MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 84639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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84002	NC_003366	TAAT	2	8	3009112	3009119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84003	NC_003366	T	6	6	3009119	3009124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84004	NC_003366	TAAT	2	8	3009137	3009144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84005	NC_003366	TAC	2	6	3009149	3009154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84006	NC_003366	TA	4	8	3009160	3009167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84007	NC_003366	AT	4	8	3009186	3009193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84008	NC_003366	A	6	6	3009208	3009213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84009	NC_003366	AT	4	8	3009226	3009233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84010	NC_003366	A	6	6	3009251	3009256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84011	NC_003366	TTTA	2	8	3009265	3009272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84012	NC_003366	A	6	6	3009299	3009304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84013	NC_003366	AAAT	2	8	3009310	3009317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84014	NC_003366	TTAA	2	8	3009333	3009340	50 %	50 %	0 %	0 %	18311617
84015	NC_003366	TCT	2	6	3009391	3009396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311617
84016	NC_003366	TTTCAT	2	12	3009410	3009421	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	18311617
84017	NC_003366	TCT	2	6	3009456	3009461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311617
84018	NC_003366	T	6	6	3009473	3009478	0 %	100 %	0 %	0 %	18311617
84019	NC_003366	TC	3	6	3009521	3009526	0 %	50 %	0 %	50 %	18311617
84020	NC_003366	GTCTT	2	10	3009540	3009549	0 %	60 %	20 %	20 %	18311617
84021	NC_003366	TAA	2	6	3009561	3009566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311617
84022	NC_003366	CAG	2	6	3009599	3009604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18311617
84023	NC_003366	ATCT	2	8	3009612	3009619	25 %	50 %	0 %	25 %	18311617
84024	NC_003366	TCC	2	6	3009621	3009626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311617
84025	NC_003366	TTA	2	6	3009683	3009688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18311617
84026	NC_003366	GCA	2	6	3009694	3009699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18311617
84027	NC_003366	CAG	2	6	3009728	3009733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18311617
84028	NC_003366	TTG	2	6	3009800	3009805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18311617
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84031	NC_003366	AT	3	6	3009995	3010000	50 %	50 %	0 %	0 %	18311617
84032	NC_003366	AAG	2	6	3010028	3010033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18311617
84033	NC_003366	TTTTC	2	10	3010037	3010046	0 %	80 %	0 %	20 %	18311617
84034	NC_003366	CTT	2	6	3010052	3010057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311617
84035	NC_003366	CTT	2	6	3010074	3010079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311617
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84038	NC_003366	TAG	2	6	3010184	3010189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311617
84039	NC_003366	CTG	2	6	3010211	3010216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18311617
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84041	NC_003366	GAT	2	6	3010282	3010287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18311617
84042	NC_003366	CT	3	6	3010298	3010303	0 %	50 %	0 %	50 %	18311617
84043	NC_003366	TCT	2	6	3010306	3010311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311617
84044	NC_003366	ATA	2	6	3010370	3010375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311617
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84047	NC_003366	ATC	2	6	3010551	3010556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311617
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84052	NC_003366	CT	4	8	3010694	3010701	0 %	50 %	0 %	50 %	18311617
84053	NC_003366	TCA	2	6	3010714	3010719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311617
84054	NC_003366	TAA	2	6	3010734	3010739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311617
84055	NC_003366	CTC	2	6	3010785	3010790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18311617
84056	NC_003366	T	6	6	3010824	3010829	0 %	100 %	0 %	0 %	18311617
84057	NC_003366	TCA	2	6	3010855	3010860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311617
84058	NC_003366	CTT	2	6	3010898	3010903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311617
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84061	NC_003366	TCT	2	6	3010963	3010968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311617
84062	NC_003366	TTC	2	6	3010986	3010991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18311617
84063	NC_003366	TA	3	6	3011073	3011078	50 %	50 %	0 %	0 %	18311617
84064	NC_003366	AT	3	6	3011129	3011134	50 %	50 %	0 %	0 %	18311617
84065	NC_003366	TATT	2	8	3011135	3011142	25 %	75 %	0 %	0 %	18311617
84066	NC_003366	TCC	2	6	3011239	3011244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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84089	NC_003366	TGCTAT	2	12	3011980	3011991	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	18311619
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84119	NC_003366	TTCT	2	8	3013026	3013033	0 %	75 %	0 %	25 %	18311619
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84241	NC_003366	ATA	2	6	3017268	3017273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18311626
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84493	NC_003366	CTA	2	6	3025750	3025755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18311636
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