MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 46002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002932	GCC	2	6	47716	47721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672890
1002	NC_002932	GCG	2	6	47731	47736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672890
1003	NC_002932	GCC	2	6	47781	47786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672890
1004	NC_002932	CCGTC	2	10	47937	47946	0 %	20 %	20 %	60 %	21672890
1005	NC_002932	CGA	2	6	47978	47983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672890
1006	NC_002932	GAA	2	6	47994	47999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672890
1007	NC_002932	TTCG	2	8	48000	48007	0 %	50 %	25 %	25 %	21672890
1008	NC_002932	CCG	2	6	48171	48176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672890
1009	NC_002932	GCG	3	9	48180	48188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672890
1010	NC_002932	GCT	2	6	48194	48199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672890
1011	NC_002932	C	6	6	48229	48234	0 %	0 %	0 %	100 %	21672891
1012	NC_002932	GCG	2	6	48270	48275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672891
1013	NC_002932	CG	3	6	48308	48313	0 %	0 %	50 %	50 %	21672891
1014	NC_002932	ACG	2	6	48376	48381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672891
1015	NC_002932	CCG	2	6	48391	48396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672891
1016	NC_002932	CTG	2	6	48437	48442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672891
1017	NC_002932	CGG	2	6	48485	48490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672891
1018	NC_002932	CGC	2	6	48493	48498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672891
1019	NC_002932	CGT	2	6	48532	48537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672891
1020	NC_002932	CGG	2	6	48569	48574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672891
1021	NC_002932	TGCCG	2	10	48602	48611	0 %	20 %	40 %	40 %	21672891
1022	NC_002932	CACGG	2	10	48620	48629	20 %	0 %	40 %	40 %	21672891
1023	NC_002932	T	6	6	48634	48639	0 %	100 %	0 %	0 %	21672891
1024	NC_002932	CGA	2	6	48682	48687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672891
1025	NC_002932	CG	3	6	48695	48700	0 %	0 %	50 %	50 %	21672891
1026	NC_002932	CCG	2	6	48778	48783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672891
1027	NC_002932	ATCC	2	8	48824	48831	25 %	25 %	0 %	50 %	21672891
1028	NC_002932	AGC	2	6	48849	48854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672891
1029	NC_002932	GCG	2	6	48926	48931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672892
1030	NC_002932	CGC	2	6	48936	48941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672892
1031	NC_002932	CGG	2	6	48997	49002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672892
1032	NC_002932	CAC	2	6	49078	49083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672892
1033	NC_002932	CGC	2	6	49147	49152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672892
1034	NC_002932	GTT	2	6	49191	49196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672892
1035	NC_002932	AGCG	2	8	49219	49226	25 %	0 %	50 %	25 %	21672892
1036	NC_002932	GGT	2	6	49243	49248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672892
1037	NC_002932	CGG	2	6	49317	49322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672892
1038	NC_002932	CGA	2	6	49347	49352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672892
1039	NC_002932	ACG	2	6	49459	49464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672892
1040	NC_002932	GAC	2	6	49479	49484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672892
1041	NC_002932	CT	3	6	49552	49557	0 %	50 %	0 %	50 %	21672892
1042	NC_002932	GGC	2	6	49558	49563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672892
1043	NC_002932	GCT	2	6	49572	49577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672892
1044	NC_002932	GGT	2	6	49584	49589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672892
1045	NC_002932	GCG	2	6	49609	49614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672892
1046	NC_002932	TCGGCG	2	12	49619	49630	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	21672892
1047	NC_002932	GAT	2	6	49645	49650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672892
1048	NC_002932	GGC	3	9	49768	49776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672892
1049	NC_002932	GTG	2	6	49807	49812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672892
1050	NC_002932	CAG	2	6	49819	49824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672892
1051	NC_002932	CGA	2	6	49828	49833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672892
1052	NC_002932	CGTC	2	8	49853	49860	0 %	25 %	25 %	50 %	21672892
1053	NC_002932	ATC	2	6	49870	49875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672892
1054	NC_002932	GCCGAG	2	12	49918	49929	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	21672892
1055	NC_002932	GAG	2	6	49940	49945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672892
1056	NC_002932	CAG	2	6	49951	49956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672892
1057	NC_002932	CGCTC	2	10	49986	49995	0 %	20 %	20 %	60 %	21672892
1058	NC_002932	GCT	2	6	50022	50027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672892
1059	NC_002932	CGG	2	6	50071	50076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672892
1060	NC_002932	CCG	2	6	50102	50107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672892
1061	NC_002932	CGGT	2	8	50143	50150	0 %	25 %	50 %	25 %	21672893
1062	NC_002932	CGT	2	6	50169	50174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672893
1063	NC_002932	CCG	2	6	50182	50187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672893
1064	NC_002932	TCA	2	6	50237	50242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672893
1065	NC_002932	CGG	2	6	50255	50260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672893
1066	NC_002932	TGA	2	6	50267	50272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672893
1067	NC_002932	GGC	2	6	50291	50296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672893
1068	NC_002932	GCG	2	6	50351	50356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672893
1069	NC_002932	CGCCGA	2	12	50450	50461	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	21672893
1070	NC_002932	GCC	2	6	50466	50471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672893
1071	NC_002932	GCC	2	6	50501	50506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672893
1072	NC_002932	CGTT	2	8	50521	50528	0 %	50 %	25 %	25 %	21672893
1073	NC_002932	CGTG	2	8	50534	50541	0 %	25 %	50 %	25 %	21672893
1074	NC_002932	GATGTT	2	12	50580	50591	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21672893
1075	NC_002932	CGG	3	9	50621	50629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672893
1076	NC_002932	TGT	2	6	50855	50860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672893
1077	NC_002932	GCC	2	6	51014	51019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672893
1078	NC_002932	CGAG	2	8	51038	51045	25 %	0 %	50 %	25 %	21672893
1079	NC_002932	GACA	2	8	51161	51168	50 %	0 %	25 %	25 %	21672894
1080	NC_002932	AGG	2	6	51195	51200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672894
1081	NC_002932	GCG	2	6	51208	51213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672894
1082	NC_002932	GCT	2	6	51349	51354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672894
1083	NC_002932	CGG	2	6	51370	51375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672894
1084	NC_002932	AGC	2	6	51378	51383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672894
1085	NC_002932	CGATGG	2	12	51412	51423	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21672894
1086	NC_002932	CTC	2	6	51443	51448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672894
1087	NC_002932	CAC	3	9	51485	51493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672894
1088	NC_002932	GT	3	6	51497	51502	0 %	50 %	50 %	0 %	21672894
1089	NC_002932	CGCC	2	8	51549	51556	0 %	0 %	25 %	75 %	21672894
1090	NC_002932	TGA	2	6	51559	51564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672894
1091	NC_002932	TGA	2	6	51580	51585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672894
1092	NC_002932	GCC	2	6	51588	51593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672894
1093	NC_002932	CGC	4	12	51629	51640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672894
1094	NC_002932	CGGG	2	8	51676	51683	0 %	0 %	75 %	25 %	21672894
1095	NC_002932	GCA	2	6	51685	51690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672894
1096	NC_002932	CG	3	6	51731	51736	0 %	0 %	50 %	50 %	21672894
1097	NC_002932	CG	4	8	51816	51823	0 %	0 %	50 %	50 %	21672894
1098	NC_002932	AGAT	2	8	51849	51856	50 %	25 %	25 %	0 %	21672894
1099	NC_002932	CAG	2	6	51884	51889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672894
1100	NC_002932	GGC	2	6	52126	52131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_002932	TGG	2	6	52148	52153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_002932	GAAG	2	8	52155	52162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_002932	GAAAA	2	10	52192	52201	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_002932	CT	3	6	52203	52208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_002932	ATC	2	6	52252	52257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_002932	TTG	2	6	52293	52298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_002932	CGC	2	6	52353	52358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672895
1108	NC_002932	CTG	2	6	52392	52397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672895
1109	NC_002932	TTC	2	6	52458	52463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672895
1110	NC_002932	ATT	2	6	52557	52562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672895
1111	NC_002932	TGT	2	6	52565	52570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672895
1112	NC_002932	TGC	2	6	52640	52645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672895
1113	NC_002932	ATG	2	6	52648	52653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672895
1114	NC_002932	TCG	2	6	52660	52665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672895
1115	NC_002932	TGA	2	6	52706	52711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672895
1116	NC_002932	GGC	2	6	52740	52745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672895
1117	NC_002932	TGT	2	6	52796	52801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672895
1118	NC_002932	TGA	2	6	52826	52831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672895
1119	NC_002932	GCC	2	6	52839	52844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672895
1120	NC_002932	TCC	2	6	52891	52896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672895
1121	NC_002932	TGA	2	6	52937	52942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672895
1122	NC_002932	GCC	2	6	53022	53027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672895
1123	NC_002932	CCT	2	6	53087	53092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672895
1124	NC_002932	GCG	2	6	53097	53102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672895
1125	NC_002932	TCGACA	2	12	53128	53139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21672895
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1127	NC_002932	T	6	6	53167	53172	0 %	100 %	0 %	0 %	21672895
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1255	NC_002932	ATG	2	6	58845	58850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672897
1256	NC_002932	GCG	2	6	58853	58858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672897
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1258	NC_002932	CTG	2	6	59075	59080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672897
1259	NC_002932	AGC	2	6	59201	59206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672898
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1263	NC_002932	GCC	2	6	59321	59326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672898
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1265	NC_002932	A	9	9	59490	59498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_002932	GCC	2	6	59568	59573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672899
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1301	NC_002932	CGG	2	6	61443	61448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672902
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1339	NC_002932	GCGCTC	2	12	62937	62948	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21672903
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1342	NC_002932	GCC	2	6	63110	63115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672903
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1356	NC_002932	ATCG	2	8	63666	63673	25 %	25 %	25 %	25 %	21672904
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1359	NC_002932	TCG	2	6	63842	63847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672904
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1365	NC_002932	CTC	2	6	64150	64155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672904
1366	NC_002932	GCC	2	6	64164	64169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672904
1367	NC_002932	GA	3	6	64205	64210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1368	NC_002932	GAC	2	6	64252	64257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1369	NC_002932	TTC	2	6	64280	64285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1370	NC_002932	CAG	2	6	64320	64325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1371	NC_002932	AGC	2	6	64387	64392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1372	NC_002932	AGC	2	6	64411	64416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1373	NC_002932	CG	3	6	64469	64474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1374	NC_002932	CT	3	6	64522	64527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1375	NC_002932	CGA	2	6	64563	64568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672905
1376	NC_002932	CGG	2	6	64574	64579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672905
1377	NC_002932	CGGTC	2	10	64598	64607	0 %	20 %	40 %	40 %	21672905
1378	NC_002932	CGG	2	6	64644	64649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672905
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