MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 46002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002932	CGGT	2	8	26568	26575	0 %	25 %	50 %	25 %	21672871
502	NC_002932	GAC	2	6	26582	26587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672871
503	NC_002932	CAT	2	6	26615	26620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672871
504	NC_002932	TTG	2	6	26622	26627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672871
505	NC_002932	GCC	2	6	26636	26641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672871
506	NC_002932	CCG	2	6	26646	26651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672871
507	NC_002932	CT	3	6	26727	26732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_002932	CAA	2	6	26804	26809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672872
509	NC_002932	CTT	2	6	26811	26816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672872
510	NC_002932	GTT	2	6	26997	27002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672872
511	NC_002932	GCC	2	6	27018	27023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672872
512	NC_002932	GC	3	6	27101	27106	0 %	0 %	50 %	50 %	21672872
513	NC_002932	CGC	3	9	27104	27112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672872
514	NC_002932	TGA	3	9	27116	27124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672872
515	NC_002932	GTA	2	6	27144	27149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672872
516	NC_002932	TGA	2	6	27161	27166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672872
517	NC_002932	CAT	2	6	27192	27197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672872
518	NC_002932	GAT	2	6	27207	27212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672872
519	NC_002932	TCC	3	9	27277	27285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672872
520	NC_002932	CGT	2	6	27341	27346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672872
521	NC_002932	GGT	2	6	27450	27455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672872
522	NC_002932	GCC	3	9	27456	27464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672872
523	NC_002932	CAC	3	9	27474	27482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672872
524	NC_002932	TCA	2	6	27506	27511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672872
525	NC_002932	GCCT	2	8	27561	27568	0 %	25 %	25 %	50 %	21672872
526	NC_002932	ACG	2	6	27613	27618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672872
527	NC_002932	GATCG	2	10	27657	27666	20 %	20 %	40 %	20 %	21672872
528	NC_002932	CGA	2	6	27686	27691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672872
529	NC_002932	GC	3	6	27848	27853	0 %	0 %	50 %	50 %	21672872
530	NC_002932	CGA	2	6	27888	27893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672872
531	NC_002932	TTG	2	6	27940	27945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672872
532	NC_002932	ACC	2	6	27952	27957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672872
533	NC_002932	GC	3	6	27985	27990	0 %	0 %	50 %	50 %	21672872
534	NC_002932	CGT	2	6	28019	28024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672872
535	NC_002932	CGA	3	9	28034	28042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672872
536	NC_002932	GCC	2	6	28136	28141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672873
537	NC_002932	CTT	2	6	28183	28188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672873
538	NC_002932	CT	3	6	28213	28218	0 %	50 %	0 %	50 %	21672873
539	NC_002932	CGAC	2	8	28234	28241	25 %	0 %	25 %	50 %	21672873
540	NC_002932	T	7	7	28259	28265	0 %	100 %	0 %	0 %	21672873
541	NC_002932	CAA	2	6	28267	28272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672873
542	NC_002932	T	6	6	28295	28300	0 %	100 %	0 %	0 %	21672873
543	NC_002932	CGT	2	6	28321	28326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672873
544	NC_002932	ACA	2	6	28332	28337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672873
545	NC_002932	CGA	2	6	28438	28443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672873
546	NC_002932	GC	3	6	28499	28504	0 %	0 %	50 %	50 %	21672873
547	NC_002932	TCG	2	6	28563	28568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672873
548	NC_002932	TTCC	2	8	28579	28586	0 %	50 %	0 %	50 %	21672873
549	NC_002932	CGC	2	6	28635	28640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672873
550	NC_002932	CGG	2	6	28722	28727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672873
551	NC_002932	TCG	2	6	28731	28736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672873
552	NC_002932	T	6	6	28755	28760	0 %	100 %	0 %	0 %	21672873
553	NC_002932	GGC	2	6	28777	28782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672873
554	NC_002932	CGC	2	6	28813	28818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672873
555	NC_002932	ACC	3	9	28821	28829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672873
556	NC_002932	CTG	2	6	28844	28849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672873
557	NC_002932	CCG	2	6	28885	28890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672873
558	NC_002932	AGC	3	9	28893	28901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672873
559	NC_002932	GCG	2	6	28902	28907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672873
560	NC_002932	TCA	3	9	28912	28920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672873
561	NC_002932	TTG	2	6	29053	29058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_002932	CGG	2	6	29078	29083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_002932	TGC	2	6	29110	29115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672874
564	NC_002932	GCG	2	6	29133	29138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672874
565	NC_002932	CG	3	6	29142	29147	0 %	0 %	50 %	50 %	21672874
566	NC_002932	CGCC	2	8	29164	29171	0 %	0 %	25 %	75 %	21672874
567	NC_002932	CCT	3	9	29203	29211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672874
568	NC_002932	AGC	2	6	29223	29228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672874
569	NC_002932	CGG	2	6	29266	29271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672874
570	NC_002932	CCA	2	6	29287	29292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672874
571	NC_002932	CG	3	6	29329	29334	0 %	0 %	50 %	50 %	21672874
572	NC_002932	CCG	2	6	29404	29409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672874
573	NC_002932	TCG	2	6	29517	29522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672874
574	NC_002932	GCG	3	9	29564	29572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672874
575	NC_002932	GGCCA	2	10	29588	29597	20 %	0 %	40 %	40 %	21672874
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578	NC_002932	CCGA	2	8	29634	29641	25 %	0 %	25 %	50 %	21672874
579	NC_002932	GCC	2	6	29646	29651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672874
580	NC_002932	TGCC	2	8	29670	29677	0 %	25 %	25 %	50 %	21672874
581	NC_002932	TGC	2	6	29734	29739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672874
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584	NC_002932	GCA	2	6	29855	29860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672874
585	NC_002932	CCCG	2	8	29866	29873	0 %	0 %	25 %	75 %	21672874
586	NC_002932	CG	3	6	29999	30004	0 %	0 %	50 %	50 %	21672874
587	NC_002932	TCG	2	6	30012	30017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672874
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589	NC_002932	CGC	2	6	30079	30084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672874
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593	NC_002932	TCG	2	6	30213	30218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672874
594	NC_002932	TGA	2	6	30223	30228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672874
595	NC_002932	GCG	2	6	30249	30254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672874
596	NC_002932	GAG	2	6	30288	30293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672874
597	NC_002932	GAC	2	6	30296	30301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672874
598	NC_002932	TCGC	2	8	30306	30313	0 %	25 %	25 %	50 %	21672874
599	NC_002932	CAG	3	9	30425	30433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672874
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601	NC_002932	CGA	2	6	30469	30474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672874
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603	NC_002932	GAT	2	6	30536	30541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672875
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609	NC_002932	GTC	2	6	30674	30679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672875
610	NC_002932	GCC	2	6	30738	30743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672875
611	NC_002932	CCCG	2	8	30810	30817	0 %	0 %	25 %	75 %	21672875
612	NC_002932	CGG	2	6	30832	30837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672875
613	NC_002932	GC	3	6	30928	30933	0 %	0 %	50 %	50 %	21672875
614	NC_002932	GTT	2	6	30992	30997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672875
615	NC_002932	CAG	2	6	31031	31036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672875
616	NC_002932	CGG	2	6	31090	31095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672875
617	NC_002932	TCC	2	6	31139	31144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672875
618	NC_002932	CTC	2	6	31160	31165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672875
619	NC_002932	GC	3	6	31193	31198	0 %	0 %	50 %	50 %	21672875
620	NC_002932	CAG	2	6	31199	31204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672875
621	NC_002932	CGT	2	6	31208	31213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672875
622	NC_002932	TCT	2	6	31249	31254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672875
623	NC_002932	GCG	2	6	31269	31274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672875
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625	NC_002932	GC	3	6	31285	31290	0 %	0 %	50 %	50 %	21672875
626	NC_002932	GCC	2	6	31298	31303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672875
627	NC_002932	CAC	3	9	31310	31318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672875
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629	NC_002932	CCA	2	6	31396	31401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672875
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639	NC_002932	TGA	2	6	31743	31748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672876
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641	NC_002932	TGA	2	6	31800	31805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672876
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752	NC_002932	CGA	2	6	36538	36543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672879
753	NC_002932	CG	3	6	36550	36555	0 %	0 %	50 %	50 %	21672879
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755	NC_002932	CGA	2	6	36595	36600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672879
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757	NC_002932	ACC	3	9	36675	36683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672879
758	NC_002932	TCG	2	6	36687	36692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672879
759	NC_002932	ACG	2	6	36723	36728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672879
760	NC_002932	CCCG	2	8	36732	36739	0 %	0 %	25 %	75 %	21672879
761	NC_002932	TCATT	2	10	36797	36806	20 %	60 %	0 %	20 %	21672880
762	NC_002932	GTG	2	6	36845	36850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672880
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802	NC_002932	GCG	2	6	38268	38273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672880
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817	NC_002932	GTA	2	6	38728	38733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672881
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819	NC_002932	CAC	2	6	38896	38901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672881
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823	NC_002932	GGGCGT	2	12	39150	39161	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	21672881
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842	NC_002932	CAG	2	6	40153	40158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672881
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858	NC_002932	CCT	2	6	40780	40785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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863	NC_002932	ATCCT	2	10	40980	40989	20 %	40 %	0 %	40 %	21672883
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870	NC_002932	CTC	2	6	41249	41254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672883
871	NC_002932	GAA	2	6	41264	41269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672883
872	NC_002932	CGG	3	9	41311	41319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672883
873	NC_002932	CAT	2	6	41465	41470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672883
874	NC_002932	GGC	2	6	41515	41520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672883
875	NC_002932	TTC	2	6	41544	41549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672883
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877	NC_002932	GTG	2	6	41774	41779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672884
878	NC_002932	AGC	2	6	41803	41808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672884
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880	NC_002932	GC	3	6	41949	41954	0 %	0 %	50 %	50 %	21672884
881	NC_002932	TGG	2	6	41963	41968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672884
882	NC_002932	TGC	2	6	42013	42018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672884
883	NC_002932	CGAG	2	8	42053	42060	25 %	0 %	50 %	25 %	21672884
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