MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 115616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003910	AAAG	2	8	46066	46073	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_003910	T	6	6	46115	46120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_003910	TGT	2	6	46221	46226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71279429
1004	NC_003910	C	6	6	46297	46302	0 %	0 %	0 %	100 %	71279429
1005	NC_003910	TAT	2	6	46310	46315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279429
1006	NC_003910	ATG	2	6	46340	46345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71279429
1007	NC_003910	ACT	2	6	46464	46469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_003910	TGG	2	6	46502	46507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_003910	GGTGA	2	10	46560	46569	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_003910	AGGT	2	8	46621	46628	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_003910	TAG	2	6	46720	46725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_003910	GCGA	2	8	46728	46735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_003910	TAG	2	6	46767	46772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_003910	G	6	6	46877	46882	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_003910	TCC	2	6	46887	46892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_003910	TAC	2	6	46902	46907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_003910	GGA	2	6	47197	47202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_003910	AC	3	6	47207	47212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_003910	TGA	2	6	47231	47236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_003910	AC	3	6	47414	47419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_003910	AAC	2	6	47451	47456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_003910	AGG	2	6	47525	47530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_003910	AGC	2	6	47541	47546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_003910	AAAG	2	8	47555	47562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_003910	AGTCG	2	10	47577	47586	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1026	NC_003910	CCG	2	6	47763	47768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_003910	CAGGG	2	10	47799	47808	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_003910	AGGCG	2	10	47823	47832	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1029	NC_003910	TA	3	6	47877	47882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_003910	AGG	2	6	47889	47894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_003910	GGT	2	6	47947	47952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_003910	ACGAG	2	10	47991	48000	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1033	NC_003910	GTT	2	6	48017	48022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_003910	AT	3	6	48059	48064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_003910	GGT	2	6	48090	48095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_003910	GA	3	6	48120	48125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_003910	GCT	2	6	48178	48183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_003910	AGT	2	6	48214	48219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_003910	TTA	2	6	48246	48251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_003910	TGA	2	6	48350	48355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_003910	CGG	2	6	48372	48377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_003910	TGG	2	6	48622	48627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_003910	ACC	2	6	48643	48648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_003910	TGG	2	6	48703	48708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_003910	TCC	2	6	48729	48734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_003910	GGA	2	6	48746	48751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_003910	GACA	2	8	48823	48830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_003910	GGT	2	6	48866	48871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_003910	CGG	2	6	48953	48958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_003910	TCA	2	6	48981	48986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_003910	CGT	2	6	49061	49066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_003910	GCT	2	6	49115	49120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_003910	GT	3	6	49314	49319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_003910	TGC	2	6	49323	49328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_003910	ACA	2	6	49375	49380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71279040
1056	NC_003910	AGT	2	6	49385	49390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71279040
1057	NC_003910	T	6	6	49537	49542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_003910	TGC	2	6	49669	49674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_003910	A	6	6	49764	49769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_003910	TAT	2	6	49834	49839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_003910	CTCA	2	8	49846	49853	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_003910	AAG	2	6	49870	49875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_003910	TCT	2	6	49892	49897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_003910	TG	3	6	49954	49959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_003910	TGT	2	6	49974	49979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_003910	A	7	7	50008	50014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_003910	AATG	2	8	50020	50027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_003910	AAAT	2	8	50038	50045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_003910	TTAT	2	8	50050	50057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_003910	TTAG	2	8	50060	50067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_003910	GGC	2	6	50208	50213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_003910	CTG	2	6	50260	50265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_003910	GCG	2	6	50270	50275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_003910	TGG	2	6	50308	50313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_003910	ACA	2	6	50317	50322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_003910	G	7	7	50366	50372	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_003910	TTC	2	6	50374	50379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_003910	CGA	2	6	50447	50452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_003910	GAT	2	6	50472	50477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_003910	GCA	2	6	50521	50526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_003910	GT	3	6	50574	50579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_003910	GAA	2	6	50580	50585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_003910	AAC	2	6	50657	50662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_003910	AGA	2	6	50663	50668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_003910	CAG	2	6	50689	50694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_003910	GTG	2	6	50838	50843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_003910	GGAA	2	8	50879	50886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_003910	GGC	2	6	50900	50905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_003910	GAA	2	6	51143	51148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_003910	AGAGA	2	10	51170	51179	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_003910	TGC	2	6	51219	51224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_003910	GTC	2	6	51231	51236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_003910	GGA	2	6	51345	51350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_003910	GAC	2	6	51358	51363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_003910	TCA	2	6	51370	51375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1097	NC_003910	GCA	2	6	51426	51431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_003910	AC	3	6	51565	51570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_003910	AAG	2	6	51601	51606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_003910	GGA	2	6	51627	51632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_003910	CAC	2	6	51637	51642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_003910	CCT	2	6	51708	51713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_003910	CA	3	6	51773	51778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_003910	GCCT	2	8	51838	51845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_003910	AGG	2	6	51853	51858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_003910	CAG	2	6	51860	51865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_003910	CCA	2	6	51883	51888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_003910	TCA	2	6	51891	51896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_003910	AAAG	2	8	51910	51917	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_003910	T	6	6	51959	51964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_003910	TA	3	6	52041	52046	50 %	50 %	0 %	0 %	71282016
1112	NC_003910	TGT	2	6	52065	52070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71282016
1113	NC_003910	TGAA	2	8	52115	52122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_003910	C	6	6	52141	52146	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1115	NC_003910	TAT	2	6	52154	52159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_003910	ATG	2	6	52184	52189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_003910	ACT	2	6	52308	52313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_003910	TGG	2	6	52346	52351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_003910	GGTGA	2	10	52404	52413	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_003910	AGGT	2	8	52465	52472	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_003910	TAG	2	6	52564	52569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_003910	GCGA	2	8	52572	52579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_003910	TAG	2	6	52611	52616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_003910	G	6	6	52721	52726	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_003910	TCC	2	6	52731	52736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_003910	TAC	2	6	52746	52751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_003910	GGA	2	6	53041	53046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_003910	AC	3	6	53051	53056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_003910	TGA	2	6	53075	53080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_003910	AC	3	6	53258	53263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_003910	AAC	2	6	53295	53300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_003910	AGG	2	6	53369	53374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_003910	AGC	2	6	53385	53390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_003910	AAAG	2	8	53399	53406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_003910	AGTCG	2	10	53421	53430	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1136	NC_003910	CCG	2	6	53607	53612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_003910	CAGGG	2	10	53643	53652	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1138	NC_003910	AGGCG	2	10	53667	53676	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1139	NC_003910	TA	3	6	53721	53726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_003910	AGG	2	6	53733	53738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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