MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia muridarum Nigg

Total Repeats: 23890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_002620	AGA	2	6	222818	222823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834810
5003	NC_002620	AG	3	6	222828	222833	50 %	0 %	50 %	0 %	15834810
5004	NC_002620	GAAC	2	8	222996	223003	50 %	0 %	25 %	25 %	15834810
5005	NC_002620	GAG	2	6	223021	223026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15834810
5006	NC_002620	GTT	2	6	223144	223149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834810
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5009	NC_002620	TCT	2	6	223302	223307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834810
5010	NC_002620	TTG	2	6	223346	223351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834810
5011	NC_002620	TAA	2	6	223361	223366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15834810
5012	NC_002620	GCA	2	6	223368	223373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15834810
5013	NC_002620	GATA	2	8	223405	223412	50 %	25 %	25 %	0 %	15834810
5014	NC_002620	GTT	2	6	223558	223563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834810
5015	NC_002620	AAGT	2	8	223591	223598	50 %	25 %	25 %	0 %	15834810
5016	NC_002620	GA	3	6	223670	223675	50 %	0 %	50 %	0 %	15834810
5017	NC_002620	T	6	6	223718	223723	0 %	100 %	0 %	0 %	15834810
5018	NC_002620	AAGCA	2	10	223724	223733	60 %	0 %	20 %	20 %	15834810
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5020	NC_002620	GGA	2	6	223880	223885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15834810
5021	NC_002620	GA	3	6	223945	223950	50 %	0 %	50 %	0 %	15834810
5022	NC_002620	TA	3	6	223961	223966	50 %	50 %	0 %	0 %	15834810
5023	NC_002620	TGTAG	2	10	223991	224000	20 %	40 %	40 %	0 %	15834810
5024	NC_002620	GA	3	6	224082	224087	50 %	0 %	50 %	0 %	15834810
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5031	NC_002620	GTAA	2	8	224324	224331	50 %	25 %	25 %	0 %	15834810
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5039	NC_002620	GTGG	2	8	224728	224735	0 %	25 %	75 %	0 %	15834811
5040	NC_002620	TTA	2	6	224744	224749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834811
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5045	NC_002620	A	6	6	225037	225042	100 %	0 %	0 %	0 %	15834812
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5050	NC_002620	T	6	6	225215	225220	0 %	100 %	0 %	0 %	15834812
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5054	NC_002620	CAGAA	2	10	225531	225540	60 %	0 %	20 %	20 %	15834812
5055	NC_002620	A	7	7	225539	225545	100 %	0 %	0 %	0 %	15834812
5056	NC_002620	T	7	7	225584	225590	0 %	100 %	0 %	0 %	15834812
5057	NC_002620	AGGG	2	8	225596	225603	25 %	0 %	75 %	0 %	15834812
5058	NC_002620	ATG	2	6	225631	225636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834812
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5060	NC_002620	TGC	2	6	225693	225698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15834812
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5094	NC_002620	T	7	7	227628	227634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_002620	ATTT	2	8	227636	227643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_002620	TCT	2	6	227717	227722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5099	NC_002620	GAGG	2	8	227887	227894	25 %	0 %	75 %	0 %	15834814
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5108	NC_002620	ACT	2	6	228200	228205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15834814
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5110	NC_002620	AG	3	6	228288	228293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_002620	GGA	2	6	228327	228332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_002620	TCC	2	6	228337	228342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_002620	AGAA	2	8	228500	228507	75 %	0 %	25 %	0 %	15834815
5114	NC_002620	AAAG	2	8	228529	228536	75 %	0 %	25 %	0 %	15834815
5115	NC_002620	AAT	2	6	228557	228562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15834815
5116	NC_002620	CA	3	6	228584	228589	50 %	0 %	0 %	50 %	15834815
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5124	NC_002620	GAT	2	6	228852	228857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834816
5125	NC_002620	A	6	6	228910	228915	100 %	0 %	0 %	0 %	15834816
5126	NC_002620	TCT	2	6	228919	228924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834816
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5128	NC_002620	CTG	2	6	229034	229039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15834816
5129	NC_002620	ATT	2	6	229053	229058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834816
5130	NC_002620	GAG	2	6	229129	229134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15834816
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5132	NC_002620	GCTT	2	8	229158	229165	0 %	50 %	25 %	25 %	15834816
5133	NC_002620	T	6	6	229407	229412	0 %	100 %	0 %	0 %	15834816
5134	NC_002620	ATC	2	6	229430	229435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15834816
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5137	NC_002620	TTA	2	6	229511	229516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834816
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5139	NC_002620	GCTC	2	8	229579	229586	0 %	25 %	25 %	50 %	15834816
5140	NC_002620	GCA	2	6	229606	229611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15834816
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5142	NC_002620	TAA	2	6	229666	229671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_002620	A	6	6	229670	229675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_002620	CGT	2	6	229727	229732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5145	NC_002620	ATC	2	6	229751	229756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5147	NC_002620	A	8	8	229865	229872	100 %	0 %	0 %	0 %	15834817
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5151	NC_002620	ATT	2	6	230078	230083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834817
5152	NC_002620	GGCT	2	8	230089	230096	0 %	25 %	50 %	25 %	15834817
5153	NC_002620	AGCAC	2	10	230139	230148	40 %	0 %	20 %	40 %	15834817
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5167	NC_002620	TGG	2	6	230683	230688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15834817
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5239	NC_002620	TTTTG	2	10	233686	233695	0 %	80 %	20 %	0 %	15834817
5240	NC_002620	CTTC	2	8	233709	233716	0 %	50 %	0 %	50 %	15834817
5241	NC_002620	TTG	2	6	233769	233774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834817
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5246	NC_002620	AACA	2	8	234076	234083	75 %	0 %	0 %	25 %	15834817
5247	NC_002620	GAAG	2	8	234191	234198	50 %	0 %	50 %	0 %	15834817
5248	NC_002620	CTA	2	6	234209	234214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15834817
5249	NC_002620	GGA	2	6	234341	234346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15834817
5250	NC_002620	TCT	2	6	234350	234355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834817
5251	NC_002620	ATA	2	6	234360	234365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15834817
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5380	NC_002620	GAA	2	6	240659	240664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834824
5381	NC_002620	TAC	2	6	240669	240674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15834824
5382	NC_002620	TTA	2	6	240708	240713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834824
5383	NC_002620	T	6	6	240777	240782	0 %	100 %	0 %	0 %	15834824
5384	NC_002620	GTT	2	6	240812	240817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5385	NC_002620	T	7	7	240910	240916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5451	NC_002620	ATA	2	6	243865	243870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5497	NC_002620	CTT	2	6	245634	245639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834829
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