867
5044	NC_004552	GAT	2	6	245121	245126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184867
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5046	NC_004552	GATG	2	8	245184	245191	25 %	25 %	50 %	0 %	62184867
5047	NC_004552	TTC	2	6	245260	245265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184867
5048	NC_004552	TAAAAG	2	12	245298	245309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	62184867
5049	NC_004552	GTT	2	6	245325	245330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184867
5050	NC_004552	GATC	2	8	245433	245440	25 %	25 %	25 %	25 %	62184867
5051	NC_004552	GAT	2	6	245442	245447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184867
5052	NC_004552	ATG	2	6	245488	245493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184867
5053	NC_004552	AGATA	2	10	245503	245512	60 %	20 %	20 %	0 %	62184867
5054	NC_004552	TTATC	2	10	245517	245526	20 %	60 %	0 %	20 %	62184867
5055	NC_004552	TCT	3	9	245622	245630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184868
5056	NC_004552	TAG	2	6	245655	245660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184868
5057	NC_004552	GCT	2	6	245712	245717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184868
5058	NC_004552	AG	3	6	245742	245747	50 %	0 %	50 %	0 %	62184868
5059	NC_004552	CTT	2	6	245758	245763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184868
5060	NC_004552	GAT	2	6	245785	245790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184868
5061	NC_004552	AGAA	2	8	245792	245799	75 %	0 %	25 %	0 %	62184868
5062	NC_004552	GAT	2	6	245881	245886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184868
5063	NC_004552	CAT	2	6	245944	245949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184868
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5065	NC_004552	CTTT	2	8	246033	246040	0 %	75 %	0 %	25 %	62184868
5066	NC_004552	GTG	2	6	246232	246237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184868
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5078	NC_004552	GGAAT	2	10	246881	246890	40 %	20 %	40 %	0 %	62184869
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5081	NC_004552	GTA	2	6	247033	247038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184869
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5083	NC_004552	T	6	6	247110	247115	0 %	100 %	0 %	0 %	62184869
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5086	NC_004552	GTA	2	6	247234	247239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184869
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5089	NC_004552	TCT	2	6	247337	247342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184869
5090	NC_004552	GTTT	2	8	247464	247471	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_004552	T	6	6	247481	247486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_004552	AAT	2	6	247575	247580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_004552	CAA	2	6	247590	247595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_004552	A	7	7	247604	247610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_004552	TCA	2	6	247612	247617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_004552	AAG	2	6	247619	247624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_004552	ATC	2	6	247783	247788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184870
5098	NC_004552	TAC	2	6	247806	247811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184870
5099	NC_004552	GAA	2	6	247819	247824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184870
5100	NC_004552	TGA	2	6	247830	247835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184870
5101	NC_004552	TTGAG	2	10	247865	247874	20 %	40 %	40 %	0 %	62184870
5102	NC_004552	GTT	2	6	247931	247936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184870
5103	NC_004552	GA	3	6	248035	248040	50 %	0 %	50 %	0 %	62184870
5104	NC_004552	TATT	2	8	248051	248058	25 %	75 %	0 %	0 %	62184870
5105	NC_004552	GAA	2	6	248107	248112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184870
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5108	NC_004552	TTCT	2	8	248253	248260	0 %	75 %	0 %	25 %	62184870
5109	NC_004552	AAC	2	6	248262	248267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184870
5110	NC_004552	CAA	2	6	248286	248291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184870
5111	NC_004552	GTT	2	6	248314	248319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184870
5112	NC_004552	AAT	2	6	248365	248370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184870
5113	NC_004552	AGA	2	6	248407	248412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184870
5114	NC_004552	CTT	2	6	248478	248483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184870
5115	NC_004552	GAAAC	2	10	248519	248528	60 %	0 %	20 %	20 %	62184870
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5117	NC_004552	TCCT	2	8	248590	248597	0 %	50 %	0 %	50 %	62184870
5118	NC_004552	TTC	2	6	248674	248679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184870
5119	NC_004552	T	6	6	248789	248794	0 %	100 %	0 %	0 %	62184870
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5121	NC_004552	AG	3	6	248905	248910	50 %	0 %	50 %	0 %	62184870
5122	NC_004552	GTTT	2	8	248988	248995	0 %	75 %	25 %	0 %	62184870
5123	NC_004552	T	6	6	248993	248998	0 %	100 %	0 %	0 %	62184870
5124	NC_004552	AGG	2	6	249006	249011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184870
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5126	NC_004552	CAG	2	6	249285	249290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184870
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5128	NC_004552	GTT	2	6	249336	249341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184870
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5130	NC_004552	TAACA	2	10	249489	249498	60 %	20 %	0 %	20 %	62184870
5131	NC_004552	TACA	2	8	249516	249523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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