MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 24952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_003361	TGCG	2	8	234198	234205	0 %	25 %	50 %	25 %	29839985
5002	NC_003361	ACA	2	6	234221	234226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839985
5003	NC_003361	CTT	2	6	234276	234281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839985
5004	NC_003361	TGA	2	6	234348	234353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839985
5005	NC_003361	GAG	2	6	234365	234370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29839985
5006	NC_003361	ATT	2	6	234422	234427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839985
5007	NC_003361	TTA	2	6	234461	234466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839985
5008	NC_003361	GAA	2	6	234499	234504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839985
5009	NC_003361	GTT	2	6	234548	234553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839985
5010	NC_003361	TAGGAA	2	12	234750	234761	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29839985
5011	NC_003361	GTT	3	9	234776	234784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839985
5012	NC_003361	TGA	3	9	234787	234795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839985
5013	NC_003361	ACG	2	6	234926	234931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_003361	T	6	6	235025	235030	0 %	100 %	0 %	0 %	29839986
5015	NC_003361	GTT	2	6	235057	235062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839986
5016	NC_003361	ATC	2	6	235080	235085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839986
5017	NC_003361	T	7	7	235097	235103	0 %	100 %	0 %	0 %	29839986
5018	NC_003361	T	7	7	235174	235180	0 %	100 %	0 %	0 %	29839986
5019	NC_003361	TCT	2	6	235195	235200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839986
5020	NC_003361	GTCC	2	8	235220	235227	0 %	25 %	25 %	50 %	29839986
5021	NC_003361	TTGT	2	8	235236	235243	0 %	75 %	25 %	0 %	29839986
5022	NC_003361	GTG	2	6	235305	235310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29839986
5023	NC_003361	AGA	2	6	235390	235395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839986
5024	NC_003361	ACA	2	6	235421	235426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839986
5025	NC_003361	CAA	2	6	235428	235433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839986
5026	NC_003361	TCT	2	6	235456	235461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839986
5027	NC_003361	CT	3	6	235460	235465	0 %	50 %	0 %	50 %	29839986
5028	NC_003361	GAA	2	6	235510	235515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839986
5029	NC_003361	GTT	2	6	235544	235549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839986
5030	NC_003361	T	6	6	235632	235637	0 %	100 %	0 %	0 %	29839986
5031	NC_003361	CTT	2	6	235814	235819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839986
5032	NC_003361	ATG	2	6	235829	235834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839986
5033	NC_003361	TGT	2	6	235864	235869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839986
5034	NC_003361	TGT	2	6	235891	235896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839986
5035	NC_003361	A	6	6	235948	235953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_003361	AG	4	8	235961	235968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_003361	TCT	2	6	236274	236279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_003361	TA	3	6	236358	236363	50 %	50 %	0 %	0 %	29839987
5039	NC_003361	CGA	4	12	236370	236381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839987
5040	NC_003361	TGC	2	6	236387	236392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839987
5041	NC_003361	CAG	2	6	236401	236406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839987
5042	NC_003361	T	6	6	236471	236476	0 %	100 %	0 %	0 %	29839987
5043	NC_003361	AAC	3	9	236546	236554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839987
5044	NC_003361	T	6	6	236561	236566	0 %	100 %	0 %	0 %	29839987
5045	NC_003361	ATT	2	6	236567	236572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839987
5046	NC_003361	CTT	2	6	236614	236619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839987
5047	NC_003361	TGT	2	6	236634	236639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839987
5048	NC_003361	TTGA	2	8	236657	236664	25 %	50 %	25 %	0 %	29839987
5049	NC_003361	GCT	2	6	236705	236710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839987
5050	NC_003361	CTTT	2	8	236730	236737	0 %	75 %	0 %	25 %	29839987
5051	NC_003361	TGCT	2	8	236765	236772	0 %	50 %	25 %	25 %	29839987
5052	NC_003361	ACG	2	6	236807	236812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839987
5053	NC_003361	TTTG	2	8	236816	236823	0 %	75 %	25 %	0 %	29839987
5054	NC_003361	CTG	2	6	236824	236829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839987
5055	NC_003361	CATC	2	8	236857	236864	25 %	25 %	0 %	50 %	29839987
5056	NC_003361	GCT	2	6	236874	236879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839987
5057	NC_003361	TTGAT	2	10	236898	236907	20 %	60 %	20 %	0 %	29839987
5058	NC_003361	CTT	2	6	236935	236940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839987
5059	NC_003361	ACG	2	6	236990	236995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839987
5060	NC_003361	T	6	6	237044	237049	0 %	100 %	0 %	0 %	29839987
5061	NC_003361	CATG	2	8	237115	237122	25 %	25 %	25 %	25 %	29839987
5062	NC_003361	CTTG	2	8	237133	237140	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_003361	GAAT	2	8	237184	237191	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_003361	GAA	3	9	237198	237206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_003361	T	6	6	237221	237226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_003361	AAG	2	6	237230	237235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_003361	T	7	7	237245	237251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_003361	CAG	2	6	237275	237280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_003361	AATT	2	8	237321	237328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_003361	ATT	2	6	237466	237471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_003361	A	7	7	237510	237516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_003361	T	7	7	237534	237540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_003361	GA	3	6	237555	237560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_003361	CTC	2	6	237578	237583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_003361	CTT	2	6	237697	237702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839988
5076	NC_003361	ATT	2	6	237709	237714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839988
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5079	NC_003361	T	6	6	237761	237766	0 %	100 %	0 %	0 %	29839988
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5082	NC_003361	TAA	2	6	237872	237877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839988
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5084	NC_003361	TTTTTC	2	12	237955	237966	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	29839988
5085	NC_003361	AG	3	6	237969	237974	50 %	0 %	50 %	0 %	29839988
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5090	NC_003361	CGGCAG	2	12	238524	238535	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	29839988
5091	NC_003361	CTG	2	6	238646	238651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839988
5092	NC_003361	ATA	4	12	238694	238705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839988
5093	NC_003361	ATTAA	2	10	238716	238725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_003361	TAA	2	6	238729	238734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_003361	CTT	2	6	238773	238778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839989
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5098	NC_003361	AGCA	2	8	238899	238906	50 %	0 %	25 %	25 %	29839989
5099	NC_003361	GCA	2	6	238932	238937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839989
5100	NC_003361	CGT	2	6	238965	238970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839989
5101	NC_003361	TGG	2	6	239079	239084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29839989
5102	NC_003361	TGC	2	6	239088	239093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839989
5103	NC_003361	AGC	2	6	239131	239136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839989
5104	NC_003361	T	6	6	239159	239164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_003361	TCA	2	6	239166	239171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_003361	T	6	6	239222	239227	0 %	100 %	0 %	0 %	29839990
5107	NC_003361	TAATG	2	10	239238	239247	40 %	40 %	20 %	0 %	29839990
5108	NC_003361	T	6	6	239265	239270	0 %	100 %	0 %	0 %	29839990
5109	NC_003361	GTT	2	6	239369	239374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839990
5110	NC_003361	A	7	7	239400	239406	100 %	0 %	0 %	0 %	29839990
5111	NC_003361	TTTC	2	8	239414	239421	0 %	75 %	0 %	25 %	29839990
5112	NC_003361	TAA	2	6	239435	239440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839990
5113	NC_003361	T	7	7	239624	239630	0 %	100 %	0 %	0 %	29839990
5114	NC_003361	GCG	2	6	239724	239729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29839990
5115	NC_003361	TTG	2	6	239730	239735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839990
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5119	NC_003361	ATG	2	6	239986	239991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_003361	AGT	2	6	240070	240075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_003361	TAT	2	6	240117	240122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_003361	GTT	2	6	240142	240147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_003361	GTT	2	6	240171	240176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839991
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5125	NC_003361	TCCTT	2	10	240265	240274	0 %	60 %	0 %	40 %	29839991
5126	NC_003361	TGA	2	6	240294	240299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839991
5127	NC_003361	GAT	2	6	240327	240332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839991
5128	NC_003361	TTCAG	2	10	240357	240366	20 %	40 %	20 %	20 %	29839991
5129	NC_003361	ACTT	2	8	240380	240387	25 %	50 %	0 %	25 %	29839991
5130	NC_003361	TGC	2	6	240433	240438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839991
5131	NC_003361	GAT	2	6	240549	240554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839991
5132	NC_003361	ATT	2	6	240559	240564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839991
5133	NC_003361	CTG	2	6	240584	240589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839991
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5135	NC_003361	AGG	2	6	240696	240701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29839991
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5143	NC_003361	ATG	2	6	241076	241081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839991
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5152	NC_003361	ATT	2	6	241483	241488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839991
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5154	NC_003361	AAG	2	6	241577	241582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839991
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5157	NC_003361	TGT	2	6	241667	241672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5158	NC_003361	TAA	2	6	241693	241698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839992
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5163	NC_003361	ATG	2	6	241901	241906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839992
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5188	NC_003361	TGT	2	6	243084	243089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5189	NC_003361	TAC	2	6	243187	243192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839994
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5231	NC_003361	TGC	2	6	245295	245300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839996
5232	NC_003361	GCA	2	6	245335	245340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839996
5233	NC_003361	T	7	7	245360	245366	0 %	100 %	0 %	0 %	29839996
5234	NC_003361	GAG	2	6	245457	245462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29839996
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5237	NC_003361	TTTGA	2	10	245656	245665	20 %	60 %	20 %	0 %	29839997
5238	NC_003361	GGA	2	6	245702	245707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29839997
5239	NC_003361	ATA	2	6	245728	245733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839997
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5241	NC_003361	TCA	2	6	246102	246107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839997
5242	NC_003361	TCC	2	6	246122	246127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29839997
5243	NC_003361	T	6	6	246153	246158	0 %	100 %	0 %	0 %	29839997
5244	NC_003361	ACA	2	6	246177	246182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839997
5245	NC_003361	GATATG	2	12	246236	246247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839997
5246	NC_003361	CAA	2	6	246319	246324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839997
5247	NC_003361	AGT	2	6	246484	246489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839997
5248	NC_003361	CGTAT	2	10	246516	246525	20 %	40 %	20 %	20 %	29839997
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5368	NC_003361	ATA	2	6	252127	252132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5369	NC_003361	T	9	9	252191	252199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5378	NC_003361	CAT	2	6	252750	252755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840006
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5480	NC_003361	TTTAT	2	10	256992	257001	20 %	80 %	0 %	0 %	29840009
5481	NC_003361	CTT	3	9	257009	257017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840009
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5487	NC_003361	TTG	2	6	257232	257237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840009
5488	NC_003361	CAT	2	6	257367	257372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840009
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5490	NC_003361	TTG	2	6	257481	257486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840009
5491	NC_003361	ATG	2	6	257560	257565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840009
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5493	NC_003361	AG	3	6	257624	257629	50 %	0 %	50 %	0 %	29840010
5494	NC_003361	TCT	2	6	257651	257656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840010
5495	NC_003361	GCTT	2	8	257693	257700	0 %	50 %	25 %	25 %	29840010
5496	NC_003361	TAA	2	6	257802	257807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840010
5497	NC_003361	GGC	2	6	257926	257931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29840010
5498	NC_003361	TCT	3	9	258096	258104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840010
5499	NC_003361	GAA	2	6	258151	258156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840010
5500	NC_003361	AAG	2	6	258175	258180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840010

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