MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 23950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004552	CAT	2	6	218140	218145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184844
4502	NC_004552	TGT	2	6	218167	218172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4503	NC_004552	AGT	2	6	218236	218241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184844
4504	NC_004552	GCG	2	6	218264	218269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184844
4505	NC_004552	TAAG	2	8	218444	218451	50 %	25 %	25 %	0 %	62184844
4506	NC_004552	TGGAT	2	10	218528	218537	20 %	40 %	40 %	0 %	62184844
4507	NC_004552	GAA	2	6	218551	218556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184844
4508	NC_004552	GTT	2	6	218558	218563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4509	NC_004552	CTG	3	9	218587	218595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184844
4510	NC_004552	AGG	2	6	218627	218632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184844
4511	NC_004552	TCT	2	6	218646	218651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184844
4512	NC_004552	GTT	2	6	218681	218686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4513	NC_004552	TGA	2	6	218711	218716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184844
4514	NC_004552	TCC	2	6	218717	218722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184844
4515	NC_004552	AAT	2	6	218895	218900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184844
4516	NC_004552	GGA	2	6	218919	218924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184844
4517	NC_004552	TTA	2	6	218943	218948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184844
4518	NC_004552	AGA	2	6	218975	218980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184844
4519	NC_004552	CAT	2	6	219004	219009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184844
4520	NC_004552	GATT	2	8	219021	219028	25 %	50 %	25 %	0 %	62184844
4521	NC_004552	GCA	2	6	219030	219035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184844
4522	NC_004552	TGGAT	2	10	219080	219089	20 %	40 %	40 %	0 %	62184844
4523	NC_004552	T	6	6	219089	219094	0 %	100 %	0 %	0 %	62184844
4524	NC_004552	TTCC	2	8	219175	219182	0 %	50 %	0 %	50 %	62184844
4525	NC_004552	GTT	2	6	219203	219208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4526	NC_004552	GTT	2	6	219220	219225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4527	NC_004552	GCT	2	6	219279	219284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184844
4528	NC_004552	T	6	6	219297	219302	0 %	100 %	0 %	0 %	62184844
4529	NC_004552	CGT	2	6	219322	219327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184844
4530	NC_004552	GTT	2	6	219552	219557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4531	NC_004552	CCA	2	6	219570	219575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4532	NC_004552	AGG	2	6	219605	219610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184844
4533	NC_004552	CTG	2	6	219616	219621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184844
4534	NC_004552	TGT	2	6	219719	219724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4535	NC_004552	TGT	2	6	219737	219742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4536	NC_004552	AGA	2	6	219845	219850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184844
4537	NC_004552	TGT	3	9	219862	219870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4538	NC_004552	CAG	2	6	219931	219936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184844
4539	NC_004552	CAC	2	6	219943	219948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4540	NC_004552	TGA	2	6	219983	219988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184844
4541	NC_004552	GTA	2	6	219990	219995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184844
4542	NC_004552	ATAG	2	8	220070	220077	50 %	25 %	25 %	0 %	62184844
4543	NC_004552	TAT	2	6	220099	220104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184844
4544	NC_004552	GGT	2	6	220201	220206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184844
4545	NC_004552	GA	3	6	220213	220218	50 %	0 %	50 %	0 %	62184844
4546	NC_004552	T	6	6	220226	220231	0 %	100 %	0 %	0 %	62184844
4547	NC_004552	CAC	2	6	220246	220251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4548	NC_004552	GTT	2	6	220262	220267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4549	NC_004552	T	6	6	220266	220271	0 %	100 %	0 %	0 %	62184844
4550	NC_004552	CTT	2	6	220315	220320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184844
4551	NC_004552	TGC	2	6	220328	220333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184844
4552	NC_004552	CTG	3	9	220339	220347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184844
4553	NC_004552	GC	3	6	220348	220353	0 %	0 %	50 %	50 %	62184844
4554	NC_004552	GTA	2	6	220356	220361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184844
4555	NC_004552	AC	3	6	220441	220446	50 %	0 %	0 %	50 %	62184844
4556	NC_004552	CCA	2	6	220449	220454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4557	NC_004552	TTC	2	6	220457	220462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184844
4558	NC_004552	TTG	2	6	220467	220472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4559	NC_004552	AGA	2	6	220520	220525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184844
4560	NC_004552	AT	3	6	220569	220574	50 %	50 %	0 %	0 %	62184844
4561	NC_004552	CCA	3	9	220578	220586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4562	NC_004552	TTG	2	6	220602	220607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4563	NC_004552	TAAGG	2	10	220634	220643	40 %	20 %	40 %	0 %	62184844
4564	NC_004552	CCA	2	6	220671	220676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4565	NC_004552	TTC	2	6	220679	220684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184844
4566	NC_004552	TTG	2	6	220689	220694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4567	NC_004552	T	7	7	220766	220772	0 %	100 %	0 %	0 %	62184844
4568	NC_004552	GTA	2	6	220782	220787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184844
4569	NC_004552	CAC	3	9	220837	220845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4570	NC_004552	GA	3	6	220894	220899	50 %	0 %	50 %	0 %	62184844
4571	NC_004552	ACC	2	6	220925	220930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4572	NC_004552	AGG	2	6	220943	220948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184844
4573	NC_004552	TTC	2	6	220973	220978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184844
4574	NC_004552	CTT	2	6	221011	221016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184844
4575	NC_004552	GA	3	6	221077	221082	50 %	0 %	50 %	0 %	62184844
4576	NC_004552	ATAG	2	8	221111	221118	50 %	25 %	25 %	0 %	62184844
4577	NC_004552	CCA	2	6	221121	221126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4578	NC_004552	TG	3	6	221154	221159	0 %	50 %	50 %	0 %	62184844
4579	NC_004552	TTGTA	2	10	221174	221183	20 %	60 %	20 %	0 %	62184844
4580	NC_004552	AATGGT	2	12	221348	221359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184844
4581	NC_004552	AGG	2	6	221399	221404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184844
4582	NC_004552	ATG	2	6	221470	221475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184844
4583	NC_004552	T	6	6	221480	221485	0 %	100 %	0 %	0 %	62184844
4584	NC_004552	AAT	2	6	221516	221521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62184844
4585	NC_004552	CT	3	6	221655	221660	0 %	50 %	0 %	50 %	62184844
4586	NC_004552	GA	3	6	221683	221688	50 %	0 %	50 %	0 %	62184844
4587	NC_004552	AGG	2	6	221723	221728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184844
4588	NC_004552	ACC	2	6	221735	221740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4589	NC_004552	CTCCAG	2	12	221743	221754	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	62184844
4590	NC_004552	TAAA	2	8	221863	221870	75 %	25 %	0 %	0 %	62184844
4591	NC_004552	CAC	2	6	221872	221877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184844
4592	NC_004552	TTG	2	6	221882	221887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4593	NC_004552	ATC	2	6	221894	221899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184844
4594	NC_004552	TA	3	6	221949	221954	50 %	50 %	0 %	0 %	62184844
4595	NC_004552	CCT	3	9	222060	222068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62184844
4596	NC_004552	AGTAGA	2	12	222080	222091	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4597	NC_004552	TGT	2	6	222098	222103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4598	NC_004552	GAAGAT	2	12	222123	222134	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4599	NC_004552	ATG	2	6	222223	222228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184844
4600	NC_004552	ATC	2	6	222239	222244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184844
4601	NC_004552	GGCTT	2	10	222304	222313	0 %	40 %	40 %	20 %	62184844
4602	NC_004552	TGT	2	6	222458	222463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62184844
4603	NC_004552	TGC	2	6	222483	222488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184844
4604	NC_004552	GCA	2	6	222597	222602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62184844
4605	NC_004552	ATA	2	6	222707	222712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_004552	A	6	6	222712	222717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_004552	AAGA	2	8	222724	222731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_004552	ATGC	2	8	222786	222793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4609	NC_004552	ACC	2	6	222851	222856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184845
4610	NC_004552	TGG	2	6	222895	222900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184845
4611	NC_004552	GGT	2	6	222938	222943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62184845
4612	NC_004552	CTT	2	6	222964	222969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184845
4613	NC_004552	TCT	2	6	223038	223043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184845
4614	NC_004552	GAA	2	6	223103	223108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184845
4615	NC_004552	AG	3	6	223119	223124	50 %	0 %	50 %	0 %	62184845
4616	NC_004552	GAA	2	6	223158	223163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184845
4617	NC_004552	TCA	2	6	223357	223362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184845
4618	NC_004552	TTC	2	6	223370	223375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184845
4619	NC_004552	GCC	2	6	223425	223430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62184845
4620	NC_004552	ACC	2	6	223518	223523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184845
4621	NC_004552	ACA	2	6	223623	223628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184845
4622	NC_004552	CCA	2	6	223629	223634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62184845
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4753	NC_004552	TCGG	2	8	230194	230201	0 %	25 %	50 %	25 %	62184852
4754	NC_004552	ATT	2	6	230217	230222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62184852
4755	NC_004552	AAC	2	6	230226	230231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184852
4756	NC_004552	AAAC	2	8	230327	230334	75 %	0 %	0 %	25 %	62184852
4757	NC_004552	AT	3	6	230337	230342	50 %	50 %	0 %	0 %	62184853
4758	NC_004552	ACA	2	6	230440	230445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62184853
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4761	NC_004552	TGC	2	6	230706	230711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184853
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4765	NC_004552	ATC	2	6	230878	230883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62184853
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4774	NC_004552	GA	3	6	231253	231258	50 %	0 %	50 %	0 %	62184854
4775	NC_004552	T	6	6	231298	231303	0 %	100 %	0 %	0 %	62184854
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4784	NC_004552	GAA	2	6	231966	231971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4785	NC_004552	ATTAA	2	10	232024	232033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4786	NC_004552	A	6	6	232032	232037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4787	NC_004552	TA	4	8	232051	232058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4788	NC_004552	T	7	7	232062	232068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4789	NC_004552	T	6	6	232099	232104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4790	NC_004552	TGG	2	6	232115	232120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4791	NC_004552	GCG	2	6	232130	232135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4793	NC_004552	T	6	6	232230	232235	0 %	100 %	0 %	0 %	62184855
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4806	NC_004552	AGG	2	6	232806	232811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62184855
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4811	NC_004552	A	6	6	233084	233089	100 %	0 %	0 %	0 %	62184855
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4831	NC_004552	GGC	2	6	234217	234222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62184856
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4852	NC_004552	TGA	2	6	235603	235608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184857
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4860	NC_004552	T	6	6	236061	236066	0 %	100 %	0 %	0 %	62184858
4861	NC_004552	TATT	2	8	236127	236134	25 %	75 %	0 %	0 %	62184858
4862	NC_004552	CGT	2	6	236185	236190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62184858
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4867	NC_004552	GAA	2	6	236326	236331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62184858
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4869	NC_004552	TG	4	8	236471	236478	0 %	50 %	50 %	0 %	62184858
4870	NC_004552	TC	4	8	236563	236570	0 %	50 %	0 %	50 %	62184858
4871	NC_004552	CTT	2	6	236630	236635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62184858
4872	NC_004552	ATG	2	6	236645	236650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62184858
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4874	NC_004552	A	6	6	236757	236762	100 %	0 %	0 %	0 %	62184858
4875	NC_004552	AG	3	6	236776	236781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4876	NC_004552	AT	3	6	236846	236851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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