MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 43750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002971	TGC	2	6	137358	137363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653509
3002	NC_002971	AG	3	6	137415	137420	50 %	0 %	50 %	0 %	29653509
3003	NC_002971	ATA	2	6	137448	137453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653509
3004	NC_002971	CGG	2	6	137616	137621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653509
3005	NC_002971	CGTT	2	8	137636	137643	0 %	50 %	25 %	25 %	29653509
3006	NC_002971	GGC	2	6	137725	137730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653509
3007	NC_002971	GGT	2	6	137798	137803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653509
3008	NC_002971	TGACGT	2	12	137811	137822	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29653509
3009	NC_002971	GTT	2	6	137894	137899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653509
3010	NC_002971	T	6	6	137960	137965	0 %	100 %	0 %	0 %	29653510
3011	NC_002971	TTG	2	6	138111	138116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653510
3012	NC_002971	CG	3	6	138131	138136	0 %	0 %	50 %	50 %	29653510
3013	NC_002971	CCA	3	9	138173	138181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653510
3014	NC_002971	CGAC	2	8	138200	138207	25 %	0 %	25 %	50 %	29653510
3015	NC_002971	T	8	8	138260	138267	0 %	100 %	0 %	0 %	29653510
3016	NC_002971	TAA	2	6	138303	138308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653510
3017	NC_002971	TGAT	2	8	138409	138416	25 %	50 %	25 %	0 %	29653510
3018	NC_002971	CGC	2	6	138429	138434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653510
3019	NC_002971	AGT	2	6	138503	138508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653510
3020	NC_002971	CCA	2	6	138538	138543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653510
3021	NC_002971	AATCC	2	10	138547	138556	40 %	20 %	0 %	40 %	29653510
3022	NC_002971	CCT	2	6	138568	138573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_002971	GTT	2	6	138666	138671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653511
3024	NC_002971	T	7	7	138681	138687	0 %	100 %	0 %	0 %	29653511
3025	NC_002971	TAG	2	6	138694	138699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653511
3026	NC_002971	CTT	2	6	138816	138821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653511
3027	NC_002971	T	6	6	138820	138825	0 %	100 %	0 %	0 %	29653511
3028	NC_002971	AATT	2	8	138829	138836	50 %	50 %	0 %	0 %	29653511
3029	NC_002971	CGG	2	6	138846	138851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653511
3030	NC_002971	A	8	8	138997	139004	100 %	0 %	0 %	0 %	29653511
3031	NC_002971	AGT	2	6	139025	139030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653511
3032	NC_002971	CCAG	2	8	139034	139041	25 %	0 %	25 %	50 %	29653511
3033	NC_002971	GCG	2	6	139119	139124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653511
3034	NC_002971	T	6	6	139128	139133	0 %	100 %	0 %	0 %	29653511
3035	NC_002971	TTA	2	6	139173	139178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653511
3036	NC_002971	T	7	7	139206	139212	0 %	100 %	0 %	0 %	29653511
3037	NC_002971	TAAAT	2	10	139243	139252	60 %	40 %	0 %	0 %	29653511
3038	NC_002971	TTTGG	2	10	139253	139262	0 %	60 %	40 %	0 %	29653511
3039	NC_002971	GCG	2	6	139310	139315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653511
3040	NC_002971	TA	3	6	139396	139401	50 %	50 %	0 %	0 %	29653511
3041	NC_002971	A	6	6	139415	139420	100 %	0 %	0 %	0 %	29653511
3042	NC_002971	AAT	2	6	139423	139428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653511
3043	NC_002971	GCT	2	6	139456	139461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653512
3044	NC_002971	CCG	2	6	139512	139517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653512
3045	NC_002971	TAA	2	6	139520	139525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653512
3046	NC_002971	TTC	2	6	139589	139594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653512
3047	NC_002971	ATAA	2	8	139598	139605	75 %	25 %	0 %	0 %	29653512
3048	NC_002971	AAT	2	6	139658	139663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653512
3049	NC_002971	TGG	2	6	139674	139679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653512
3050	NC_002971	A	6	6	139682	139687	100 %	0 %	0 %	0 %	29653512
3051	NC_002971	CAA	2	6	139734	139739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653512
3052	NC_002971	ATGAT	2	10	139779	139788	40 %	40 %	20 %	0 %	29653512
3053	NC_002971	TTA	2	6	139903	139908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653512
3054	NC_002971	T	7	7	139946	139952	0 %	100 %	0 %	0 %	29653512
3055	NC_002971	A	8	8	139988	139995	100 %	0 %	0 %	0 %	29653512
3056	NC_002971	TGA	3	9	140032	140040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653512
3057	NC_002971	GAA	2	6	140048	140053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653512
3058	NC_002971	CAA	2	6	140111	140116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653512
3059	NC_002971	T	7	7	140179	140185	0 %	100 %	0 %	0 %	29653512
3060	NC_002971	AAAC	2	8	140195	140202	75 %	0 %	0 %	25 %	29653512
3061	NC_002971	CTT	2	6	140203	140208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653512
3062	NC_002971	TAA	2	6	140219	140224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653512
3063	NC_002971	TAA	2	6	140228	140233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653512
3064	NC_002971	ATT	2	6	140268	140273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653512
3065	NC_002971	TCC	2	6	140393	140398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29653512
3066	NC_002971	TTA	2	6	140440	140445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653512
3067	NC_002971	T	6	6	140478	140483	0 %	100 %	0 %	0 %	29653512
3068	NC_002971	GCT	2	6	140587	140592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653513
3069	NC_002971	CCA	2	6	140966	140971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653513
3070	NC_002971	A	7	7	140995	141001	100 %	0 %	0 %	0 %	29653513
3071	NC_002971	GCG	2	6	141013	141018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653513
3072	NC_002971	TCT	2	6	141085	141090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653513
3073	NC_002971	T	7	7	141103	141109	0 %	100 %	0 %	0 %	29653513
3074	NC_002971	GTT	2	6	141197	141202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653513
3075	NC_002971	T	7	7	141206	141212	0 %	100 %	0 %	0 %	29653513
3076	NC_002971	ATG	2	6	141214	141219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653513
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3079	NC_002971	ATG	2	6	141267	141272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653513
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3081	NC_002971	CTA	2	6	141325	141330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653513
3082	NC_002971	TAAAA	2	10	141365	141374	80 %	20 %	0 %	0 %	29653513
3083	NC_002971	AG	3	6	141467	141472	50 %	0 %	50 %	0 %	29653513
3084	NC_002971	TAG	2	6	141473	141478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653513
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3089	NC_002971	GCA	2	6	141661	141666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653513
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3091	NC_002971	TAGC	2	8	141758	141765	25 %	25 %	25 %	25 %	29653513
3092	NC_002971	AAGT	2	8	141883	141890	50 %	25 %	25 %	0 %	29653513
3093	NC_002971	T	6	6	141908	141913	0 %	100 %	0 %	0 %	29653513
3094	NC_002971	GCA	2	6	141947	141952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653513
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3096	NC_002971	GTTA	2	8	142002	142009	25 %	50 %	25 %	0 %	29653513
3097	NC_002971	GCC	2	6	142067	142072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653514
3098	NC_002971	CCG	2	6	142079	142084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653514
3099	NC_002971	GAC	2	6	142339	142344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653514
3100	NC_002971	CCG	2	6	142360	142365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653514
3101	NC_002971	AAG	2	6	142380	142385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653514
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3104	NC_002971	ATA	2	6	142472	142477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653514
3105	NC_002971	TGA	2	6	142539	142544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_002971	CCT	2	6	142566	142571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_002971	GGT	2	6	142618	142623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_002971	TGA	2	6	142791	142796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918904
3109	NC_002971	CGTAA	2	10	142810	142819	40 %	20 %	20 %	20 %	215918904
3110	NC_002971	TCC	2	6	142841	142846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215918904
3111	NC_002971	CTG	2	6	142850	142855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215918904
3112	NC_002971	AAT	2	6	142939	142944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_002971	ATT	2	6	142967	142972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_002971	TA	3	6	142988	142993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_002971	CTT	2	6	143002	143007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_002971	AATTT	2	10	143015	143024	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_002971	ATT	2	6	143038	143043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653515
3118	NC_002971	CCT	2	6	143066	143071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29653515
3119	NC_002971	ATTC	2	8	143084	143091	25 %	50 %	0 %	25 %	29653515
3120	NC_002971	TCAA	2	8	143123	143130	50 %	25 %	0 %	25 %	29653515
3121	NC_002971	ACCC	2	8	143173	143180	25 %	0 %	0 %	75 %	29653516
3122	NC_002971	CAG	2	6	143195	143200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653516
3123	NC_002971	ACTA	2	8	143246	143253	50 %	25 %	0 %	25 %	29653516
3124	NC_002971	ATT	2	6	143267	143272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653516
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