MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens str. 13 plasmid pCP13

Total Repeats: 287

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003042	A	7	7	184	190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003042	T	7	7	616	622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003042	T	6	6	673	678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003042	A	6	6	708	713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003042	A	7	7	766	772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003042	A	6	6	914	919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003042	A	6	6	1556	1561	100 %	0 %	0 %	0 %	15081480
8	NC_003042	A	6	6	1798	1803	100 %	0 %	0 %	0 %	15081481
9	NC_003042	A	6	6	2200	2205	100 %	0 %	0 %	0 %	15081481
10	NC_003042	A	6	6	2507	2512	100 %	0 %	0 %	0 %	15081481
11	NC_003042	A	8	8	2603	2610	100 %	0 %	0 %	0 %	15081481
12	NC_003042	A	6	6	2936	2941	100 %	0 %	0 %	0 %	15081481
13	NC_003042	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	15081481
14	NC_003042	A	6	6	3151	3156	100 %	0 %	0 %	0 %	15081482
15	NC_003042	A	6	6	3197	3202	100 %	0 %	0 %	0 %	15081482
16	NC_003042	T	6	6	3281	3286	0 %	100 %	0 %	0 %	15081482
17	NC_003042	A	7	7	3557	3563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003042	A	7	7	3646	3652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003042	A	6	6	3654	3659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003042	T	7	7	3758	3764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003042	T	6	6	3784	3789	0 %	100 %	0 %	0 %	15081484
22	NC_003042	A	6	6	4236	4241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003042	A	6	6	4717	4722	100 %	0 %	0 %	0 %	15081486
24	NC_003042	A	7	7	4805	4811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003042	T	7	7	5401	5407	0 %	100 %	0 %	0 %	15081487
26	NC_003042	T	6	6	5605	5610	0 %	100 %	0 %	0 %	15081487
27	NC_003042	T	7	7	5721	5727	0 %	100 %	0 %	0 %	15081487
28	NC_003042	T	6	6	6023	6028	0 %	100 %	0 %	0 %	15081488
29	NC_003042	T	6	6	6430	6435	0 %	100 %	0 %	0 %	15081488
30	NC_003042	T	7	7	6891	6897	0 %	100 %	0 %	0 %	15081488
31	NC_003042	A	8	8	6941	6948	100 %	0 %	0 %	0 %	15081488
32	NC_003042	T	6	6	7020	7025	0 %	100 %	0 %	0 %	15081488
33	NC_003042	A	8	8	7166	7173	100 %	0 %	0 %	0 %	15081488
34	NC_003042	T	6	6	7402	7407	0 %	100 %	0 %	0 %	15081488
35	NC_003042	T	6	6	7860	7865	0 %	100 %	0 %	0 %	15081488
36	NC_003042	T	9	9	7955	7963	0 %	100 %	0 %	0 %	15081488
37	NC_003042	T	7	7	8443	8449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003042	T	6	6	8496	8501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003042	A	8	8	8571	8578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003042	A	6	6	8669	8674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003042	A	6	6	9163	9168	100 %	0 %	0 %	0 %	15081491
42	NC_003042	A	10	10	9250	9259	100 %	0 %	0 %	0 %	15081491
43	NC_003042	A	6	6	9383	9388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003042	A	6	6	9405	9410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003042	T	7	7	9505	9511	0 %	100 %	0 %	0 %	15081492
46	NC_003042	T	6	6	9513	9518	0 %	100 %	0 %	0 %	15081492
47	NC_003042	T	6	6	9543	9548	0 %	100 %	0 %	0 %	15081492
48	NC_003042	T	7	7	9782	9788	0 %	100 %	0 %	0 %	15081492
49	NC_003042	T	6	6	9809	9814	0 %	100 %	0 %	0 %	15081492
50	NC_003042	T	8	8	9876	9883	0 %	100 %	0 %	0 %	15081492
51	NC_003042	A	6	6	10062	10067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003042	T	7	7	10093	10099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003042	T	6	6	10293	10298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003042	A	6	6	10363	10368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003042	A	6	6	10459	10464	100 %	0 %	0 %	0 %	15081494
56	NC_003042	A	7	7	10466	10472	100 %	0 %	0 %	0 %	15081494
57	NC_003042	T	7	7	11181	11187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003042	T	8	8	11207	11214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003042	A	6	6	11230	11235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003042	A	6	6	11420	11425	100 %	0 %	0 %	0 %	15081495
61	NC_003042	A	6	6	12084	12089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003042	T	6	6	12108	12113	0 %	100 %	0 %	0 %	15081496
63	NC_003042	T	6	6	12374	12379	0 %	100 %	0 %	0 %	15081496
64	NC_003042	A	6	6	12403	12408	100 %	0 %	0 %	0 %	15081496
65	NC_003042	T	6	6	12425	12430	0 %	100 %	0 %	0 %	15081496
66	NC_003042	A	6	6	12877	12882	100 %	0 %	0 %	0 %	15081496
67	NC_003042	A	6	6	12927	12932	100 %	0 %	0 %	0 %	15081496
68	NC_003042	A	6	6	13194	13199	100 %	0 %	0 %	0 %	15081496
69	NC_003042	A	6	6	13263	13268	100 %	0 %	0 %	0 %	15081496
70	NC_003042	A	8	8	13628	13635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003042	G	6	6	13641	13646	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003042	A	7	7	13657	13663	100 %	0 %	0 %	0 %	15081497
73	NC_003042	A	7	7	14452	14458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003042	T	8	8	14484	14491	0 %	100 %	0 %	0 %	15081498
75	NC_003042	A	6	6	14708	14713	100 %	0 %	0 %	0 %	15081498
76	NC_003042	A	6	6	14759	14764	100 %	0 %	0 %	0 %	15081498
77	NC_003042	T	6	6	15014	15019	0 %	100 %	0 %	0 %	15081498
78	NC_003042	T	6	6	15086	15091	0 %	100 %	0 %	0 %	15081498
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82	NC_003042	A	7	7	15534	15540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003042	A	6	6	15636	15641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003042	T	7	7	15799	15805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003042	T	7	7	15857	15863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003042	A	8	8	15893	15900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003042	A	7	7	15952	15958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003042	A	6	6	16178	16183	100 %	0 %	0 %	0 %	15081500
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90	NC_003042	A	7	7	16326	16332	100 %	0 %	0 %	0 %	15081501
91	NC_003042	A	7	7	16394	16400	100 %	0 %	0 %	0 %	15081501
92	NC_003042	A	6	6	16481	16486	100 %	0 %	0 %	0 %	15081501
93	NC_003042	A	6	6	16739	16744	100 %	0 %	0 %	0 %	15081501
94	NC_003042	A	7	7	16875	16881	100 %	0 %	0 %	0 %	15081502
95	NC_003042	A	7	7	16920	16926	100 %	0 %	0 %	0 %	15081502
96	NC_003042	A	7	7	17036	17042	100 %	0 %	0 %	0 %	15081502
97	NC_003042	A	7	7	17221	17227	100 %	0 %	0 %	0 %	15081503
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99	NC_003042	T	6	6	17590	17595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003042	A	6	6	17625	17630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003042	A	7	7	17683	17689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003042	A	6	6	17906	17911	100 %	0 %	0 %	0 %	15081504
103	NC_003042	A	6	6	17941	17946	100 %	0 %	0 %	0 %	15081504
104	NC_003042	A	7	7	18043	18049	100 %	0 %	0 %	0 %	15081505
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106	NC_003042	A	7	7	18413	18419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_003042	A	6	6	18931	18936	100 %	0 %	0 %	0 %	15081506
110	NC_003042	A	6	6	19000	19005	100 %	0 %	0 %	0 %	15081506
111	NC_003042	A	8	8	19190	19197	100 %	0 %	0 %	0 %	15081506
112	NC_003042	A	6	6	19281	19286	100 %	0 %	0 %	0 %	15081506
113	NC_003042	T	6	6	19328	19333	0 %	100 %	0 %	0 %	15081506
114	NC_003042	A	6	6	19414	19419	100 %	0 %	0 %	0 %	15081506
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116	NC_003042	A	6	6	19595	19600	100 %	0 %	0 %	0 %	15081506
117	NC_003042	A	6	6	19975	19980	100 %	0 %	0 %	0 %	15081508
118	NC_003042	A	7	7	20204	20210	100 %	0 %	0 %	0 %	15081508
119	NC_003042	A	6	6	20320	20325	100 %	0 %	0 %	0 %	15081508
120	NC_003042	A	7	7	20665	20671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003042	A	8	8	20726	20733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003042	T	7	7	21545	21551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003042	A	8	8	21626	21633	100 %	0 %	0 %	0 %	15081510
124	NC_003042	A	8	8	21757	21764	100 %	0 %	0 %	0 %	15081510
125	NC_003042	A	6	6	21819	21824	100 %	0 %	0 %	0 %	15081510
126	NC_003042	A	6	6	21838	21843	100 %	0 %	0 %	0 %	15081510
127	NC_003042	T	6	6	21856	21861	0 %	100 %	0 %	0 %	15081510
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130	NC_003042	A	6	6	22495	22500	100 %	0 %	0 %	0 %	15081510
131	NC_003042	A	7	7	22511	22517	100 %	0 %	0 %	0 %	15081510
132	NC_003042	T	6	6	22662	22667	0 %	100 %	0 %	0 %	15081511
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134	NC_003042	A	6	6	22786	22791	100 %	0 %	0 %	0 %	15081511
135	NC_003042	A	7	7	22895	22901	100 %	0 %	0 %	0 %	15081511
136	NC_003042	A	6	6	23007	23012	100 %	0 %	0 %	0 %	15081511
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.