MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 25566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002491	ATT	2	6	143615	143620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_002491	TTTTC	2	10	143910	143919	0 %	80 %	0 %	20 %	15835647
3003	NC_002491	AAG	2	6	143976	143981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835647
3004	NC_002491	AGA	2	6	144059	144064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835647
3005	NC_002491	ACA	2	6	144072	144077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835647
3006	NC_002491	TGA	2	6	144102	144107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835647
3007	NC_002491	AAG	2	6	144121	144126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835647
3008	NC_002491	AAG	2	6	144136	144141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835647
3009	NC_002491	GAT	2	6	144173	144178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835647
3010	NC_002491	GTT	2	6	144201	144206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835647
3011	NC_002491	AAAC	2	8	144217	144224	75 %	0 %	0 %	25 %	15835647
3012	NC_002491	AAG	2	6	144369	144374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835647
3013	NC_002491	ATA	2	6	144447	144452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_002491	A	8	8	144481	144488	100 %	0 %	0 %	0 %	15835648
3015	NC_002491	ACCC	2	8	144490	144497	25 %	0 %	0 %	75 %	15835648
3016	NC_002491	TTC	2	6	144525	144530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835648
3017	NC_002491	TTTG	2	8	144544	144551	0 %	75 %	25 %	0 %	15835648
3018	NC_002491	A	6	6	144572	144577	100 %	0 %	0 %	0 %	15835648
3019	NC_002491	TATGT	2	10	144608	144617	20 %	60 %	20 %	0 %	15835648
3020	NC_002491	CTT	2	6	144629	144634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835648
3021	NC_002491	T	6	6	144642	144647	0 %	100 %	0 %	0 %	15835648
3022	NC_002491	AAG	2	6	144658	144663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835648
3023	NC_002491	TTG	2	6	144665	144670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835648
3024	NC_002491	GGTAG	2	10	144679	144688	20 %	20 %	60 %	0 %	15835648
3025	NC_002491	GAA	2	6	144745	144750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835648
3026	NC_002491	CTG	2	6	144761	144766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835648
3027	NC_002491	GAAA	2	8	144773	144780	75 %	0 %	25 %	0 %	15835648
3028	NC_002491	A	6	6	144778	144783	100 %	0 %	0 %	0 %	15835648
3029	NC_002491	AAGAAA	2	12	144793	144804	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15835648
3030	NC_002491	CTT	2	6	144810	144815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_002491	T	7	7	144869	144875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_002491	TC	3	6	144886	144891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_002491	T	6	6	144994	144999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_002491	CAC	2	6	145027	145032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_002491	GAA	2	6	145048	145053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835649
3036	NC_002491	A	6	6	145052	145057	100 %	0 %	0 %	0 %	15835649
3037	NC_002491	T	6	6	145116	145121	0 %	100 %	0 %	0 %	15835649
3038	NC_002491	TCT	2	6	145165	145170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835649
3039	NC_002491	TGA	2	6	145222	145227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835649
3040	NC_002491	AAGC	2	8	145229	145236	50 %	0 %	25 %	25 %	15835649
3041	NC_002491	TAAA	2	8	145317	145324	75 %	25 %	0 %	0 %	15835649
3042	NC_002491	TTA	2	6	145337	145342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835649
3043	NC_002491	C	6	6	145345	145350	0 %	0 %	0 %	100 %	15835649
3044	NC_002491	TGA	3	9	145357	145365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835649
3045	NC_002491	AGG	2	6	145399	145404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835649
3046	NC_002491	CT	3	6	145416	145421	0 %	50 %	0 %	50 %	15835649
3047	NC_002491	TTG	2	6	145422	145427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835649
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3049	NC_002491	CT	3	6	145487	145492	0 %	50 %	0 %	50 %	15835649
3050	NC_002491	AG	3	6	145596	145601	50 %	0 %	50 %	0 %	15835649
3051	NC_002491	TACA	2	8	145629	145636	50 %	25 %	0 %	25 %	15835649
3052	NC_002491	AGA	3	9	145672	145680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835649
3053	NC_002491	CTT	2	6	145688	145693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835649
3054	NC_002491	GGA	2	6	145742	145747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835649
3055	NC_002491	CA	3	6	145783	145788	50 %	0 %	0 %	50 %	15835649
3056	NC_002491	GA	3	6	145958	145963	50 %	0 %	50 %	0 %	15835649
3057	NC_002491	TA	3	6	146022	146027	50 %	50 %	0 %	0 %	15835649
3058	NC_002491	ACC	2	6	146091	146096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835649
3059	NC_002491	ATT	2	6	146152	146157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835650
3060	NC_002491	TTA	2	6	146205	146210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835650
3061	NC_002491	TTG	2	6	146242	146247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835650
3062	NC_002491	T	6	6	146339	146344	0 %	100 %	0 %	0 %	15835650
3063	NC_002491	GCT	2	6	146399	146404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835650
3064	NC_002491	TAT	2	6	146414	146419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835650
3065	NC_002491	TGT	2	6	146466	146471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835650
3066	NC_002491	GCTA	2	8	146489	146496	25 %	25 %	25 %	25 %	15835650
3067	NC_002491	GTG	2	6	146523	146528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835650
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3069	NC_002491	TTTG	2	8	146649	146656	0 %	75 %	25 %	0 %	15835650
3070	NC_002491	C	6	6	146661	146666	0 %	0 %	0 %	100 %	15835650
3071	NC_002491	ATT	2	6	146685	146690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835650
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3073	NC_002491	TTG	2	6	146734	146739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835650
3074	NC_002491	GGTT	2	8	146814	146821	0 %	50 %	50 %	0 %	15835650
3075	NC_002491	T	6	6	146860	146865	0 %	100 %	0 %	0 %	15835650
3076	NC_002491	T	8	8	146920	146927	0 %	100 %	0 %	0 %	15835650
3077	NC_002491	ATGG	2	8	146934	146941	25 %	25 %	50 %	0 %	15835650
3078	NC_002491	GA	3	6	146942	146947	50 %	0 %	50 %	0 %	15835650
3079	NC_002491	T	6	6	146976	146981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3082	NC_002491	T	6	6	147031	147036	0 %	100 %	0 %	0 %	15835651
3083	NC_002491	TCT	2	6	147041	147046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835651
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3086	NC_002491	A	6	6	147159	147164	100 %	0 %	0 %	0 %	15835651
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3090	NC_002491	AGA	2	6	147276	147281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835651
3091	NC_002491	ATC	2	6	147290	147295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835651
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3094	NC_002491	GCT	2	6	147335	147340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835651
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3096	NC_002491	A	7	7	147376	147382	100 %	0 %	0 %	0 %	15835651
3097	NC_002491	GCT	2	6	147416	147421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835651
3098	NC_002491	TGT	3	9	147496	147504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835651
3099	NC_002491	TGA	2	6	147645	147650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835651
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3101	NC_002491	A	6	6	147947	147952	100 %	0 %	0 %	0 %	15835651
3102	NC_002491	TAT	2	6	147983	147988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835651
3103	NC_002491	TCG	2	6	148006	148011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835651
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3106	NC_002491	AAC	2	6	148095	148100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835651
3107	NC_002491	AG	3	6	148144	148149	50 %	0 %	50 %	0 %	15835651
3108	NC_002491	TGG	2	6	148158	148163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835651
3109	NC_002491	A	6	6	148256	148261	100 %	0 %	0 %	0 %	15835651
3110	NC_002491	T	6	6	148262	148267	0 %	100 %	0 %	0 %	15835651
3111	NC_002491	A	7	7	148304	148310	100 %	0 %	0 %	0 %	15835651
3112	NC_002491	AGG	2	6	148315	148320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835651
3113	NC_002491	TGT	2	6	148371	148376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835652
3114	NC_002491	ATT	2	6	148431	148436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835652
3115	NC_002491	T	6	6	148490	148495	0 %	100 %	0 %	0 %	15835652
3116	NC_002491	AG	3	6	148503	148508	50 %	0 %	50 %	0 %	15835652
3117	NC_002491	TTC	2	6	148521	148526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835652
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3120	NC_002491	AAG	2	6	148615	148620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835652
3121	NC_002491	AGA	2	6	148656	148661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835652
3122	NC_002491	GTAG	2	8	148683	148690	25 %	25 %	50 %	0 %	15835652
3123	NC_002491	CTTT	2	8	148715	148722	0 %	75 %	0 %	25 %	15835653
3124	NC_002491	TGA	2	6	148846	148851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835653
3125	NC_002491	GTG	3	9	148863	148871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835653
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3127	NC_002491	TTG	2	6	148964	148969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835653
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3152	NC_002491	AGA	2	6	149784	149789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835653
3153	NC_002491	GGT	2	6	149802	149807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3157	NC_002491	GA	3	6	149979	149984	50 %	0 %	50 %	0 %	15835654
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3220	NC_002491	TCTTT	2	10	153447	153456	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3234	NC_002491	T	6	6	154001	154006	0 %	100 %	0 %	0 %	15835659
3235	NC_002491	GATA	2	8	154036	154043	50 %	25 %	25 %	0 %	15835659
3236	NC_002491	ATGA	2	8	154076	154083	50 %	25 %	25 %	0 %	15835659
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3241	NC_002491	TGA	2	6	154240	154245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835659
3242	NC_002491	GTG	2	6	154364	154369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835659
3243	NC_002491	CAT	2	6	154385	154390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835659
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3245	NC_002491	GATCA	2	10	154409	154418	40 %	20 %	20 %	20 %	15835659
3246	NC_002491	GAT	2	6	154556	154561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835659
3247	NC_002491	TTCCAG	2	12	154615	154626	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15835659
3248	NC_002491	ATG	2	6	154638	154643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835659
3249	NC_002491	GTT	3	9	154681	154689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835659
3250	NC_002491	GAA	2	6	154764	154769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835659
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