MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 84639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003366	ACTAT	2	10	19886	19895	40 %	40 %	0 %	20 %	18308994
502	NC_003366	A	7	7	19919	19925	100 %	0 %	0 %	0 %	18308994
503	NC_003366	TAT	2	6	19946	19951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308994
504	NC_003366	ATG	2	6	19955	19960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308994
505	NC_003366	A	6	6	19970	19975	100 %	0 %	0 %	0 %	18308994
506	NC_003366	GTT	2	6	19987	19992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18308994
507	NC_003366	A	6	6	19998	20003	100 %	0 %	0 %	0 %	18308994
508	NC_003366	AAT	2	6	20068	20073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308994
509	NC_003366	TAG	2	6	20127	20132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308994
510	NC_003366	GAT	2	6	20188	20193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308994
511	NC_003366	A	6	6	20199	20204	100 %	0 %	0 %	0 %	18308994
512	NC_003366	AT	3	6	20211	20216	50 %	50 %	0 %	0 %	18308994
513	NC_003366	ATA	2	6	20272	20277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308994
514	NC_003366	ATA	2	6	20287	20292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308994
515	NC_003366	TAAAT	2	10	20295	20304	60 %	40 %	0 %	0 %	18308994
516	NC_003366	TAAA	2	8	20312	20319	75 %	25 %	0 %	0 %	18308994
517	NC_003366	AAG	2	6	20334	20339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308994
518	NC_003366	GAG	2	6	20371	20376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18308994
519	NC_003366	AGA	2	6	20506	20511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308994
520	NC_003366	ATA	2	6	20560	20565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308994
521	NC_003366	AT	3	6	20567	20572	50 %	50 %	0 %	0 %	18308994
522	NC_003366	AG	3	6	20578	20583	50 %	0 %	50 %	0 %	18308994
523	NC_003366	A	7	7	20588	20594	100 %	0 %	0 %	0 %	18308994
524	NC_003366	GGT	2	6	20674	20679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_003366	AT	3	6	20693	20698	50 %	50 %	0 %	0 %	18308995
526	NC_003366	A	6	6	20728	20733	100 %	0 %	0 %	0 %	18308995
527	NC_003366	TAA	2	6	20757	20762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308995
528	NC_003366	GATT	2	8	20784	20791	25 %	50 %	25 %	0 %	18308995
529	NC_003366	A	6	6	20892	20897	100 %	0 %	0 %	0 %	18308995
530	NC_003366	T	6	6	20947	20952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_003366	AT	3	6	20953	20958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_003366	TAA	3	9	20970	20978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_003366	TA	3	6	21002	21007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_003366	AG	3	6	21016	21021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_003366	TGA	2	6	21080	21085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_003366	T	7	7	21129	21135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_003366	T	6	6	21201	21206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_003366	AT	3	6	21207	21212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_003366	T	7	7	21212	21218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_003366	TAA	2	6	21222	21227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_003366	TAAATA	2	12	21233	21244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_003366	A	6	6	21279	21284	100 %	0 %	0 %	0 %	161485645
543	NC_003366	AAG	2	6	21288	21293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485645
544	NC_003366	GAA	2	6	21301	21306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485645
545	NC_003366	A	6	6	21310	21315	100 %	0 %	0 %	0 %	161485645
546	NC_003366	GAA	2	6	21379	21384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485645
547	NC_003366	AGA	2	6	21385	21390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485645
548	NC_003366	A	7	7	21459	21465	100 %	0 %	0 %	0 %	161485645
549	NC_003366	GA	3	6	21501	21506	50 %	0 %	50 %	0 %	161485645
550	NC_003366	ATAAA	2	10	21515	21524	80 %	20 %	0 %	0 %	161485645
551	NC_003366	TGA	2	6	21528	21533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161485645
552	NC_003366	TGA	2	6	21624	21629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161485645
553	NC_003366	CTA	2	6	21662	21667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161485645
554	NC_003366	AG	3	6	21792	21797	50 %	0 %	50 %	0 %	161485645
555	NC_003366	TAA	2	6	21803	21808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161485645
556	NC_003366	ACT	2	6	21809	21814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161485645
557	NC_003366	AC	3	6	21825	21830	50 %	0 %	0 %	50 %	161485645
558	NC_003366	ACC	2	6	21858	21863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161485645
559	NC_003366	ACTGGT	2	12	21889	21900	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161485645
560	NC_003366	GAA	2	6	21916	21921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485645
561	NC_003366	TGC	2	6	22035	22040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485645
562	NC_003366	CAG	2	6	22073	22078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161485645
563	NC_003366	ACA	2	6	22104	22109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161485645
564	NC_003366	TAA	2	6	22116	22121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161485645
565	NC_003366	AGTT	2	8	22127	22134	25 %	50 %	25 %	0 %	161485645
566	NC_003366	GAA	2	6	22162	22167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485645
567	NC_003366	CTG	2	6	22262	22267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485645
568	NC_003366	GTT	2	6	22328	22333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161485645
569	NC_003366	AGA	2	6	22357	22362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485645
570	NC_003366	GAA	2	6	22442	22447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161485645
571	NC_003366	GCT	2	6	22453	22458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485645
572	NC_003366	CAA	2	6	22474	22479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161485645
573	NC_003366	AGT	2	6	22491	22496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161485645
574	NC_003366	AT	3	6	22518	22523	50 %	50 %	0 %	0 %	161485645
575	NC_003366	ATA	2	6	22542	22547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161485645
576	NC_003366	AGA	2	6	22559	22564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_003366	AT	3	6	22566	22571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_003366	TA	3	6	22587	22592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_003366	ATAA	2	8	22598	22605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_003366	A	6	6	22621	22626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_003366	T	8	8	22644	22651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_003366	A	6	6	22663	22668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_003366	ATT	2	6	22716	22721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_003366	CTG	2	6	22840	22845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18308997
585	NC_003366	GAA	2	6	22863	22868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308997
586	NC_003366	AT	3	6	22886	22891	50 %	50 %	0 %	0 %	18308997
587	NC_003366	TGA	2	6	22904	22909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308997
588	NC_003366	AGA	2	6	22913	22918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308997
589	NC_003366	A	7	7	22937	22943	100 %	0 %	0 %	0 %	18308997
590	NC_003366	AGACA	2	10	22988	22997	60 %	0 %	20 %	20 %	18308997
591	NC_003366	A	6	6	23043	23048	100 %	0 %	0 %	0 %	18308997
592	NC_003366	AAT	2	6	23055	23060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308997
593	NC_003366	GATA	2	8	23133	23140	50 %	25 %	25 %	0 %	18308997
594	NC_003366	TA	3	6	23172	23177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_003366	TTTTAT	2	12	23210	23221	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_003366	T	7	7	23221	23227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_003366	A	7	7	23230	23236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_003366	ATA	2	6	23264	23269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_003366	GA	3	6	23284	23289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_003366	GCGT	2	8	23327	23334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
601	NC_003366	TC	3	6	23363	23368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_003366	T	8	8	23374	23381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_003366	A	6	6	23384	23389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_003366	TTTA	2	8	23522	23529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_003366	TAAAA	2	10	23539	23548	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_003366	AAT	2	6	23549	23554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_003366	CTT	2	6	23593	23598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_003366	TAAT	2	8	23603	23610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_003366	A	6	6	23618	23623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_003366	TTA	2	6	23651	23656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_003366	ATA	2	6	23688	23693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_003366	TTGT	2	8	23699	23706	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_003366	TAATT	2	10	23720	23729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_003366	GAG	2	6	23746	23751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_003366	ATC	2	6	23765	23770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18308998
616	NC_003366	A	6	6	23787	23792	100 %	0 %	0 %	0 %	18308998
617	NC_003366	AGT	2	6	23838	23843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308998
618	NC_003366	GCA	2	6	23850	23855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18308998
619	NC_003366	T	6	6	23862	23867	0 %	100 %	0 %	0 %	18308998
620	NC_003366	TAT	2	6	23897	23902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308998
621	NC_003366	ATA	2	6	23961	23966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308998
622	NC_003366	TAT	2	6	23995	24000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308998
623	NC_003366	ATT	2	6	24023	24028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308998
624	NC_003366	A	6	6	24032	24037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_003366	A	6	6	24054	24059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_003366	T	7	7	24067	24073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_003366	A	7	7	24076	24082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_003366	AAAATG	2	12	24095	24106	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_003366	ATA	3	9	24109	24117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_003366	GA	3	6	24133	24138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_003366	GCGT	2	8	24176	24183	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
632	NC_003366	TC	3	6	24212	24217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_003366	T	8	8	24343	24350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_003366	TAA	2	6	24400	24405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308999
635	NC_003366	CTT	2	6	24451	24456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18308999
636	NC_003366	A	6	6	24470	24475	100 %	0 %	0 %	0 %	18308999
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638	NC_003366	AT	3	6	24487	24492	50 %	50 %	0 %	0 %	18308999
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