MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 24952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_003361	GAA	2	6	46789	46794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839806
1003	NC_003361	TCC	2	6	46806	46811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29839806
1004	NC_003361	CAA	2	6	46831	46836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839806
1005	NC_003361	GAAA	2	8	46842	46849	75 %	0 %	25 %	0 %	29839806
1006	NC_003361	AGA	2	6	46860	46865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839806
1007	NC_003361	CT	3	6	46897	46902	0 %	50 %	0 %	50 %	29839806
1008	NC_003361	GCT	2	6	46903	46908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839806
1009	NC_003361	CCT	2	6	47051	47056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29839806
1010	NC_003361	TAC	2	6	47092	47097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839806
1011	NC_003361	TC	3	6	47301	47306	0 %	50 %	0 %	50 %	29839806
1012	NC_003361	CA	3	6	47388	47393	50 %	0 %	0 %	50 %	29839806
1013	NC_003361	GCA	2	6	47403	47408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839806
1014	NC_003361	TTG	2	6	47431	47436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839806
1015	NC_003361	GTT	2	6	47441	47446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839806
1016	NC_003361	AGA	2	6	47463	47468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839806
1017	NC_003361	GGT	2	6	47473	47478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29839806
1018	NC_003361	TTAC	2	8	47479	47486	25 %	50 %	0 %	25 %	29839806
1019	NC_003361	GGT	2	6	47509	47514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29839806
1020	NC_003361	ACA	2	6	47568	47573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839806
1021	NC_003361	GAA	2	6	47575	47580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839806
1022	NC_003361	CTA	2	6	47582	47587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839806
1023	NC_003361	GCA	2	6	47611	47616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839806
1024	NC_003361	TAG	2	6	47639	47644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839806
1025	NC_003361	GA	3	6	47777	47782	50 %	0 %	50 %	0 %	29839806
1026	NC_003361	AAG	2	6	47904	47909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839807
1027	NC_003361	AAGA	2	8	47919	47926	75 %	0 %	25 %	0 %	29839807
1028	NC_003361	AAG	2	6	48037	48042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839807
1029	NC_003361	ATT	2	6	48048	48053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839807
1030	NC_003361	TA	4	8	48115	48122	50 %	50 %	0 %	0 %	29839807
1031	NC_003361	AT	3	6	48131	48136	50 %	50 %	0 %	0 %	29839807
1032	NC_003361	CT	3	6	48165	48170	0 %	50 %	0 %	50 %	29839807
1033	NC_003361	AAC	2	6	48394	48399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839807
1034	NC_003361	ATT	2	6	48588	48593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839807
1035	NC_003361	ATC	2	6	48679	48684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839807
1036	NC_003361	TAC	2	6	48777	48782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839807
1037	NC_003361	A	7	7	49003	49009	100 %	0 %	0 %	0 %	29839807
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1039	NC_003361	TAC	2	6	49082	49087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839807
1040	NC_003361	AG	3	6	49268	49273	50 %	0 %	50 %	0 %	29839807
1041	NC_003361	GTACG	2	10	49275	49284	20 %	20 %	40 %	20 %	29839807
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1045	NC_003361	A	6	6	49403	49408	100 %	0 %	0 %	0 %	29839808
1046	NC_003361	TCTGT	2	10	49427	49436	0 %	60 %	20 %	20 %	29839808
1047	NC_003361	ACC	2	6	49477	49482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29839808
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1050	NC_003361	A	9	9	49747	49755	100 %	0 %	0 %	0 %	29839808
1051	NC_003361	CTTC	2	8	49762	49769	0 %	50 %	0 %	50 %	29839808
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1053	NC_003361	A	6	6	49782	49787	100 %	0 %	0 %	0 %	29839808
1054	NC_003361	GAAGA	2	10	49799	49808	60 %	0 %	40 %	0 %	29839808
1055	NC_003361	A	6	6	49882	49887	100 %	0 %	0 %	0 %	29839808
1056	NC_003361	TTG	2	6	49890	49895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839808
1057	NC_003361	A	7	7	49905	49911	100 %	0 %	0 %	0 %	29839808
1058	NC_003361	GAA	2	6	49922	49927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839808
1059	NC_003361	AGC	2	6	49986	49991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839808
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1061	NC_003361	AGC	2	6	50040	50045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839808
1062	NC_003361	ATT	2	6	50056	50061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839808
1063	NC_003361	ATT	2	6	50140	50145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839808
1064	NC_003361	TTAT	2	8	50319	50326	25 %	75 %	0 %	0 %	29839808
1065	NC_003361	TGT	2	6	50395	50400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839808
1066	NC_003361	CTG	2	6	50442	50447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839808
1067	NC_003361	ATT	2	6	50453	50458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839808
1068	NC_003361	AGC	2	6	50563	50568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839808
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1088	NC_003361	TCTT	2	8	51494	51501	0 %	75 %	0 %	25 %	29839808
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1098	NC_003361	CCT	2	6	52022	52027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29839808
1099	NC_003361	TA	3	6	52083	52088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_003361	GAT	2	6	52099	52104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1103	NC_003361	TCG	2	6	52166	52171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_003361	TTG	2	6	52181	52186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_003361	T	6	6	52197	52202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_003361	TCTTT	2	10	52224	52233	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1107	NC_003361	T	6	6	52231	52236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_003361	GTC	2	6	52283	52288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_003361	A	6	6	52319	52324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_003361	TGA	2	6	52358	52363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_003361	CTT	2	6	52364	52369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_003361	ATC	2	6	52401	52406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_003361	ATA	2	6	52409	52414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_003361	TTC	2	6	52458	52463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_003361	GAAG	2	8	52553	52560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_003361	TGT	2	6	52678	52683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_003361	CG	3	6	52755	52760	0 %	0 %	50 %	50 %	29839809
1118	NC_003361	TGA	2	6	52769	52774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839809
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1120	NC_003361	TAT	2	6	52793	52798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839809
1121	NC_003361	GTT	2	6	52805	52810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839809
1122	NC_003361	ACG	2	6	52830	52835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839809
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1124	NC_003361	CG	3	6	52977	52982	0 %	0 %	50 %	50 %	29839809
1125	NC_003361	T	6	6	52993	52998	0 %	100 %	0 %	0 %	29839809
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1128	NC_003361	ATG	2	6	53078	53083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839809
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1131	NC_003361	TCA	2	6	53197	53202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839809
1132	NC_003361	ATA	2	6	53203	53208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839809
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1252	NC_003361	CT	3	6	58437	58442	0 %	50 %	0 %	50 %	29839815
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