MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 5881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002971	CAAA	2	8	247	254	75 %	0 %	0 %	25 %	29653365
2	NC_002971	CCAA	2	8	401	408	50 %	0 %	0 %	50 %	29653365
3	NC_002971	TTTA	2	8	596	603	25 %	75 %	0 %	0 %	29653365
4	NC_002971	GATC	2	8	821	828	25 %	25 %	25 %	25 %	29653365
5	NC_002971	TCAA	2	8	1144	1151	50 %	25 %	0 %	25 %	29653365
6	NC_002971	TTGC	2	8	1430	1437	0 %	50 %	25 %	25 %	29653365
7	NC_002971	CAAA	2	8	2194	2201	75 %	0 %	0 %	25 %	29653366
8	NC_002971	AATT	2	8	2348	2355	50 %	50 %	0 %	0 %	29653366
9	NC_002971	ATCG	2	8	2416	2423	25 %	25 %	25 %	25 %	29653366
10	NC_002971	AATC	2	8	2877	2884	50 %	25 %	0 %	25 %	215918858
11	NC_002971	CGAT	2	8	3028	3035	25 %	25 %	25 %	25 %	215918858
12	NC_002971	CCTT	2	8	3188	3195	0 %	50 %	0 %	50 %	215918858
13	NC_002971	GTGG	2	8	3420	3427	0 %	25 %	75 %	0 %	215918858
14	NC_002971	TTAC	2	8	3585	3592	25 %	50 %	0 %	25 %	215918858
15	NC_002971	ATTT	2	8	3647	3654	25 %	75 %	0 %	0 %	215918858
16	NC_002971	TGAT	2	8	3702	3709	25 %	50 %	25 %	0 %	215918858
17	NC_002971	GCTT	2	8	4715	4722	0 %	50 %	25 %	25 %	215918859
18	NC_002971	CCAT	2	8	4840	4847	25 %	25 %	0 %	50 %	215918859
19	NC_002971	CACT	2	8	4973	4980	25 %	25 %	0 %	50 %	215918859
20	NC_002971	CTTG	2	8	5216	5223	0 %	50 %	25 %	25 %	215918859
21	NC_002971	TGAG	2	8	5995	6002	25 %	25 %	50 %	0 %	215918859
22	NC_002971	ACCC	2	8	6688	6695	25 %	0 %	0 %	75 %	215918860
23	NC_002971	GTAT	2	8	6869	6876	25 %	50 %	25 %	0 %	215918860
24	NC_002971	AGCG	2	8	7256	7263	25 %	0 %	50 %	25 %	215918860
25	NC_002971	TTGT	2	8	7304	7311	0 %	75 %	25 %	0 %	215918860
26	NC_002971	GGGT	2	8	7417	7424	0 %	25 %	75 %	0 %	215918860
27	NC_002971	GAAT	2	8	7684	7691	50 %	25 %	25 %	0 %	215918860
28	NC_002971	CTTT	2	8	8002	8009	0 %	75 %	0 %	25 %	215918861
29	NC_002971	GGGT	2	8	8036	8043	0 %	25 %	75 %	0 %	215918861
30	NC_002971	TAGC	2	8	8168	8175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_002971	TTAA	2	8	8247	8254	50 %	50 %	0 %	0 %	29653371
32	NC_002971	TATC	2	8	8818	8825	25 %	50 %	0 %	25 %	29653372
33	NC_002971	TTTA	2	8	9283	9290	25 %	75 %	0 %	0 %	215918863
34	NC_002971	CATC	2	8	9961	9968	25 %	25 %	0 %	50 %	29653373
35	NC_002971	ACCG	2	8	10594	10601	25 %	0 %	25 %	50 %	29653373
36	NC_002971	TCTT	2	8	11627	11634	0 %	75 %	0 %	25 %	29653374
37	NC_002971	TGAA	2	8	11890	11897	50 %	25 %	25 %	0 %	29653375
38	NC_002971	CGTT	2	8	12416	12423	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_002971	CTAA	2	8	12527	12534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_002971	TCGA	2	8	12885	12892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_002971	AATA	2	8	13255	13262	75 %	25 %	0 %	0 %	29653378
42	NC_002971	TGCG	2	8	13582	13589	0 %	25 %	50 %	25 %	29653378
43	NC_002971	ACCA	2	8	13622	13629	50 %	0 %	0 %	50 %	29653378
44	NC_002971	ATGG	2	8	14078	14085	25 %	25 %	50 %	0 %	29653378
45	NC_002971	TAAA	2	8	14245	14252	75 %	25 %	0 %	0 %	29653378
46	NC_002971	CCGA	2	8	14373	14380	25 %	0 %	25 %	50 %	29653378
47	NC_002971	CTTC	2	8	15280	15287	0 %	50 %	0 %	50 %	29653380
48	NC_002971	TTCA	2	8	16072	16079	25 %	50 %	0 %	25 %	29653380
49	NC_002971	TATC	2	8	16226	16233	25 %	50 %	0 %	25 %	29653381
50	NC_002971	ATCA	2	8	16315	16322	50 %	25 %	0 %	25 %	29653381
51	NC_002971	ATTA	2	8	16505	16512	50 %	50 %	0 %	0 %	29653381
52	NC_002971	AATT	2	8	16720	16727	50 %	50 %	0 %	0 %	29653381
53	NC_002971	ATTG	2	8	17069	17076	25 %	50 %	25 %	0 %	29653382
54	NC_002971	TTTC	2	8	17438	17445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_002971	TTCC	2	8	17908	17915	0 %	50 %	0 %	50 %	215918865
56	NC_002971	ATTG	2	8	18177	18184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002971	AAAT	2	8	18504	18511	75 %	25 %	0 %	0 %	29653385
58	NC_002971	AATC	2	8	18621	18628	50 %	25 %	0 %	25 %	29653385
59	NC_002971	AACT	2	8	18737	18744	50 %	25 %	0 %	25 %	29653385
60	NC_002971	GCTC	2	8	18929	18936	0 %	25 %	25 %	50 %	29653385
61	NC_002971	AATT	2	8	18968	18975	50 %	50 %	0 %	0 %	29653385
62	NC_002971	TTAA	2	8	19696	19703	50 %	50 %	0 %	0 %	29653385
63	NC_002971	TCAA	2	8	19795	19802	50 %	25 %	0 %	25 %	29653385
64	NC_002971	TAAA	2	8	19991	19998	75 %	25 %	0 %	0 %	29653385
65	NC_002971	AAAG	2	8	20070	20077	75 %	0 %	25 %	0 %	29653385
66	NC_002971	TTTC	2	8	20476	20483	0 %	75 %	0 %	25 %	29653385
67	NC_002971	TAAA	2	8	20720	20727	75 %	25 %	0 %	0 %	29653385
68	NC_002971	AAGA	2	8	20928	20935	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002971	TTCT	2	8	21209	21216	0 %	75 %	0 %	25 %	29653386
70	NC_002971	CCAC	2	8	21663	21670	25 %	0 %	0 %	75 %	29653386
71	NC_002971	GGTA	2	8	22025	22032	25 %	25 %	50 %	0 %	215918866
72	NC_002971	GTTT	2	8	22234	22241	0 %	75 %	25 %	0 %	215918866
73	NC_002971	GAGC	2	8	22924	22931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_002971	TCCA	2	8	23447	23454	25 %	25 %	0 %	50 %	29653390
75	NC_002971	TAAA	2	8	23720	23727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002971	ATTT	2	8	24070	24077	25 %	75 %	0 %	0 %	29653391
77	NC_002971	CCGC	2	8	24105	24112	0 %	0 %	25 %	75 %	29653391
78	NC_002971	TGAT	2	8	24440	24447	25 %	50 %	25 %	0 %	29653391
79	NC_002971	ATTT	2	8	24469	24476	25 %	75 %	0 %	0 %	29653391
80	NC_002971	CCGC	2	8	25053	25060	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_002971	ATAA	2	8	25634	25641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002971	ACCG	3	12	25767	25778	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002971	GGAC	2	8	26592	26599	25 %	0 %	50 %	25 %	215918867
84	NC_002971	GATA	2	8	26740	26747	50 %	25 %	25 %	0 %	215918867
85	NC_002971	CCGC	2	8	27014	27021	0 %	0 %	25 %	75 %	215918867
86	NC_002971	AAAG	2	8	27381	27388	75 %	0 %	25 %	0 %	29653393
87	NC_002971	AATA	2	8	29207	29214	75 %	25 %	0 %	0 %	29653394
88	NC_002971	ATTC	2	8	29216	29223	25 %	50 %	0 %	25 %	29653394
89	NC_002971	TTGA	2	8	29297	29304	25 %	50 %	25 %	0 %	29653394
90	NC_002971	CTTT	2	8	29484	29491	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_002971	TTTG	2	8	29734	29741	0 %	75 %	25 %	0 %	29653395
92	NC_002971	GGTA	2	8	30321	30328	25 %	25 %	50 %	0 %	29653396
93	NC_002971	ATCA	2	8	30745	30752	50 %	25 %	0 %	25 %	29653397
94	NC_002971	AATT	2	8	30762	30769	50 %	50 %	0 %	0 %	29653397
95	NC_002971	AACT	2	8	31802	31809	50 %	25 %	0 %	25 %	29653398
96	NC_002971	TAAA	2	8	32352	32359	75 %	25 %	0 %	0 %	29653399
97	NC_002971	GCAG	2	8	33155	33162	25 %	0 %	50 %	25 %	161511219
98	NC_002971	ATAA	2	8	33740	33747	75 %	25 %	0 %	0 %	29653401
99	NC_002971	GCCC	2	8	33812	33819	0 %	0 %	25 %	75 %	29653401
100	NC_002971	CATT	2	8	34363	34370	25 %	50 %	0 %	25 %	29653401
101	NC_002971	TAAA	2	8	34600	34607	75 %	25 %	0 %	0 %	29653402
102	NC_002971	GTTT	2	8	35326	35333	0 %	75 %	25 %	0 %	29653402
103	NC_002971	AACG	2	8	35886	35893	50 %	0 %	25 %	25 %	29653402
104	NC_002971	ATTT	2	8	36019	36026	25 %	75 %	0 %	0 %	29653402
105	NC_002971	TTTG	2	8	36037	36044	0 %	75 %	25 %	0 %	29653402
106	NC_002971	ATCA	2	8	36185	36192	50 %	25 %	0 %	25 %	29653402
107	NC_002971	ATTG	2	8	36240	36247	25 %	50 %	25 %	0 %	29653402
108	NC_002971	TGAA	2	8	36417	36424	50 %	25 %	25 %	0 %	29653402
109	NC_002971	GTTG	2	8	36457	36464	0 %	50 %	50 %	0 %	29653402
110	NC_002971	ACCC	2	8	36624	36631	25 %	0 %	0 %	75 %	215918869
111	NC_002971	GTAT	2	8	36805	36812	25 %	50 %	25 %	0 %	215918869
112	NC_002971	AGCG	2	8	37192	37199	25 %	0 %	50 %	25 %	215918869
113	NC_002971	TTGT	2	8	37240	37247	0 %	75 %	25 %	0 %	215918869
114	NC_002971	GGGT	2	8	37353	37360	0 %	25 %	75 %	0 %	215918869
115	NC_002971	GAAT	2	8	37620	37627	50 %	25 %	25 %	0 %	215918869
116	NC_002971	CTTT	2	8	37938	37945	0 %	75 %	0 %	25 %	215918870
117	NC_002971	GGGT	2	8	37972	37979	0 %	25 %	75 %	0 %	215918870
118	NC_002971	CTTC	2	8	38374	38381	0 %	50 %	0 %	50 %	29653404
119	NC_002971	ACCA	2	8	38445	38452	50 %	0 %	0 %	50 %	29653404
120	NC_002971	TAAA	2	8	38514	38521	75 %	25 %	0 %	0 %	29653404
121	NC_002971	TTGC	2	8	38666	38673	0 %	50 %	25 %	25 %	29653404
122	NC_002971	ATCC	2	8	39123	39130	25 %	25 %	0 %	50 %	29653404
123	NC_002971	GGCG	2	8	39172	39179	0 %	0 %	75 %	25 %	29653404
124	NC_002971	GCTT	2	8	39853	39860	0 %	50 %	25 %	25 %	29653404
125	NC_002971	TGAC	2	8	40137	40144	25 %	25 %	25 %	25 %	29653404
126	NC_002971	AATT	2	8	40394	40401	50 %	50 %	0 %	0 %	215918871
127	NC_002971	TAAA	2	8	40780	40787	75 %	25 %	0 %	0 %	215918871
128	NC_002971	CGAT	2	8	40869	40876	25 %	25 %	25 %	25 %	215918871
129	NC_002971	TCGC	2	8	41356	41363	0 %	25 %	25 %	50 %	215918871
130	NC_002971	ATTC	2	8	41487	41494	25 %	50 %	0 %	25 %	29653406
131	NC_002971	AAAC	2	8	41581	41588	75 %	0 %	0 %	25 %	29653406
132	NC_002971	TCGC	2	8	42167	42174	0 %	25 %	25 %	50 %	215918872
133	NC_002971	GGCT	2	8	42566	42573	0 %	25 %	50 %	25 %	215918872
134	NC_002971	GATA	2	8	42592	42599	50 %	25 %	25 %	0 %	215918872
135	NC_002971	GGAG	2	8	42861	42868	25 %	0 %	75 %	0 %	215918872
136	NC_002971	CGTT	2	8	43205	43212	0 %	50 %	25 %	25 %	29653408
137	NC_002971	GTGA	2	8	43391	43398	25 %	25 %	50 %	0 %	29653408
138	NC_002971	AGGA	2	8	43654	43661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002971	AAAT	2	8	43948	43955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002971	TCGC	2	8	44084	44091	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002971	TAAT	2	8	44110	44117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002971	TAAA	2	8	44254	44261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002971	ATGC	2	8	44357	44364	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_002971	AATT	2	8	44594	44601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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