MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 84639

< Previous12...158159160161162163164165166167168169170Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
84501	NC_003366	TATCTT	2	12	3026035	3026046	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	18311636
84502	NC_003366	TCT	2	6	3026064	3026069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311636
84503	NC_003366	TCTA	2	8	3026198	3026205	25 %	50 %	0 %	25 %	18311636
84504	NC_003366	TAT	2	6	3026231	3026236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311636
84505	NC_003366	GTT	2	6	3026251	3026256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18311636
84506	NC_003366	TCT	2	6	3026318	3026323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311636
84507	NC_003366	TAAC	2	8	3026397	3026404	50 %	25 %	0 %	25 %	18311636
84508	NC_003366	ATT	3	9	3026412	3026420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311636
84509	NC_003366	A	6	6	3026468	3026473	100 %	0 %	0 %	0 %	18311636
84510	NC_003366	TTAG	2	8	3026484	3026491	25 %	50 %	25 %	0 %	18311636
84511	NC_003366	TTCT	2	8	3026584	3026591	0 %	75 %	0 %	25 %	18311636
84512	NC_003366	AG	3	6	3026622	3026627	50 %	0 %	50 %	0 %	18311636
84513	NC_003366	CAG	2	6	3026632	3026637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18311636
84514	NC_003366	CAT	2	6	3026771	3026776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311636
84515	NC_003366	TAATGT	2	12	3026789	3026800	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	18311636
84516	NC_003366	AAC	2	6	3026873	3026878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311636
84517	NC_003366	TCA	2	6	3026912	3026917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84518	NC_003366	CAA	2	6	3026933	3026938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311637
84519	NC_003366	ATT	3	9	3027049	3027057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311637
84520	NC_003366	TA	3	6	3027096	3027101	50 %	50 %	0 %	0 %	18311637
84521	NC_003366	ATC	2	6	3027190	3027195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311637
84522	NC_003366	TATTT	2	10	3027226	3027235	20 %	80 %	0 %	0 %	18311637
84523	NC_003366	TCTA	2	8	3027268	3027275	25 %	50 %	0 %	25 %	18311637
84524	NC_003366	T	6	6	3027399	3027404	0 %	100 %	0 %	0 %	18311637
84525	NC_003366	ACA	2	6	3027434	3027439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311637
84526	NC_003366	CTA	2	6	3027468	3027473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311637
84527	NC_003366	TA	3	6	3027499	3027504	50 %	50 %	0 %	0 %	18311637
84528	NC_003366	TTC	2	6	3027505	3027510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311637
84529	NC_003366	TTG	2	6	3027522	3027527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18311637
84530	NC_003366	CT	3	6	3027552	3027557	0 %	50 %	0 %	50 %	18311637
84531	NC_003366	TGA	2	6	3027583	3027588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311637
84532	NC_003366	CTA	2	6	3027609	3027614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311637
84533	NC_003366	TAA	2	6	3027636	3027641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311637
84534	NC_003366	TCA	2	6	3027650	3027655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311637
84535	NC_003366	AATTA	2	10	3027664	3027673	60 %	40 %	0 %	0 %	18311637
84536	NC_003366	TTTAC	2	10	3027674	3027683	20 %	60 %	0 %	20 %	18311637
84537	NC_003366	TTC	2	6	3027736	3027741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311637
84538	NC_003366	AT	3	6	3027783	3027788	50 %	50 %	0 %	0 %	18311637
84539	NC_003366	TTA	2	6	3027882	3027887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311637
84540	NC_003366	TTC	2	6	3027921	3027926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311637
84541	NC_003366	A	6	6	3027932	3027937	100 %	0 %	0 %	0 %	18311637
84542	NC_003366	TTA	2	6	3027984	3027989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311637
84543	NC_003366	TAG	2	6	3028008	3028013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311637
84544	NC_003366	ACC	2	6	3028021	3028026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18311637
84545	NC_003366	ACTA	2	8	3028084	3028091	50 %	25 %	0 %	25 %	18311637
84546	NC_003366	ATT	2	6	3028111	3028116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311637
84547	NC_003366	TAA	2	6	3028162	3028167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311637
84548	NC_003366	TTTA	2	8	3028195	3028202	25 %	75 %	0 %	0 %	18311637
84549	NC_003366	AGC	2	6	3028273	3028278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18311637
84550	NC_003366	CTC	2	6	3028303	3028308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84551	NC_003366	CAA	2	6	3028353	3028358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84552	NC_003366	ATT	2	6	3028387	3028392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84553	NC_003366	A	7	7	3028399	3028405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84554	NC_003366	TTAC	2	8	3028433	3028440	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84555	NC_003366	AATT	2	8	3028456	3028463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84556	NC_003366	A	7	7	3028480	3028486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84557	NC_003366	ATA	2	6	3028499	3028504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84558	NC_003366	T	6	6	3028516	3028521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84559	NC_003366	CAA	2	6	3028530	3028535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84560	NC_003366	ACT	2	6	3028553	3028558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84561	NC_003366	A	7	7	3028612	3028618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84562	NC_003366	CTA	2	6	3028655	3028660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311638
84563	NC_003366	TTC	2	6	3028677	3028682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311638
84564	NC_003366	ATT	2	6	3028710	3028715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311638
84565	NC_003366	TGAA	2	8	3028725	3028732	50 %	25 %	25 %	0 %	18311638
84566	NC_003366	CTT	2	6	3028738	3028743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311638
84567	NC_003366	TTA	2	6	3028807	3028812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311638
84568	NC_003366	TCT	2	6	3028831	3028836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311638
84569	NC_003366	TTA	2	6	3028897	3028902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311638
84570	NC_003366	AACTA	2	10	3028905	3028914	60 %	20 %	0 %	20 %	18311638
84571	NC_003366	C	6	6	3028943	3028948	0 %	0 %	0 %	100 %	18311638
84572	NC_003366	ATG	2	6	3028957	3028962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311638
84573	NC_003366	TTC	2	6	3029010	3029015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311638
84574	NC_003366	AAG	2	6	3029140	3029145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18311638
84575	NC_003366	CTTC	2	8	3029152	3029159	0 %	50 %	0 %	50 %	18311638
84576	NC_003366	TCT	2	6	3029185	3029190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311638
84577	NC_003366	CTT	2	6	3029225	3029230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311638
84578	NC_003366	CAC	2	6	3029275	3029280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84579	NC_003366	ATT	3	9	3029299	3029307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311639
84580	NC_003366	CT	3	6	3029341	3029346	0 %	50 %	0 %	50 %	18311639
84581	NC_003366	AAC	2	6	3029360	3029365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311639
84582	NC_003366	CAT	2	6	3029453	3029458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311639
84583	NC_003366	TATTCA	2	12	3029482	3029493	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	18311639
84584	NC_003366	CCA	2	6	3029496	3029501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18311639
84585	NC_003366	TAA	2	6	3029540	3029545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311639
84586	NC_003366	GAT	2	6	3029547	3029552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311639
84587	NC_003366	TGT	2	6	3029558	3029563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18311639
84588	NC_003366	ATA	2	6	3029680	3029685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311639
84589	NC_003366	TAA	2	6	3029699	3029704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311639
84590	NC_003366	AAC	2	6	3029710	3029715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311639
84591	NC_003366	ATT	2	6	3029732	3029737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311639
84592	NC_003366	TCA	2	6	3029752	3029757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311639
84593	NC_003366	TTG	2	6	3029762	3029767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18311639
84594	NC_003366	ATT	2	6	3029780	3029785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311639
84595	NC_003366	TCT	2	6	3029794	3029799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311639
84596	NC_003366	TTG	2	6	3029837	3029842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18311639
84597	NC_003366	TAA	2	6	3029870	3029875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311639
84598	NC_003366	TAA	2	6	3029888	3029893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311639
84599	NC_003366	TAA	2	6	3029897	3029902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311639
84600	NC_003366	TTA	2	6	3029911	3029916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311639
84601	NC_003366	CAA	2	6	3029953	3029958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311639
84602	NC_003366	CCT	2	6	3030031	3030036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84603	NC_003366	TA	3	6	3030049	3030054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84604	NC_003366	TTC	2	6	3030106	3030111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311640
84605	NC_003366	CAA	2	6	3030195	3030200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18311640
84606	NC_003366	AT	3	6	3030219	3030224	50 %	50 %	0 %	0 %	18311640
84607	NC_003366	T	6	6	3030257	3030262	0 %	100 %	0 %	0 %	18311640
84608	NC_003366	T	6	6	3030283	3030288	0 %	100 %	0 %	0 %	18311641
84609	NC_003366	ATT	2	6	3030294	3030299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311641
84610	NC_003366	CTT	2	6	3030371	3030376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311641
84611	NC_003366	CTT	2	6	3030453	3030458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311641
84612	NC_003366	T	6	6	3030508	3030513	0 %	100 %	0 %	0 %	18311641
84613	NC_003366	TTCT	2	8	3030592	3030599	0 %	75 %	0 %	25 %	18311641
84614	NC_003366	T	6	6	3030630	3030635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84615	NC_003366	TCT	3	9	3030705	3030713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311642
84616	NC_003366	TTC	2	6	3030725	3030730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311642
84617	NC_003366	CTT	2	6	3030772	3030777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311642
84618	NC_003366	T	7	7	3030782	3030788	0 %	100 %	0 %	0 %	18311642
84619	NC_003366	T	6	6	3030861	3030866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84620	NC_003366	T	6	6	3030971	3030976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84621	NC_003366	AT	3	6	3030979	3030984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84622	NC_003366	ATA	2	6	3030987	3030992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84623	NC_003366	ATTAA	2	10	3031004	3031013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84624	NC_003366	TAA	2	6	3031024	3031029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84625	NC_003366	A	6	6	3031034	3031039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84626	NC_003366	TA	3	6	3031040	3031045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84627	NC_003366	TAAA	2	8	3031056	3031063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84628	NC_003366	CTAT	2	8	3031065	3031072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84629	NC_003366	TTA	2	6	3031088	3031093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84630	NC_003366	TTAA	2	8	3031108	3031115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84631	NC_003366	TTTA	2	8	3031138	3031145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84632	NC_003366	AT	4	8	3031168	3031175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84633	NC_003366	ATAA	2	8	3031198	3031205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84634	NC_003366	ATAA	2	8	3031244	3031251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84635	NC_003366	TTA	2	6	3031259	3031264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84636	NC_003366	TAT	2	6	3031279	3031284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84637	NC_003366	TTA	2	6	3031315	3031320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84638	NC_003366	TAT	2	6	3031349	3031354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84639	NC_003366	AT	3	6	3031390	3031395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...158159160161162163164165166167168169170Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.