MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 3004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003361	AAGG	2	8	174	181	50 %	0 %	50 %	0 %	29839770
2	NC_003361	TTCT	2	8	634	641	0 %	75 %	0 %	25 %	29839770
3	NC_003361	TTTC	2	8	1106	1113	0 %	75 %	0 %	25 %	29839771
4	NC_003361	AGGT	2	8	1393	1400	25 %	25 %	50 %	0 %	29839771
5	NC_003361	GGTT	2	8	1410	1417	0 %	50 %	50 %	0 %	29839771
6	NC_003361	AAGG	2	8	1505	1512	50 %	0 %	50 %	0 %	29839771
7	NC_003361	TAAA	2	8	2090	2097	75 %	25 %	0 %	0 %	29839771
8	NC_003361	AGAT	2	8	2445	2452	50 %	25 %	25 %	0 %	29839771
9	NC_003361	TGTT	2	8	2742	2749	0 %	75 %	25 %	0 %	29839772
10	NC_003361	AGTA	2	8	2883	2890	50 %	25 %	25 %	0 %	29839772
11	NC_003361	TTTG	2	8	3200	3207	0 %	75 %	25 %	0 %	29839773
12	NC_003361	TCTT	2	8	4258	4265	0 %	75 %	0 %	25 %	29839773
13	NC_003361	AGAA	2	8	4519	4526	75 %	0 %	25 %	0 %	29839773
14	NC_003361	TTCT	2	8	5083	5090	0 %	75 %	0 %	25 %	29839773
15	NC_003361	GAAA	2	8	5155	5162	75 %	0 %	25 %	0 %	29839773
16	NC_003361	AATC	2	8	5318	5325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_003361	CAAT	2	8	5364	5371	50 %	25 %	0 %	25 %	29839774
18	NC_003361	TGCT	2	8	6897	6904	0 %	50 %	25 %	25 %	29839775
19	NC_003361	TGTT	2	8	7686	7693	0 %	75 %	25 %	0 %	29839775
20	NC_003361	AAAT	2	8	7922	7929	75 %	25 %	0 %	0 %	29839776
21	NC_003361	AAGA	2	8	8170	8177	75 %	0 %	25 %	0 %	29839776
22	NC_003361	ATGA	2	8	8388	8395	50 %	25 %	25 %	0 %	29839776
23	NC_003361	TCCT	2	8	8408	8415	0 %	50 %	0 %	50 %	29839776
24	NC_003361	ACAT	2	8	8770	8777	50 %	25 %	0 %	25 %	29839776
25	NC_003361	TAGA	2	8	8961	8968	50 %	25 %	25 %	0 %	29839776
26	NC_003361	AAAG	2	8	9034	9041	75 %	0 %	25 %	0 %	29839776
27	NC_003361	CTTT	2	8	9164	9171	0 %	75 %	0 %	25 %	29839776
28	NC_003361	TAAA	2	8	10434	10441	75 %	25 %	0 %	0 %	29839776
29	NC_003361	TAAG	2	8	10680	10687	50 %	25 %	25 %	0 %	29839776
30	NC_003361	AAAG	2	8	10973	10980	75 %	0 %	25 %	0 %	29839777
31	NC_003361	AGGA	2	8	11503	11510	50 %	0 %	50 %	0 %	29839777
32	NC_003361	AGAT	2	8	11659	11666	50 %	25 %	25 %	0 %	29839777
33	NC_003361	AGAT	2	8	12028	12035	50 %	25 %	25 %	0 %	29839777
34	NC_003361	CAGA	2	8	12364	12371	50 %	0 %	25 %	25 %	29839777
35	NC_003361	AAAT	2	8	13108	13115	75 %	25 %	0 %	0 %	29839777
36	NC_003361	GCAA	2	8	13232	13239	50 %	0 %	25 %	25 %	29839777
37	NC_003361	GAAG	2	8	13652	13659	50 %	0 %	50 %	0 %	29839777
38	NC_003361	AATT	2	8	14515	14522	50 %	50 %	0 %	0 %	29839778
39	NC_003361	TTAC	2	8	14625	14632	25 %	50 %	0 %	25 %	29839778
40	NC_003361	TATT	2	8	14801	14808	25 %	75 %	0 %	0 %	29839778
41	NC_003361	TTCT	2	8	14966	14973	0 %	75 %	0 %	25 %	29839778
42	NC_003361	ATTG	2	8	15100	15107	25 %	50 %	25 %	0 %	29839778
43	NC_003361	TGTT	2	8	15307	15314	0 %	75 %	25 %	0 %	29839778
44	NC_003361	CTTT	2	8	15775	15782	0 %	75 %	0 %	25 %	29839779
45	NC_003361	ATAA	2	8	15933	15940	75 %	25 %	0 %	0 %	29839779
46	NC_003361	TTTC	2	8	16369	16376	0 %	75 %	0 %	25 %	29839779
47	NC_003361	TAAA	2	8	16945	16952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003361	AGAA	2	8	17085	17092	75 %	0 %	25 %	0 %	29839780
49	NC_003361	TAGA	2	8	17344	17351	50 %	25 %	25 %	0 %	29839780
50	NC_003361	CAGT	2	8	17412	17419	25 %	25 %	25 %	25 %	29839780
51	NC_003361	TCTA	2	8	18139	18146	25 %	50 %	0 %	25 %	29839781
52	NC_003361	ATTA	2	8	18286	18293	50 %	50 %	0 %	0 %	29839781
53	NC_003361	TACA	2	8	19356	19363	50 %	25 %	0 %	25 %	29839782
54	NC_003361	CCAG	2	8	20600	20607	25 %	0 %	25 %	50 %	29839783
55	NC_003361	TCAT	2	8	20938	20945	25 %	50 %	0 %	25 %	29839783
56	NC_003361	GTTA	2	8	21134	21141	25 %	50 %	25 %	0 %	29839783
57	NC_003361	GAAA	2	8	21172	21179	75 %	0 %	25 %	0 %	29839783
58	NC_003361	TATG	2	8	21488	21495	25 %	50 %	25 %	0 %	29839783
59	NC_003361	TTAC	2	8	21571	21578	25 %	50 %	0 %	25 %	29839783
60	NC_003361	TTAA	2	8	22316	22323	50 %	50 %	0 %	0 %	29839784
61	NC_003361	GAAG	2	8	22330	22337	50 %	0 %	50 %	0 %	29839784
62	NC_003361	CAAA	2	8	22510	22517	75 %	0 %	0 %	25 %	29839784
63	NC_003361	GAAT	2	8	23509	23516	50 %	25 %	25 %	0 %	29839784
64	NC_003361	TGGA	2	8	23770	23777	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003361	TTTA	2	8	24279	24286	25 %	75 %	0 %	0 %	29839785
66	NC_003361	TGGT	2	8	24466	24473	0 %	50 %	50 %	0 %	29839785
67	NC_003361	TTTC	2	8	24908	24915	0 %	75 %	0 %	25 %	29839785
68	NC_003361	GTTT	2	8	25321	25328	0 %	75 %	25 %	0 %	29839785
69	NC_003361	GCTG	2	8	26323	26330	0 %	25 %	50 %	25 %	29839785
70	NC_003361	TAAA	2	8	26375	26382	75 %	25 %	0 %	0 %	29839785
71	NC_003361	TATT	2	8	26555	26562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003361	ATTA	2	8	26567	26574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003361	CAAT	2	8	27508	27515	50 %	25 %	0 %	25 %	29839786
74	NC_003361	TTAT	2	8	27566	27573	25 %	75 %	0 %	0 %	29839786
75	NC_003361	AAAT	2	8	28610	28617	75 %	25 %	0 %	0 %	29839786
76	NC_003361	TGGA	2	8	28849	28856	25 %	25 %	50 %	0 %	29839786
77	NC_003361	AGAA	2	8	29590	29597	75 %	0 %	25 %	0 %	29839788
78	NC_003361	AGCA	2	8	30569	30576	50 %	0 %	25 %	25 %	29839789
79	NC_003361	GAAA	2	8	31038	31045	75 %	0 %	25 %	0 %	29839790
80	NC_003361	TTAA	2	8	32213	32220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003361	TTGT	2	8	32255	32262	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003361	GTCC	2	8	32496	32503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_003361	CTTC	2	8	32572	32579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_003361	TTTA	2	8	32915	32922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003361	AGGA	2	8	32972	32979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003361	TTTG	2	8	33051	33058	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003361	ATCG	2	8	33154	33161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_003361	TGCA	2	8	33482	33489	25 %	25 %	25 %	25 %	29839792
89	NC_003361	TAGA	2	8	33765	33772	50 %	25 %	25 %	0 %	29839793
90	NC_003361	GTAC	2	8	33927	33934	25 %	25 %	25 %	25 %	29839793
91	NC_003361	TGTT	2	8	33952	33959	0 %	75 %	25 %	0 %	29839793
92	NC_003361	TTGC	2	8	35831	35838	0 %	50 %	25 %	25 %	29839795
93	NC_003361	TAAT	2	8	35963	35970	50 %	50 %	0 %	0 %	29839795
94	NC_003361	TAAA	2	8	36075	36082	75 %	25 %	0 %	0 %	29839795
95	NC_003361	CTTG	2	8	36329	36336	0 %	50 %	25 %	25 %	29839795
96	NC_003361	ATTT	2	8	36404	36411	25 %	75 %	0 %	0 %	29839795
97	NC_003361	TGTT	2	8	37534	37541	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003361	TCAA	2	8	37607	37614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_003361	AAAG	2	8	38012	38019	75 %	0 %	25 %	0 %	29839796
100	NC_003361	TTTA	2	8	38242	38249	25 %	75 %	0 %	0 %	29839796
101	NC_003361	TTTA	2	8	38497	38504	25 %	75 %	0 %	0 %	29839796
102	NC_003361	CTTT	2	8	38627	38634	0 %	75 %	0 %	25 %	29839796
103	NC_003361	TAAA	2	8	39709	39716	75 %	25 %	0 %	0 %	29839797
104	NC_003361	CAAT	2	8	40026	40033	50 %	25 %	0 %	25 %	29839798
105	NC_003361	TTCT	2	8	40035	40042	0 %	75 %	0 %	25 %	29839798
106	NC_003361	GAAA	2	8	40277	40284	75 %	0 %	25 %	0 %	29839798
107	NC_003361	GTAA	2	8	41038	41045	50 %	25 %	25 %	0 %	29839798
108	NC_003361	TGAT	2	8	41606	41613	25 %	50 %	25 %	0 %	29839798
109	NC_003361	CCAA	2	8	42168	42175	50 %	0 %	0 %	50 %	29839798
110	NC_003361	GAAG	2	8	42192	42199	50 %	0 %	50 %	0 %	29839798
111	NC_003361	AATA	2	8	42223	42230	75 %	25 %	0 %	0 %	29839798
112	NC_003361	ATTG	2	8	42987	42994	25 %	50 %	25 %	0 %	29839801
113	NC_003361	TAAA	2	8	43297	43304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003361	TAGC	2	8	43407	43414	25 %	25 %	25 %	25 %	29839802
115	NC_003361	ATCA	2	8	44683	44690	50 %	25 %	0 %	25 %	29839803
116	NC_003361	GAAC	2	8	44963	44970	50 %	0 %	25 %	25 %	29839803
117	NC_003361	TAGA	2	8	45393	45400	50 %	25 %	25 %	0 %	29839804
118	NC_003361	AACA	2	8	45623	45630	75 %	0 %	0 %	25 %	29839804
119	NC_003361	AAAG	2	8	45632	45639	75 %	0 %	25 %	0 %	29839804
120	NC_003361	TAAA	2	8	45860	45867	75 %	25 %	0 %	0 %	29839804
121	NC_003361	AGTT	2	8	46310	46317	25 %	50 %	25 %	0 %	29839805
122	NC_003361	GAAA	2	8	46842	46849	75 %	0 %	25 %	0 %	29839806
123	NC_003361	TTAC	2	8	47479	47486	25 %	50 %	0 %	25 %	29839806
124	NC_003361	AAGA	2	8	47919	47926	75 %	0 %	25 %	0 %	29839807
125	NC_003361	ATAA	2	8	49394	49401	75 %	25 %	0 %	0 %	29839808
126	NC_003361	CTTC	2	8	49762	49769	0 %	50 %	0 %	50 %	29839808
127	NC_003361	TTAT	2	8	50319	50326	25 %	75 %	0 %	0 %	29839808
128	NC_003361	GATG	2	8	50962	50969	25 %	25 %	50 %	0 %	29839808
129	NC_003361	TCTT	2	8	51392	51399	0 %	75 %	0 %	25 %	29839808
130	NC_003361	TCTT	2	8	51494	51501	0 %	75 %	0 %	25 %	29839808
131	NC_003361	GATG	2	8	51740	51747	25 %	25 %	50 %	0 %	29839808
132	NC_003361	GAAG	2	8	52553	52560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003361	ATCC	2	8	52885	52892	25 %	25 %	0 %	50 %	29839809
134	NC_003361	TATT	2	8	53116	53123	25 %	75 %	0 %	0 %	29839809
135	NC_003361	TCTT	2	8	53737	53744	0 %	75 %	0 %	25 %	29839809
136	NC_003361	GCAA	2	8	53940	53947	50 %	0 %	25 %	25 %	29839810
137	NC_003361	CATA	2	8	54185	54192	50 %	25 %	0 %	25 %	29839810
138	NC_003361	AAAG	2	8	54645	54652	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003361	CTTT	2	8	54771	54778	0 %	75 %	0 %	25 %	29839811
140	NC_003361	TAAC	2	8	55041	55048	50 %	25 %	0 %	25 %	29839811
141	NC_003361	CATA	2	8	55337	55344	50 %	25 %	0 %	25 %	29839812
142	NC_003361	TAAG	2	8	55538	55545	50 %	25 %	25 %	0 %	29839812
143	NC_003361	TAGC	2	8	55717	55724	25 %	25 %	25 %	25 %	29839812
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145	NC_003361	CTTT	2	8	56223	56230	0 %	75 %	0 %	25 %	29839813
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