MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 115616

< Previous12...220221222223224225226227228229230231232Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
115501	NC_003910	AATA	2	8	5368613	5368620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115502	NC_003910	TAAA	2	8	5368639	5368646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115503	NC_003910	TAT	2	6	5368688	5368693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115504	NC_003910	TCA	2	6	5368761	5368766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71277760
115505	NC_003910	GTAA	2	8	5368869	5368876	50 %	25 %	25 %	0 %	71277760
115506	NC_003910	TCT	2	6	5368913	5368918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71277760
115507	NC_003910	ATT	2	6	5368956	5368961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71277760
115508	NC_003910	TAA	2	6	5369017	5369022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71277760
115509	NC_003910	ATCGGT	2	12	5369039	5369050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71277760
115510	NC_003910	CAT	2	6	5369074	5369079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71277760
115511	NC_003910	TAAT	2	8	5369098	5369105	50 %	50 %	0 %	0 %	71277760
115512	NC_003910	T	6	6	5369116	5369121	0 %	100 %	0 %	0 %	71277760
115513	NC_003910	A	6	6	5369135	5369140	100 %	0 %	0 %	0 %	71277760
115514	NC_003910	TCT	2	6	5369172	5369177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71277760
115515	NC_003910	TAA	2	6	5369210	5369215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71277760
115516	NC_003910	TTGA	2	8	5369228	5369235	25 %	50 %	25 %	0 %	71277760
115517	NC_003910	CAA	2	6	5369269	5369274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71277760
115518	NC_003910	CAT	2	6	5369275	5369280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71277760
115519	NC_003910	AAT	2	6	5369306	5369311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71277760
115520	NC_003910	AGT	2	6	5369360	5369365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71277760
115521	NC_003910	TGTT	2	8	5369390	5369397	0 %	75 %	25 %	0 %	71277760
115522	NC_003910	GAC	2	6	5369440	5369445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71277760
115523	NC_003910	AAT	2	6	5369474	5369479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71277760
115524	NC_003910	GCTT	2	8	5369493	5369500	0 %	50 %	25 %	25 %	71277760
115525	NC_003910	TCT	2	6	5369508	5369513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71277760
115526	NC_003910	ATA	2	6	5369523	5369528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71277760
115527	NC_003910	T	7	7	5369548	5369554	0 %	100 %	0 %	0 %	71277760
115528	NC_003910	TCT	2	6	5369574	5369579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71277760
115529	NC_003910	AATC	2	8	5369587	5369594	50 %	25 %	0 %	25 %	71277760
115530	NC_003910	ACAT	2	8	5369604	5369611	50 %	25 %	0 %	25 %	71277760
115531	NC_003910	AAT	2	6	5369621	5369626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71277760
115532	NC_003910	GCT	2	6	5369691	5369696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71277760
115533	NC_003910	TTAA	2	8	5369712	5369719	50 %	50 %	0 %	0 %	71277760
115534	NC_003910	ACC	2	6	5369855	5369860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71277760
115535	NC_003910	CCA	2	6	5370072	5370077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71277760
115536	NC_003910	GCG	2	6	5370099	5370104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71277760
115537	NC_003910	GTT	2	6	5370111	5370116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71277760
115538	NC_003910	TAAT	2	8	5370141	5370148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115539	NC_003910	TGA	2	6	5370161	5370166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115540	NC_003910	AAT	2	6	5370198	5370203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115541	NC_003910	ATTT	2	8	5370243	5370250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115542	NC_003910	TGC	2	6	5370278	5370283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281074
115543	NC_003910	T	6	6	5370293	5370298	0 %	100 %	0 %	0 %	71281074
115544	NC_003910	ATT	2	6	5370318	5370323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281074
115545	NC_003910	TTAC	2	8	5370348	5370355	25 %	50 %	0 %	25 %	71281074
115546	NC_003910	TAC	2	6	5370407	5370412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281074
115547	NC_003910	AT	3	6	5370417	5370422	50 %	50 %	0 %	0 %	71281074
115548	NC_003910	T	6	6	5370430	5370435	0 %	100 %	0 %	0 %	71281074
115549	NC_003910	T	6	6	5370469	5370474	0 %	100 %	0 %	0 %	71281074
115550	NC_003910	TACA	2	8	5370479	5370486	50 %	25 %	0 %	25 %	71281074
115551	NC_003910	GAA	2	6	5370515	5370520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281074
115552	NC_003910	GTA	2	6	5370625	5370630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281074
115553	NC_003910	AAC	2	6	5370640	5370645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281074
115554	NC_003910	CTG	2	6	5370649	5370654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281074
115555	NC_003910	T	6	6	5370700	5370705	0 %	100 %	0 %	0 %	71281074
115556	NC_003910	TCA	2	6	5370711	5370716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281074
115557	NC_003910	ACC	2	6	5370806	5370811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71281074
115558	NC_003910	TGA	2	6	5370826	5370831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281074
115559	NC_003910	TAA	2	6	5370832	5370837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281074
115560	NC_003910	TAG	2	6	5370875	5370880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281074
115561	NC_003910	ATC	2	6	5370903	5370908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281074
115562	NC_003910	CTT	2	6	5370964	5370969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71281074
115563	NC_003910	TTA	2	6	5371068	5371073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281074
115564	NC_003910	GCC	2	6	5371157	5371162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71281074
115565	NC_003910	CTT	2	6	5371186	5371191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71281074
115566	NC_003910	ATC	2	6	5371196	5371201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281074
115567	NC_003910	TTC	2	6	5371223	5371228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71281074
115568	NC_003910	TGT	2	6	5371229	5371234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281074
115569	NC_003910	AGC	2	6	5371241	5371246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281074
115570	NC_003910	GGTA	3	12	5371252	5371263	25 %	25 %	50 %	0 %	71281074
115571	NC_003910	CCA	3	9	5371269	5371277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71281074
115572	NC_003910	CTA	2	6	5371282	5371287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281074
115573	NC_003910	GTT	2	6	5371340	5371345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281074
115574	NC_003910	TTA	2	6	5371383	5371388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281074
115575	NC_003910	CAT	2	6	5371423	5371428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281074
115576	NC_003910	TA	4	8	5371489	5371496	50 %	50 %	0 %	0 %	71281074
115577	NC_003910	AT	3	6	5371554	5371559	50 %	50 %	0 %	0 %	71281074
115578	NC_003910	CAA	2	6	5371636	5371641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281074
115579	NC_003910	CAC	2	6	5371645	5371650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71281074
115580	NC_003910	TAAT	2	8	5371693	5371700	50 %	50 %	0 %	0 %	71281074
115581	NC_003910	ACTG	2	8	5371782	5371789	25 %	25 %	25 %	25 %	71281074
115582	NC_003910	TGC	2	6	5371833	5371838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281074
115583	NC_003910	AGTA	2	8	5371851	5371858	50 %	25 %	25 %	0 %	71281074
115584	NC_003910	AAC	2	6	5371862	5371867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281074
115585	NC_003910	CTTCT	2	10	5371915	5371924	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115586	NC_003910	TTG	2	6	5371925	5371930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115587	NC_003910	ATT	2	6	5371938	5371943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115588	NC_003910	CTA	2	6	5372006	5372011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115589	NC_003910	T	6	6	5372040	5372045	0 %	100 %	0 %	0 %	71279931
115590	NC_003910	TGG	2	6	5372048	5372053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71279931
115591	NC_003910	CGC	2	6	5372065	5372070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71279931
115592	NC_003910	CAT	2	6	5372071	5372076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71279931
115593	NC_003910	TGCT	2	8	5372104	5372111	0 %	50 %	25 %	25 %	71279931
115594	NC_003910	AACC	2	8	5372112	5372119	50 %	0 %	0 %	50 %	71279931
115595	NC_003910	TTA	2	6	5372125	5372130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279931
115596	NC_003910	TTA	2	6	5372239	5372244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279931
115597	NC_003910	ATT	2	6	5372264	5372269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279931
115598	NC_003910	GAC	2	6	5372341	5372346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71280614
115599	NC_003910	T	6	6	5372440	5372445	0 %	100 %	0 %	0 %	71280614
115600	NC_003910	T	6	6	5372468	5372473	0 %	100 %	0 %	0 %	71280614
115601	NC_003910	TAA	2	6	5372524	5372529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71280614
115602	NC_003910	A	6	6	5372565	5372570	100 %	0 %	0 %	0 %	71280614
115603	NC_003910	CAA	2	6	5372593	5372598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71280614
115604	NC_003910	ACG	3	9	5372705	5372713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281168
115605	NC_003910	TTACGC	2	12	5372766	5372777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	71281168
115606	NC_003910	GTT	3	9	5372825	5372833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115607	NC_003910	CA	3	6	5372858	5372863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115608	NC_003910	A	6	6	5372869	5372874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115609	NC_003910	T	6	6	5372948	5372953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115610	NC_003910	TAT	2	6	5373021	5373026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71277886
115611	NC_003910	TAA	2	6	5373029	5373034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71277886
115612	NC_003910	T	8	8	5373087	5373094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115613	NC_003910	TTCT	2	8	5373102	5373109	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115614	NC_003910	TA	3	6	5373113	5373118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115615	NC_003910	TGT	2	6	5373142	5373147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115616	NC_003910	A	6	6	5373149	5373154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...220221222223224225226227228229230231232Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.