MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 84639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_003366	AATT	2	8	150372	150379	50 %	50 %	0 %	0 %	18309092
4002	NC_003366	ATC	2	6	150414	150419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309092
4003	NC_003366	TTA	2	6	150437	150442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309092
4004	NC_003366	CAC	2	6	150473	150478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18309092
4005	NC_003366	TA	3	6	150546	150551	50 %	50 %	0 %	0 %	18309092
4006	NC_003366	ACC	2	6	150651	150656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18309092
4007	NC_003366	TACT	2	8	150677	150684	25 %	50 %	0 %	25 %	18309092
4008	NC_003366	TAT	2	6	150702	150707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309092
4009	NC_003366	TTC	2	6	150726	150731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309092
4010	NC_003366	TTG	2	6	150734	150739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309092
4011	NC_003366	CAA	2	6	150782	150787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309092
4012	NC_003366	TCA	3	9	150802	150810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309092
4013	NC_003366	TAAG	2	8	150813	150820	50 %	25 %	25 %	0 %	18309092
4014	NC_003366	TCT	2	6	150898	150903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309092
4015	NC_003366	TGCA	2	8	150912	150919	25 %	25 %	25 %	25 %	18309092
4016	NC_003366	ATC	2	6	150981	150986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309092
4017	NC_003366	TGT	2	6	151017	151022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309092
4018	NC_003366	AT	3	6	151102	151107	50 %	50 %	0 %	0 %	18309092
4019	NC_003366	TGT	2	6	151149	151154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309092
4020	NC_003366	TTC	2	6	151175	151180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309092
4021	NC_003366	CTT	2	6	151316	151321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309092
4022	NC_003366	TTTC	2	8	151344	151351	0 %	75 %	0 %	25 %	18309092
4023	NC_003366	TCA	2	6	151360	151365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309092
4024	NC_003366	AGTA	2	8	151385	151392	50 %	25 %	25 %	0 %	18309092
4025	NC_003366	TTAC	2	8	151411	151418	25 %	50 %	0 %	25 %	18309092
4026	NC_003366	ACA	2	6	151435	151440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309092
4027	NC_003366	GCT	2	6	151477	151482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309092
4028	NC_003366	TTC	2	6	151491	151496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309092
4029	NC_003366	AAG	2	6	151521	151526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309092
4030	NC_003366	CAG	2	6	151529	151534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309092
4031	NC_003366	ACTTTT	2	12	151560	151571	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	18309092
4032	NC_003366	T	6	6	151568	151573	0 %	100 %	0 %	0 %	18309092
4033	NC_003366	TCA	2	6	151642	151647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309092
4034	NC_003366	TAA	2	6	151652	151657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309092
4035	NC_003366	TAACA	2	10	151689	151698	60 %	20 %	0 %	20 %	18309092
4036	NC_003366	A	6	6	151731	151736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_003366	AAC	2	6	151744	151749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_003366	GGT	2	6	151884	151889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309093
4039	NC_003366	TTCTT	2	10	151921	151930	0 %	80 %	0 %	20 %	18309093
4040	NC_003366	TTC	2	6	151946	151951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309093
4041	NC_003366	CAA	2	6	151952	151957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309093
4042	NC_003366	CTT	2	6	151991	151996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309093
4043	NC_003366	TAT	2	6	152000	152005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309093
4044	NC_003366	CAA	2	6	152027	152032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309093
4045	NC_003366	TCA	2	6	152056	152061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_003366	T	6	6	152083	152088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_003366	TATATT	2	12	152132	152143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_003366	T	7	7	152145	152151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_003366	AAG	2	6	152170	152175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_003366	ATC	2	6	152187	152192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_003366	CAA	2	6	152196	152201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_003366	AGA	2	6	152202	152207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_003366	ATTATA	2	12	152211	152222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_003366	TAG	2	6	152256	152261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_003366	ATTT	2	8	152313	152320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_003366	TAAG	2	8	152331	152338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_003366	AAT	2	6	152362	152367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_003366	ATTTT	2	10	152368	152377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_003366	AT	3	6	152444	152449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_003366	GAA	2	6	152484	152489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_003366	AAAT	2	8	152503	152510	75 %	25 %	0 %	0 %	18309094
4062	NC_003366	TAA	2	6	152511	152516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309094
4063	NC_003366	ACA	2	6	152558	152563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309094
4064	NC_003366	AGT	2	6	152584	152589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309094
4065	NC_003366	ATG	2	6	152658	152663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309094
4066	NC_003366	AG	3	6	152696	152701	50 %	0 %	50 %	0 %	18309094
4067	NC_003366	TAG	2	6	152721	152726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309094
4068	NC_003366	AAT	2	6	152804	152809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309094
4069	NC_003366	ATT	2	6	152876	152881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309094
4070	NC_003366	TTC	2	6	152928	152933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309094
4071	NC_003366	CAAGA	2	10	152988	152997	60 %	0 %	20 %	20 %	18309094
4072	NC_003366	AAT	2	6	153011	153016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309094
4073	NC_003366	AGA	2	6	153091	153096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309094
4074	NC_003366	ATA	2	6	153147	153152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309094
4075	NC_003366	GATTA	2	10	153234	153243	40 %	40 %	20 %	0 %	18309094
4076	NC_003366	TAA	2	6	153277	153282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309094
4077	NC_003366	AAAG	2	8	153320	153327	75 %	0 %	25 %	0 %	18309094
4078	NC_003366	TAGA	2	8	153336	153343	50 %	25 %	25 %	0 %	18309094
4079	NC_003366	TAAA	2	8	153348	153355	75 %	25 %	0 %	0 %	18309094
4080	NC_003366	A	6	6	153379	153384	100 %	0 %	0 %	0 %	18309094
4081	NC_003366	TGGAGA	2	12	153403	153414	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	18309094
4082	NC_003366	ATA	2	6	153477	153482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309094
4083	NC_003366	TGA	2	6	153499	153504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309094
4084	NC_003366	TAA	2	6	153520	153525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309094
4085	NC_003366	ATA	2	6	153537	153542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309094
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4087	NC_003366	GAAA	2	8	153577	153584	75 %	0 %	25 %	0 %	18309094
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4089	NC_003366	TAA	2	6	153679	153684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309094
4090	NC_003366	A	6	6	153724	153729	100 %	0 %	0 %	0 %	18309094
4091	NC_003366	TAA	2	6	153739	153744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309094
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4093	NC_003366	AAT	2	6	153767	153772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309094
4094	NC_003366	AAATAA	2	12	153775	153786	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	18309094
4095	NC_003366	TAA	2	6	153799	153804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309094
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4097	NC_003366	TGG	2	6	153898	153903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309094
4098	NC_003366	TA	3	6	153962	153967	50 %	50 %	0 %	0 %	18309094
4099	NC_003366	GAA	2	6	153979	153984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309094
4100	NC_003366	ATG	2	6	153996	154001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309094
4101	NC_003366	AG	3	6	154010	154015	50 %	0 %	50 %	0 %	18309094
4102	NC_003366	TGA	2	6	154048	154053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309094
4103	NC_003366	A	6	6	154059	154064	100 %	0 %	0 %	0 %	18309094
4104	NC_003366	TAT	2	6	154086	154091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_003366	A	7	7	154118	154124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_003366	TTA	2	6	154130	154135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_003366	T	9	9	154139	154147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_003366	ATT	2	6	154148	154153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_003366	ACA	2	6	154156	154161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_003366	TA	3	6	154184	154189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_003366	GAT	2	6	154266	154271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309095
4112	NC_003366	ATC	2	6	154373	154378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309095
4113	NC_003366	AGA	2	6	154400	154405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309095
4114	NC_003366	TGA	2	6	154421	154426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309095
4115	NC_003366	AAT	2	6	154432	154437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309095
4116	NC_003366	TAA	2	6	154439	154444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_003366	GTA	2	6	154472	154477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_003366	A	7	7	154481	154487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_003366	AG	3	6	154531	154536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_003366	AGA	2	6	154649	154654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_003366	AGA	2	6	154661	154666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_003366	ATA	2	6	154681	154686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_003366	GGA	2	6	154762	154767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18309096
4124	NC_003366	GAA	2	6	154816	154821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309096
4125	NC_003366	A	6	6	154838	154843	100 %	0 %	0 %	0 %	18309096
4126	NC_003366	AT	3	6	154856	154861	50 %	50 %	0 %	0 %	18309096
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4128	NC_003366	ACA	2	6	154918	154923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309096
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