MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 24952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_003361	ATC	2	6	210472	210477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839964
4502	NC_003361	TGG	2	6	210538	210543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_003361	GTAG	2	8	210714	210721	25 %	25 %	50 %	0 %	29839965
4504	NC_003361	GAC	2	6	210729	210734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839965
4505	NC_003361	TGG	2	6	210748	210753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29839965
4506	NC_003361	AAG	2	6	210771	210776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839965
4507	NC_003361	TACA	2	8	210785	210792	50 %	25 %	0 %	25 %	29839965
4508	NC_003361	TTC	2	6	210799	210804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839965
4509	NC_003361	T	6	6	210859	210864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_003361	GC	3	6	210958	210963	0 %	0 %	50 %	50 %	29839966
4511	NC_003361	GGC	2	6	210971	210976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29839966
4512	NC_003361	TACC	2	8	211007	211014	25 %	25 %	0 %	50 %	29839966
4513	NC_003361	GGT	2	6	211019	211024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29839966
4514	NC_003361	GGT	2	6	211031	211036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29839966
4515	NC_003361	GGC	2	6	211040	211045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29839966
4516	NC_003361	ATT	3	9	211058	211066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839966
4517	NC_003361	AAT	2	6	211151	211156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839966
4518	NC_003361	GAA	2	6	211164	211169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839966
4519	NC_003361	GTC	2	6	211190	211195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839966
4520	NC_003361	ATT	2	6	211207	211212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839966
4521	NC_003361	ATT	2	6	211235	211240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839966
4522	NC_003361	GGT	2	6	211292	211297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29839966
4523	NC_003361	T	6	6	211309	211314	0 %	100 %	0 %	0 %	29839966
4524	NC_003361	GTT	2	6	211447	211452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839966
4525	NC_003361	TAC	2	6	211498	211503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839966
4526	NC_003361	GA	3	6	211536	211541	50 %	0 %	50 %	0 %	29839966
4527	NC_003361	ATT	2	6	211562	211567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839966
4528	NC_003361	TTA	2	6	211655	211660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839966
4529	NC_003361	GA	3	6	211685	211690	50 %	0 %	50 %	0 %	29839966
4530	NC_003361	GAA	2	6	211700	211705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839966
4531	NC_003361	AGA	2	6	211744	211749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839966
4532	NC_003361	GAT	2	6	211790	211795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839966
4533	NC_003361	CTT	2	6	211796	211801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839966
4534	NC_003361	TGA	2	6	211804	211809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839966
4535	NC_003361	GA	3	6	211808	211813	50 %	0 %	50 %	0 %	29839966
4536	NC_003361	TTG	2	6	211959	211964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839967
4537	NC_003361	ATA	2	6	212045	212050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839967
4538	NC_003361	ATG	2	6	212126	212131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839967
4539	NC_003361	AAAG	2	8	212172	212179	75 %	0 %	25 %	0 %	29839967
4540	NC_003361	CAT	2	6	212209	212214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839967
4541	NC_003361	GGT	2	6	212314	212319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29839967
4542	NC_003361	GA	3	6	212379	212384	50 %	0 %	50 %	0 %	29839967
4543	NC_003361	CT	3	6	212440	212445	0 %	50 %	0 %	50 %	29839967
4544	NC_003361	ATT	2	6	212489	212494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839967
4545	NC_003361	CCT	2	6	212570	212575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29839967
4546	NC_003361	AT	3	6	212627	212632	50 %	50 %	0 %	0 %	29839967
4547	NC_003361	GGA	2	6	212700	212705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29839967
4548	NC_003361	A	7	7	212713	212719	100 %	0 %	0 %	0 %	29839967
4549	NC_003361	GTT	2	6	212794	212799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839968
4550	NC_003361	ATG	2	6	212844	212849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839968
4551	NC_003361	GA	3	6	212896	212901	50 %	0 %	50 %	0 %	29839968
4552	NC_003361	GTT	2	6	212915	212920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839968
4553	NC_003361	TCA	2	6	212950	212955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839968
4554	NC_003361	TCC	2	6	213015	213020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29839968
4555	NC_003361	GAA	2	6	213125	213130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839968
4556	NC_003361	GGAA	2	8	213173	213180	50 %	0 %	50 %	0 %	29839968
4557	NC_003361	CCAA	2	8	213207	213214	50 %	0 %	0 %	50 %	29839968
4558	NC_003361	T	6	6	213231	213236	0 %	100 %	0 %	0 %	29839968
4559	NC_003361	TAA	2	6	213276	213281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29839968
4560	NC_003361	GTT	2	6	213304	213309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839968
4561	NC_003361	CCA	2	6	213316	213321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29839968
4562	NC_003361	TGA	2	6	213377	213382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839968
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4564	NC_003361	GTT	2	6	213456	213461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839969
4565	NC_003361	TTAT	2	8	213477	213484	25 %	75 %	0 %	0 %	29839969
4566	NC_003361	TTC	2	6	213491	213496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839969
4567	NC_003361	AGCA	2	8	213536	213543	50 %	0 %	25 %	25 %	29839969
4568	NC_003361	CTA	2	6	213549	213554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839969
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4575	NC_003361	TC	3	6	214027	214032	0 %	50 %	0 %	50 %	29839969
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4581	NC_003361	TGA	2	6	214290	214295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_003361	TAA	2	6	214327	214332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_003361	GAAT	2	8	214334	214341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_003361	T	6	6	214360	214365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4587	NC_003361	TTC	2	6	214568	214573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_003361	T	6	6	214628	214633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_003361	A	7	7	214725	214731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_003361	CTT	2	6	214817	214822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_003361	CT	3	6	214823	214828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_003361	GT	3	6	214838	214843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_003361	GGA	2	6	214852	214857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_003361	GAA	2	6	214866	214871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839970
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4596	NC_003361	GGA	2	6	215019	215024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29839970
4597	NC_003361	AG	3	6	215151	215156	50 %	0 %	50 %	0 %	29839970
4598	NC_003361	GCT	2	6	215207	215212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839970
4599	NC_003361	ATT	2	6	215236	215241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839970
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4601	NC_003361	TGA	2	6	215363	215368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839970
4602	NC_003361	TGT	2	6	215384	215389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839970
4603	NC_003361	TGC	2	6	215399	215404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29839970
4604	NC_003361	CATTC	2	10	215425	215434	20 %	40 %	0 %	40 %	29839970
4605	NC_003361	CAA	2	6	215455	215460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29839970
4606	NC_003361	TTG	2	6	215476	215481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29839970
4607	NC_003361	TAT	2	6	215620	215625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839971
4608	NC_003361	ATC	2	6	215700	215705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29839971
4609	NC_003361	GAC	2	6	215788	215793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839971
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4611	NC_003361	CTT	2	6	215822	215827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839971
4612	NC_003361	TTCT	2	8	215865	215872	0 %	75 %	0 %	25 %	29839971
4613	NC_003361	GTG	2	6	215898	215903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29839971
4614	NC_003361	ATG	2	6	215925	215930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839971
4615	NC_003361	AATG	2	8	215957	215964	50 %	25 %	25 %	0 %	29839971
4616	NC_003361	TTA	2	6	216006	216011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839971
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4623	NC_003361	TTC	2	6	216531	216536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29839972
4624	NC_003361	AATT	2	8	216588	216595	50 %	50 %	0 %	0 %	29839972
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