MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 24952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_003361	T	6	6	141770	141775	0 %	100 %	0 %	0 %	29839902
3003	NC_003361	AG	3	6	141778	141783	50 %	0 %	50 %	0 %	29839902
3004	NC_003361	ATT	2	6	141835	141840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839902
3005	NC_003361	AGT	2	6	141865	141870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839902
3006	NC_003361	TGC	2	6	142008	142013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839902
3007	NC_003361	TA	3	6	142018	142023	50 %	50 %	0 %	0 %	29839902
3008	NC_003361	T	6	6	142090	142095	0 %	100 %	0 %	0 %	29839903
3009	NC_003361	GAG	2	6	142231	142236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29839903
3010	NC_003361	CTT	2	6	142237	142242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839903
3011	NC_003361	ATT	2	6	142301	142306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839903
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3013	NC_003361	GACT	2	8	142363	142370	25 %	25 %	25 %	25 %	29839903
3014	NC_003361	A	6	6	142371	142376	100 %	0 %	0 %	0 %	29839903
3015	NC_003361	TCC	2	6	142406	142411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29839903
3016	NC_003361	GCA	2	6	142437	142442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839903
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3018	NC_003361	TTG	2	6	142525	142530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839903
3019	NC_003361	AGA	2	6	142551	142556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839903
3020	NC_003361	AT	3	6	142583	142588	50 %	50 %	0 %	0 %	29839903
3021	NC_003361	GT	3	6	142653	142658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_003361	T	6	6	142658	142663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_003361	T	6	6	142679	142684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_003361	ATG	2	6	142767	142772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_003361	TCCT	2	8	142858	142865	0 %	50 %	0 %	50 %	29839904
3026	NC_003361	AGAAA	2	10	142889	142898	80 %	0 %	20 %	0 %	29839904
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3033	NC_003361	TAG	2	6	143254	143259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839904
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3043	NC_003361	TTA	2	6	143574	143579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839905
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3047	NC_003361	T	6	6	143776	143781	0 %	100 %	0 %	0 %	29839905
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3049	NC_003361	TTG	2	6	143811	143816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839905
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3055	NC_003361	CAA	2	6	144174	144179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839905
3056	NC_003361	TG	3	6	144214	144219	0 %	50 %	50 %	0 %	29839905
3057	NC_003361	AT	3	6	144310	144315	50 %	50 %	0 %	0 %	29839905
3058	NC_003361	CCG	2	6	144326	144331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29839905
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3061	NC_003361	TGAA	2	8	144398	144405	50 %	25 %	25 %	0 %	29839905
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3063	NC_003361	TCC	2	6	144418	144423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29839905
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3065	NC_003361	A	7	7	144455	144461	100 %	0 %	0 %	0 %	29839905
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3067	NC_003361	TAA	2	6	144542	144547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3091	NC_003361	ATTA	2	8	145587	145594	50 %	50 %	0 %	0 %	29839906
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3095	NC_003361	AGT	2	6	145699	145704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839907
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3097	NC_003361	TATT	2	8	145880	145887	25 %	75 %	0 %	0 %	29839907
3098	NC_003361	TTC	2	6	145958	145963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839907
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3101	NC_003361	ATTT	2	8	146037	146044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_003361	ATAAA	2	10	146057	146066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_003361	ATTTT	2	10	146072	146081	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_003361	AG	3	6	146089	146094	50 %	0 %	50 %	0 %	29839908
3105	NC_003361	A	6	6	146103	146108	100 %	0 %	0 %	0 %	29839908
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3108	NC_003361	GTTT	2	8	146187	146194	0 %	75 %	25 %	0 %	29839908
3109	NC_003361	AGA	2	6	146198	146203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839908
3110	NC_003361	TGA	2	6	146210	146215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839908
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3113	NC_003361	CTT	2	6	146406	146411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_003361	CTA	2	6	146457	146462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_003361	T	6	6	146499	146504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_003361	AATA	2	8	146553	146560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_003361	GAA	2	6	146576	146581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_003361	ATT	2	6	146618	146623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_003361	T	6	6	146669	146674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_003361	ATT	2	6	146683	146688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_003361	T	8	8	146776	146783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_003361	ACA	2	6	146793	146798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_003361	A	6	6	146814	146819	100 %	0 %	0 %	0 %	29839909
3124	NC_003361	CTT	2	6	146832	146837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839909
3125	NC_003361	CTT	2	6	146842	146847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839909
3126	NC_003361	ACA	2	6	146859	146864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839909
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