MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 chromosome

Total Repeats: 101682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_003030	CAC	2	6	38616	38621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15893326
1003	NC_003030	AATTT	2	10	38669	38678	40 %	60 %	0 %	0 %	15893326
1004	NC_003030	CT	3	6	38704	38709	0 %	50 %	0 %	50 %	15893326
1005	NC_003030	T	6	6	38776	38781	0 %	100 %	0 %	0 %	15893326
1006	NC_003030	TCT	2	6	38816	38821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893326
1007	NC_003030	TGT	2	6	38876	38881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893326
1008	NC_003030	TGA	2	6	38893	38898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893326
1009	NC_003030	TAA	2	6	38908	38913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893326
1010	NC_003030	GAT	2	6	38919	38924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893326
1011	NC_003030	ATT	2	6	38983	38988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893326
1012	NC_003030	CTT	2	6	39015	39020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893326
1013	NC_003030	TA	3	6	39090	39095	50 %	50 %	0 %	0 %	15893326
1014	NC_003030	AAT	2	6	39131	39136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893326
1015	NC_003030	CAA	2	6	39171	39176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15893326
1016	NC_003030	T	6	6	39184	39189	0 %	100 %	0 %	0 %	15893326
1017	NC_003030	CTT	2	6	39204	39209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893326
1018	NC_003030	AGC	2	6	39241	39246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893326
1019	NC_003030	AC	3	6	39263	39268	50 %	0 %	0 %	50 %	15893326
1020	NC_003030	ATA	2	6	39276	39281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893326
1021	NC_003030	TCA	2	6	39293	39298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893326
1022	NC_003030	CAT	2	6	39306	39311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893326
1023	NC_003030	T	6	6	39340	39345	0 %	100 %	0 %	0 %	15893326
1024	NC_003030	ATTGA	2	10	39351	39360	40 %	40 %	20 %	0 %	15893326
1025	NC_003030	TG	3	6	39370	39375	0 %	50 %	50 %	0 %	15893326
1026	NC_003030	TAT	2	6	39447	39452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893326
1027	NC_003030	TCT	2	6	39470	39475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893326
1028	NC_003030	GCTTTT	2	12	39494	39505	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15893326
1029	NC_003030	TTA	2	6	39510	39515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893326
1030	NC_003030	TCT	2	6	39541	39546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893326
1031	NC_003030	AAG	2	6	39580	39585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893326
1032	NC_003030	T	7	7	39597	39603	0 %	100 %	0 %	0 %	15893326
1033	NC_003030	TTA	2	6	39636	39641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893326
1034	NC_003030	AGC	2	6	39670	39675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893326
1035	NC_003030	TCTACC	2	12	39692	39703	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15893326
1036	NC_003030	ATT	2	6	39769	39774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893326
1037	NC_003030	ATT	2	6	39836	39841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893326
1038	NC_003030	TCC	2	6	39855	39860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_003030	AT	3	6	39883	39888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_003030	TAA	2	6	39889	39894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_003030	A	6	6	39903	39908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_003030	TAAA	2	8	39961	39968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_003030	ATTT	2	8	39988	39995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_003030	AAG	2	6	40002	40007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_003030	ATT	2	6	40033	40038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_003030	TGGT	2	8	40053	40060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_003030	AATTA	2	10	40063	40072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_003030	A	6	6	40072	40077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_003030	TAG	2	6	40120	40125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893327
1050	NC_003030	TAA	2	6	40135	40140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893327
1051	NC_003030	CTA	2	6	40144	40149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893327
1052	NC_003030	GA	3	6	40200	40205	50 %	0 %	50 %	0 %	15893327
1053	NC_003030	ATA	2	6	40237	40242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893327
1054	NC_003030	GTT	2	6	40278	40283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893327
1055	NC_003030	A	6	6	40305	40310	100 %	0 %	0 %	0 %	15893327
1056	NC_003030	CAG	2	6	40546	40551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893327
1057	NC_003030	AGC	2	6	40565	40570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893327
1058	NC_003030	AAT	2	6	40581	40586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893327
1059	NC_003030	CTT	2	6	40613	40618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893327
1060	NC_003030	ATGGA	2	10	40684	40693	40 %	20 %	40 %	0 %	15893327
1061	NC_003030	A	7	7	40704	40710	100 %	0 %	0 %	0 %	15893327
1062	NC_003030	TAA	2	6	40802	40807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893328
1063	NC_003030	TGG	2	6	40848	40853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15893328
1064	NC_003030	TAA	2	6	40866	40871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893328
1065	NC_003030	TAA	2	6	40917	40922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893328
1066	NC_003030	TA	3	6	40930	40935	50 %	50 %	0 %	0 %	15893328
1067	NC_003030	GAA	2	6	40957	40962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893328
1068	NC_003030	TG	3	6	40984	40989	0 %	50 %	50 %	0 %	15893328
1069	NC_003030	TTTC	2	8	41005	41012	0 %	75 %	0 %	25 %	15893328
1070	NC_003030	AAG	2	6	41074	41079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893328
1071	NC_003030	GTA	2	6	41080	41085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893328
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1077	NC_003030	A	8	8	41222	41229	100 %	0 %	0 %	0 %	15893328
1078	NC_003030	TA	4	8	41290	41297	50 %	50 %	0 %	0 %	15893328
1079	NC_003030	GA	4	8	41317	41324	50 %	0 %	50 %	0 %	15893328
1080	NC_003030	TAA	3	9	41333	41341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893328
1081	NC_003030	ATA	2	6	41429	41434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893328
1082	NC_003030	TA	3	6	41433	41438	50 %	50 %	0 %	0 %	15893328
1083	NC_003030	ATA	2	6	41507	41512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893328
1084	NC_003030	TA	4	8	41576	41583	50 %	50 %	0 %	0 %	15893328
1085	NC_003030	CATT	2	8	41659	41666	25 %	50 %	0 %	25 %	15893328
1086	NC_003030	ATA	2	6	41699	41704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893328
1087	NC_003030	GAT	2	6	41719	41724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893328
1088	NC_003030	TA	4	8	41734	41741	50 %	50 %	0 %	0 %	15893328
1089	NC_003030	ATA	2	6	41786	41791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893328
1090	NC_003030	T	6	6	41815	41820	0 %	100 %	0 %	0 %	15893328
1091	NC_003030	TGC	2	6	41844	41849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_003030	TACAT	2	10	41866	41875	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1093	NC_003030	ATT	2	6	41889	41894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893329
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1095	NC_003030	ACT	2	6	41999	42004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893329
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1099	NC_003030	TA	4	8	42109	42116	50 %	50 %	0 %	0 %	15893329
1100	NC_003030	CTTTA	2	10	42181	42190	20 %	60 %	0 %	20 %	15893329
1101	NC_003030	CA	3	6	42248	42253	50 %	0 %	0 %	50 %	15893329
1102	NC_003030	CATA	2	8	42307	42314	50 %	25 %	0 %	25 %	15893329
1103	NC_003030	T	6	6	42339	42344	0 %	100 %	0 %	0 %	15893329
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1107	NC_003030	T	7	7	42583	42589	0 %	100 %	0 %	0 %	15893329
1108	NC_003030	AT	3	6	42628	42633	50 %	50 %	0 %	0 %	15893329
1109	NC_003030	CTT	3	9	42646	42654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893329
1110	NC_003030	AGGAG	2	10	42685	42694	40 %	0 %	60 %	0 %	15893329
1111	NC_003030	TAT	2	6	42756	42761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893329
1112	NC_003030	TAATT	2	10	42789	42798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_003030	TTATAA	2	12	42811	42822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_003030	A	6	6	42844	42849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_003030	TGA	2	6	42858	42863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_003030	ATT	3	9	42884	42892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_003030	ATG	2	6	42993	42998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893330
1118	NC_003030	TTA	2	6	43051	43056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893330
1119	NC_003030	GAA	2	6	43073	43078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893330
1120	NC_003030	AGA	2	6	43120	43125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893330
1121	NC_003030	AGGAA	2	10	43141	43150	60 %	0 %	40 %	0 %	15893330
1122	NC_003030	T	6	6	43220	43225	0 %	100 %	0 %	0 %	15893330
1123	NC_003030	TA	3	6	43295	43300	50 %	50 %	0 %	0 %	15893330
1124	NC_003030	ATT	2	6	43304	43309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893330
1125	NC_003030	A	7	7	43348	43354	100 %	0 %	0 %	0 %	15893330
1126	NC_003030	T	7	7	43381	43387	0 %	100 %	0 %	0 %	15893330
1127	NC_003030	TAA	2	6	43419	43424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893330
1128	NC_003030	AT	3	6	43491	43496	50 %	50 %	0 %	0 %	15893330
1129	NC_003030	TAT	2	6	43556	43561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893331
1130	NC_003030	AT	3	6	43599	43604	50 %	50 %	0 %	0 %	15893331
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1132	NC_003030	TTA	2	6	43675	43680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893331
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