MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 25566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_002491	CCT	2	6	117606	117611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161353805
2502	NC_002491	TCT	2	6	117637	117642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161353805
2503	NC_002491	ATT	2	6	117651	117656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161353805
2504	NC_002491	TC	3	6	117783	117788	0 %	50 %	0 %	50 %	161353805
2505	NC_002491	AGA	2	6	117837	117842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353805
2506	NC_002491	TTG	2	6	117845	117850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161353805
2507	NC_002491	AGA	2	6	117920	117925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353805
2508	NC_002491	CTT	2	6	117958	117963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161353805
2509	NC_002491	TA	3	6	117967	117972	50 %	50 %	0 %	0 %	161353805
2510	NC_002491	GTTC	2	8	118191	118198	0 %	50 %	25 %	25 %	161353805
2511	NC_002491	GGC	2	6	118236	118241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161353805
2512	NC_002491	AGC	2	6	118244	118249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161353805
2513	NC_002491	ATGT	2	8	118256	118263	25 %	50 %	25 %	0 %	161353805
2514	NC_002491	ATT	2	6	118290	118295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161353805
2515	NC_002491	GCG	2	6	118350	118355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161353805
2516	NC_002491	ACG	2	6	118403	118408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161353805
2517	NC_002491	GAA	2	6	118447	118452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353805
2518	NC_002491	TTC	2	6	118517	118522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835631
2519	NC_002491	A	6	6	118585	118590	100 %	0 %	0 %	0 %	15835631
2520	NC_002491	TCC	2	6	118598	118603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835631
2521	NC_002491	AAC	2	6	118653	118658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835631
2522	NC_002491	TGT	2	6	118728	118733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835631
2523	NC_002491	T	6	6	118733	118738	0 %	100 %	0 %	0 %	15835631
2524	NC_002491	AGA	2	6	118751	118756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835631
2525	NC_002491	TCA	2	6	118764	118769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835631
2526	NC_002491	T	6	6	118831	118836	0 %	100 %	0 %	0 %	15835631
2527	NC_002491	AG	3	6	118853	118858	50 %	0 %	50 %	0 %	15835631
2528	NC_002491	AAG	2	6	118895	118900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835631
2529	NC_002491	TAA	2	6	118927	118932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835631
2530	NC_002491	TTTGTA	2	12	119130	119141	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15835631
2531	NC_002491	AAGG	2	8	119205	119212	50 %	0 %	50 %	0 %	15835631
2532	NC_002491	TGT	2	6	119294	119299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835631
2533	NC_002491	T	6	6	119330	119335	0 %	100 %	0 %	0 %	15835631
2534	NC_002491	AG	3	6	119352	119357	50 %	0 %	50 %	0 %	15835631
2535	NC_002491	CTC	2	6	119377	119382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835631
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2537	NC_002491	CTTA	2	8	119489	119496	25 %	50 %	0 %	25 %	15835631
2538	NC_002491	TCC	2	6	119591	119596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835631
2539	NC_002491	AAG	2	6	119619	119624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835631
2540	NC_002491	TGT	2	6	119680	119685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835631
2541	NC_002491	TCA	2	6	119905	119910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835631
2542	NC_002491	CTT	2	6	119925	119930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835631
2543	NC_002491	ATC	2	6	119933	119938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835631
2544	NC_002491	TTG	2	6	120009	120014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835631
2545	NC_002491	GCAG	2	8	120056	120063	25 %	0 %	50 %	25 %	15835631
2546	NC_002491	AGG	2	6	120067	120072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835631
2547	NC_002491	AGCA	2	8	120077	120084	50 %	0 %	25 %	25 %	15835631
2548	NC_002491	GCT	2	6	120121	120126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835631
2549	NC_002491	AGT	2	6	120132	120137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835631
2550	NC_002491	AGC	2	6	120234	120239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835631
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2552	NC_002491	T	6	6	120310	120315	0 %	100 %	0 %	0 %	15835631
2553	NC_002491	AGA	2	6	120392	120397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835631
2554	NC_002491	AGT	2	6	120399	120404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835631
2555	NC_002491	GA	3	6	120484	120489	50 %	0 %	50 %	0 %	15835631
2556	NC_002491	ATA	2	6	120538	120543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835631
2557	NC_002491	TGT	2	6	120576	120581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835631
2558	NC_002491	GAAG	2	8	120685	120692	50 %	0 %	50 %	0 %	15835631
2559	NC_002491	TCG	2	6	120744	120749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835631
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2561	NC_002491	AG	3	6	120794	120799	50 %	0 %	50 %	0 %	15835631
2562	NC_002491	TCT	2	6	120804	120809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835631
2563	NC_002491	GGA	2	6	120905	120910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835631
2564	NC_002491	GA	3	6	120937	120942	50 %	0 %	50 %	0 %	15835631
2565	NC_002491	AGGG	2	8	121003	121010	25 %	0 %	75 %	0 %	15835631
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2567	NC_002491	TAC	2	6	121208	121213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835631
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2569	NC_002491	TCC	2	6	121313	121318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835631
2570	NC_002491	TCC	2	6	121325	121330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835631
2571	NC_002491	ATGTT	2	10	121377	121386	20 %	60 %	20 %	0 %	15835631
2572	NC_002491	TG	3	6	121400	121405	0 %	50 %	50 %	0 %	15835631
2573	NC_002491	T	6	6	121624	121629	0 %	100 %	0 %	0 %	15835631
2574	NC_002491	TGAAA	2	10	121646	121655	60 %	20 %	20 %	0 %	15835631
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2578	NC_002491	ATC	2	6	121913	121918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835631
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2581	NC_002491	GGAATG	2	12	122220	122231	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15835631
2582	NC_002491	GAG	2	6	122268	122273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835631
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2584	NC_002491	ATC	2	6	122370	122375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835631
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2587	NC_002491	TCC	2	6	122513	122518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835631
2588	NC_002491	TCC	2	6	122552	122557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835631
2589	NC_002491	TAGCC	2	10	122592	122601	20 %	20 %	20 %	40 %	15835631
2590	NC_002491	AG	3	6	122618	122623	50 %	0 %	50 %	0 %	15835631
2591	NC_002491	AG	4	8	122657	122664	50 %	0 %	50 %	0 %	15835631
2592	NC_002491	A	7	7	122683	122689	100 %	0 %	0 %	0 %	15835631
2593	NC_002491	TTCC	2	8	122737	122744	0 %	50 %	0 %	50 %	15835631
2594	NC_002491	GA	3	6	122820	122825	50 %	0 %	50 %	0 %	15835631
2595	NC_002491	T	6	6	122907	122912	0 %	100 %	0 %	0 %	15835631
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2597	NC_002491	T	6	6	122955	122960	0 %	100 %	0 %	0 %	15835631
2598	NC_002491	TA	3	6	123048	123053	50 %	50 %	0 %	0 %	15835631
2599	NC_002491	GAA	2	6	123069	123074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835631
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2602	NC_002491	GAG	2	6	123199	123204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835631
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2606	NC_002491	TGT	2	6	123477	123482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835631
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2608	NC_002491	AG	3	6	123551	123556	50 %	0 %	50 %	0 %	15835631
2609	NC_002491	CTT	2	6	123604	123609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835631
2610	NC_002491	GAAGA	2	10	123644	123653	60 %	0 %	40 %	0 %	15835631
2611	NC_002491	A	6	6	123664	123669	100 %	0 %	0 %	0 %	15835631
2612	NC_002491	AGT	2	6	123674	123679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835631
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2614	NC_002491	GA	3	6	123741	123746	50 %	0 %	50 %	0 %	15835631
2615	NC_002491	TCT	2	6	123756	123761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835631
2616	NC_002491	CGT	2	6	123779	123784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835631
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2619	NC_002491	CAG	2	6	123835	123840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835631
2620	NC_002491	T	6	6	123933	123938	0 %	100 %	0 %	0 %	15835631
2621	NC_002491	TCC	2	6	124111	124116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2622	NC_002491	TAA	2	6	124134	124139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_002491	T	6	6	124146	124151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_002491	T	6	6	124156	124161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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