MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 84639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_003366	A	6	6	37667	37672	100 %	0 %	0 %	0 %	18309007
1003	NC_003366	TTG	2	6	37687	37692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309007
1004	NC_003366	ATG	2	6	37699	37704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309007
1005	NC_003366	TAA	2	6	37786	37791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309007
1006	NC_003366	ACT	2	6	37803	37808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309007
1007	NC_003366	TGA	2	6	37820	37825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309007
1008	NC_003366	TAA	2	6	37867	37872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309007
1009	NC_003366	GAA	2	6	37923	37928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309007
1010	NC_003366	TGG	2	6	37994	37999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18309007
1011	NC_003366	TGC	2	6	38033	38038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309007
1012	NC_003366	ATA	2	6	38055	38060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309007
1013	NC_003366	A	6	6	38161	38166	100 %	0 %	0 %	0 %	18309007
1014	NC_003366	TTA	2	6	38193	38198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309007
1015	NC_003366	A	6	6	38218	38223	100 %	0 %	0 %	0 %	18309007
1016	NC_003366	TAA	2	6	38239	38244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309007
1017	NC_003366	AAG	2	6	38257	38262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309007
1018	NC_003366	AGAAA	2	10	38274	38283	80 %	0 %	20 %	0 %	18309007
1019	NC_003366	TAAA	2	8	38308	38315	75 %	25 %	0 %	0 %	18309007
1020	NC_003366	ACATGA	2	12	38359	38370	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	18309007
1021	NC_003366	CTG	2	6	38407	38412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309007
1022	NC_003366	AGG	2	6	38462	38467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18309007
1023	NC_003366	ATTT	2	8	38512	38519	25 %	75 %	0 %	0 %	18309007
1024	NC_003366	AT	4	8	38552	38559	50 %	50 %	0 %	0 %	18309007
1025	NC_003366	ATA	2	6	38601	38606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309007
1026	NC_003366	TAAA	2	8	38631	38638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_003366	AT	3	6	38651	38656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_003366	TAAT	2	8	38662	38669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_003366	AT	3	6	38674	38679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_003366	T	6	6	38693	38698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_003366	ATTT	2	8	38699	38706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_003366	TAA	2	6	38707	38712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_003366	TAA	2	6	38717	38722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_003366	TTA	2	6	38730	38735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309008
1035	NC_003366	AGA	2	6	38759	38764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309008
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1037	NC_003366	TA	3	6	38808	38813	50 %	50 %	0 %	0 %	18309008
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1039	NC_003366	T	7	7	38967	38973	0 %	100 %	0 %	0 %	18309008
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1042	NC_003366	GCT	3	9	39058	39066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18309008
1043	NC_003366	TTC	2	6	39077	39082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309008
1044	NC_003366	TCT	2	6	39145	39150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309008
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1047	NC_003366	CTA	2	6	39248	39253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309008
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1049	NC_003366	CT	3	6	39291	39296	0 %	50 %	0 %	50 %	18309008
1050	NC_003366	TAT	2	6	39311	39316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309008
1051	NC_003366	TGA	2	6	39333	39338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309008
1052	NC_003366	TTC	2	6	39378	39383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309008
1053	NC_003366	CAA	2	6	39392	39397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309008
1054	NC_003366	TTG	2	6	39419	39424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309008
1055	NC_003366	TAT	2	6	39449	39454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309008
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1057	NC_003366	TAT	2	6	39503	39508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309008
1058	NC_003366	TAAT	2	8	39532	39539	50 %	50 %	0 %	0 %	18309008
1059	NC_003366	T	6	6	39600	39605	0 %	100 %	0 %	0 %	18309008
1060	NC_003366	TCC	2	6	39618	39623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_003366	A	6	6	39667	39672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_003366	TA	3	6	39682	39687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_003366	TAA	3	9	39717	39725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_003366	GAA	2	6	39738	39743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_003366	TTA	2	6	39760	39765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_003366	AT	3	6	39770	39775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_003366	GGT	2	6	39800	39805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_003366	AGT	2	6	39821	39826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_003366	CGC	2	6	39865	39870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1071	NC_003366	TA	3	6	39916	39921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_003366	A	8	8	39937	39944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_003366	AAT	2	6	39958	39963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_003366	TCA	2	6	39981	39986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_003366	ATA	2	6	40023	40028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_003366	TAT	2	6	40877	40882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309009
1102	NC_003366	TGT	2	6	40926	40931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309009
1103	NC_003366	A	7	7	40977	40983	100 %	0 %	0 %	0 %	18309009
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1109	NC_003366	ATC	2	6	41082	41087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309009
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1111	NC_003366	A	6	6	41143	41148	100 %	0 %	0 %	0 %	18309009
1112	NC_003366	AGA	2	6	41157	41162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309009
1113	NC_003366	A	6	6	41168	41173	100 %	0 %	0 %	0 %	18309009
1114	NC_003366	TAA	2	6	41174	41179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309009
1115	NC_003366	T	6	6	41187	41192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_003366	ATAA	2	8	41200	41207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_003366	TAAATT	2	12	41225	41236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_003366	A	6	6	41257	41262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_003366	ATT	2	6	41271	41276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_003366	AAT	2	6	41279	41284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_003366	CTAT	2	8	41373	41380	25 %	50 %	0 %	25 %	18309010
1122	NC_003366	TCTT	2	8	41391	41398	0 %	75 %	0 %	25 %	18309010
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1126	NC_003366	T	6	6	41464	41469	0 %	100 %	0 %	0 %	18309010
1127	NC_003366	GAA	2	6	41524	41529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309010
1128	NC_003366	ATT	2	6	41597	41602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309010
1129	NC_003366	AAT	2	6	41623	41628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309010
1130	NC_003366	TTC	2	6	41738	41743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309010
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