MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 115616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_003910	A	6	6	508460	508465	100 %	0 %	0 %	0 %	71279338
11003	NC_003910	TCT	2	6	508574	508579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71279338
11004	NC_003910	GAA	2	6	508613	508618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71279338
11005	NC_003910	CAT	2	6	508638	508643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71279338
11006	NC_003910	A	6	6	508709	508714	100 %	0 %	0 %	0 %	71279338
11007	NC_003910	ATA	2	6	508778	508783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71279338
11008	NC_003910	TTGG	2	8	508798	508805	0 %	50 %	50 %	0 %	71279338
11009	NC_003910	ACC	3	9	508820	508828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71279338
11010	NC_003910	ATC	2	6	508870	508875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_003910	GCT	2	6	508917	508922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_003910	CTT	2	6	508971	508976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_003910	T	6	6	508995	509000	0 %	100 %	0 %	0 %	71278725
11014	NC_003910	TTC	2	6	509007	509012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71278725
11015	NC_003910	CTT	2	6	509030	509035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71278725
11016	NC_003910	GA	3	6	509044	509049	50 %	0 %	50 %	0 %	71278725
11017	NC_003910	ACA	2	6	509068	509073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278725
11018	NC_003910	TTC	2	6	509169	509174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71278725
11019	NC_003910	TCA	2	6	509201	509206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278725
11020	NC_003910	CGATA	2	10	509243	509252	40 %	20 %	20 %	20 %	71278725
11021	NC_003910	TG	3	6	509302	509307	0 %	50 %	50 %	0 %	71278725
11022	NC_003910	GCC	2	6	509358	509363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71278725
11023	NC_003910	CGA	2	6	509524	509529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71278725
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11025	NC_003910	TAAT	2	8	509615	509622	50 %	50 %	0 %	0 %	71278725
11026	NC_003910	TAA	2	6	509631	509636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278725
11027	NC_003910	CAT	2	6	509915	509920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278725
11028	NC_003910	ATA	2	6	509924	509929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278725
11029	NC_003910	GAT	2	6	509933	509938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278725
11030	NC_003910	A	6	6	509955	509960	100 %	0 %	0 %	0 %	71278725
11031	NC_003910	TAA	2	6	510047	510052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278725
11032	NC_003910	TAA	2	6	510132	510137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278725
11033	NC_003910	GTT	2	6	510184	510189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71278725
11034	NC_003910	AGT	2	6	510248	510253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71279977
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11036	NC_003910	AATC	2	8	510562	510569	50 %	25 %	0 %	25 %	71279977
11037	NC_003910	T	6	6	510583	510588	0 %	100 %	0 %	0 %	71279977
11038	NC_003910	GTT	2	6	510633	510638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71279977
11039	NC_003910	GTA	2	6	510715	510720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71279977
11040	NC_003910	TCA	2	6	510731	510736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71279977
11041	NC_003910	TAA	2	6	510748	510753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71279977
11042	NC_003910	AT	4	8	510851	510858	50 %	50 %	0 %	0 %	71279977
11043	NC_003910	AATG	2	8	510877	510884	50 %	25 %	25 %	0 %	71279977
11044	NC_003910	TGA	2	6	510905	510910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71279977
11045	NC_003910	ATT	2	6	510911	510916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279977
11046	NC_003910	CTG	2	6	510976	510981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71279977
11047	NC_003910	TTGA	2	8	511002	511009	25 %	50 %	25 %	0 %	71279977
11048	NC_003910	CAG	2	6	511136	511141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71280803
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11050	NC_003910	GTT	2	6	511367	511372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71280803
11051	NC_003910	ATTG	2	8	511425	511432	25 %	50 %	25 %	0 %	71280803
11052	NC_003910	GTT	2	6	511442	511447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71280803
11053	NC_003910	T	6	6	511505	511510	0 %	100 %	0 %	0 %	71280803
11054	NC_003910	TTG	2	6	511555	511560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71280803
11055	NC_003910	TTTTC	2	10	511583	511592	0 %	80 %	0 %	20 %	71280803
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11057	NC_003910	CAT	2	6	511628	511633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71280803
11058	NC_003910	TAA	2	6	511659	511664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71280803
11059	NC_003910	AAAAAT	2	12	511706	511717	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71280803
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11062	NC_003910	ATCTG	2	10	511864	511873	20 %	40 %	20 %	20 %	71280803
11063	NC_003910	TTC	2	6	511911	511916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71280803
11064	NC_003910	TGT	2	6	511927	511932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71280803
11065	NC_003910	TAA	2	6	511934	511939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71280803
11066	NC_003910	A	6	6	511969	511974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_003910	GTT	2	6	511986	511991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_003910	ATT	2	6	512057	512062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_003910	TGT	2	6	512078	512083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_003910	T	6	6	512181	512186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_003910	AAC	2	6	512214	512219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_003910	CAA	2	6	512261	512266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278886
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11074	NC_003910	TAG	2	6	512393	512398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_003910	ATG	2	6	512478	512483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_003910	AT	3	6	512492	512497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_003910	AAG	2	6	512520	512525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_003910	CAG	2	6	512529	512534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_003910	AT	3	6	512649	512654	50 %	50 %	0 %	0 %	71279668
11080	NC_003910	TCA	2	6	512658	512663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71279668
11081	NC_003910	AT	4	8	512693	512700	50 %	50 %	0 %	0 %	71279668
11082	NC_003910	CCA	2	6	512734	512739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71279668
11083	NC_003910	CTG	2	6	512743	512748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71279668
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11088	NC_003910	A	6	6	512901	512906	100 %	0 %	0 %	0 %	71279668
11089	NC_003910	A	6	6	512935	512940	100 %	0 %	0 %	0 %	71279668
11090	NC_003910	AAAC	2	8	512973	512980	75 %	0 %	0 %	25 %	71279668
11091	NC_003910	AT	3	6	513043	513048	50 %	50 %	0 %	0 %	71279668
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11094	NC_003910	A	6	6	513238	513243	100 %	0 %	0 %	0 %	71279668
11095	NC_003910	GGCT	2	8	513255	513262	0 %	25 %	50 %	25 %	71279668
11096	NC_003910	AATGA	2	10	513403	513412	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_003910	TGG	2	6	513453	513458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_003910	AAGA	2	8	513473	513480	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_003910	ACTC	3	12	513516	513527	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11100	NC_003910	CTT	2	6	513588	513593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71282130
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11103	NC_003910	CAT	2	6	513622	513627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71282130
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11106	NC_003910	ATCA	2	8	513785	513792	50 %	25 %	0 %	25 %	71282130
11107	NC_003910	TTA	2	6	514026	514031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71282130
11108	NC_003910	AAG	2	6	514061	514066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71282130
11109	NC_003910	AAT	2	6	514077	514082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71282130
11110	NC_003910	TTA	2	6	514120	514125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_003910	TGT	2	6	514130	514135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_003910	ATT	2	6	514177	514182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_003910	TTG	2	6	514187	514192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_003910	AT	3	6	514222	514227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_003910	TGC	2	6	514235	514240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_003910	TAAG	2	8	514248	514255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_003910	TA	3	6	514312	514317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_003910	TA	3	6	514344	514349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_003910	TAA	2	6	514366	514371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_003910	TTAG	2	8	514407	514414	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_003910	ATGC	2	8	514448	514455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11122	NC_003910	ATG	2	6	514480	514485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_003910	T	7	7	514489	514495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_003910	GTTTC	2	10	514504	514513	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11125	NC_003910	TTG	2	6	514553	514558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_003910	GTA	2	6	514611	514616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11128	NC_003910	A	7	7	514680	514686	100 %	0 %	0 %	0 %	71277770
11129	NC_003910	TGA	2	6	514724	514729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71277770
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11499	NC_003910	TTG	2	6	531570	531575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281284
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