MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 25566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002491	ACA	2	6	23343	23348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835551
502	NC_002491	GTA	2	6	23644	23649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835551
503	NC_002491	ACA	2	6	23664	23669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835551
504	NC_002491	TCGATT	2	12	23927	23938	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
505	NC_002491	T	7	7	23972	23978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_002491	A	7	7	23997	24003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_002491	TTA	2	6	24115	24120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835552
508	NC_002491	CT	3	6	24143	24148	0 %	50 %	0 %	50 %	15835552
509	NC_002491	TGC	2	6	24168	24173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835552
510	NC_002491	CAC	2	6	24219	24224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835552
511	NC_002491	AAAC	2	8	24310	24317	75 %	0 %	0 %	25 %	15835552
512	NC_002491	GTT	2	6	24332	24337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835552
513	NC_002491	CTT	2	6	24363	24368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835552
514	NC_002491	ATT	2	6	24400	24405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835552
515	NC_002491	GTT	3	9	24424	24432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835552
516	NC_002491	CAG	2	6	24440	24445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835552
517	NC_002491	TCG	2	6	24670	24675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835552
518	NC_002491	CAA	2	6	24676	24681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835552
519	NC_002491	ACA	2	6	24749	24754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835552
520	NC_002491	ACA	2	6	24760	24765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835552
521	NC_002491	AGG	2	6	24768	24773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835552
522	NC_002491	CTG	2	6	24782	24787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835552
523	NC_002491	ATTG	2	8	24862	24869	25 %	50 %	25 %	0 %	15835552
524	NC_002491	CAG	2	6	24944	24949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835552
525	NC_002491	A	6	6	24976	24981	100 %	0 %	0 %	0 %	15835552
526	NC_002491	GAG	3	9	25001	25009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835552
527	NC_002491	AAC	2	6	25021	25026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835552
528	NC_002491	AGG	2	6	25050	25055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835552
529	NC_002491	GA	3	6	25079	25084	50 %	0 %	50 %	0 %	15835552
530	NC_002491	TAC	2	6	25128	25133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835552
531	NC_002491	CT	3	6	25276	25281	0 %	50 %	0 %	50 %	15835552
532	NC_002491	GA	3	6	25340	25345	50 %	0 %	50 %	0 %	15835552
533	NC_002491	TGC	2	6	25406	25411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835553
534	NC_002491	ATGG	2	8	25488	25495	25 %	25 %	50 %	0 %	15835553
535	NC_002491	ACT	2	6	25500	25505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835553
536	NC_002491	GCA	2	6	25599	25604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835553
537	NC_002491	TAT	2	6	25659	25664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835553
538	NC_002491	CAT	2	6	25668	25673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835553
539	NC_002491	CAG	2	6	25686	25691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835553
540	NC_002491	ACT	2	6	25731	25736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835553
541	NC_002491	TAC	2	6	25766	25771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835553
542	NC_002491	AAT	2	6	25800	25805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835553
543	NC_002491	CGA	2	6	25815	25820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835553
544	NC_002491	CAAAAA	2	12	25829	25840	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	15835553
545	NC_002491	CAA	2	6	25988	25993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835554
546	NC_002491	AGG	3	9	26085	26093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835554
547	NC_002491	TTC	2	6	26095	26100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835554
548	NC_002491	ATG	2	6	26369	26374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835554
549	NC_002491	GGA	2	6	26392	26397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835554
550	NC_002491	GAT	2	6	26466	26471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835554
551	NC_002491	TC	3	6	26601	26606	0 %	50 %	0 %	50 %	15835554
552	NC_002491	CTT	2	6	26716	26721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835554
553	NC_002491	ATC	2	6	26735	26740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835554
554	NC_002491	TCAG	2	8	26768	26775	25 %	25 %	25 %	25 %	15835554
555	NC_002491	TTC	2	6	26796	26801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835554
556	NC_002491	GCTAT	2	10	26807	26816	20 %	40 %	20 %	20 %	15835554
557	NC_002491	GGA	2	6	26824	26829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835554
558	NC_002491	CT	3	6	26912	26917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_002491	TATTT	2	10	26933	26942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_002491	GTT	2	6	26960	26965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_002491	TGT	2	6	26999	27004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_002491	T	6	6	27040	27045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_002491	GAA	2	6	27055	27060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_002491	TCTAG	2	10	27100	27109	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
565	NC_002491	T	6	6	27116	27121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_002491	AATAT	2	10	27185	27194	60 %	40 %	0 %	0 %	15835555
567	NC_002491	TGT	2	6	27212	27217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835555
568	NC_002491	CCACT	2	10	27266	27275	20 %	20 %	0 %	60 %	15835555
569	NC_002491	TGC	2	6	27342	27347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835555
570	NC_002491	CTAC	2	8	27353	27360	25 %	25 %	0 %	50 %	15835555
571	NC_002491	TC	3	6	27361	27366	0 %	50 %	0 %	50 %	15835555
572	NC_002491	TA	3	6	27382	27387	50 %	50 %	0 %	0 %	15835555
573	NC_002491	GGT	2	6	27400	27405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835555
574	NC_002491	CTG	2	6	27434	27439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835555
575	NC_002491	TAC	2	6	27594	27599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835555
576	NC_002491	TGG	2	6	27687	27692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835555
577	NC_002491	A	6	6	27766	27771	100 %	0 %	0 %	0 %	15835555
578	NC_002491	AGG	2	6	27858	27863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835555
579	NC_002491	TGC	2	6	27942	27947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835555
580	NC_002491	CTT	2	6	27998	28003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835555
581	NC_002491	TGG	2	6	28035	28040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835555
582	NC_002491	AGG	2	6	28119	28124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835555
583	NC_002491	TC	3	6	28141	28146	0 %	50 %	0 %	50 %	15835555
584	NC_002491	CT	3	6	28172	28177	0 %	50 %	0 %	50 %	15835555
585	NC_002491	TAA	2	6	28182	28187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835555
586	NC_002491	AGG	2	6	28212	28217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835555
587	NC_002491	AGG	2	6	28236	28241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835555
588	NC_002491	AGG	2	6	28263	28268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835555
589	NC_002491	ACA	2	6	28300	28305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835555
590	NC_002491	TGC	2	6	28371	28376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835555
591	NC_002491	CTAT	2	8	28391	28398	25 %	50 %	0 %	25 %	15835555
592	NC_002491	ACC	2	6	28414	28419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835555
593	NC_002491	GA	4	8	28502	28509	50 %	0 %	50 %	0 %	15835555
594	NC_002491	CAG	2	6	28517	28522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835555
595	NC_002491	TAG	2	6	28571	28576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835555
596	NC_002491	CA	3	6	28614	28619	50 %	0 %	0 %	50 %	15835555
597	NC_002491	CTT	2	6	28648	28653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835555
598	NC_002491	AGA	2	6	28686	28691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_002491	TCA	2	6	28697	28702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835556
600	NC_002491	CAG	2	6	28763	28768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835556
601	NC_002491	GGGA	2	8	28890	28897	25 %	0 %	75 %	0 %	15835556
602	NC_002491	TTG	2	6	29105	29110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835556
603	NC_002491	TAG	2	6	29142	29147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835556
604	NC_002491	GTA	2	6	29338	29343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835556
605	NC_002491	CTC	2	6	29433	29438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835556
606	NC_002491	GTC	2	6	29458	29463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835556
607	NC_002491	AAT	2	6	29497	29502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835556
608	NC_002491	ATG	2	6	29555	29560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835556
609	NC_002491	TAC	3	9	29590	29598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835556
610	NC_002491	T	6	6	29610	29615	0 %	100 %	0 %	0 %	15835556
611	NC_002491	TAC	2	6	29623	29628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835556
612	NC_002491	AGG	2	6	29685	29690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835556
613	NC_002491	GA	3	6	29755	29760	50 %	0 %	50 %	0 %	15835556
614	NC_002491	TC	3	6	29886	29891	0 %	50 %	0 %	50 %	15835556
615	NC_002491	AG	3	6	30056	30061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_002491	TTG	2	6	30095	30100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_002491	TC	3	6	30107	30112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_002491	T	7	7	30152	30158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_002491	AGA	2	6	30163	30168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_002491	AGG	2	6	30240	30245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_002491	T	6	6	30283	30288	0 %	100 %	0 %	0 %	15835557
622	NC_002491	AAG	3	9	30305	30313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835557
623	NC_002491	ATC	2	6	30389	30394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835557
624	NC_002491	GCCA	2	8	30429	30436	25 %	0 %	25 %	50 %	15835557
625	NC_002491	AAT	2	6	30482	30487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835557
626	NC_002491	AG	4	8	30514	30521	50 %	0 %	50 %	0 %	15835557
627	NC_002491	TTTC	2	8	30724	30731	0 %	75 %	0 %	25 %	15835557
628	NC_002491	AACG	2	8	30970	30977	50 %	0 %	25 %	25 %	15835557
629	NC_002491	ATA	2	6	30983	30988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835557
630	NC_002491	GAG	2	6	31067	31072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835557
631	NC_002491	GGA	2	6	31117	31122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835557
632	NC_002491	GC	3	6	31165	31170	0 %	0 %	50 %	50 %	15835557
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751	NC_002491	TCAAA	2	10	36733	36742	60 %	20 %	0 %	20 %	15835561
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757	NC_002491	ATAG	2	8	37250	37257	50 %	25 %	25 %	0 %	15835561
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