MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 84639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_003366	GCA	2	6	134696	134701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309079
3503	NC_003366	TAC	2	6	134710	134715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309079
3504	NC_003366	TGG	2	6	134734	134739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309079
3505	NC_003366	GA	3	6	134752	134757	50 %	0 %	50 %	0 %	18309079
3506	NC_003366	AGAA	2	8	134767	134774	75 %	0 %	25 %	0 %	18309079
3507	NC_003366	TGA	2	6	134775	134780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309079
3508	NC_003366	TAA	3	9	134832	134840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309079
3509	NC_003366	TTAA	2	8	134888	134895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_003366	A	6	6	134904	134909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_003366	TAA	2	6	134920	134925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_003366	TA	3	6	134951	134956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_003366	AT	4	8	134962	134969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_003366	TTAA	2	8	134995	135002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_003366	ATTT	2	8	135014	135021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_003366	AAC	2	6	135075	135080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_003366	ACA	2	6	135089	135094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_003366	TAAT	2	8	135097	135104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_003366	AAAT	2	8	135105	135112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_003366	T	7	7	135136	135142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_003366	AAAAAT	2	12	135167	135178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_003366	TA	3	6	135185	135190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_003366	A	6	6	135194	135199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_003366	AAT	2	6	135310	135315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309080
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3526	NC_003366	AT	3	6	135360	135365	50 %	50 %	0 %	0 %	18309080
3527	NC_003366	TTA	2	6	135371	135376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309080
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3532	NC_003366	T	6	6	135548	135553	0 %	100 %	0 %	0 %	18309080
3533	NC_003366	TTA	2	6	135578	135583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309080
3534	NC_003366	TCA	2	6	135587	135592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309080
3535	NC_003366	TAT	2	6	135648	135653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_003366	ACT	2	6	135723	135728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_003366	CAA	2	6	135804	135809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_003366	AT	3	6	135821	135826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_003366	ATAA	2	8	135837	135844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_003366	ATA	2	6	135874	135879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_003366	ATTT	2	8	135881	135888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_003366	ATA	2	6	135891	135896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_003366	TTA	2	6	135904	135909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_003366	TAA	2	6	135931	135936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_003366	AAG	2	6	135987	135992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_003366	GCAA	2	8	136073	136080	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3547	NC_003366	G	6	6	136132	136137	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_003366	CAT	2	6	136147	136152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_003366	GAG	2	6	136176	136181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_003366	CAA	2	6	136212	136217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309081
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3553	NC_003366	AAG	2	6	136401	136406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309081
3554	NC_003366	GAAAT	2	10	136433	136442	60 %	20 %	20 %	0 %	18309081
3555	NC_003366	TGG	2	6	136462	136467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309081
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3557	NC_003366	CAA	2	6	136527	136532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309081
3558	NC_003366	AGC	2	6	136534	136539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309081
3559	NC_003366	CAG	2	6	136563	136568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309081
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3561	NC_003366	AGA	2	6	136579	136584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309081
3562	NC_003366	TGA	2	6	136594	136599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309081
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3564	NC_003366	GTT	2	6	136628	136633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309081
3565	NC_003366	TAG	2	6	136635	136640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309081
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3572	NC_003366	TAG	2	6	136917	136922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309081
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3590	NC_003366	GTG	3	9	137491	137499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309082
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3593	NC_003366	GTG	2	6	137662	137667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309082
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3598	NC_003366	AGA	2	6	137852	137857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309082
3599	NC_003366	GCT	2	6	137880	137885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309082
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3604	NC_003366	TATT	2	8	138147	138154	25 %	75 %	0 %	0 %	18309082
3605	NC_003366	AAC	2	6	138156	138161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309082
3606	NC_003366	AAT	2	6	138260	138265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309082
3607	NC_003366	TGA	2	6	138272	138277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309082
3608	NC_003366	ATGA	2	8	138345	138352	50 %	25 %	25 %	0 %	18309082
3609	NC_003366	GAA	2	6	138357	138362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309082
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3612	NC_003366	TAA	2	6	138490	138495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309082
3613	NC_003366	AG	3	6	138588	138593	50 %	0 %	50 %	0 %	18309082
3614	NC_003366	AT	3	6	138601	138606	50 %	50 %	0 %	0 %	18309082
3615	NC_003366	TAGAAA	2	12	138607	138618	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	18309082
3616	NC_003366	AT	3	6	138625	138630	50 %	50 %	0 %	0 %	18309082
3617	NC_003366	TGG	2	6	138674	138679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309082
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3621	NC_003366	A	6	6	138799	138804	100 %	0 %	0 %	0 %	18309082
3622	NC_003366	GAA	2	6	138900	138905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309082
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