MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 9806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003366	AGAA	2	8	693	700	75 %	0 %	25 %	0 %	18308983
2	NC_003366	ATGC	2	8	917	924	25 %	25 %	25 %	25 %	18308983
3	NC_003366	AAAT	2	8	2098	2105	75 %	25 %	0 %	0 %	18308984
4	NC_003366	AAAC	2	8	2849	2856	75 %	0 %	0 %	25 %	18308984
5	NC_003366	AAGG	2	8	2894	2901	50 %	0 %	50 %	0 %	18308984
6	NC_003366	TACT	2	8	3038	3045	25 %	50 %	0 %	25 %	18308984
7	NC_003366	AATT	3	12	3585	3596	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
8	NC_003366	AATT	2	8	3885	3892	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
9	NC_003366	GAAA	2	8	4043	4050	75 %	0 %	25 %	0 %	18308986
10	NC_003366	GATA	2	8	4841	4848	50 %	25 %	25 %	0 %	18308987
11	NC_003366	ATTA	2	8	4908	4915	50 %	50 %	0 %	0 %	18308987
12	NC_003366	ATTT	2	8	4964	4971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003366	ATTT	2	8	5003	5010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003366	TACA	2	8	5354	5361	50 %	25 %	0 %	25 %	18308988
15	NC_003366	AATG	2	8	6049	6056	50 %	25 %	25 %	0 %	18308988
16	NC_003366	ATAA	2	8	7136	7143	75 %	25 %	0 %	0 %	18308989
17	NC_003366	TTAG	2	8	7364	7371	25 %	50 %	25 %	0 %	18308989
18	NC_003366	ACAT	2	8	7727	7734	50 %	25 %	0 %	25 %	18308989
19	NC_003366	TGCT	2	8	8094	8101	0 %	50 %	25 %	25 %	18308989
20	NC_003366	TTAT	2	8	8927	8934	25 %	75 %	0 %	0 %	18308989
21	NC_003366	AAGA	2	8	8989	8996	75 %	0 %	25 %	0 %	18308989
22	NC_003366	TGTA	2	8	9352	9359	25 %	50 %	25 %	0 %	18308989
23	NC_003366	ATAA	2	8	9719	9726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003366	AAAT	2	8	9800	9807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003366	GTGA	2	8	10570	10577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003366	GTTA	2	8	11261	11268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003366	AGAA	2	8	12086	12093	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003366	GCGA	2	8	12115	12122	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_003366	CATT	2	8	12979	12986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_003366	GCTA	2	8	13351	13358	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_003366	AGGT	2	8	13520	13527	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003366	AAAT	2	8	15207	15214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003366	AATT	2	8	15921	15928	50 %	50 %	0 %	0 %	18308992
34	NC_003366	TAAA	2	8	15951	15958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003366	TATT	2	8	16443	16450	25 %	75 %	0 %	0 %	18308993
36	NC_003366	TTTA	2	8	16477	16484	25 %	75 %	0 %	0 %	18308993
37	NC_003366	TATT	2	8	16919	16926	25 %	75 %	0 %	0 %	18308993
38	NC_003366	AGAT	2	8	17416	17423	50 %	25 %	25 %	0 %	18308993
39	NC_003366	ATTT	2	8	17642	17649	25 %	75 %	0 %	0 %	18308993
40	NC_003366	GAAA	2	8	17798	17805	75 %	0 %	25 %	0 %	18308993
41	NC_003366	TGAT	2	8	18042	18049	25 %	50 %	25 %	0 %	18308993
42	NC_003366	TAAT	2	8	18099	18106	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
43	NC_003366	TTTA	2	8	18130	18137	25 %	75 %	0 %	0 %	18308993
44	NC_003366	ATGG	2	8	18506	18513	25 %	25 %	50 %	0 %	18308993
45	NC_003366	ATTT	2	8	18713	18720	25 %	75 %	0 %	0 %	18308993
46	NC_003366	TTCT	2	8	18765	18772	0 %	75 %	0 %	25 %	18308993
47	NC_003366	ATTT	2	8	18927	18934	25 %	75 %	0 %	0 %	18308993
48	NC_003366	TAAA	2	8	18990	18997	75 %	25 %	0 %	0 %	18308993
49	NC_003366	ATTA	2	8	19034	19041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003366	AAAT	2	8	19099	19106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003366	AATA	2	8	19608	19615	75 %	25 %	0 %	0 %	18308994
52	NC_003366	ATTT	2	8	19618	19625	25 %	75 %	0 %	0 %	18308994
53	NC_003366	AAAG	2	8	19677	19684	75 %	0 %	25 %	0 %	18308994
54	NC_003366	TAAA	2	8	20312	20319	75 %	25 %	0 %	0 %	18308994
55	NC_003366	GATT	2	8	20784	20791	25 %	50 %	25 %	0 %	18308995
56	NC_003366	AGTT	2	8	22127	22134	25 %	50 %	25 %	0 %	161485645
57	NC_003366	ATAA	2	8	22598	22605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003366	GATA	2	8	23133	23140	50 %	25 %	25 %	0 %	18308997
59	NC_003366	GCGT	2	8	23327	23334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_003366	TTTA	2	8	23522	23529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003366	TAAT	2	8	23603	23610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003366	TTGT	2	8	23699	23706	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003366	GCGT	2	8	24176	24183	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_003366	AGTA	2	8	24479	24486	50 %	25 %	25 %	0 %	18308999
65	NC_003366	TTAA	2	8	24551	24558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003366	ATGA	2	8	24769	24776	50 %	25 %	25 %	0 %	18309000
67	NC_003366	TATC	2	8	24914	24921	25 %	50 %	0 %	25 %	18309000
68	NC_003366	AAAT	2	8	24943	24950	75 %	25 %	0 %	0 %	18309000
69	NC_003366	ATTT	2	8	25383	25390	25 %	75 %	0 %	0 %	18309000
70	NC_003366	GAAT	2	8	25477	25484	50 %	25 %	25 %	0 %	18309000
71	NC_003366	AAAT	2	8	26094	26101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003366	ATAA	2	8	26191	26198	75 %	25 %	0 %	0 %	18309002
73	NC_003366	AATT	2	8	26213	26220	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
74	NC_003366	GATG	2	8	26677	26684	25 %	25 %	50 %	0 %	18309002
75	NC_003366	AGAT	2	8	27221	27228	50 %	25 %	25 %	0 %	18309002
76	NC_003366	TGGA	2	8	27418	27425	25 %	25 %	50 %	0 %	18309002
77	NC_003366	GAAA	2	8	27563	27570	75 %	0 %	25 %	0 %	18309002
78	NC_003366	GCAG	2	8	27732	27739	25 %	0 %	50 %	25 %	18309002
79	NC_003366	GAAA	2	8	28341	28348	75 %	0 %	25 %	0 %	18309002
80	NC_003366	AGAT	2	8	28743	28750	50 %	25 %	25 %	0 %	18309002
81	NC_003366	CCTT	2	8	28875	28882	0 %	50 %	0 %	50 %	18309002
82	NC_003366	TTTA	2	8	28895	28902	25 %	75 %	0 %	0 %	18309002
83	NC_003366	TAGA	2	8	28913	28920	50 %	25 %	25 %	0 %	18309002
84	NC_003366	TAAA	2	8	28997	29004	75 %	25 %	0 %	0 %	18309002
85	NC_003366	CAAG	2	8	30278	30285	50 %	0 %	25 %	25 %	18309003
86	NC_003366	AGAA	2	8	31143	31150	75 %	0 %	25 %	0 %	18309003
87	NC_003366	TAAA	2	8	31206	31213	75 %	25 %	0 %	0 %	18309003
88	NC_003366	CTTA	2	8	31408	31415	25 %	50 %	0 %	25 %	18309003
89	NC_003366	ATTT	2	8	31795	31802	25 %	75 %	0 %	0 %	18309003
90	NC_003366	ATAA	2	8	31952	31959	75 %	25 %	0 %	0 %	18309003
91	NC_003366	ATTA	2	8	32290	32297	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
92	NC_003366	GGAT	2	8	33205	33212	25 %	25 %	50 %	0 %	18309003
93	NC_003366	ATAA	2	8	33269	33276	75 %	25 %	0 %	0 %	18309003
94	NC_003366	ATTG	2	8	34039	34046	25 %	50 %	25 %	0 %	18309004
95	NC_003366	TTCT	2	8	34370	34377	0 %	75 %	0 %	25 %	18309004
96	NC_003366	GAAA	2	8	35033	35040	75 %	0 %	25 %	0 %	18309005
97	NC_003366	AGAA	2	8	35956	35963	75 %	0 %	25 %	0 %	18309005
98	NC_003366	AAAT	2	8	36204	36211	75 %	25 %	0 %	0 %	18309006
99	NC_003366	TAAT	2	8	37157	37164	50 %	50 %	0 %	0 %	18309006
100	NC_003366	TGCT	2	8	37583	37590	0 %	50 %	25 %	25 %	18309007
101	NC_003366	ATTT	2	8	37628	37635	25 %	75 %	0 %	0 %	18309007
102	NC_003366	TAAA	2	8	38308	38315	75 %	25 %	0 %	0 %	18309007
103	NC_003366	ATTT	2	8	38512	38519	25 %	75 %	0 %	0 %	18309007
104	NC_003366	TAAA	2	8	38631	38638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003366	TAAT	2	8	38662	38669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003366	ATTT	2	8	38699	38706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003366	TTGT	2	8	38906	38913	0 %	75 %	25 %	0 %	18309008
108	NC_003366	TAAT	2	8	39532	39539	50 %	50 %	0 %	0 %	18309008
109	NC_003366	ATTT	2	8	40132	40139	25 %	75 %	0 %	0 %	18309009
110	NC_003366	TTCT	2	8	40372	40379	0 %	75 %	0 %	25 %	18309009
111	NC_003366	ACTA	2	8	40543	40550	50 %	25 %	0 %	25 %	18309009
112	NC_003366	ATTT	2	8	40788	40795	25 %	75 %	0 %	0 %	18309009
113	NC_003366	ATAA	2	8	41200	41207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003366	CTAT	2	8	41373	41380	25 %	50 %	0 %	25 %	18309010
115	NC_003366	TCTT	2	8	41391	41398	0 %	75 %	0 %	25 %	18309010
116	NC_003366	CTTA	2	8	42008	42015	25 %	50 %	0 %	25 %	18309010
117	NC_003366	TAAA	2	8	42288	42295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003366	TAAA	2	8	43667	43674	75 %	25 %	0 %	0 %	18309012
119	NC_003366	CTAC	2	8	43850	43857	25 %	25 %	0 %	50 %	18309012
120	NC_003366	TAGA	2	8	44393	44400	50 %	25 %	25 %	0 %	18309012
121	NC_003366	ATGT	2	8	44667	44674	25 %	50 %	25 %	0 %	18309013
122	NC_003366	GTAA	2	8	44888	44895	50 %	25 %	25 %	0 %	18309013
123	NC_003366	TTAC	2	8	44900	44907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_003366	TACT	2	8	45438	45445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_003366	TAAT	2	8	45465	45472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003366	ATAA	2	8	45542	45549	75 %	25 %	0 %	0 %	18309015
127	NC_003366	ATAA	2	8	45943	45950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003366	GAAG	2	8	46013	46020	50 %	0 %	50 %	0 %	18309016
129	NC_003366	CCTA	2	8	46584	46591	25 %	25 %	0 %	50 %	18309016
130	NC_003366	ATGA	2	8	47510	47517	50 %	25 %	25 %	0 %	18309017
131	NC_003366	TATT	2	8	47586	47593	25 %	75 %	0 %	0 %	18309017
132	NC_003366	TACT	2	8	47773	47780	25 %	50 %	0 %	25 %	18309017
133	NC_003366	TTGA	2	8	48235	48242	25 %	50 %	25 %	0 %	18309017
134	NC_003366	ATTT	2	8	48281	48288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003366	AAAG	2	8	48594	48601	75 %	0 %	25 %	0 %	18309018
136	NC_003366	CATG	2	8	48805	48812	25 %	25 %	25 %	25 %	18309018
137	NC_003366	GAAA	2	8	49142	49149	75 %	0 %	25 %	0 %	18309018
138	NC_003366	TCTT	2	8	49853	49860	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_003366	AATT	2	8	50144	50151	50 %	50 %	0 %	0 %	18309019
140	NC_003366	AATA	2	8	50312	50319	75 %	25 %	0 %	0 %	18309019
141	NC_003366	TAAG	2	8	50515	50522	50 %	25 %	25 %	0 %	18309019
142	NC_003366	AGAA	2	8	50531	50538	75 %	0 %	25 %	0 %	18309019
143	NC_003366	TAAA	2	8	50866	50873	75 %	25 %	0 %	0 %	18309019
144	NC_003366	AAGG	2	8	51445	51452	50 %	0 %	50 %	0 %	18309020
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146	NC_003366	TAAA	2	8	51517	51524	75 %	25 %	0 %	0 %	18309021
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