MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 25566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_002491	GCT	2	6	48600	48605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835571
1003	NC_002491	GGA	2	6	48776	48781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835571
1004	NC_002491	ACA	2	6	48831	48836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835571
1005	NC_002491	TTTC	2	8	48984	48991	0 %	75 %	0 %	25 %	15835571
1006	NC_002491	GAA	2	6	49046	49051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835571
1007	NC_002491	TCT	2	6	49074	49079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835571
1008	NC_002491	GTT	2	6	49145	49150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_002491	A	6	6	49157	49162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_002491	ATT	2	6	49204	49209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_002491	TTG	2	6	49229	49234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_002491	AAG	2	6	49260	49265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835572
1013	NC_002491	GAA	2	6	49315	49320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835572
1014	NC_002491	AGG	2	6	49351	49356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835572
1015	NC_002491	GAT	2	6	49462	49467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835572
1016	NC_002491	ATG	2	6	49487	49492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835572
1017	NC_002491	GAG	2	6	49525	49530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835572
1018	NC_002491	GGATA	2	10	49626	49635	40 %	20 %	40 %	0 %	15835572
1019	NC_002491	GA	4	8	49647	49654	50 %	0 %	50 %	0 %	15835572
1020	NC_002491	AAG	2	6	49724	49729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835572
1021	NC_002491	GA	3	6	49746	49751	50 %	0 %	50 %	0 %	15835572
1022	NC_002491	A	7	7	49758	49764	100 %	0 %	0 %	0 %	15835572
1023	NC_002491	ATAAA	2	10	49773	49782	80 %	20 %	0 %	0 %	15835572
1024	NC_002491	GA	4	8	49874	49881	50 %	0 %	50 %	0 %	15835572
1025	NC_002491	T	7	7	49929	49935	0 %	100 %	0 %	0 %	15835572
1026	NC_002491	GAA	2	6	49947	49952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835572
1027	NC_002491	AG	3	6	49968	49973	50 %	0 %	50 %	0 %	15835572
1028	NC_002491	TAG	2	6	49974	49979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835572
1029	NC_002491	CA	3	6	49980	49985	50 %	0 %	0 %	50 %	15835572
1030	NC_002491	GA	3	6	49986	49991	50 %	0 %	50 %	0 %	15835572
1031	NC_002491	AGA	2	6	50078	50083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835572
1032	NC_002491	AGA	2	6	50107	50112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835572
1033	NC_002491	ACCTAG	2	12	50175	50186	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15835572
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1037	NC_002491	GTA	2	6	50356	50361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835572
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1039	NC_002491	GTG	2	6	50380	50385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835572
1040	NC_002491	GGA	2	6	50418	50423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835572
1041	NC_002491	AGGA	2	8	50494	50501	50 %	0 %	50 %	0 %	15835572
1042	NC_002491	TTG	2	6	50602	50607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835572
1043	NC_002491	GAAA	2	8	50661	50668	75 %	0 %	25 %	0 %	15835572
1044	NC_002491	A	6	6	50666	50671	100 %	0 %	0 %	0 %	15835572
1045	NC_002491	A	6	6	50676	50681	100 %	0 %	0 %	0 %	15835572
1046	NC_002491	CTTT	2	8	50713	50720	0 %	75 %	0 %	25 %	15835573
1047	NC_002491	GGT	2	6	50806	50811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835573
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1050	NC_002491	CCT	2	6	51030	51035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835573
1051	NC_002491	T	6	6	51044	51049	0 %	100 %	0 %	0 %	15835573
1052	NC_002491	CAT	2	6	51054	51059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835573
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1054	NC_002491	GGA	2	6	51128	51133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835573
1055	NC_002491	ACA	2	6	51170	51175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835573
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1057	NC_002491	T	6	6	51291	51296	0 %	100 %	0 %	0 %	15835573
1058	NC_002491	CCTT	2	8	51317	51324	0 %	50 %	0 %	50 %	15835573
1059	NC_002491	TGT	2	6	51334	51339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835573
1060	NC_002491	AG	3	6	51347	51352	50 %	0 %	50 %	0 %	15835573
1061	NC_002491	GTT	2	6	51383	51388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835573
1062	NC_002491	TAT	2	6	51405	51410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835573
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1064	NC_002491	GAG	2	6	51450	51455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835573
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1066	NC_002491	AGATC	2	10	51510	51519	40 %	20 %	20 %	20 %	15835574
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1072	NC_002491	AAG	3	9	51923	51931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835575
1073	NC_002491	TTA	2	6	51951	51956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835575
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1088	NC_002491	CCTA	2	8	52737	52744	25 %	25 %	0 %	50 %	15835575
1089	NC_002491	AG	3	6	52750	52755	50 %	0 %	50 %	0 %	15835575
1090	NC_002491	A	6	6	52854	52859	100 %	0 %	0 %	0 %	15835575
1091	NC_002491	AAGA	2	8	52861	52868	75 %	0 %	25 %	0 %	15835575
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1094	NC_002491	TC	3	6	53127	53132	0 %	50 %	0 %	50 %	15835575
1095	NC_002491	CAG	2	6	53219	53224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835575
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1097	NC_002491	GAA	2	6	53467	53472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835575
1098	NC_002491	ACA	2	6	53486	53491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835575
1099	NC_002491	CAT	2	6	53498	53503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835575
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1101	NC_002491	ATG	2	6	53542	53547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_002491	A	6	6	53598	53603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_002491	CGG	2	6	53615	53620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_002491	GCA	2	6	53698	53703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835576
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1107	NC_002491	T	9	9	53892	53900	0 %	100 %	0 %	0 %	15835576
1108	NC_002491	TATC	2	8	53925	53932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_002491	ACA	2	6	54014	54019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835577
1110	NC_002491	TAA	2	6	54028	54033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835577
1111	NC_002491	GCA	2	6	54101	54106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835577
1112	NC_002491	T	8	8	54113	54120	0 %	100 %	0 %	0 %	15835577
1113	NC_002491	A	6	6	54125	54130	100 %	0 %	0 %	0 %	15835577
1114	NC_002491	GAG	2	6	54159	54164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835577
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1116	NC_002491	AGA	2	6	54232	54237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835577
1117	NC_002491	ATGA	2	8	54280	54287	50 %	25 %	25 %	0 %	15835577
1118	NC_002491	GCT	2	6	54372	54377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835577
1119	NC_002491	CTTG	2	8	54400	54407	0 %	50 %	25 %	25 %	15835577
1120	NC_002491	AAG	3	9	54421	54429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835577
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1122	NC_002491	AAG	2	6	54488	54493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835577
1123	NC_002491	GAA	2	6	54531	54536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835577
1124	NC_002491	GA	3	6	54556	54561	50 %	0 %	50 %	0 %	15835577
1125	NC_002491	GA	5	10	54603	54612	50 %	0 %	50 %	0 %	15835577
1126	NC_002491	TGC	2	6	54673	54678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835577
1127	NC_002491	CTT	2	6	54699	54704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835577
1128	NC_002491	T	6	6	54759	54764	0 %	100 %	0 %	0 %	15835577
1129	NC_002491	T	6	6	54786	54791	0 %	100 %	0 %	0 %	15835577
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