MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 25566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002491	GAA	2	6	214255	214260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835709
4502	NC_002491	AGA	3	9	214263	214271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835709
4503	NC_002491	CAG	2	6	214387	214392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_002491	TTA	2	6	214503	214508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_002491	TG	3	6	214536	214541	0 %	50 %	50 %	0 %	15835710
4506	NC_002491	TAC	2	6	214550	214555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835710
4507	NC_002491	TGA	2	6	214598	214603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835710
4508	NC_002491	TTTA	2	8	214738	214745	25 %	75 %	0 %	0 %	15835710
4509	NC_002491	ATAG	2	8	214752	214759	50 %	25 %	25 %	0 %	15835710
4510	NC_002491	GCT	2	6	214815	214820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835710
4511	NC_002491	TAT	2	6	214823	214828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835710
4512	NC_002491	CTT	2	6	214838	214843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835710
4513	NC_002491	GAT	3	9	214897	214905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835710
4514	NC_002491	GAA	2	6	214927	214932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835711
4515	NC_002491	CA	3	6	215013	215018	50 %	0 %	0 %	50 %	15835711
4516	NC_002491	TA	3	6	215039	215044	50 %	50 %	0 %	0 %	15835711
4517	NC_002491	GAT	2	6	215089	215094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835711
4518	NC_002491	A	6	6	215114	215119	100 %	0 %	0 %	0 %	15835711
4519	NC_002491	CGTT	2	8	215153	215160	0 %	50 %	25 %	25 %	15835711
4520	NC_002491	GAG	2	6	215245	215250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835711
4521	NC_002491	AGAA	2	8	215255	215262	75 %	0 %	25 %	0 %	15835711
4522	NC_002491	A	6	6	215261	215266	100 %	0 %	0 %	0 %	15835711
4523	NC_002491	GCA	2	6	215284	215289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835711
4524	NC_002491	TTA	2	6	215296	215301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835711
4525	NC_002491	TTC	2	6	215337	215342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835711
4526	NC_002491	ATC	2	6	215355	215360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835711
4527	NC_002491	TGG	2	6	215379	215384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835711
4528	NC_002491	AGA	2	6	215543	215548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835711
4529	NC_002491	AG	3	6	215583	215588	50 %	0 %	50 %	0 %	15835711
4530	NC_002491	AGA	2	6	215601	215606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835711
4531	NC_002491	ATTCA	2	10	215637	215646	40 %	40 %	0 %	20 %	15835711
4532	NC_002491	AGC	2	6	215670	215675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835711
4533	NC_002491	TA	3	6	215704	215709	50 %	50 %	0 %	0 %	15835711
4534	NC_002491	ATT	2	6	215711	215716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835711
4535	NC_002491	CT	3	6	215771	215776	0 %	50 %	0 %	50 %	15835711
4536	NC_002491	TGA	2	6	215793	215798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835711
4537	NC_002491	CAA	2	6	215809	215814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835711
4538	NC_002491	ATA	2	6	215825	215830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835711
4539	NC_002491	AT	3	6	215835	215840	50 %	50 %	0 %	0 %	15835711
4540	NC_002491	ATG	2	6	215894	215899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835711
4541	NC_002491	CTT	2	6	216219	216224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_002491	GAG	2	6	216236	216241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835712
4543	NC_002491	GAA	2	6	216355	216360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835712
4544	NC_002491	AGCA	2	8	216413	216420	50 %	0 %	25 %	25 %	15835712
4545	NC_002491	TCT	3	9	216535	216543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835712
4546	NC_002491	CGT	2	6	216571	216576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835712
4547	NC_002491	T	6	6	216649	216654	0 %	100 %	0 %	0 %	15835712
4548	NC_002491	GCT	2	6	216739	216744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835712
4549	NC_002491	TC	3	6	216820	216825	0 %	50 %	0 %	50 %	15835712
4550	NC_002491	TCA	2	6	216844	216849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835712
4551	NC_002491	TTC	2	6	216963	216968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835712
4552	NC_002491	AGG	2	6	217013	217018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835712
4553	NC_002491	CT	3	6	217125	217130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_002491	CAA	2	6	217155	217160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_002491	AT	3	6	217251	217256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_002491	A	6	6	217258	217263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_002491	ACCC	2	8	217274	217281	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4558	NC_002491	GA	3	6	217375	217380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_002491	TTCTCT	2	12	217430	217441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835713
4560	NC_002491	GTT	2	6	217477	217482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835713
4561	NC_002491	GTT	2	6	217560	217565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835713
4562	NC_002491	TCC	2	6	217583	217588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835713
4563	NC_002491	GA	3	6	217597	217602	50 %	0 %	50 %	0 %	15835713
4564	NC_002491	TTTG	2	8	217617	217624	0 %	75 %	25 %	0 %	15835713
4565	NC_002491	AGGTT	2	10	217701	217710	20 %	40 %	40 %	0 %	15835714
4566	NC_002491	GA	3	6	217734	217739	50 %	0 %	50 %	0 %	15835714
4567	NC_002491	AGG	2	6	217771	217776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835714
4568	NC_002491	TCTT	2	8	217791	217798	0 %	75 %	0 %	25 %	15835714
4569	NC_002491	AAG	2	6	217833	217838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835714
4570	NC_002491	TGA	2	6	217839	217844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835714
4571	NC_002491	TAC	2	6	217847	217852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835714
4572	NC_002491	GTTGT	2	10	217886	217895	0 %	60 %	40 %	0 %	15835714
4573	NC_002491	CATTTA	2	12	217966	217977	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15835714
4574	NC_002491	T	7	7	217988	217994	0 %	100 %	0 %	0 %	15835714
4575	NC_002491	CTT	2	6	218073	218078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835715
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4581	NC_002491	CTAG	2	8	218620	218627	25 %	25 %	25 %	25 %	15835716
4582	NC_002491	TGT	2	6	218634	218639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835716
4583	NC_002491	TCCCC	2	10	218641	218650	0 %	20 %	0 %	80 %	15835716
4584	NC_002491	ATG	2	6	218706	218711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835716
4585	NC_002491	AAT	2	6	218723	218728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835716
4586	NC_002491	TAT	2	6	218729	218734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835716
4587	NC_002491	T	6	6	218751	218756	0 %	100 %	0 %	0 %	15835716
4588	NC_002491	A	7	7	218757	218763	100 %	0 %	0 %	0 %	15835716
4589	NC_002491	TAA	2	6	218764	218769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835716
4590	NC_002491	TTA	2	6	218799	218804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_002491	CAA	2	6	218819	218824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_002491	TAA	2	6	218830	218835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_002491	ATC	2	6	218844	218849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_002491	TA	3	6	218868	218873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_002491	AAT	2	6	218876	218881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_002491	ATT	2	6	218949	218954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835717
4597	NC_002491	A	7	7	218966	218972	100 %	0 %	0 %	0 %	15835717
4598	NC_002491	TGG	2	6	219054	219059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835717
4599	NC_002491	CAC	2	6	219079	219084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835717
4600	NC_002491	ATAGCT	2	12	219117	219128	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15835717
4601	NC_002491	TCT	2	6	219129	219134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835717
4602	NC_002491	ATA	2	6	219176	219181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835717
4603	NC_002491	AGG	2	6	219182	219187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835717
4604	NC_002491	AGG	2	6	219239	219244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835717
4605	NC_002491	ATA	2	6	219248	219253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835717
4606	NC_002491	ATT	2	6	219281	219286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835717
4607	NC_002491	GAT	2	6	219317	219322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835717
4608	NC_002491	CTT	2	6	219415	219420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835717
4609	NC_002491	T	6	6	219473	219478	0 %	100 %	0 %	0 %	15835717
4610	NC_002491	TAA	2	6	219488	219493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835717
4611	NC_002491	CTT	2	6	219528	219533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835717
4612	NC_002491	TCAA	2	8	219603	219610	50 %	25 %	0 %	25 %	15835717
4613	NC_002491	TTA	2	6	219741	219746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835717
4614	NC_002491	CGGCTT	2	12	219751	219762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835717
4615	NC_002491	TAA	2	6	219850	219855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835717
4616	NC_002491	T	6	6	219871	219876	0 %	100 %	0 %	0 %	15835717
4617	NC_002491	AAT	2	6	219908	219913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835717
4618	NC_002491	GCA	2	6	219966	219971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835717
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4622	NC_002491	T	6	6	220310	220315	0 %	100 %	0 %	0 %	15835717
4623	NC_002491	ATG	2	6	220317	220322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835717
4624	NC_002491	AAC	2	6	220340	220345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835718
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4626	NC_002491	ACAA	2	8	220450	220457	75 %	0 %	0 %	25 %	15835718
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