MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Corynebacterium efficiens YS-314 plasmid pCE2

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004319	CTGG	2	8	300	307	0 %	25 %	50 %	25 %	23577971
2	NC_004319	GATG	2	8	565	572	25 %	25 %	50 %	0 %	23577971
3	NC_004319	CTGG	2	8	1425	1432	0 %	25 %	50 %	25 %	23577971
4	NC_004319	CCCT	2	8	1445	1452	0 %	25 %	0 %	75 %	23577971
5	NC_004319	TCCC	2	8	1794	1801	0 %	25 %	0 %	75 %	23577971
6	NC_004319	TATG	2	8	2024	2031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004319	CTCG	2	8	2357	2364	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_004319	CCCG	2	8	2445	2452	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_004319	CACC	2	8	2532	2539	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_004319	GAAA	2	8	2557	2564	75 %	0 %	25 %	0 %	23577972
11	NC_004319	GGAT	2	8	2625	2632	25 %	25 %	50 %	0 %	23577972
12	NC_004319	TCAC	2	8	3173	3180	25 %	25 %	0 %	50 %	23577972
13	NC_004319	TGGA	2	8	3232	3239	25 %	25 %	50 %	0 %	23577972
14	NC_004319	TTCT	2	8	3511	3518	0 %	75 %	0 %	25 %	23577972
15	NC_004319	CTGG	2	8	4587	4594	0 %	25 %	50 %	25 %	23577972
16	NC_004319	GTGC	2	8	5526	5533	0 %	25 %	50 %	25 %	23577972
17	NC_004319	GAAG	2	8	6019	6026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004319	TTTA	2	8	6045	6052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004319	CTAG	2	8	6385	6392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_004319	AGCT	2	8	7051	7058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_004319	TACT	2	8	7141	7148	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_004319	TGAT	2	8	7357	7364	25 %	50 %	25 %	0 %	23577973
23	NC_004319	GCCG	2	8	7473	7480	0 %	0 %	50 %	50 %	23577973
24	NC_004319	ACGG	2	8	7485	7492	25 %	0 %	50 %	25 %	23577973
25	NC_004319	GTGG	2	8	8810	8817	0 %	25 %	75 %	0 %	23577975
26	NC_004319	TGAT	2	8	8857	8864	25 %	50 %	25 %	0 %	23577975
27	NC_004319	GTGC	2	8	9072	9079	0 %	25 %	50 %	25 %	23577975
28	NC_004319	CATT	2	8	9733	9740	25 %	50 %	0 %	25 %	23577975
29	NC_004319	ATGA	2	8	9774	9781	50 %	25 %	25 %	0 %	23577975
30	NC_004319	CGCA	2	8	11167	11174	25 %	0 %	25 %	50 %	23577976
31	NC_004319	ATTT	2	8	11922	11929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004319	ATCT	2	8	12401	12408	25 %	50 %	0 %	25 %	23577977
33	NC_004319	CATA	2	8	12470	12477	50 %	25 %	0 %	25 %	23577977
34	NC_004319	GTGG	2	8	12647	12654	0 %	25 %	75 %	0 %	23577977
35	NC_004319	ATGA	2	8	13753	13760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004319	CTGC	2	8	13769	13776	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_004319	ACTG	2	8	13844	13851	25 %	25 %	25 %	25 %	23577979
38	NC_004319	GTGG	2	8	14611	14618	0 %	25 %	75 %	0 %	23577979
39	NC_004319	CAGC	2	8	14753	14760	25 %	0 %	25 %	50 %	23577979
40	NC_004319	TCCT	2	8	15264	15271	0 %	50 %	0 %	50 %	23577980
41	NC_004319	CATC	2	8	17085	17092	25 %	25 %	0 %	50 %	23577981
42	NC_004319	GCCA	2	8	17392	17399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_004319	TATC	2	8	17487	17494	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_004319	AAGC	2	8	18153	18160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_004319	TGAT	2	8	18664	18671	25 %	50 %	25 %	0 %	23577982
46	NC_004319	TGGG	2	8	19474	19481	0 %	25 %	75 %	0 %	23577983
47	NC_004319	TTGA	2	8	19519	19526	25 %	50 %	25 %	0 %	23577983
48	NC_004319	GTGC	2	8	19735	19742	0 %	25 %	50 %	25 %	23577983
49	NC_004319	GACG	2	8	20025	20032	25 %	0 %	50 %	25 %	23577983
50	NC_004319	GCTA	2	8	20994	21001	25 %	25 %	25 %	25 %	23577984
51	NC_004319	GATC	2	8	22017	22024	25 %	25 %	25 %	25 %	23577984
52	NC_004319	TCCG	2	8	22247	22254	0 %	25 %	25 %	50 %	23577984
53	NC_004319	GGAC	2	8	22487	22494	25 %	0 %	50 %	25 %	23577984
54	NC_004319	CCGG	2	8	22847	22854	0 %	0 %	50 %	50 %	23577985
55	NC_004319	CTGG	2	8	22868	22875	0 %	25 %	50 %	25 %	23577985
56	NC_004319	GCCA	2	8	22928	22935	25 %	0 %	25 %	50 %	23577985
57	NC_004319	TGGC	2	8	23734	23741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.