MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Corynebacterium jeikeium K411 plasmid pKW4

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003080	CGT	2	6	40	45	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_003080	CGG	2	6	121	126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_003080	GTT	2	6	208	213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15320555
4	NC_003080	CGG	2	6	330	335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320555
5	NC_003080	GTA	2	6	338	343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320555
6	NC_003080	GCA	2	6	381	386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320555
7	NC_003080	CTT	2	6	388	393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320555
8	NC_003080	CAC	2	6	471	476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320555
9	NC_003080	CGT	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320555
10	NC_003080	GTT	2	6	559	564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15320555
11	NC_003080	CGG	2	6	594	599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320555
12	NC_003080	GCT	2	6	642	647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320555
13	NC_003080	CAC	2	6	783	788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320555
14	NC_003080	ACC	2	6	800	805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320555
15	NC_003080	CGG	2	6	807	812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320555
16	NC_003080	GAT	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320555
17	NC_003080	CGA	2	6	927	932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320555
18	NC_003080	ATC	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320555
19	NC_003080	TCG	2	6	1344	1349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320555
20	NC_003080	TAG	2	6	1383	1388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320555
21	NC_003080	CCA	2	6	1448	1453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320555
22	NC_003080	GGC	2	6	1465	1470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320555
23	NC_003080	ACT	2	6	1595	1600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320555
24	NC_003080	AAG	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320555
25	NC_003080	CCG	2	6	1934	1939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_003080	TCA	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_003080	GCC	2	6	2200	2205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_003080	TCC	2	6	2276	2281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_003080	GCC	2	6	2344	2349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_003080	GCA	2	6	2405	2410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_003080	CGG	2	6	2430	2435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_003080	TCG	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_003080	CAC	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_003080	CAA	2	6	2997	3002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15320556
35	NC_003080	ACT	2	6	3044	3049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
36	NC_003080	CAA	2	6	3075	3080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15320556
37	NC_003080	CTA	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
38	NC_003080	TCA	2	6	3248	3253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
39	NC_003080	CAG	2	6	3291	3296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320556
40	NC_003080	AAG	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320556
41	NC_003080	CCG	2	6	3336	3341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15320556
42	NC_003080	CCA	2	6	3456	3461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320556
43	NC_003080	ACC	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320556
44	NC_003080	AGA	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320556
45	NC_003080	AGA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320556
46	NC_003080	CAT	2	6	3717	3722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
47	NC_003080	CAG	2	6	3782	3787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320556
48	NC_003080	TGA	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320556
49	NC_003080	TTC	2	6	3865	3870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320556
50	NC_003080	AGA	2	6	3901	3906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320556
51	NC_003080	AGT	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320556
52	NC_003080	TAC	2	6	4030	4035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
53	NC_003080	CAA	2	6	4111	4116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15320556
54	NC_003080	AGT	2	6	4130	4135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320556
55	NC_003080	TTC	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320556
56	NC_003080	GTA	2	6	4224	4229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320557
57	NC_003080	GAC	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320557
58	NC_003080	ATC	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320557
59	NC_003080	TCT	3	9	4413	4421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320557
60	NC_003080	AGA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320557
61	NC_003080	AAT	2	6	4465	4470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15320557
62	NC_003080	GCA	2	6	4541	4546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320557
63	NC_003080	TCC	2	6	4669	4674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15320558
64	NC_003080	GTC	2	6	4684	4689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320558
65	NC_003080	GCT	2	6	4735	4740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320558
66	NC_003080	ACG	2	6	4860	4865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320558
67	NC_003080	CCA	2	6	4984	4989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320558
68	NC_003080	TCT	2	6	5150	5155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320558
69	NC_003080	GTA	2	6	5180	5185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320558
70	NC_003080	TCT	2	6	5198	5203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320558
71	NC_003080	TCC	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15320558
72	NC_003080	CAG	2	6	5430	5435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320558
73	NC_003080	ACT	2	6	5527	5532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320558
74	NC_003080	CCT	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15320559
75	NC_003080	ATA	2	6	5604	5609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15320559
76	NC_003080	GAT	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320559
77	NC_003080	ATC	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320559
78	NC_003080	GAA	2	6	5868	5873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320559
79	NC_003080	AGA	2	6	6127	6132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320559
80	NC_003080	AGT	2	6	6195	6200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320559
81	NC_003080	ATT	2	6	6201	6206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15320559
82	NC_003080	AGG	2	6	6405	6410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320560
83	NC_003080	TCA	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320560
84	NC_003080	GGA	2	6	6514	6519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320560
85	NC_003080	GAT	3	9	6554	6562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320560
86	NC_003080	TGT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15320560
87	NC_003080	GTA	2	6	6592	6597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320561
88	NC_003080	TTC	2	6	6682	6687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320561
89	NC_003080	TCT	2	6	6702	6707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320561
90	NC_003080	ACG	2	6	6791	6796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320561
91	NC_003080	TTC	2	6	6800	6805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320561
92	NC_003080	TTG	2	6	6903	6908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003080	CTT	2	6	7097	7102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_003080	ACC	2	6	7113	7118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_003080	CAT	2	6	7152	7157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_003080	CCT	2	6	7187	7192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_003080	CGC	2	6	7200	7205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_003080	CTA	2	6	7242	7247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_003080	CGC	2	6	7311	7316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_003080	TGG	2	6	7390	7395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003080	AGC	2	6	7418	7423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_003080	ATC	2	6	7472	7477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320562
103	NC_003080	GGC	2	6	7558	7563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320562
104	NC_003080	CGC	2	6	7629	7634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15320562
105	NC_003080	GGA	2	6	7683	7688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320562
106	NC_003080	GGT	2	6	7744	7749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15320562
107	NC_003080	TCG	2	6	7767	7772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320562
108	NC_003080	ACG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320562
109	NC_003080	TCG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320562
110	NC_003080	CTC	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15320562
111	NC_003080	AGT	2	6	8244	8249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320562
112	NC_003080	CGG	2	6	8281	8286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_003080	CTG	2	6	8460	8465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320563
114	NC_003080	GCC	2	6	8475	8480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15320563
115	NC_003080	GAT	2	6	8594	8599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320563
116	NC_003080	ACT	2	6	8627	8632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320563
117	NC_003080	TGT	2	6	8633	8638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15320563
118	NC_003080	TTC	2	6	8675	8680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_003080	CAA	2	6	8761	8766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62420831
120	NC_003080	CGA	2	6	8782	8787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62420831
121	NC_003080	TTG	2	6	8835	8840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62420831
122	NC_003080	CAC	2	6	8847	8852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62420831
123	NC_003080	ACA	2	6	9006	9011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_003080	TCA	2	6	9069	9074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_003080	GCA	2	6	9151	9156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_003080	GCA	2	6	9193	9198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_003080	CAG	2	6	9337	9342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_003080	CGT	2	6	9579	9584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320564
129	NC_003080	TCA	2	6	9598	9603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320564
130	NC_003080	CTT	2	6	9636	9641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320564
131	NC_003080	AGT	2	6	9690	9695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320564
132	NC_003080	AGC	2	6	9812	9817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_003080	CAT	2	6	9893	9898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_003080	AGG	2	6	10099	10104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320565
135	NC_003080	CGG	2	6	10285	10290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320565
136	NC_003080	CTT	2	6	10348	10353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320565
137	NC_003080	CGT	2	6	10359	10364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320565
138	NC_003080	CGC	2	6	10388	10393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15320565
139	NC_003080	CTG	2	6	10462	10467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320565
140	NC_003080	ATG	2	6	10644	10649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003080	GTC	2	6	10968	10973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320566
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166	NC_003080	GTC	2	6	12474	12479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320567
167	NC_003080	ACC	2	6	12526	12531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320567
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.