MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 84639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_003366	TA	3	6	114047	114052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_003366	TA	3	6	114059	114064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_003366	ATA	2	6	114072	114077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_003366	TA	3	6	114164	114169	50 %	50 %	0 %	0 %	18309062
3005	NC_003366	TTG	2	6	114174	114179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309062
3006	NC_003366	ATGT	2	8	114180	114187	25 %	50 %	25 %	0 %	18309062
3007	NC_003366	GAT	3	9	114218	114226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309062
3008	NC_003366	TAT	2	6	114235	114240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309062
3009	NC_003366	AAT	2	6	114260	114265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309062
3010	NC_003366	A	6	6	114274	114279	100 %	0 %	0 %	0 %	18309062
3011	NC_003366	TA	3	6	114308	114313	50 %	50 %	0 %	0 %	18309062
3012	NC_003366	A	7	7	114320	114326	100 %	0 %	0 %	0 %	18309062
3013	NC_003366	ATA	2	6	114347	114352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_003366	T	6	6	114356	114361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_003366	ATAA	2	8	114364	114371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_003366	TA	3	6	114381	114386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_003366	GTAC	2	8	114420	114427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_003366	TAAA	2	8	114453	114460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_003366	ATT	2	6	114461	114466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_003366	ATA	2	6	114492	114497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_003366	AAG	2	6	114531	114536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_003366	T	6	6	114578	114583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_003366	GAA	2	6	114588	114593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309063
3024	NC_003366	GTT	2	6	114598	114603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309063
3025	NC_003366	AGCA	2	8	114704	114711	50 %	0 %	25 %	25 %	18309063
3026	NC_003366	TAGA	2	8	114716	114723	50 %	25 %	25 %	0 %	18309063
3027	NC_003366	TGA	2	6	114771	114776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309063
3028	NC_003366	TAA	3	9	114830	114838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309063
3029	NC_003366	ATG	2	6	114920	114925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309063
3030	NC_003366	GCT	2	6	114934	114939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309063
3031	NC_003366	TA	3	6	114988	114993	50 %	50 %	0 %	0 %	18309063
3032	NC_003366	GGA	2	6	115015	115020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18309063
3033	NC_003366	ATC	2	6	115143	115148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309063
3034	NC_003366	AGC	2	6	115251	115256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309063
3035	NC_003366	AAT	2	6	115281	115286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309063
3036	NC_003366	ACT	2	6	115301	115306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309063
3037	NC_003366	GTT	2	6	115354	115359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309063
3038	NC_003366	GGA	2	6	115366	115371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18309063
3039	NC_003366	GTT	2	6	115390	115395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309063
3040	NC_003366	AAG	2	6	115409	115414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309063
3041	NC_003366	CTG	2	6	115466	115471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309063
3042	NC_003366	ATT	2	6	115515	115520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309063
3043	NC_003366	ATA	2	6	115530	115535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309063
3044	NC_003366	TA	3	6	115540	115545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_003366	T	6	6	115577	115582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_003366	AT	3	6	115583	115588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_003366	AAT	2	6	115652	115657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_003366	A	7	7	115668	115674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_003366	ATT	2	6	115747	115752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_003366	TA	3	6	115763	115768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_003366	TA	3	6	115776	115781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_003366	CTATA	2	10	115807	115816	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3053	NC_003366	TA	3	6	115844	115849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_003366	A	7	7	115898	115904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_003366	ATA	2	6	115935	115940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_003366	ATT	3	9	115941	115949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_003366	ATA	3	9	115952	115960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_003366	TGA	2	6	115970	115975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_003366	CAA	2	6	115986	115991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_003366	TAAA	2	8	116001	116008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_003366	TTGT	2	8	116046	116053	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_003366	AGG	2	6	116059	116064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_003366	A	6	6	116077	116082	100 %	0 %	0 %	0 %	18309064
3064	NC_003366	TTTG	2	8	116083	116090	0 %	75 %	25 %	0 %	18309064
3065	NC_003366	AAT	2	6	116241	116246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309064
3066	NC_003366	GAA	2	6	116371	116376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309064
3067	NC_003366	GCT	2	6	116386	116391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309064
3068	NC_003366	CAAG	2	8	116446	116453	50 %	0 %	25 %	25 %	18309064
3069	NC_003366	A	6	6	116485	116490	100 %	0 %	0 %	0 %	18309064
3070	NC_003366	ATT	2	6	116592	116597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309064
3071	NC_003366	TTA	2	6	116663	116668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_003366	T	6	6	116714	116719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_003366	TA	3	6	116743	116748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_003366	ATT	2	6	116749	116754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_003366	AAT	2	6	116780	116785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_003366	TATTTT	2	12	116827	116838	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_003366	ATA	2	6	116845	116850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_003366	GAT	2	6	116868	116873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_003366	AT	3	6	116955	116960	50 %	50 %	0 %	0 %	18309065
3080	NC_003366	TTA	2	6	117057	117062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309065
3081	NC_003366	GAAA	2	8	117064	117071	75 %	0 %	25 %	0 %	18309065
3082	NC_003366	TAA	2	6	117139	117144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309065
3083	NC_003366	GAA	2	6	117168	117173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309065
3084	NC_003366	GGAA	2	8	117209	117216	50 %	0 %	50 %	0 %	18309065
3085	NC_003366	ATG	2	6	117241	117246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309065
3086	NC_003366	GAT	2	6	117351	117356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309065
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3088	NC_003366	TG	3	6	117406	117411	0 %	50 %	50 %	0 %	18309065
3089	NC_003366	ATA	2	6	117459	117464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309065
3090	NC_003366	TCA	2	6	117479	117484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309065
3091	NC_003366	GAATG	2	10	117504	117513	40 %	20 %	40 %	0 %	18309065
3092	NC_003366	ATAA	2	8	117565	117572	75 %	25 %	0 %	0 %	18309065
3093	NC_003366	AAG	2	6	117576	117581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_003366	AAT	2	6	117586	117591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_003366	TAG	2	6	117627	117632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_003366	CTT	2	6	117681	117686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_003366	T	7	7	117926	117932	0 %	100 %	0 %	0 %	18309066
3098	NC_003366	ATT	2	6	117967	117972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309066
3099	NC_003366	AT	3	6	117989	117994	50 %	50 %	0 %	0 %	18309066
3100	NC_003366	TCA	2	6	117995	118000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309066
3101	NC_003366	TGAT	2	8	118078	118085	25 %	50 %	25 %	0 %	18309066
3102	NC_003366	TTC	2	6	118141	118146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309066
3103	NC_003366	TAG	2	6	118149	118154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309066
3104	NC_003366	ATTT	2	8	118203	118210	25 %	75 %	0 %	0 %	18309066
3105	NC_003366	AT	3	6	118227	118232	50 %	50 %	0 %	0 %	18309066
3106	NC_003366	T	6	6	118363	118368	0 %	100 %	0 %	0 %	18309066
3107	NC_003366	ATA	2	6	118385	118390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309066
3108	NC_003366	TGT	3	9	118396	118404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309066
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3110	NC_003366	TTTC	2	8	118493	118500	0 %	75 %	0 %	25 %	18309066
3111	NC_003366	CCA	2	6	118541	118546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18309066
3112	NC_003366	T	7	7	118552	118558	0 %	100 %	0 %	0 %	18309066
3113	NC_003366	CTT	2	6	118592	118597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309066
3114	NC_003366	T	6	6	118604	118609	0 %	100 %	0 %	0 %	18309066
3115	NC_003366	TAA	2	6	118659	118664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309066
3116	NC_003366	CTA	2	6	118674	118679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309066
3117	NC_003366	AAT	2	6	118732	118737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_003366	AT	3	6	118783	118788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_003366	A	6	6	118834	118839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_003366	AAG	2	6	118844	118849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_003366	CAA	2	6	118938	118943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_003366	TAT	2	6	118976	118981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_003366	AT	3	6	119020	119025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_003366	GTA	2	6	119069	119074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_003366	AT	3	6	119076	119081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_003366	TAT	2	6	119115	119120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_003366	AAAC	2	8	119134	119141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_003366	TAT	2	6	119197	119202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309067
3129	NC_003366	TAT	2	6	119212	119217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309067
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3131	NC_003366	AAAT	2	8	119376	119383	75 %	25 %	0 %	0 %	18309067
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