MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 84639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_003366	TAGA	2	8	166562	166569	50 %	25 %	25 %	0 %	18309109
4503	NC_003366	A	6	6	166572	166577	100 %	0 %	0 %	0 %	18309109
4504	NC_003366	CTTG	2	8	166621	166628	0 %	50 %	25 %	25 %	18309109
4505	NC_003366	ATT	2	6	166672	166677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309109
4506	NC_003366	GTT	2	6	166813	166818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_003366	AGT	2	6	166854	166859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_003366	AGC	2	6	166878	166883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_003366	AT	3	6	166888	166893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_003366	AAT	2	6	166920	166925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_003366	AAAG	3	12	166932	166943	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_003366	ATGG	2	8	167016	167023	25 %	25 %	50 %	0 %	18309110
4513	NC_003366	TTC	2	6	167089	167094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309110
4514	NC_003366	TA	4	8	167107	167114	50 %	50 %	0 %	0 %	18309110
4515	NC_003366	GAT	2	6	167136	167141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309110
4516	NC_003366	AGT	2	6	167189	167194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309110
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4519	NC_003366	AAG	2	6	167305	167310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309110
4520	NC_003366	CAT	2	6	167320	167325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309110
4521	NC_003366	GCA	2	6	167328	167333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18309110
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4523	NC_003366	CTT	2	6	167489	167494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309110
4524	NC_003366	TTC	2	6	167502	167507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18309110
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4528	NC_003366	ACA	2	6	167722	167727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_003366	TAA	2	6	167728	167733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_003366	TAA	2	6	167761	167766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_003366	ATAAA	2	10	167822	167831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_003366	AAT	2	6	167876	167881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4534	NC_003366	TTA	2	6	167977	167982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_003366	TA	3	6	167985	167990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_003366	T	6	6	167992	167997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_003366	TA	3	6	168010	168015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_003366	GTAT	2	8	168021	168028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_003366	AAT	2	6	168029	168034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_003366	CTTA	2	8	168068	168075	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4541	NC_003366	A	7	7	168117	168123	100 %	0 %	0 %	0 %	18309111
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4543	NC_003366	TAT	2	6	168168	168173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309111
4544	NC_003366	CTA	2	6	168200	168205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309111
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4549	NC_003366	ACTT	2	8	168424	168431	25 %	50 %	0 %	25 %	18309111
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4554	NC_003366	TA	3	6	168629	168634	50 %	50 %	0 %	0 %	18309111
4555	NC_003366	GGA	2	6	168667	168672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18309111
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4561	NC_003366	TCA	3	9	168837	168845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18309111
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4563	NC_003366	ATT	2	6	168922	168927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18309111
4564	NC_003366	GAA	2	6	168941	168946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18309111
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4566	NC_003366	AT	3	6	169103	169108	50 %	50 %	0 %	0 %	18309111
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4573	NC_003366	AT	3	6	169228	169233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_003366	CAT	2	6	169259	169264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4593	NC_003366	ATTT	2	8	169858	169865	25 %	75 %	0 %	0 %	18309113
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4600	NC_003366	TAG	2	6	170163	170168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18309113
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4608	NC_003366	A	6	6	170394	170399	100 %	0 %	0 %	0 %	18309113
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4613	NC_003366	CTTT	2	8	170528	170535	0 %	75 %	0 %	25 %	18309113
4614	NC_003366	T	7	7	170533	170539	0 %	100 %	0 %	0 %	18309113
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4626	NC_003366	TA	3	6	170745	170750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_003366	TTCAT	2	10	170783	170792	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4628	NC_003366	TTA	2	6	170796	170801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_003366	TA	3	6	170819	170824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4998	NC_003366	T	6	6	182404	182409	0 %	100 %	0 %	0 %	18309123
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