MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia muridarum Nigg

Total Repeats: 23890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002620	T	6	6	20961	20966	0 %	100 %	0 %	0 %	15834638
502	NC_002620	CGA	2	6	21143	21148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15834639
503	NC_002620	TAAT	2	8	21280	21287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_002620	TTTTA	2	10	21311	21320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_002620	A	6	6	21343	21348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_002620	TGT	2	6	21466	21471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834640
507	NC_002620	GAA	2	6	21487	21492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834640
508	NC_002620	TCT	2	6	21580	21585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834640
509	NC_002620	T	6	6	21603	21608	0 %	100 %	0 %	0 %	15834640
510	NC_002620	AGT	2	6	21612	21617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834640
511	NC_002620	AAG	2	6	21629	21634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834640
512	NC_002620	CTG	2	6	21638	21643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15834640
513	NC_002620	AGG	2	6	21681	21686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15834640
514	NC_002620	TGC	2	6	21725	21730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15834640
515	NC_002620	GAA	2	6	21766	21771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834640
516	NC_002620	T	7	7	21861	21867	0 %	100 %	0 %	0 %	15834640
517	NC_002620	TGTT	2	8	21895	21902	0 %	75 %	25 %	0 %	15834640
518	NC_002620	TTA	2	6	21922	21927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834640
519	NC_002620	GGA	2	6	21963	21968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15834640
520	NC_002620	TTA	2	6	21970	21975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834640
521	NC_002620	CTTA	2	8	22034	22041	25 %	50 %	0 %	25 %	15834640
522	NC_002620	ATCT	2	8	22112	22119	25 %	50 %	0 %	25 %	15834640
523	NC_002620	GTA	2	6	22172	22177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834640
524	NC_002620	AAAG	2	8	22241	22248	75 %	0 %	25 %	0 %	15834640
525	NC_002620	CT	3	6	22283	22288	0 %	50 %	0 %	50 %	15834640
526	NC_002620	T	8	8	22318	22325	0 %	100 %	0 %	0 %	15834640
527	NC_002620	TCT	2	6	22360	22365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834640
528	NC_002620	A	6	6	22369	22374	100 %	0 %	0 %	0 %	15834640
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531	NC_002620	TC	3	6	22529	22534	0 %	50 %	0 %	50 %	15834640
532	NC_002620	GAA	2	6	22567	22572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834640
533	NC_002620	TGGG	2	8	22580	22587	0 %	25 %	75 %	0 %	15834640
534	NC_002620	GAA	2	6	22624	22629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834640
535	NC_002620	GGGA	2	8	22732	22739	25 %	0 %	75 %	0 %	15834640
536	NC_002620	GTA	2	6	22762	22767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834641
537	NC_002620	TTA	2	6	22768	22773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834641
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539	NC_002620	TTC	2	6	22833	22838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834641
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541	NC_002620	CT	3	6	22922	22927	0 %	50 %	0 %	50 %	15834641
542	NC_002620	GCT	2	6	22933	22938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15834641
543	NC_002620	CAA	2	6	22942	22947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15834641
544	NC_002620	AGTT	2	8	22982	22989	25 %	50 %	25 %	0 %	15834641
545	NC_002620	T	7	7	22988	22994	0 %	100 %	0 %	0 %	15834641
546	NC_002620	AAG	2	6	23046	23051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834641
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548	NC_002620	TGT	2	6	23096	23101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834641
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551	NC_002620	AGAT	2	8	23159	23166	50 %	25 %	25 %	0 %	15834641
552	NC_002620	ATT	2	6	23193	23198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834641
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554	NC_002620	TCTT	2	8	23232	23239	0 %	75 %	0 %	25 %	15834641
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558	NC_002620	AAAAG	2	10	23453	23462	80 %	0 %	20 %	0 %	15834642
559	NC_002620	T	6	6	23486	23491	0 %	100 %	0 %	0 %	15834642
560	NC_002620	TTGC	2	8	23551	23558	0 %	50 %	25 %	25 %	15834642
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562	NC_002620	TAT	2	6	23568	23573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834642
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568	NC_002620	T	6	6	23882	23887	0 %	100 %	0 %	0 %	15834642
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593	NC_002620	AGGT	2	8	24912	24919	25 %	25 %	50 %	0 %	15834643
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597	NC_002620	GGGGT	2	10	25043	25052	0 %	20 %	80 %	0 %	15834643
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600	NC_002620	TTCA	2	8	25191	25198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_002620	T	7	7	25210	25216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_002620	GAG	2	6	25280	25285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_002620	CCT	2	6	25298	25303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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605	NC_002620	CAA	2	6	25329	25334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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614	NC_002620	TTA	2	6	25919	25924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834644
615	NC_002620	GA	3	6	25934	25939	50 %	0 %	50 %	0 %	15834644
616	NC_002620	G	6	6	25978	25983	0 %	0 %	100 %	0 %	15834644
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620	NC_002620	CTC	2	6	26105	26110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15834644
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631	NC_002620	C	6	6	26471	26476	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
632	NC_002620	TC	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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634	NC_002620	TGT	2	6	26569	26574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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