MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 24952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_003361	TGA	2	6	188314	188319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839945
4002	NC_003361	TAAA	2	8	188334	188341	75 %	25 %	0 %	0 %	29839945
4003	NC_003361	CTA	2	6	188406	188411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839945
4004	NC_003361	GAA	2	6	188423	188428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839945
4005	NC_003361	TAA	2	6	188572	188577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839945
4006	NC_003361	AAG	2	6	188631	188636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839945
4007	NC_003361	AAG	2	6	188655	188660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839945
4008	NC_003361	TGG	2	6	188680	188685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29839945
4009	NC_003361	ACG	2	6	188711	188716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839945
4010	NC_003361	TGA	2	6	188766	188771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839945
4011	NC_003361	CTT	2	6	188802	188807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839945
4012	NC_003361	A	6	6	188809	188814	100 %	0 %	0 %	0 %	29839945
4013	NC_003361	AG	3	6	188911	188916	50 %	0 %	50 %	0 %	29839945
4014	NC_003361	GCT	2	6	188933	188938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839945
4015	NC_003361	AAC	2	6	188962	188967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839945
4016	NC_003361	TCT	2	6	188981	188986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839945
4017	NC_003361	TGT	2	6	189007	189012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839945
4018	NC_003361	GAA	2	6	189164	189169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839945
4019	NC_003361	TC	3	6	189174	189179	0 %	50 %	0 %	50 %	29839945
4020	NC_003361	GCAA	2	8	189189	189196	50 %	0 %	25 %	25 %	29839945
4021	NC_003361	TGA	2	6	189252	189257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839945
4022	NC_003361	TTA	2	6	189262	189267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839945
4023	NC_003361	GGA	2	6	189275	189280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29839945
4024	NC_003361	TCT	2	6	189310	189315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839945
4025	NC_003361	TATT	2	8	189443	189450	25 %	75 %	0 %	0 %	29839945
4026	NC_003361	A	6	6	189488	189493	100 %	0 %	0 %	0 %	29839945
4027	NC_003361	CTT	2	6	189545	189550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839945
4028	NC_003361	ATT	2	6	189628	189633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839945
4029	NC_003361	TTC	2	6	189647	189652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839945
4030	NC_003361	ATG	2	6	189692	189697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839945
4031	NC_003361	TGCGT	2	10	189782	189791	0 %	40 %	40 %	20 %	29839945
4032	NC_003361	GGT	2	6	189836	189841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29839945
4033	NC_003361	TGT	2	6	189883	189888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839945
4034	NC_003361	TAA	2	6	189898	189903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839945
4035	NC_003361	TCT	2	6	189935	189940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839945
4036	NC_003361	CTT	2	6	190104	190109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839945
4037	NC_003361	AG	3	6	190111	190116	50 %	0 %	50 %	0 %	29839945
4038	NC_003361	TAA	2	6	190165	190170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839945
4039	NC_003361	CAA	2	6	190178	190183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839945
4040	NC_003361	TAG	2	6	190311	190316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839945
4041	NC_003361	CA	3	6	190318	190323	50 %	0 %	0 %	50 %	29839945
4042	NC_003361	TGA	2	6	190371	190376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839945
4043	NC_003361	ATA	2	6	190398	190403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839945
4044	NC_003361	ATT	2	6	190447	190452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839945
4045	NC_003361	TAA	2	6	190470	190475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839945
4046	NC_003361	ACG	2	6	190476	190481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839945
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4048	NC_003361	GAA	2	6	190500	190505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839945
4049	NC_003361	ACA	2	6	190523	190528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839945
4050	NC_003361	TAT	2	6	190536	190541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839945
4051	NC_003361	TGTT	2	8	190551	190558	0 %	75 %	25 %	0 %	29839945
4052	NC_003361	TCA	2	6	190587	190592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839945
4053	NC_003361	ATC	2	6	190621	190626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839945
4054	NC_003361	CTT	2	6	190646	190651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839945
4055	NC_003361	GAAA	2	8	190673	190680	75 %	0 %	25 %	0 %	29839945
4056	NC_003361	AAT	2	6	190686	190691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839945
4057	NC_003361	TTC	2	6	190795	190800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839946
4058	NC_003361	TGCTT	2	10	190840	190849	0 %	60 %	20 %	20 %	29839946
4059	NC_003361	GCTT	2	8	191010	191017	0 %	50 %	25 %	25 %	29839946
4060	NC_003361	CTT	2	6	191090	191095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839946
4061	NC_003361	TTACT	2	10	191208	191217	20 %	60 %	0 %	20 %	29839946
4062	NC_003361	AAG	2	6	191250	191255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839946
4063	NC_003361	ATT	2	6	191288	191293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839946
4064	NC_003361	ATC	2	6	191298	191303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839946
4065	NC_003361	CG	3	6	191413	191418	0 %	0 %	50 %	50 %	29839946
4066	NC_003361	TTA	2	6	191477	191482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839946
4067	NC_003361	TGAC	2	8	191505	191512	25 %	25 %	25 %	25 %	29839946
4068	NC_003361	TGC	2	6	191698	191703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839946
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4071	NC_003361	A	6	6	191790	191795	100 %	0 %	0 %	0 %	29839946
4072	NC_003361	ATG	2	6	191814	191819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839946
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4074	NC_003361	AAAC	2	8	191836	191843	75 %	0 %	0 %	25 %	29839946
4075	NC_003361	AAGC	2	8	191855	191862	50 %	0 %	25 %	25 %	29839946
4076	NC_003361	TAT	2	6	191871	191876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839946
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4079	NC_003361	TAT	2	6	191953	191958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839946
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4086	NC_003361	CGA	2	6	192202	192207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839946
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4089	NC_003361	ATC	2	6	192327	192332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839946
4090	NC_003361	ATAGA	2	10	192393	192402	60 %	20 %	20 %	0 %	29839946
4091	NC_003361	TCT	2	6	192464	192469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839946
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4094	NC_003361	AGCC	2	8	192533	192540	25 %	0 %	25 %	50 %	29839946
4095	NC_003361	A	7	7	192564	192570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_003361	CCA	2	6	192576	192581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_003361	T	6	6	192601	192606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_003361	TCT	2	6	192683	192688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_003361	TTTC	2	8	192735	192742	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4100	NC_003361	TTC	2	6	192795	192800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_003361	T	6	6	192818	192823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_003361	TTTTA	2	10	192863	192872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_003361	TAA	2	6	192885	192890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_003361	ATTTA	2	10	192896	192905	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_003361	T	8	8	192946	192953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_003361	GCA	2	6	192982	192987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_003361	ATC	2	6	193008	193013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839947
4108	NC_003361	AGG	2	6	193096	193101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29839947
4109	NC_003361	ATT	2	6	193150	193155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839947
4110	NC_003361	ATT	2	6	193171	193176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839947
4111	NC_003361	GCT	2	6	193240	193245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839947
4112	NC_003361	AGC	2	6	193262	193267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839947
4113	NC_003361	A	7	7	193279	193285	100 %	0 %	0 %	0 %	29839947
4114	NC_003361	AG	3	6	193293	193298	50 %	0 %	50 %	0 %	29839947
4115	NC_003361	GTT	2	6	193304	193309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839947
4116	NC_003361	AG	3	6	193326	193331	50 %	0 %	50 %	0 %	29839947
4117	NC_003361	TGA	2	6	193371	193376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839947
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4119	NC_003361	TGT	2	6	193533	193538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839947
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4121	NC_003361	GCG	2	6	193786	193791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29839947
4122	NC_003361	TGGA	2	8	193821	193828	25 %	25 %	50 %	0 %	29839947
4123	NC_003361	ATT	2	6	193893	193898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839947
4124	NC_003361	GCA	2	6	193966	193971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839947
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