MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 75539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003910	ATA	2	6	24	29	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003910	ATA	2	6	42	47	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003910	TAC	2	6	55	60	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_003910	AAG	2	6	112	117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71278268
5	NC_003910	CTT	2	6	255	260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71278268
6	NC_003910	ATT	2	6	284	289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278268
7	NC_003910	GTA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278268
8	NC_003910	ATT	2	6	377	382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278268
9	NC_003910	GCT	3	9	507	515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278268
10	NC_003910	ATT	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278268
11	NC_003910	TGG	2	6	566	571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71278268
12	NC_003910	TTA	2	6	594	599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278268
13	NC_003910	CAA	2	6	626	631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278268
14	NC_003910	AAT	2	6	699	704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278268
15	NC_003910	ACT	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278268
16	NC_003910	GAT	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278268
17	NC_003910	AAG	2	6	793	798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71278268
18	NC_003910	GAT	2	6	888	893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278268
19	NC_003910	TGA	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278268
20	NC_003910	ATA	2	6	1183	1188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278268
21	NC_003910	TGG	2	6	1340	1345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71278268
22	NC_003910	ACA	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278268
23	NC_003910	AGA	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71278268
24	NC_003910	TAA	2	6	1455	1460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278268
25	NC_003910	ATT	2	6	1519	1524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279230
26	NC_003910	ATT	3	9	1534	1542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279230
27	NC_003910	ATT	2	6	1717	1722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279230
28	NC_003910	GTA	2	6	1803	1808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71279230
29	NC_003910	CTG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71279230
30	NC_003910	GAA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71279230
31	NC_003910	TTA	2	6	1951	1956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279230
32	NC_003910	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71279230
33	NC_003910	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71279230
34	NC_003910	ATT	2	6	2171	2176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279230
35	NC_003910	AGA	2	6	2231	2236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71279230
36	NC_003910	GAA	2	6	2408	2413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71279230
37	NC_003910	AGT	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71279230
38	NC_003910	TGT	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71279230
39	NC_003910	TAT	2	6	2605	2610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003910	TAC	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71280559
41	NC_003910	ATC	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71280559
42	NC_003910	AAT	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71280559
43	NC_003910	AGT	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71280559
44	NC_003910	TGT	2	6	2838	2843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71280559
45	NC_003910	GGA	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71280559
46	NC_003910	ATT	2	6	3152	3157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71280559
47	NC_003910	ACA	2	6	3450	3455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71280559
48	NC_003910	GTT	2	6	3459	3464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71280559
49	NC_003910	TGA	2	6	3537	3542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71280559
50	NC_003910	TTA	2	6	3614	3619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71280559
51	NC_003910	AGA	2	6	3630	3635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71280559
52	NC_003910	TGA	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71280559
53	NC_003910	TGG	2	6	3726	3731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71280559
54	NC_003910	AAT	2	6	3745	3750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71280559
55	NC_003910	GAT	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
56	NC_003910	CAT	2	6	3892	3897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281227
57	NC_003910	GAT	2	6	4000	4005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
58	NC_003910	CTG	3	9	4049	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281227
59	NC_003910	TTA	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281227
60	NC_003910	GGT	2	6	4084	4089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281227
61	NC_003910	TGG	2	6	4095	4100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281227
62	NC_003910	AGT	2	6	4152	4157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
63	NC_003910	CGC	2	6	4192	4197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71281227
64	NC_003910	TGA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
65	NC_003910	GAA	2	6	4414	4419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281227
66	NC_003910	AGA	2	6	4425	4430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281227
67	NC_003910	TGG	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281227
68	NC_003910	ATT	2	6	4469	4474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281227
69	NC_003910	GAA	2	6	4501	4506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281227
70	NC_003910	ATG	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
71	NC_003910	TAA	2	6	4602	4607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281227
72	NC_003910	TGG	2	6	4623	4628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281227
73	NC_003910	AAG	2	6	4688	4693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281227
74	NC_003910	GAA	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281227
75	NC_003910	TGA	2	6	4743	4748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
76	NC_003910	CTG	2	6	4766	4771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281227
77	NC_003910	ATC	2	6	4918	4923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281227
78	NC_003910	TTG	2	6	4931	4936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281227
79	NC_003910	TGC	2	6	4938	4943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281227
80	NC_003910	GCT	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281227
81	NC_003910	CTG	2	6	5087	5092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281227
82	NC_003910	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
83	NC_003910	TCT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71281227
84	NC_003910	TGA	2	6	5247	5252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
85	NC_003910	CAT	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281227
86	NC_003910	TTA	2	6	5332	5337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281227
87	NC_003910	TCT	2	6	5345	5350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71281227
88	NC_003910	CCA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71281227
89	NC_003910	GAT	3	9	5449	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
90	NC_003910	AAC	2	6	5475	5480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281227
91	NC_003910	TGC	2	6	5538	5543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281227
92	NC_003910	TGA	2	6	5658	5663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
93	NC_003910	TGA	2	6	5670	5675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281227
94	NC_003910	GAA	2	6	5911	5916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281227
95	NC_003910	GTG	2	6	5933	5938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281227
96	NC_003910	CAG	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281227
97	NC_003910	AGC	2	6	6050	6055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281227
98	NC_003910	ACT	2	6	6139	6144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281227
99	NC_003910	ATT	2	6	6449	6454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281893
100	NC_003910	CGT	2	6	6583	6588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281893
101	NC_003910	ATT	2	6	6632	6637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281893
102	NC_003910	AGA	2	6	6747	6752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281893
103	NC_003910	CAA	2	6	6841	6846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281893
104	NC_003910	TTA	2	6	6975	6980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281893
105	NC_003910	ATT	2	6	7050	7055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281893
106	NC_003910	TTA	2	6	7248	7253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281893
107	NC_003910	AAT	2	6	7291	7296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281893
108	NC_003910	ACT	2	6	7326	7331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281166
109	NC_003910	AGA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281166
110	NC_003910	ACC	2	6	7367	7372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71281166
111	NC_003910	ACA	2	6	7408	7413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281166
112	NC_003910	TCG	2	6	7475	7480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281166
113	NC_003910	GAT	2	6	7518	7523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281166
114	NC_003910	CAG	2	6	7546	7551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281166
115	NC_003910	TGA	2	6	7565	7570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281166
116	NC_003910	ACG	2	6	7728	7733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281166
117	NC_003910	ATT	2	6	7836	7841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281166
118	NC_003910	TCA	2	6	7895	7900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281166
119	NC_003910	TTG	2	6	7996	8001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281166
120	NC_003910	TGA	2	6	8048	8053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281166
121	NC_003910	TGA	2	6	8114	8119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281166
122	NC_003910	CAG	2	6	8137	8142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281166
123	NC_003910	ATC	2	6	8167	8172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281166
124	NC_003910	TAA	2	6	8213	8218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281166
125	NC_003910	ATT	2	6	8262	8267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281166
126	NC_003910	AGC	2	6	8386	8391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281166
127	NC_003910	ATG	2	6	8575	8580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281166
128	NC_003910	GTA	2	6	8776	8781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281166
129	NC_003910	TAA	2	6	8831	8836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281166
130	NC_003910	ATT	2	6	8846	8851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281166
131	NC_003910	TAT	2	6	8900	8905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281166
132	NC_003910	AAG	2	6	8973	8978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281166
133	NC_003910	CAC	2	6	8986	8991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71281166
134	NC_003910	TGC	3	9	9056	9064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281166
135	NC_003910	TAA	2	6	9065	9070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281166
136	NC_003910	CTT	2	6	9269	9274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71281166
137	NC_003910	TGA	2	6	9289	9294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281166
138	NC_003910	GAT	2	6	9297	9302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281166
139	NC_003910	CTT	2	6	9353	9358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71281166
140	NC_003910	TAA	2	6	9479	9484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003910	CAA	3	9	9510	9518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_003910	TTC	2	6	9711	9716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_003910	CCT	2	6	9721	9726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_003910	TAA	2	6	9746	9751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003910	ATT	2	6	9872	9877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281828
146	NC_003910	ATG	2	6	9982	9987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281828
147	NC_003910	TCA	2	6	10004	10009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281828
148	NC_003910	TAA	2	6	10161	10166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281828
149	NC_003910	TGA	2	6	10357	10362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71277957
150	NC_003910	TGA	2	6	10521	10526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003910	CTT	2	6	10582	10587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_003910	AAT	2	6	10620	10625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003910	ATT	2	6	10651	10656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_003910	ATA	2	6	10834	10839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278597
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166	NC_003910	CAA	2	6	11407	11412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278597
167	NC_003910	TCA	2	6	11688	11693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278396
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171	NC_003910	AAT	2	6	11854	11859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_003910	TTA	2	6	11953	11958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_003910	ACA	2	6	12078	12083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71279252
174	NC_003910	ATT	2	6	12108	12113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279252
175	NC_003910	TAC	2	6	12163	12168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71279252
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186	NC_003910	CAA	2	6	12986	12991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71279252
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215	NC_003910	TTG	2	6	15472	15477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_003910	TGG	2	6	17270	17275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281222
248	NC_003910	GTA	2	6	17284	17289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281222
249	NC_003910	TGG	3	9	17291	17299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281222
250	NC_003910	GTA	2	6	17307	17312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281222
251	NC_003910	TTG	2	6	17419	17424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281222
252	NC_003910	TCT	2	6	17440	17445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71281222
253	NC_003910	GCA	2	6	17490	17495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281222
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255	NC_003910	TTC	2	6	17582	17587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71281222
256	NC_003910	TGT	2	6	17626	17631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281222
257	NC_003910	GCT	2	6	17654	17659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281222
258	NC_003910	TCA	2	6	17733	17738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_003910	TTG	2	6	17875	17880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71280386
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261	NC_003910	GTT	2	6	18032	18037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71280386
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