MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens str. 13 plasmid pCP13

Total Repeats: 1639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003042	A	6	6	31000	31005	100 %	0 %	0 %	0 %	15081523
1002	NC_003042	A	6	6	31087	31092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_003042	TAA	2	6	31095	31100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_003042	AAAT	2	8	31112	31119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_003042	TTAAAT	2	12	31139	31150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_003042	ATT	2	6	31167	31172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081524
1007	NC_003042	TAT	2	6	31174	31179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081524
1008	NC_003042	TCT	2	6	31180	31185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081524
1009	NC_003042	CAG	2	6	31311	31316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15081524
1010	NC_003042	AAATC	2	10	31326	31335	60 %	20 %	0 %	20 %	15081524
1011	NC_003042	TAA	2	6	31378	31383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081524
1012	NC_003042	TGT	2	6	31390	31395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081524
1013	NC_003042	TTC	2	6	31494	31499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081524
1014	NC_003042	CAC	2	6	31500	31505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15081524
1015	NC_003042	CATA	2	8	31508	31515	50 %	25 %	0 %	25 %	15081524
1016	NC_003042	ATT	2	6	31570	31575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081524
1017	NC_003042	ATT	2	6	31651	31656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081524
1018	NC_003042	TCA	2	6	31754	31759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081524
1019	NC_003042	TAT	2	6	31794	31799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081524
1020	NC_003042	T	7	7	31819	31825	0 %	100 %	0 %	0 %	15081524
1021	NC_003042	TTA	2	6	31872	31877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081524
1022	NC_003042	ACT	2	6	31924	31929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081524
1023	NC_003042	TGT	2	6	32018	32023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081524
1024	NC_003042	ATT	2	6	32027	32032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081524
1025	NC_003042	CCA	2	6	32042	32047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15081524
1026	NC_003042	CTG	2	6	32154	32159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15081524
1027	NC_003042	CCA	2	6	32165	32170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15081524
1028	NC_003042	TAT	3	9	32190	32198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081524
1029	NC_003042	AAGA	2	8	32261	32268	75 %	0 %	25 %	0 %	15081524
1030	NC_003042	A	7	7	32274	32280	100 %	0 %	0 %	0 %	15081524
1031	NC_003042	ATT	2	6	32282	32287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081524
1032	NC_003042	TAT	2	6	32296	32301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081524
1033	NC_003042	TTTC	2	8	32319	32326	0 %	75 %	0 %	25 %	15081524
1034	NC_003042	CCT	2	6	32339	32344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_003042	A	7	7	32348	32354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_003042	A	8	8	32360	32367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_003042	A	6	6	32382	32387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_003042	T	7	7	32397	32403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_003042	AATTT	2	10	32414	32423	40 %	60 %	0 %	0 %	15081525
1040	NC_003042	ATA	2	6	32429	32434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081525
1041	NC_003042	TAA	2	6	32465	32470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081525
1042	NC_003042	AT	3	6	32478	32483	50 %	50 %	0 %	0 %	15081525
1043	NC_003042	TAT	2	6	32527	32532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081525
1044	NC_003042	T	6	6	32534	32539	0 %	100 %	0 %	0 %	15081525
1045	NC_003042	ATT	3	9	32564	32572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081525
1046	NC_003042	TTTA	2	8	32600	32607	25 %	75 %	0 %	0 %	15081525
1047	NC_003042	T	7	7	32614	32620	0 %	100 %	0 %	0 %	15081525
1048	NC_003042	ATA	2	6	32748	32753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081525
1049	NC_003042	CAA	2	6	32770	32775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15081525
1050	NC_003042	TA	3	6	32825	32830	50 %	50 %	0 %	0 %	15081525
1051	NC_003042	TTG	2	6	32928	32933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081525
1052	NC_003042	T	6	6	33029	33034	0 %	100 %	0 %	0 %	15081525
1053	NC_003042	TA	3	6	33041	33046	50 %	50 %	0 %	0 %	15081525
1054	NC_003042	AAT	2	6	33077	33082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081525
1055	NC_003042	T	7	7	33094	33100	0 %	100 %	0 %	0 %	15081525
1056	NC_003042	ATT	2	6	33105	33110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081525
1057	NC_003042	CTC	2	6	33116	33121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15081526
1058	NC_003042	TC	3	6	33137	33142	0 %	50 %	0 %	50 %	15081526
1059	NC_003042	TTA	2	6	33185	33190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081526
1060	NC_003042	ATTT	2	8	33228	33235	25 %	75 %	0 %	0 %	15081526
1061	NC_003042	AAT	2	6	33271	33276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081526
1062	NC_003042	TAT	3	9	33284	33292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081526
1063	NC_003042	TTG	2	6	33294	33299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081526
1064	NC_003042	T	6	6	33341	33346	0 %	100 %	0 %	0 %	15081526
1065	NC_003042	AAC	2	6	33375	33380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15081526
1066	NC_003042	ACC	2	6	33411	33416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15081526
1067	NC_003042	TTAA	2	8	33445	33452	50 %	50 %	0 %	0 %	15081526
1068	NC_003042	TAA	2	6	33504	33509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081526
1069	NC_003042	CTT	2	6	33519	33524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081526
1070	NC_003042	TTC	2	6	33528	33533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081526
1071	NC_003042	TCA	2	6	33550	33555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081526
1072	NC_003042	CTTT	2	8	33560	33567	0 %	75 %	0 %	25 %	15081526
1073	NC_003042	ATT	2	6	33591	33596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081526
1074	NC_003042	AGA	2	6	33708	33713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15081526
1075	NC_003042	TCTTT	2	10	33780	33789	0 %	80 %	0 %	20 %	15081526
1076	NC_003042	T	6	6	33805	33810	0 %	100 %	0 %	0 %	15081526
1077	NC_003042	TCTTCA	2	12	33826	33837	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15081526
1078	NC_003042	TTC	2	6	33885	33890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081526
1079	NC_003042	AT	3	6	33927	33932	50 %	50 %	0 %	0 %	15081526
1080	NC_003042	TCT	2	6	33973	33978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081526
1081	NC_003042	TAC	2	6	34118	34123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081526
1082	NC_003042	CTA	2	6	34133	34138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081526
1083	NC_003042	T	7	7	34233	34239	0 %	100 %	0 %	0 %	15081526
1084	NC_003042	TCC	2	6	34335	34340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15081526
1085	NC_003042	CTT	2	6	34441	34446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081526
1086	NC_003042	TAACC	2	10	34534	34543	40 %	20 %	0 %	40 %	15081526
1087	NC_003042	T	6	6	34571	34576	0 %	100 %	0 %	0 %	15081526
1088	NC_003042	ATAA	2	8	34604	34611	75 %	25 %	0 %	0 %	15081526
1089	NC_003042	TTA	2	6	34631	34636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081526
1090	NC_003042	TTG	2	6	34682	34687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081526
1091	NC_003042	ATT	2	6	34689	34694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081526
1092	NC_003042	TTC	2	6	34717	34722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081526
1093	NC_003042	TCA	2	6	34855	34860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081526
1094	NC_003042	A	6	6	34966	34971	100 %	0 %	0 %	0 %	15081526
1095	NC_003042	ATTATA	2	12	34977	34988	50 %	50 %	0 %	0 %	15081526
1096	NC_003042	TACT	2	8	35028	35035	25 %	50 %	0 %	25 %	15081527
1097	NC_003042	CAT	2	6	35089	35094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081527
1098	NC_003042	TCTT	2	8	35109	35116	0 %	75 %	0 %	25 %	15081527
1099	NC_003042	T	6	6	35115	35120	0 %	100 %	0 %	0 %	15081527
1100	NC_003042	CTTT	2	8	35137	35144	0 %	75 %	0 %	25 %	15081527
1101	NC_003042	CTT	2	6	35180	35185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081527
1102	NC_003042	A	6	6	35198	35203	100 %	0 %	0 %	0 %	15081527
1103	NC_003042	TCT	2	6	35208	35213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081527
1104	NC_003042	AT	4	8	35282	35289	50 %	50 %	0 %	0 %	15081527
1105	NC_003042	CTT	2	6	35320	35325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081527
1106	NC_003042	TTC	2	6	35327	35332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081527
1107	NC_003042	TCT	2	6	35364	35369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081527
1108	NC_003042	CTAT	2	8	35409	35416	25 %	50 %	0 %	25 %	15081527
1109	NC_003042	TA	3	6	35431	35436	50 %	50 %	0 %	0 %	15081527
1110	NC_003042	T	6	6	35467	35472	0 %	100 %	0 %	0 %	15081527
1111	NC_003042	TTC	2	6	35518	35523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081527
1112	NC_003042	TAGA	2	8	35536	35543	50 %	25 %	25 %	0 %	15081527
1113	NC_003042	ATTT	2	8	35548	35555	25 %	75 %	0 %	0 %	15081527
1114	NC_003042	AT	4	8	35560	35567	50 %	50 %	0 %	0 %	15081527
1115	NC_003042	AAT	2	6	35588	35593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081527
1116	NC_003042	TCT	3	9	35649	35657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081527
1117	NC_003042	TGT	2	6	35714	35719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081527
1118	NC_003042	TATCT	2	10	35771	35780	20 %	60 %	0 %	20 %	15081527
1119	NC_003042	TCTT	2	8	35811	35818	0 %	75 %	0 %	25 %	15081527
1120	NC_003042	TTA	2	6	35899	35904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081527
1121	NC_003042	ATCA	2	8	35912	35919	50 %	25 %	0 %	25 %	15081527
1122	NC_003042	TCT	2	6	35925	35930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081527
1123	NC_003042	A	6	6	35934	35939	100 %	0 %	0 %	0 %	15081527
1124	NC_003042	AAAT	2	8	35944	35951	75 %	25 %	0 %	0 %	15081527
1125	NC_003042	TAT	2	6	35965	35970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081527
1126	NC_003042	TCT	2	6	36000	36005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081527
1127	NC_003042	ATC	2	6	36056	36061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081527
1128	NC_003042	TAT	2	6	36119	36124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081527
1129	NC_003042	TACCT	2	10	36131	36140	20 %	40 %	0 %	40 %	15081527
1130	NC_003042	CTTT	2	8	36225	36232	0 %	75 %	0 %	25 %	15081527
1131	NC_003042	T	6	6	36248	36253	0 %	100 %	0 %	0 %	15081527
1132	NC_003042	GTT	2	6	36298	36303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15081527
1133	NC_003042	T	6	6	36311	36316	0 %	100 %	0 %	0 %	15081527
1134	NC_003042	TAA	2	6	36379	36384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081527
1135	NC_003042	ACT	2	6	36414	36419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081527
1136	NC_003042	ATT	2	6	36426	36431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081527
1137	NC_003042	TCA	2	6	36432	36437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081527
1138	NC_003042	ATA	2	6	36464	36469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081527
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1140	NC_003042	AT	3	6	36509	36514	50 %	50 %	0 %	0 %	15081527
1141	NC_003042	AAAT	2	8	36551	36558	75 %	25 %	0 %	0 %	15081527
1142	NC_003042	ATT	2	6	36644	36649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081527
1143	NC_003042	ATATA	2	10	36683	36692	60 %	40 %	0 %	0 %	15081527
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1147	NC_003042	ATT	2	6	36761	36766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081527
1148	NC_003042	TAT	2	6	36767	36772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081527
1149	NC_003042	TAA	3	9	36778	36786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15081527
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1151	NC_003042	TTC	2	6	36851	36856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15081527
1152	NC_003042	T	6	6	36872	36877	0 %	100 %	0 %	0 %	15081527
1153	NC_003042	CAT	2	6	36886	36891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15081527
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1156	NC_003042	T	6	6	37130	37135	0 %	100 %	0 %	0 %	15081527
1157	NC_003042	CCT	2	6	37147	37152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1159	NC_003042	ATT	2	6	37203	37208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15081528
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1182	NC_003042	TAAA	2	8	37885	37892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1398	NC_003042	ATA	2	6	45106	45111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1399	NC_003042	AAT	2	6	45116	45121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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