MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 43750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002971	TCG	2	6	45151	45156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_002971	GTT	2	6	45207	45212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_002971	C	6	6	45218	45223	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1004	NC_002971	TTG	2	6	45241	45246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_002971	CTT	2	6	45248	45253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_002971	TTC	2	6	45268	45273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_002971	TTG	2	6	45280	45285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_002971	TAA	2	6	45420	45425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_002971	TAA	2	6	45466	45471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_002971	T	6	6	45542	45547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_002971	TTA	2	6	45593	45598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_002971	T	6	6	45602	45607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_002971	T	7	7	45705	45711	0 %	100 %	0 %	0 %	215918873
1014	NC_002971	ATG	2	6	45768	45773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918873
1015	NC_002971	ACG	2	6	45852	45857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918873
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1017	NC_002971	AAG	2	6	45975	45980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215918873
1018	NC_002971	T	6	6	45999	46004	0 %	100 %	0 %	0 %	215918873
1019	NC_002971	ACG	2	6	46011	46016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918873
1020	NC_002971	T	6	6	46018	46023	0 %	100 %	0 %	0 %	215918873
1021	NC_002971	TTG	2	6	46079	46084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215918873
1022	NC_002971	GAT	2	6	46292	46297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215918873
1023	NC_002971	CTT	2	6	46375	46380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215918873
1024	NC_002971	TCT	2	6	46428	46433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215918873
1025	NC_002971	GAG	2	6	46469	46474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215918873
1026	NC_002971	GGA	2	6	46487	46492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215918873
1027	NC_002971	TAAA	2	8	46497	46504	75 %	25 %	0 %	0 %	215918873
1028	NC_002971	GAA	3	9	46525	46533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215918873
1029	NC_002971	AGC	3	9	46560	46568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918873
1030	NC_002971	A	6	6	46585	46590	100 %	0 %	0 %	0 %	215918873
1031	NC_002971	GTT	2	6	46650	46655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_002971	T	6	6	46739	46744	0 %	100 %	0 %	0 %	29653410
1033	NC_002971	TGGAT	2	10	46758	46767	20 %	40 %	40 %	0 %	29653410
1034	NC_002971	AAAG	2	8	46769	46776	75 %	0 %	25 %	0 %	29653410
1035	NC_002971	TGA	2	6	46779	46784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653410
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1040	NC_002971	ATT	2	6	46933	46938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653410
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1042	NC_002971	TTA	2	6	46950	46955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653410
1043	NC_002971	TTGT	2	8	46960	46967	0 %	75 %	25 %	0 %	29653410
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1050	NC_002971	A	7	7	47370	47376	100 %	0 %	0 %	0 %	29653410
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1054	NC_002971	TTG	2	6	47642	47647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653410
1055	NC_002971	TAAA	2	8	47665	47672	75 %	25 %	0 %	0 %	29653410
1056	NC_002971	GAC	2	6	47689	47694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653410
1057	NC_002971	TAA	2	6	47698	47703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653410
1058	NC_002971	A	6	6	47730	47735	100 %	0 %	0 %	0 %	29653410
1059	NC_002971	CCAA	2	8	47749	47756	50 %	0 %	0 %	50 %	29653410
1060	NC_002971	AGCA	2	8	47866	47873	50 %	0 %	25 %	25 %	29653410
1061	NC_002971	AGG	2	6	48074	48079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_002971	TA	3	6	48094	48099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_002971	ATTC	2	8	48171	48178	25 %	50 %	0 %	25 %	29653411
1064	NC_002971	GAG	2	6	48201	48206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29653411
1065	NC_002971	TCG	2	6	48207	48212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653411
1066	NC_002971	GTGA	2	8	48218	48225	25 %	25 %	50 %	0 %	29653411
1067	NC_002971	GGC	2	6	48271	48276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29653411
1068	NC_002971	TAA	2	6	48280	48285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653411
1069	NC_002971	TCA	2	6	48311	48316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653411
1070	NC_002971	A	6	6	48329	48334	100 %	0 %	0 %	0 %	29653411
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1073	NC_002971	GAT	2	6	48514	48519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653411
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1075	NC_002971	GAA	2	6	48600	48605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653411
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1079	NC_002971	CTT	2	6	48804	48809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215918874
1080	NC_002971	TTG	2	6	48865	48870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215918874
1081	NC_002971	TA	3	6	48900	48905	50 %	50 %	0 %	0 %	215918874
1082	NC_002971	GCT	2	6	48912	48917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215918874
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1085	NC_002971	A	6	6	49091	49096	100 %	0 %	0 %	0 %	215918874
1086	NC_002971	GAATAA	2	12	49130	49141	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	215918874
1087	NC_002971	TAT	2	6	49155	49160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918874
1088	NC_002971	TAT	2	6	49221	49226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215918874
1089	NC_002971	T	6	6	49261	49266	0 %	100 %	0 %	0 %	215918874
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1091	NC_002971	A	6	6	49341	49346	100 %	0 %	0 %	0 %	215918874
1092	NC_002971	T	6	6	49368	49373	0 %	100 %	0 %	0 %	215918874
1093	NC_002971	CATG	2	8	49391	49398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_002971	A	6	6	49413	49418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_002971	CTA	2	6	49442	49447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_002971	A	8	8	49479	49486	100 %	0 %	0 %	0 %	29653414
1097	NC_002971	C	6	6	49586	49591	0 %	0 %	0 %	100 %	29653414
1098	NC_002971	ACC	2	6	49592	49597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653414
1099	NC_002971	GAA	2	6	49612	49617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653414
1100	NC_002971	TTA	2	6	49623	49628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653414
1101	NC_002971	ATT	2	6	49698	49703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653414
1102	NC_002971	TAA	2	6	49707	49712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653414
1103	NC_002971	GCGGGA	2	12	49713	49724	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	29653414
1104	NC_002971	TCC	2	6	49830	49835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29653414
1105	NC_002971	ATCC	2	8	49840	49847	25 %	25 %	0 %	50 %	29653414
1106	NC_002971	TCA	2	6	49851	49856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653414
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1108	NC_002971	GTC	2	6	49867	49872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653414
1109	NC_002971	TGC	2	6	49893	49898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653414
1110	NC_002971	G	7	7	49941	49947	0 %	0 %	100 %	0 %	29653414
1111	NC_002971	GGT	2	6	49986	49991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653414
1112	NC_002971	AGG	2	6	50016	50021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29653414
1113	NC_002971	G	7	7	50062	50068	0 %	0 %	100 %	0 %	29653414
1114	NC_002971	ATC	2	6	50218	50223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653414
1115	NC_002971	TCT	2	6	50286	50291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_002971	GAA	2	6	50307	50312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29653415
1117	NC_002971	T	6	6	50318	50323	0 %	100 %	0 %	0 %	29653415
1118	NC_002971	CT	3	6	50394	50399	0 %	50 %	0 %	50 %	29653415
1119	NC_002971	GTA	2	6	50575	50580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653415
1120	NC_002971	AG	3	6	50602	50607	50 %	0 %	50 %	0 %	29653415
1121	NC_002971	TTA	2	6	50718	50723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653415
1122	NC_002971	T	6	6	50816	50821	0 %	100 %	0 %	0 %	29653415
1123	NC_002971	AG	3	6	50838	50843	50 %	0 %	50 %	0 %	29653415
1124	NC_002971	CAA	2	6	50870	50875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653416
1125	NC_002971	ATT	2	6	50883	50888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653416
1126	NC_002971	T	7	7	50922	50928	0 %	100 %	0 %	0 %	29653416
1127	NC_002971	CTT	2	6	50979	50984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653416
1128	NC_002971	GC	3	6	51025	51030	0 %	0 %	50 %	50 %	29653416
1129	NC_002971	GTT	2	6	51181	51186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653416
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