MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 84639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_003366	TTA	2	6	199975	199980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309138
5503	NC_003366	GGC	2	6	200014	200019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18309138
5504	NC_003366	ATG	2	6	200079	200084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309138
5505	NC_003366	A	7	7	200121	200127	100 %	0 %	0 %	0 %	18309138
5506	NC_003366	TGT	2	6	200179	200184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18309138
5507	NC_003366	ATG	2	6	200280	200285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309138
5508	NC_003366	A	7	7	200356	200362	100 %	0 %	0 %	0 %	18309138
5509	NC_003366	AAG	2	6	200364	200369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309138
5510	NC_003366	TTA	2	6	200382	200387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309138
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5512	NC_003366	TAA	2	6	200482	200487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309138
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5514	NC_003366	A	6	6	200558	200563	100 %	0 %	0 %	0 %	18309138
5515	NC_003366	TAC	2	6	200578	200583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309138
5516	NC_003366	TTTGGA	2	12	200591	200602	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	18309138
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5519	NC_003366	TAAC	2	8	200742	200749	50 %	25 %	0 %	25 %	18309138
5520	NC_003366	ACA	2	6	200762	200767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18309138
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5530	NC_003366	TA	3	6	201170	201175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_003366	CTT	2	6	201184	201189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_003366	TTTAA	2	10	201190	201199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_003366	T	7	7	201214	201220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_003366	TTAA	2	8	201248	201255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_003366	AGG	2	6	201261	201266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_003366	AAT	2	6	201285	201290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_003366	T	6	6	201323	201328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_003366	AT	3	6	201345	201350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_003366	ATAA	2	8	201420	201427	75 %	25 %	0 %	0 %	18309139
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5556	NC_003366	TGA	2	6	201881	201886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309139
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5559	NC_003366	TAA	2	6	202087	202092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18309139
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5561	NC_003366	AT	3	6	202188	202193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_003366	A	6	6	202194	202199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_003366	TCA	2	6	202244	202249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309140
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5591	NC_003366	AT	3	6	203180	203185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5595	NC_003366	CTT	2	6	203302	203307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_003366	T	8	8	203306	203313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_003366	AATGT	2	10	203337	203346	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_003366	ATT	2	6	203356	203361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_003366	ATA	2	6	203362	203367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_003366	TA	3	6	203366	203371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_003366	ATGT	2	8	203393	203400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_003366	A	6	6	203401	203406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_003366	A	6	6	203424	203429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_003366	TA	4	8	203454	203461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_003366	ATTTT	2	10	203491	203500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_003366	ATA	2	6	203524	203529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_003366	AATA	2	8	203535	203542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_003366	AGG	2	6	203574	203579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_003366	TTTA	2	8	203597	203604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_003366	GAA	3	9	203606	203614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_003366	TAA	2	6	203620	203625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_003366	TGTA	2	8	203651	203658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_003366	TTTA	2	8	203665	203672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_003366	AG	3	6	203676	203681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_003366	T	6	6	203692	203697	0 %	100 %	0 %	0 %	18309141
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