MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 24952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_003361	GTT	2	6	258259	258264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840010
5502	NC_003361	CT	3	6	258396	258401	0 %	50 %	0 %	50 %	29840010
5503	NC_003361	GATT	2	8	258421	258428	25 %	50 %	25 %	0 %	29840010
5504	NC_003361	ATA	2	6	258476	258481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840010
5505	NC_003361	TTC	2	6	258505	258510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840010
5506	NC_003361	AAT	2	6	258562	258567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840010
5507	NC_003361	GTC	2	6	258657	258662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840010
5508	NC_003361	ATT	2	6	258755	258760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_003361	GTT	2	6	258788	258793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_003361	GA	3	6	258838	258843	50 %	0 %	50 %	0 %	29840011
5511	NC_003361	AAT	2	6	258862	258867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840011
5512	NC_003361	A	6	6	258882	258887	100 %	0 %	0 %	0 %	29840011
5513	NC_003361	TTTAA	2	10	259005	259014	40 %	60 %	0 %	0 %	29840011
5514	NC_003361	ATC	2	6	259034	259039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840011
5515	NC_003361	T	6	6	259081	259086	0 %	100 %	0 %	0 %	29840011
5516	NC_003361	CAG	2	6	259087	259092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840011
5517	NC_003361	CTT	2	6	259093	259098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840011
5518	NC_003361	CAC	2	6	259111	259116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29840011
5519	NC_003361	TCG	2	6	259176	259181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840011
5520	NC_003361	GTT	2	6	259186	259191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840011
5521	NC_003361	ATGCCA	2	12	259218	259229	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29840011
5522	NC_003361	TTG	2	6	259250	259255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840011
5523	NC_003361	TCA	2	6	259512	259517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840011
5524	NC_003361	TGT	3	9	259575	259583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840011
5525	NC_003361	TTC	2	6	259586	259591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840011
5526	NC_003361	GAAG	2	8	259740	259747	50 %	0 %	50 %	0 %	29840011
5527	NC_003361	AG	3	6	259746	259751	50 %	0 %	50 %	0 %	29840011
5528	NC_003361	A	6	6	259752	259757	100 %	0 %	0 %	0 %	29840011
5529	NC_003361	CTT	2	6	259798	259803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840011
5530	NC_003361	CA	3	6	259886	259891	50 %	0 %	0 %	50 %	29840011
5531	NC_003361	TTC	2	6	259928	259933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840011
5532	NC_003361	TTCA	2	8	260039	260046	25 %	50 %	0 %	25 %	29840011
5533	NC_003361	TCC	2	6	260079	260084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29840011
5534	NC_003361	TTG	2	6	260143	260148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840011
5535	NC_003361	GATG	2	8	260161	260168	25 %	25 %	50 %	0 %	29840011
5536	NC_003361	GTT	2	6	260173	260178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840011
5537	NC_003361	CCTG	2	8	260180	260187	0 %	25 %	25 %	50 %	29840011
5538	NC_003361	AAAC	2	8	260200	260207	75 %	0 %	0 %	25 %	29840011
5539	NC_003361	CTT	2	6	260218	260223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840011
5540	NC_003361	TCT	2	6	260253	260258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840011
5541	NC_003361	GAA	2	6	260338	260343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840011
5542	NC_003361	CAT	2	6	260399	260404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840011
5543	NC_003361	GTGTAG	2	12	260433	260444	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	29840011
5544	NC_003361	CTT	2	6	260509	260514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840011
5545	NC_003361	A	6	6	260539	260544	100 %	0 %	0 %	0 %	29840011
5546	NC_003361	CAG	2	6	260592	260597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_003361	TTC	2	6	260618	260623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_003361	GTT	2	6	260638	260643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_003361	CGAAG	2	10	260645	260654	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5550	NC_003361	TCTT	2	8	260670	260677	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5551	NC_003361	AAT	2	6	260704	260709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_003361	ATT	2	6	260725	260730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_003361	CT	3	6	260733	260738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_003361	AAAT	2	8	260754	260761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_003361	TAGT	2	8	260781	260788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_003361	T	6	6	260800	260805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_003361	T	7	7	260809	260815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_003361	TCA	2	6	260832	260837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840012
5559	NC_003361	AATCCT	2	12	260859	260870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840012
5560	NC_003361	AGA	2	6	260876	260881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840012
5561	NC_003361	AAT	2	6	260886	260891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840012
5562	NC_003361	CTT	2	6	260911	260916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840012
5563	NC_003361	TGT	2	6	260975	260980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840012
5564	NC_003361	GAA	2	6	261108	261113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840012
5565	NC_003361	GAC	3	9	261132	261140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840012
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5571	NC_003361	GAA	2	6	261465	261470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840012
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5578	NC_003361	AT	3	6	261928	261933	50 %	50 %	0 %	0 %	29840012
5579	NC_003361	GAG	2	6	261939	261944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840012
5580	NC_003361	CGT	2	6	261951	261956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840012
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5583	NC_003361	GAAA	3	12	262049	262060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_003361	T	8	8	262087	262094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_003361	TAC	2	6	262122	262127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5589	NC_003361	TGC	2	6	262218	262223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840013
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5592	NC_003361	AGC	2	6	262366	262371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840013
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5595	NC_003361	CT	3	6	262587	262592	0 %	50 %	0 %	50 %	29840013
5596	NC_003361	AGA	2	6	262667	262672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840013
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5598	NC_003361	AGA	2	6	262709	262714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840013
5599	NC_003361	TTTG	2	8	262728	262735	0 %	75 %	25 %	0 %	29840013
5600	NC_003361	CTT	2	6	262756	262761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840013
5601	NC_003361	GA	3	6	262763	262768	50 %	0 %	50 %	0 %	29840013
5602	NC_003361	AGCC	2	8	262905	262912	25 %	0 %	25 %	50 %	29840013
5603	NC_003361	TCAT	2	8	262915	262922	25 %	50 %	0 %	25 %	29840013
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5605	NC_003361	AAAAT	2	10	263149	263158	80 %	20 %	0 %	0 %	29840014
5606	NC_003361	AAAGG	2	10	263211	263220	60 %	0 %	40 %	0 %	29840014
5607	NC_003361	GA	3	6	263293	263298	50 %	0 %	50 %	0 %	29840014
5608	NC_003361	A	7	7	263307	263313	100 %	0 %	0 %	0 %	29840014
5609	NC_003361	TTA	2	6	263319	263324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840014
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5613	NC_003361	GTTCT	2	10	263473	263482	0 %	60 %	20 %	20 %	29840015
5614	NC_003361	ACG	2	6	263501	263506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840015
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5624	NC_003361	TA	3	6	263924	263929	50 %	50 %	0 %	0 %	29840015
5625	NC_003361	ACA	2	6	263972	263977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840015
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