MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 chromosome

Total Repeats: 43750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002971	GAC	2	6	23006	23011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_002971	GCGCTT	2	12	23018	23029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_002971	ATG	2	6	23039	23044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653390
504	NC_002971	ATC	2	6	23078	23083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653390
505	NC_002971	GCT	2	6	23089	23094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653390
506	NC_002971	CAA	2	6	23263	23268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653390
507	NC_002971	GAT	2	6	23375	23380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653390
508	NC_002971	T	6	6	23380	23385	0 %	100 %	0 %	0 %	29653390
509	NC_002971	CCG	2	6	23403	23408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653390
510	NC_002971	TTA	2	6	23430	23435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653390
511	NC_002971	TCA	2	6	23439	23444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653390
512	NC_002971	TCCA	2	8	23447	23454	25 %	25 %	0 %	50 %	29653390
513	NC_002971	CAA	2	6	23488	23493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653390
514	NC_002971	AAT	2	6	23590	23595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653390
515	NC_002971	GCT	2	6	23664	23669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653390
516	NC_002971	T	6	6	23669	23674	0 %	100 %	0 %	0 %	29653390
517	NC_002971	T	6	6	23682	23687	0 %	100 %	0 %	0 %	29653390
518	NC_002971	ATG	3	9	23691	23699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653390
519	NC_002971	TAAA	2	8	23720	23727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_002971	T	6	6	23795	23800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_002971	TGT	2	6	23811	23816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_002971	ATT	2	6	23833	23838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653391
523	NC_002971	T	6	6	23846	23851	0 %	100 %	0 %	0 %	29653391
524	NC_002971	GTA	2	6	23933	23938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653391
525	NC_002971	AAT	2	6	24037	24042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653391
526	NC_002971	TAA	2	6	24055	24060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653391
527	NC_002971	ATTT	2	8	24070	24077	25 %	75 %	0 %	0 %	29653391
528	NC_002971	CCGC	2	8	24105	24112	0 %	0 %	25 %	75 %	29653391
529	NC_002971	GCA	2	6	24121	24126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653391
530	NC_002971	GAGTG	2	10	24161	24170	20 %	20 %	60 %	0 %	29653391
531	NC_002971	CAA	2	6	24184	24189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653391
532	NC_002971	GAC	2	6	24274	24279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653391
533	NC_002971	CAA	2	6	24320	24325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29653391
534	NC_002971	CAG	2	6	24327	24332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653391
535	NC_002971	CCA	2	6	24340	24345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653391
536	NC_002971	ATA	2	6	24358	24363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653391
537	NC_002971	TC	3	6	24366	24371	0 %	50 %	0 %	50 %	29653391
538	NC_002971	A	6	6	24377	24382	100 %	0 %	0 %	0 %	29653391
539	NC_002971	AT	3	6	24427	24432	50 %	50 %	0 %	0 %	29653391
540	NC_002971	TGAT	2	8	24440	24447	25 %	50 %	25 %	0 %	29653391
541	NC_002971	TGA	2	6	24454	24459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653391
542	NC_002971	ATTT	2	8	24469	24476	25 %	75 %	0 %	0 %	29653391
543	NC_002971	GAT	2	6	24511	24516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653391
544	NC_002971	TAA	2	6	24527	24532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653391
545	NC_002971	GCC	2	6	24696	24701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653391
546	NC_002971	CCG	2	6	24789	24794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_002971	ATG	3	9	24862	24870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_002971	GCC	2	6	24880	24885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_002971	TG	3	6	24902	24907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_002971	T	6	6	24913	24918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_002971	AAT	2	6	24927	24932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_002971	T	7	7	24947	24953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_002971	A	8	8	24957	24964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_002971	TAA	2	6	24995	25000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_002971	ATTTT	2	10	25040	25049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_002971	CCGC	2	8	25053	25060	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
557	NC_002971	T	6	6	25093	25098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_002971	TGA	2	6	25103	25108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_002971	CGC	2	6	25251	25256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_002971	T	7	7	25284	25290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_002971	AC	3	6	25340	25345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_002971	AAGAT	2	10	25375	25384	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
563	NC_002971	CAT	2	6	25474	25479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_002971	GTT	2	6	25488	25493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_002971	ATA	2	6	25607	25612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_002971	ATAA	2	8	25634	25641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_002971	AAG	2	6	25662	25667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_002971	ACCG	3	12	25767	25778	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
569	NC_002971	ACC	2	6	25791	25796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_002971	AAT	2	6	25893	25898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_002971	AAT	2	6	25910	25915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_002971	CGA	2	6	26000	26005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_002971	CCG	2	6	26014	26019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_002971	TAA	2	6	26061	26066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_002971	GGT	2	6	26082	26087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_002971	ACA	2	6	26098	26103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_002971	CGG	2	6	26109	26114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_002971	GT	3	6	26170	26175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_002971	TGC	2	6	26233	26238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_002971	A	6	6	26239	26244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_002971	T	6	6	26327	26332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_002971	GTT	2	6	26372	26377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_002971	C	6	6	26387	26392	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
584	NC_002971	CCA	2	6	26397	26402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_002971	ATC	2	6	26444	26449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215918867
586	NC_002971	CAA	2	6	26495	26500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215918867
587	NC_002971	AGG	2	6	26518	26523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215918867
588	NC_002971	GGAC	2	8	26592	26599	25 %	0 %	50 %	25 %	215918867
589	NC_002971	T	6	6	26623	26628	0 %	100 %	0 %	0 %	215918867
590	NC_002971	AGC	2	6	26684	26689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215918867
591	NC_002971	T	6	6	26693	26698	0 %	100 %	0 %	0 %	215918867
592	NC_002971	GATA	2	8	26740	26747	50 %	25 %	25 %	0 %	215918867
593	NC_002971	T	8	8	26759	26766	0 %	100 %	0 %	0 %	215918867
594	NC_002971	GCC	2	6	26785	26790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215918867
595	NC_002971	TCG	2	6	26873	26878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215918867
596	NC_002971	A	7	7	26882	26888	100 %	0 %	0 %	0 %	215918867
597	NC_002971	CGC	2	6	26897	26902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215918867
598	NC_002971	CCGC	2	8	27014	27021	0 %	0 %	25 %	75 %	215918867
599	NC_002971	T	6	6	27095	27100	0 %	100 %	0 %	0 %	215918867
600	NC_002971	TCT	2	6	27116	27121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653393
601	NC_002971	T	6	6	27121	27126	0 %	100 %	0 %	0 %	29653393
602	NC_002971	TTA	2	6	27157	27162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653393
603	NC_002971	GCT	2	6	27175	27180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653393
604	NC_002971	CTAATG	2	12	27191	27202	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	29653393
605	NC_002971	TGA	2	6	27212	27217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653393
606	NC_002971	TGA	2	6	27234	27239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653393
607	NC_002971	TGA	2	6	27257	27262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653393
608	NC_002971	TGT	2	6	27277	27282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29653393
609	NC_002971	AAAG	2	8	27381	27388	75 %	0 %	25 %	0 %	29653393
610	NC_002971	AGG	2	6	27616	27621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29653393
611	NC_002971	TAA	2	6	27663	27668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653393
612	NC_002971	CCG	2	6	27761	27766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653393
613	NC_002971	TTA	2	6	27821	27826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29653393
614	NC_002971	T	6	6	27859	27864	0 %	100 %	0 %	0 %	29653393
615	NC_002971	A	6	6	27929	27934	100 %	0 %	0 %	0 %	29653393
616	NC_002971	CCG	2	6	27979	27984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653393
617	NC_002971	GTA	2	6	28056	28061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29653393
618	NC_002971	AC	3	6	28090	28095	50 %	0 %	0 %	50 %	29653393
619	NC_002971	CGT	2	6	28219	28224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29653393
620	NC_002971	T	6	6	28259	28264	0 %	100 %	0 %	0 %	29653393
621	NC_002971	CAT	2	6	28311	28316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_002971	TCA	2	6	28373	28378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29653394
623	NC_002971	AAT	2	6	28412	28417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653394
624	NC_002971	ACC	2	6	28458	28463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29653394
625	NC_002971	GCAGG	2	10	28555	28564	20 %	0 %	60 %	20 %	29653394
626	NC_002971	GCA	2	6	28611	28616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653394
627	NC_002971	GA	3	6	28636	28641	50 %	0 %	50 %	0 %	29653394
628	NC_002971	CCG	2	6	28672	28677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29653394
629	NC_002971	AAT	2	6	28743	28748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29653394
630	NC_002971	TCT	2	6	28818	28823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653394
631	NC_002971	GTG	2	6	28889	28894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29653394
632	NC_002971	TCT	2	6	28971	28976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29653394
633	NC_002971	AGC	2	6	29028	29033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29653394
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635	NC_002971	T	6	6	29173	29178	0 %	100 %	0 %	0 %	29653394
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