MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 chromosome

Total Repeats: 4104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003030	ATTTT	2	10	224	233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003030	GTTCA	2	10	1106	1115	20 %	40 %	20 %	20 %	15893299
3	NC_003030	TTTAA	2	10	1559	1568	40 %	60 %	0 %	0 %	15893299
4	NC_003030	AAATT	2	10	2556	2565	60 %	40 %	0 %	0 %	15893300
5	NC_003030	ATGAT	2	10	3964	3973	40 %	40 %	20 %	0 %	15893302
6	NC_003030	TGAAA	2	10	6824	6833	60 %	20 %	20 %	0 %	15893305
7	NC_003030	ATATT	2	10	6921	6930	40 %	60 %	0 %	0 %	15893305
8	NC_003030	TCGTG	2	10	10747	10756	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_003030	AGATT	2	10	14181	14190	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003030	CATAA	2	10	14194	14203	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_003030	CTTAA	2	10	14972	14981	40 %	40 %	0 %	20 %	15893306
12	NC_003030	GACAA	2	10	15380	15389	60 %	0 %	20 %	20 %	15893307
13	NC_003030	GGTAA	2	10	15889	15898	40 %	20 %	40 %	0 %	15893308
14	NC_003030	ATTTA	2	10	16506	16515	40 %	60 %	0 %	0 %	15893308
15	NC_003030	TGAAT	2	10	18531	18540	40 %	40 %	20 %	0 %	15893308
16	NC_003030	AAAAG	2	10	18985	18994	80 %	0 %	20 %	0 %	15893309
17	NC_003030	GTATG	2	10	19300	19309	20 %	40 %	40 %	0 %	15893309
18	NC_003030	TAATT	2	10	20208	20217	40 %	60 %	0 %	0 %	15893310
19	NC_003030	TACAG	2	10	23889	23898	40 %	20 %	20 %	20 %	15893314
20	NC_003030	GAAAA	2	10	25322	25331	80 %	0 %	20 %	0 %	15893315
21	NC_003030	TGATT	2	10	25413	25422	20 %	60 %	20 %	0 %	15893315
22	NC_003030	AGAGG	2	10	26534	26543	40 %	0 %	60 %	0 %	15893316
23	NC_003030	AAAGA	2	10	28933	28942	80 %	0 %	20 %	0 %	15893318
24	NC_003030	AAGAA	2	10	29109	29118	80 %	0 %	20 %	0 %	15893318
25	NC_003030	TATAT	2	10	31983	31992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003030	AGAGG	2	10	32389	32398	40 %	0 %	60 %	0 %	15893320
27	NC_003030	TATAA	2	10	33844	33853	60 %	40 %	0 %	0 %	15893321
28	NC_003030	ATTTT	2	10	34191	34200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003030	TTAAT	2	10	34342	34351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003030	CATTT	2	10	35480	35489	20 %	60 %	0 %	20 %	15893322
31	NC_003030	GATTT	2	10	35934	35943	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003030	GTTTA	2	10	38452	38461	20 %	60 %	20 %	0 %	15893326
33	NC_003030	AATTT	2	10	38669	38678	40 %	60 %	0 %	0 %	15893326
34	NC_003030	ATTGA	2	10	39351	39360	40 %	40 %	20 %	0 %	15893326
35	NC_003030	AATTA	2	10	40063	40072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003030	ATGGA	2	10	40684	40693	40 %	20 %	40 %	0 %	15893327
37	NC_003030	ATATA	2	10	41211	41220	60 %	40 %	0 %	0 %	15893328
38	NC_003030	TACAT	2	10	41866	41875	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_003030	CTTTA	2	10	42181	42190	20 %	60 %	0 %	20 %	15893329
40	NC_003030	AGGAG	2	10	42685	42694	40 %	0 %	60 %	0 %	15893329
41	NC_003030	TAATT	2	10	42789	42798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003030	AGGAA	2	10	43141	43150	60 %	0 %	40 %	0 %	15893330
43	NC_003030	ATTTT	2	10	44301	44310	20 %	80 %	0 %	0 %	15893331
44	NC_003030	TATAT	2	10	45728	45737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003030	TTTTG	2	10	46847	46856	0 %	80 %	20 %	0 %	15893333
46	NC_003030	ACAAA	2	10	49445	49454	80 %	0 %	0 %	20 %	15893335
47	NC_003030	TAAAT	2	10	49893	49902	60 %	40 %	0 %	0 %	15893336
48	NC_003030	AATAA	2	10	50107	50116	80 %	20 %	0 %	0 %	15893337
49	NC_003030	TGGTT	2	10	52044	52053	0 %	60 %	40 %	0 %	15893337
50	NC_003030	TTAGT	2	10	53480	53489	20 %	60 %	20 %	0 %	15893337
51	NC_003030	AGATA	2	10	55011	55020	60 %	20 %	20 %	0 %	15893338
52	NC_003030	CATTT	2	10	57553	57562	20 %	60 %	0 %	20 %	15893342
53	NC_003030	GAAAA	2	10	59205	59214	80 %	0 %	20 %	0 %	15893343
54	NC_003030	AGTGC	2	10	59479	59488	20 %	20 %	40 %	20 %	15893344
55	NC_003030	AGAAT	2	10	60599	60608	60 %	20 %	20 %	0 %	15893347
56	NC_003030	AATCA	2	10	60983	60992	60 %	20 %	0 %	20 %	15893347
57	NC_003030	TAAAT	2	10	61173	61182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003030	TAAAT	2	10	62510	62519	60 %	40 %	0 %	0 %	15893350
59	NC_003030	TAATA	2	10	63336	63345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003030	TTTTA	2	10	64589	64598	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003030	AGAAA	2	10	67393	67402	80 %	0 %	20 %	0 %	15893357
62	NC_003030	GTTGT	2	10	75334	75343	0 %	60 %	40 %	0 %	15893360
63	NC_003030	AAGGC	2	10	77541	77550	40 %	0 %	40 %	20 %	15893364
64	NC_003030	TAAAA	2	10	79356	79365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003030	AAGTT	2	10	80333	80342	40 %	40 %	20 %	0 %	15893367
66	NC_003030	TTAAA	2	10	80393	80402	60 %	40 %	0 %	0 %	15893367
67	NC_003030	AATTA	2	10	80424	80433	60 %	40 %	0 %	0 %	15893367
68	NC_003030	ATAGT	2	10	81877	81886	40 %	40 %	20 %	0 %	15893369
69	NC_003030	TTAAA	2	10	86221	86230	60 %	40 %	0 %	0 %	15893373
70	NC_003030	TAAAA	2	10	86357	86366	80 %	20 %	0 %	0 %	15893373
71	NC_003030	AATTA	2	10	86706	86715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003030	ATTTT	2	10	86872	86881	20 %	80 %	0 %	0 %	15893374
73	NC_003030	ATGTT	2	10	88869	88878	20 %	60 %	20 %	0 %	15893376
74	NC_003030	CATTA	2	10	89685	89694	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_003030	AAATA	2	10	89957	89966	80 %	20 %	0 %	0 %	15893378
76	NC_003030	TAAGT	2	10	91910	91919	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003030	AAAAT	2	10	93484	93493	80 %	20 %	0 %	0 %	15893380
78	NC_003030	GTGAT	2	10	97035	97044	20 %	40 %	40 %	0 %	15893385
79	NC_003030	AAAAG	2	10	97518	97527	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003030	TACAT	2	10	98766	98775	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_003030	GATGG	2	10	104076	104085	20 %	20 %	60 %	0 %	15893391
82	NC_003030	TCTTA	2	10	104172	104181	20 %	60 %	0 %	20 %	15893391
83	NC_003030	TCCTT	2	10	104516	104525	0 %	60 %	0 %	40 %	15893391
84	NC_003030	AAGAA	2	10	105612	105621	80 %	0 %	20 %	0 %	15893392
85	NC_003030	CAGCT	2	10	106065	106074	20 %	20 %	20 %	40 %	15893393
86	NC_003030	AAATG	2	10	106767	106776	60 %	20 %	20 %	0 %	15893394
87	NC_003030	ATGGA	2	10	107111	107120	40 %	20 %	40 %	0 %	15893394
88	NC_003030	AAAGA	2	10	107592	107601	80 %	0 %	20 %	0 %	15893394
89	NC_003030	AGATA	2	10	108409	108418	60 %	20 %	20 %	0 %	15893395
90	NC_003030	TAAAG	2	10	111040	111049	60 %	20 %	20 %	0 %	15893397
91	NC_003030	AGTAA	2	10	112435	112444	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003030	TAAAA	2	10	113784	113793	80 %	20 %	0 %	0 %	15893399
93	NC_003030	GTAAA	2	10	115977	115986	60 %	20 %	20 %	0 %	15893400
94	NC_003030	GAAGT	2	10	116351	116360	40 %	20 %	40 %	0 %	15893402
95	NC_003030	TAAAA	2	10	116547	116556	80 %	20 %	0 %	0 %	15893402
96	NC_003030	AAGAA	2	10	117045	117054	80 %	0 %	20 %	0 %	15893402
97	NC_003030	AAAAG	2	10	117465	117474	80 %	0 %	20 %	0 %	15893403
98	NC_003030	CCTTC	2	10	118302	118311	0 %	40 %	0 %	60 %	15893404
99	NC_003030	GAAAA	2	10	118958	118967	80 %	0 %	20 %	0 %	15893404
100	NC_003030	AAAGA	2	10	120038	120047	80 %	0 %	20 %	0 %	15893406
101	NC_003030	CAATC	2	10	122035	122044	40 %	20 %	0 %	40 %	15893407
102	NC_003030	GATAC	2	10	124105	124114	40 %	20 %	20 %	20 %	15893409
103	NC_003030	AATAA	2	10	124284	124293	80 %	20 %	0 %	0 %	15893409
104	NC_003030	ATTTT	2	10	124727	124736	20 %	80 %	0 %	0 %	15893409
105	NC_003030	GTATT	2	10	128916	128925	20 %	60 %	20 %	0 %	15893414
106	NC_003030	CAATA	2	10	129046	129055	60 %	20 %	0 %	20 %	15893414
107	NC_003030	GGAGA	2	10	130478	130487	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003030	AGATG	2	10	131000	131009	40 %	20 %	40 %	0 %	15893415
109	NC_003030	CAAGC	2	10	132497	132506	40 %	0 %	20 %	40 %	15893416
110	NC_003030	ATGGA	2	10	132578	132587	40 %	20 %	40 %	0 %	15893416
111	NC_003030	GAACT	2	10	133961	133970	40 %	20 %	20 %	20 %	15893418
112	NC_003030	AAGCT	2	10	134237	134246	40 %	20 %	20 %	20 %	15893419
113	NC_003030	ATATT	2	10	135609	135618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003030	AATAG	2	10	136517	136526	60 %	20 %	20 %	0 %	15893421
115	NC_003030	GATTT	2	10	136929	136938	20 %	60 %	20 %	0 %	15893421
116	NC_003030	GCGGT	2	10	138278	138287	0 %	20 %	60 %	20 %	15893422
117	NC_003030	CTGTT	2	10	138743	138752	0 %	60 %	20 %	20 %	15893423
118	NC_003030	AAAAG	2	10	140286	140295	80 %	0 %	20 %	0 %	15893426
119	NC_003030	TATTT	2	10	141884	141893	20 %	80 %	0 %	0 %	15893428
120	NC_003030	TAAAA	2	10	142376	142385	80 %	20 %	0 %	0 %	15893429
121	NC_003030	TACCT	2	10	142959	142968	20 %	40 %	0 %	40 %	15893430
122	NC_003030	TTATA	2	10	144440	144449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003030	TTCTT	2	10	145981	145990	0 %	80 %	0 %	20 %	15893434
124	NC_003030	ATAAG	2	10	148898	148907	60 %	20 %	20 %	0 %	15893437
125	NC_003030	TATAA	2	10	149434	149443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003030	ATAGT	2	10	150846	150855	40 %	40 %	20 %	0 %	15893441
127	NC_003030	CTTAA	2	10	151943	151952	40 %	40 %	0 %	20 %	15893441
128	NC_003030	AAAAT	2	10	154465	154474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003030	ATAAA	2	10	154821	154830	80 %	20 %	0 %	0 %	15893444
130	NC_003030	ACTTT	2	10	156087	156096	20 %	60 %	0 %	20 %	15893446
131	NC_003030	ATATT	2	10	157436	157445	40 %	60 %	0 %	0 %	15893447
132	NC_003030	ATAGA	2	10	157747	157756	60 %	20 %	20 %	0 %	15893447
133	NC_003030	TCGTG	2	10	159373	159382	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_003030	AGATT	2	10	162807	162816	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003030	CATAA	2	10	162820	162829	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_003030	TGATA	2	10	163227	163236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003030	TCGTG	2	10	164511	164520	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_003030	AGATT	2	10	167945	167954	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003030	CATAA	2	10	167958	167967	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_003030	TGATA	2	10	168366	168375	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003030	TCGTG	2	10	169650	169659	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_003030	AGATT	2	10	173093	173102	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003030	CATAA	2	10	173106	173115	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_003030	AATTT	2	10	173500	173509	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_003030	ATATA	2	10	177102	177111	60 %	40 %	0 %	0 %	15893450
152	NC_003030	TAAAA	2	10	177444	177453	80 %	20 %	0 %	0 %	15893450
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154	NC_003030	GAATC	2	10	179976	179985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
155	NC_003030	CAAAA	2	10	181422	181431	80 %	0 %	0 %	20 %	15893453
156	NC_003030	GTATA	2	10	182292	182301	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_003030	ATATA	2	10	182936	182945	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_003030	GAATT	2	10	183419	183428	40 %	40 %	20 %	0 %	15893455
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162	NC_003030	TATTT	2	10	188671	188680	20 %	80 %	0 %	0 %	15893459
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