MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 115616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_003910	TTA	2	6	117349	117354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281278
2502	NC_003910	CGT	2	6	117377	117382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281278
2503	NC_003910	GATCA	2	10	117396	117405	40 %	20 %	20 %	20 %	71281278
2504	NC_003910	CCAA	2	8	117486	117493	50 %	0 %	0 %	50 %	71281278
2505	NC_003910	CCG	2	6	117508	117513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71281278
2506	NC_003910	AACC	2	8	117676	117683	50 %	0 %	0 %	50 %	71281278
2507	NC_003910	GTTG	2	8	117721	117728	0 %	50 %	50 %	0 %	71281278
2508	NC_003910	TAA	2	6	117801	117806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281278
2509	NC_003910	ACG	2	6	117954	117959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281278
2510	NC_003910	TGC	2	6	117967	117972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281278
2511	NC_003910	A	7	7	118023	118029	100 %	0 %	0 %	0 %	71281278
2512	NC_003910	ATC	2	6	118041	118046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281278
2513	NC_003910	ATT	2	6	118107	118112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278281
2514	NC_003910	TGT	2	6	118123	118128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71278281
2515	NC_003910	A	6	6	118175	118180	100 %	0 %	0 %	0 %	71278281
2516	NC_003910	CAA	2	6	118216	118221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278281
2517	NC_003910	ATAC	2	8	118266	118273	50 %	25 %	0 %	25 %	71278281
2518	NC_003910	GGC	2	6	118295	118300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71278281
2519	NC_003910	ATT	2	6	118318	118323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278281
2520	NC_003910	TCAA	2	8	118451	118458	50 %	25 %	0 %	25 %	71278281
2521	NC_003910	AAGT	2	8	118485	118492	50 %	25 %	25 %	0 %	71278281
2522	NC_003910	ATC	2	6	118525	118530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278281
2523	NC_003910	AT	3	6	118531	118536	50 %	50 %	0 %	0 %	71278281
2524	NC_003910	TAC	2	6	118596	118601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278281
2525	NC_003910	TAG	2	6	118606	118611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278281
2526	NC_003910	CT	3	6	118652	118657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2527	NC_003910	ATA	2	6	118659	118664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_003910	TTG	2	6	118697	118702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_003910	TAA	2	6	118897	118902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_003910	ATTC	2	8	118923	118930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2531	NC_003910	AATT	2	8	118988	118995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_003910	TAC	2	6	119096	119101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278026
2533	NC_003910	CTG	2	6	119215	119220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278026
2534	NC_003910	GCT	2	6	119268	119273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278026
2535	NC_003910	GCAA	2	8	119278	119285	50 %	0 %	25 %	25 %	71278026
2536	NC_003910	GCA	2	6	119334	119339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71278026
2537	NC_003910	TGG	2	6	119402	119407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71278026
2538	NC_003910	GCT	2	6	119418	119423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278026
2539	NC_003910	ATT	2	6	119481	119486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278026
2540	NC_003910	TGC	2	6	119513	119518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278026
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2542	NC_003910	GCT	2	6	119580	119585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278026
2543	NC_003910	TGT	2	6	119600	119605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71278026
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2545	NC_003910	GAA	2	6	119670	119675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71278026
2546	NC_003910	ATT	2	6	119717	119722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278026
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2549	NC_003910	T	6	6	119878	119883	0 %	100 %	0 %	0 %	71278609
2550	NC_003910	CGG	2	6	119904	119909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71278609
2551	NC_003910	TTGATT	2	12	119963	119974	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71278609
2552	NC_003910	ACG	3	9	120016	120024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71278609
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2556	NC_003910	TGG	2	6	120110	120115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71278609
2557	NC_003910	TGA	2	6	120147	120152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278609
2558	NC_003910	TTA	2	6	120155	120160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278609
2559	NC_003910	ATT	2	6	120193	120198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278609
2560	NC_003910	AAG	2	6	120281	120286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71278609
2561	NC_003910	GGC	2	6	120312	120317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71278609
2562	NC_003910	AGA	2	6	120351	120356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71278609
2563	NC_003910	AACC	2	8	120379	120386	50 %	0 %	0 %	50 %	71278609
2564	NC_003910	AGCA	2	8	120405	120412	50 %	0 %	25 %	25 %	71278609
2565	NC_003910	A	6	6	120415	120420	100 %	0 %	0 %	0 %	71278609
2566	NC_003910	TAGT	2	8	120445	120452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_003910	AGT	2	6	120454	120459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_003910	TTAC	2	8	120466	120473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2569	NC_003910	A	6	6	120478	120483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_003910	T	7	7	120519	120525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_003910	GTA	2	6	120528	120533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_003910	TAT	2	6	120534	120539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_003910	ATTG	2	8	120613	120620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_003910	GAA	2	6	120794	120799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_003910	TTTTCA	2	12	120825	120836	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2576	NC_003910	TCAA	2	8	120893	120900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2577	NC_003910	TTAA	2	8	120944	120951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_003910	TAT	2	6	120961	120966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_003910	TAA	3	9	120977	120985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_003910	ATG	2	6	121022	121027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281794
2581	NC_003910	TAC	2	6	121053	121058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281794
2582	NC_003910	TGGT	2	8	121061	121068	0 %	50 %	50 %	0 %	71281794
2583	NC_003910	TC	3	6	121130	121135	0 %	50 %	0 %	50 %	71281794
2584	NC_003910	CA	3	6	121188	121193	50 %	0 %	0 %	50 %	71281794
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2587	NC_003910	A	8	8	121319	121326	100 %	0 %	0 %	0 %	71281794
2588	NC_003910	GTTG	2	8	121357	121364	0 %	50 %	50 %	0 %	71281794
2589	NC_003910	ATA	2	6	121386	121391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281794
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2591	NC_003910	GTAC	2	8	121484	121491	25 %	25 %	25 %	25 %	71281794
2592	NC_003910	GCA	2	6	121555	121560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281794
2593	NC_003910	CAA	2	6	121601	121606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281794
2594	NC_003910	GGC	2	6	121616	121621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71281794
2595	NC_003910	GCA	2	6	121660	121665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281794
2596	NC_003910	TGA	2	6	121675	121680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281794
2597	NC_003910	A	6	6	121680	121685	100 %	0 %	0 %	0 %	71281794
2598	NC_003910	AT	3	6	121750	121755	50 %	50 %	0 %	0 %	71281794
2599	NC_003910	GATTG	2	10	121775	121784	20 %	40 %	40 %	0 %	71281794
2600	NC_003910	TTG	2	6	121866	121871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281794
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2602	NC_003910	CAG	2	6	121979	121984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281794
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2604	NC_003910	GT	3	6	122022	122027	0 %	50 %	50 %	0 %	71281794
2605	NC_003910	TAT	2	6	122033	122038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281794
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2607	NC_003910	A	6	6	122060	122065	100 %	0 %	0 %	0 %	71281794
2608	NC_003910	TGATG	2	10	122071	122080	20 %	40 %	40 %	0 %	71281794
2609	NC_003910	CAA	2	6	122148	122153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281794
2610	NC_003910	ATA	2	6	122250	122255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281794
2611	NC_003910	TTA	2	6	122262	122267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281794
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2613	NC_003910	ATTTT	2	10	122525	122534	20 %	80 %	0 %	0 %	71282504
2614	NC_003910	A	6	6	122572	122577	100 %	0 %	0 %	0 %	71282504
2615	NC_003910	TAT	2	6	122593	122598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71282504
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2618	NC_003910	T	6	6	122796	122801	0 %	100 %	0 %	0 %	71280942
2619	NC_003910	GAT	2	6	122849	122854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71280942
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2621	NC_003910	TTTA	2	8	122950	122957	25 %	75 %	0 %	0 %	71281419
2622	NC_003910	A	6	6	122966	122971	100 %	0 %	0 %	0 %	71281419
2623	NC_003910	GCTT	2	8	122996	123003	0 %	50 %	25 %	25 %	71281419
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2628	NC_003910	T	6	6	123351	123356	0 %	100 %	0 %	0 %	71281419
2629	NC_003910	CGC	2	6	123360	123365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71281419
2630	NC_003910	TAA	2	6	123384	123389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281419
2631	NC_003910	TAA	2	6	123413	123418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281419
2632	NC_003910	GTG	2	6	123476	123481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281419
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2666	NC_003910	CTAT	2	8	125015	125022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2681	NC_003910	AGA	2	6	125767	125772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71278483
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2723	NC_003910	GTA	2	6	128100	128105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2749	NC_003910	TGG	2	6	129102	129107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281635
2750	NC_003910	GTTG	2	8	129129	129136	0 %	50 %	50 %	0 %	71281635
2751	NC_003910	TGG	2	6	129145	129150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71281635
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