MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 115616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003910	ACC	2	6	22842	22847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71278391
502	NC_003910	GGC	2	6	22926	22931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71278391
503	NC_003910	CTT	2	6	22932	22937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71278391
504	NC_003910	ACC	2	6	22999	23004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71278391
505	NC_003910	TGC	2	6	23008	23013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278391
506	NC_003910	ACA	2	6	23014	23019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278391
507	NC_003910	CAATA	2	10	23023	23032	60 %	20 %	0 %	20 %	71278391
508	NC_003910	TAA	2	6	23050	23055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278391
509	NC_003910	TGCTG	2	10	23066	23075	0 %	40 %	40 %	20 %	71278391
510	NC_003910	CAT	2	6	23100	23105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278391
511	NC_003910	CAATTT	2	12	23178	23189	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71278391
512	NC_003910	GTG	2	6	23227	23232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71278391
513	NC_003910	TTG	2	6	23233	23238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71278391
514	NC_003910	TTG	2	6	23311	23316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71278391
515	NC_003910	T	7	7	23319	23325	0 %	100 %	0 %	0 %	71278391
516	NC_003910	ACCA	2	8	23331	23338	50 %	0 %	0 %	50 %	71278391
517	NC_003910	TGTTT	2	10	23377	23386	0 %	80 %	20 %	0 %	71278391
518	NC_003910	A	6	6	23417	23422	100 %	0 %	0 %	0 %	71278391
519	NC_003910	T	6	6	23462	23467	0 %	100 %	0 %	0 %	71278391
520	NC_003910	TGC	2	6	23479	23484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278391
521	NC_003910	TCAC	2	8	23492	23499	25 %	25 %	0 %	50 %	71278391
522	NC_003910	AT	3	6	23522	23527	50 %	50 %	0 %	0 %	71278391
523	NC_003910	A	6	6	23555	23560	100 %	0 %	0 %	0 %	71278391
524	NC_003910	CT	3	6	23568	23573	0 %	50 %	0 %	50 %	71278391
525	NC_003910	CAT	2	6	23610	23615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278391
526	NC_003910	AC	3	6	23640	23645	50 %	0 %	0 %	50 %	71278391
527	NC_003910	TTG	2	6	23695	23700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71278391
528	NC_003910	TCA	2	6	23711	23716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278391
529	NC_003910	AAC	2	6	23748	23753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278391
530	NC_003910	TGC	2	6	23758	23763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278391
531	NC_003910	ATTA	2	8	23776	23783	50 %	50 %	0 %	0 %	71278391
532	NC_003910	TGC	2	6	23816	23821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278840
533	NC_003910	CAA	2	6	23822	23827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278840
534	NC_003910	T	6	6	23874	23879	0 %	100 %	0 %	0 %	71278840
535	NC_003910	GTT	2	6	23920	23925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71278840
536	NC_003910	CTT	2	6	23939	23944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71278840
537	NC_003910	TAT	2	6	23955	23960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278840
538	NC_003910	TGC	2	6	24022	24027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278840
539	NC_003910	TCA	2	6	24100	24105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278840
540	NC_003910	TCA	2	6	24169	24174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278840
541	NC_003910	ATA	2	6	24220	24225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278840
542	NC_003910	TGC	2	6	24414	24419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278840
543	NC_003910	CAA	3	9	24512	24520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278840
544	NC_003910	TTG	3	9	24549	24557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71278840
545	NC_003910	CAA	2	6	24590	24595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278840
546	NC_003910	TTG	2	6	24623	24628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71278840
547	NC_003910	T	6	6	24642	24647	0 %	100 %	0 %	0 %	71278840
548	NC_003910	AATT	2	8	24704	24711	50 %	50 %	0 %	0 %	71278840
549	NC_003910	GCT	2	6	24715	24720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278840
550	NC_003910	TAT	2	6	24789	24794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_003910	GTAA	3	12	24796	24807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_003910	TACT	2	8	24809	24816	25 %	50 %	0 %	25 %	71279368
553	NC_003910	TGT	2	6	24817	24822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71279368
554	NC_003910	CTT	2	6	24838	24843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71279368
555	NC_003910	T	7	7	24852	24858	0 %	100 %	0 %	0 %	71279368
556	NC_003910	CAA	2	6	24892	24897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71279368
557	NC_003910	TGT	2	6	24927	24932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71279368
558	NC_003910	CAT	2	6	25009	25014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71279368
559	NC_003910	CTT	2	6	25057	25062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71279368
560	NC_003910	TAG	2	6	25084	25089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71279368
561	NC_003910	AAT	2	6	25091	25096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71279368
562	NC_003910	GAT	2	6	25112	25117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71279368
563	NC_003910	ACA	2	6	25149	25154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71279368
564	NC_003910	TGA	2	6	25161	25166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71279368
565	NC_003910	TTC	2	6	25202	25207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71279368
566	NC_003910	TTA	2	6	25331	25336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_003910	TAAT	2	8	25350	25357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_003910	ATGTT	2	10	25363	25372	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
569	NC_003910	TA	3	6	25378	25383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_003910	GTAACT	2	12	25389	25400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
571	NC_003910	TAA	2	6	25433	25438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_003910	CAG	2	6	25452	25457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_003910	ATA	2	6	25494	25499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278476
574	NC_003910	ATG	2	6	25558	25563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278476
575	NC_003910	GTA	2	6	25581	25586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278476
576	NC_003910	AAT	2	6	25677	25682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278476
577	NC_003910	ATTTA	2	10	25687	25696	40 %	60 %	0 %	0 %	71278476
578	NC_003910	TGA	2	6	25724	25729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278476
579	NC_003910	TGG	2	6	25747	25752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71278476
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581	NC_003910	A	6	6	25806	25811	100 %	0 %	0 %	0 %	71278476
582	NC_003910	CA	3	6	25903	25908	50 %	0 %	0 %	50 %	71278476
583	NC_003910	TGA	2	6	25919	25924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278476
584	NC_003910	GAT	2	6	26037	26042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278476
585	NC_003910	GTG	2	6	26092	26097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71278476
586	NC_003910	ATG	2	6	26107	26112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278476
587	NC_003910	CTA	2	6	26119	26124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278476
588	NC_003910	ATTC	2	8	26151	26158	25 %	50 %	0 %	25 %	71278476
589	NC_003910	GTA	2	6	26169	26174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278476
590	NC_003910	T	6	6	26206	26211	0 %	100 %	0 %	0 %	71278476
591	NC_003910	AGC	2	6	26219	26224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71278476
592	NC_003910	TAA	2	6	26225	26230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278476
593	NC_003910	GTT	2	6	26292	26297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71278476
594	NC_003910	ATG	2	6	26320	26325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278476
595	NC_003910	AGA	2	6	26453	26458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71278476
596	NC_003910	TACA	2	8	26518	26525	50 %	25 %	0 %	25 %	71278476
597	NC_003910	TGATT	2	10	26546	26555	20 %	60 %	20 %	0 %	71278476
598	NC_003910	ATA	2	6	26564	26569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278476
599	NC_003910	CCT	2	6	26595	26600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_003910	TAA	2	6	26656	26661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71277761
601	NC_003910	A	7	7	26723	26729	100 %	0 %	0 %	0 %	71277761
602	NC_003910	TTG	2	6	26736	26741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71277761
603	NC_003910	GTT	2	6	26761	26766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71277761
604	NC_003910	TAA	2	6	26803	26808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71277761
605	NC_003910	AAC	2	6	26820	26825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71277761
606	NC_003910	TCA	2	6	26836	26841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71277761
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608	NC_003910	CAT	2	6	26899	26904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71277761
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610	NC_003910	CAAA	2	8	26938	26945	75 %	0 %	0 %	25 %	71277761
611	NC_003910	ATT	2	6	26986	26991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71277761
612	NC_003910	GCT	2	6	27029	27034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71277761
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614	NC_003910	CAA	2	6	27071	27076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71277761
615	NC_003910	GCA	2	6	27082	27087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71277761
616	NC_003910	TAT	2	6	27094	27099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71277761
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619	NC_003910	GCG	2	6	27249	27254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71277761
620	NC_003910	CAT	2	6	27256	27261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71277761
621	NC_003910	TTA	2	6	27321	27326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71277761
622	NC_003910	TTAA	2	8	27473	27480	50 %	50 %	0 %	0 %	71277761
623	NC_003910	ATA	2	6	27515	27520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71277761
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625	NC_003910	AAAT	2	8	27618	27625	75 %	25 %	0 %	0 %	71277761
626	NC_003910	GTT	2	6	27649	27654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71277761
627	NC_003910	AGT	2	6	27691	27696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71277761
628	NC_003910	TGG	2	6	27778	27783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71277761
629	NC_003910	TA	3	6	27805	27810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_003910	TGG	2	6	27880	27885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71282268
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